Daniel Karlsson, univ.lektor, Institutionen för medicinsk teknik

Daniel Karlsson, univ.lektor, Institutionen för medicinsk teknik

Big data is high-volume, high-velocity and high-variety information assets that demand cost-effective, innovative forms of information processing for enhanced insight and decision making. Gartner IT Glossary Big data is a term for data sets that are so large or complex that traditional data processing application software is inadequate to deal with them. Wikipedia

BIG DATA-metoder Statistiska metoder AI och maskininlärning Ex. naturligt-språk- och bildbehandling

+ 1 GB text/dag (Uppsala) 1 genomsekv. = 6 GB 1 patologi WSI < 4 GB livslång journal

+ 1 GB text/dag (Uppsala) 1 genomsekv. = 6 GB 1 patologi WSI < 4 GB livslång journal 70 läkarbesök/dag 8 kirurgiska ingrepp/dag 15 000 läkemedelsdoser/dag

+ 1 GB text/dag (Uppsala) 1 genomsekv. = 6 GB 1 patologi WSI < 4 GB livslång journal 70 läkarbesök/dag 8 kirurgiska ingrepp/dag 15 000 läkemedelsdoser/dag 29 kliniker på US Olika format: Text, kodade data, kvantiteter, signaler, bilder, video,...

+ 1 GB text/dag (Uppsala) 1 genomsekv. = 6 GB 1 patologi WSI < 4 GB livslång journal 70 läkarbesök/dag 8 kirurgiska ingrepp/dag 15 000 läkemedelsdoser/dag 29 kliniker på US Olika format: Text, kodade data, kvantiteter, signaler, bilder, video,... The completeness of medication histories in hospital medical records BJCP 49(6) 597 603. The medication history in the hospital medical record is often incomplete, as 25% of the prescription drugs in use is not recorded and 61% of all patients has one of more drugs not registered. Assessing the Accuracy of Administrative Data in Health Information Systems Medical Care 42(11): 1066-1072 The correct primary diagnosis was recorded for 57% of visits. Thirteen percent of errors were caused by physician diagnostic error, 8% to missing encounter forms, and 22% to incorrectly entered data. Findings varied by condition and site but not by level of training. Accuracy of secondary diagnosis data (27%) was even poorer.

Douglas Johnston, Cleveland Clinic

Google Flu Trends Använda söktrender för att detektera influensa-utbrott (BIG) Data från Google och US CDC Vad korrelerar med förkylningssäsongen? high school basketball

Anxiety Disorder Aortic Aneurysm Arthroplasty - Hip, Total Replacemt Bone Disease CANCER Cancer Metastasis to Bone Cardiac Impairment CHEST MASS Chronic Lung Disease Depressed Mood DEPRESSION Diarrhea Elevated Blood Pressure Hair Follicle Inflammation w Abscess in Sweat Gland Areas HEALTH MAINTENANCE HYDRADENITIS HYPERTENSION Inflammation of the Large Intestine Intestinal Parasitic Infection Kidney Problems Causing a Decreased Amount of Urine to be Passed Lightheaded Low Amount of Calcium in the Blood Low Amount of Potassium in the Blood Malignant Neoplastic Disease Migraine Headache MIGRAINES Nausea and Vomiting Nephrosis PSYCH e-patient Dave and Google Health https://participatorymedicine.org/epatients/2009/04/imagine-if-someone-had-been-managin g-your-data-and-then-you-looked.html

kräver

Vad är small data? Detaljerad data om individen/patienten Assessing the Accuracy of Administrative Data in Health Information Systems Medical Care 42(11): 1066-1072 The correct primary diagnosis was recorded for 57% of visits. Thirteen percent of errors were caused by physician diagnostic error, 8% to missing encounter forms, and 22% to incorrectly entered data. Findings varied by condition and site but not by level of training. Accuracy of secondary diagnosis data (27%) was even poorer.

Vad är small data? Detaljerad data om individen/patienten Patientdata är Alltid ofullständiga Ibland felaktiga Ofta dyra att samla in

Vad är small data? Detaljerad data om individen/patienten Exempel: blodtryck

Information om blodtrycksmätning

Information från laboratorieundersökningar

Histopatologisk information

Standardiserad information Två journalsystem kan idag endast undantagsvis utbyta någon information 25412000 Diabetic retinal microaneurysm (disorder)

i2b2 - Informatics for Integrating Biology and Bedside Flera stora amerikanska universitetssjukhus Anonymiserad data Standardiserade data Text

SMART Health IT En standardiserad plattform för att utveckla hälso- och sjukvårdsappar som kan prata med sjukvårdens system

Och i Sverige År 2025 ska Sverige vara bäst i världen på att använda digitaliseringens och e-hälsans möjligheter regeringen.se Invånartjänster: HälsaFörMig, Journalen

www.liu.se