Sammanfattning biokemi

Storlek: px
Starta visningen från sidan:

Download "Sammanfattning biokemi"

Transkript

1 Sammanfattning biokemi Grunderna i biokemi Bindningsavstånd kovalent - vätebindning - elektrostatiska interaktioner van der Waals interaktioner 1,54 Å 2,4-3,5 Å 3 Å 3,5-4,5 Å Kväve och syre kan fungera som acceptor och donator i vätebindningar i biologiska system. ATP används huvudsakligen som bränsle i levande celler. ATP produceras med hjälp av en protongradient mellan olika membran. För att den kemiskreaktion ska ske spontant krävs att den fria energin ( G) måste minska, produkterna måste ha lägre fri energi än utgångsämnena ( G= - T S < 0). För evolution krävs: reproduktion (barn), variation (mutationer) och urval (tävling). Generna kodar tre och tre för aminosyrasekvensen. Denna sekvans bestämmer 3D-struktur och därigenom proteinets egenskaper. Proteiners struktur och funktion Primärstruktur aminosyrasekvens Sekundärstruktur - α-helix och β-struktur (vätebindningar håller upp strukturerna). Tertiärstruktur 3D-struktur (disulfidbryggor, vätebindningar, elektrostatiska interaktioner, van der Waals interaktioner och hydrofoba effekten håller upp strukturerna). Kvartenärstruktur subenhetspackning Aminosyra förkortningar utseende egenskaper Glycin Gly G - minst, vridbar Alanin Ala A - 3 opolär, liten Valin Val V -( 3) 2 opolär, liten Leucin Leu L - 2( 3) 2 opolär, liten Isoleucin Ile I opolär, liten Methionin Met M - 2 2S 3 opolär, liten Prolin Pro P återbinder till huvudkedjan Fenylalanin Phe F aromatisk Tyrosin Tyr Y aromatisk Tryptofan Trp W - 2-5()6 aromatisk Serin Ser S - 2 Threonin Thr T - 3 ystein ys - 2-S disulfidbindningar Lysin Lys L , basisk, stor Arginin Arg R ( 2) 2 +, basisk, stor istidin is - 2-5( 2) +, basisk, cyklisk Aspartat Asp D , sur Glutamat Glu E , sur Aspargin Asn karboxamid Glutamin Gln Q karboxamid

2 + 3 R R R - Peptidbindningar länkar ihop aminosyror Peptider med få aminosyror kallas oligopeptider. R peptidbindning Psi R α huvudkedja R Phi Peptidbindningarna är inte vridbara. Men bindningarna kring α är vridbara. Mellan = och α kallas (psi) ψ och mellan - och α kallas (phi) φ. En Ramachadranplot visar sannorlikheten för en psi eller phi vinkel. Alla α-helixar i proteiner är högervridna, 3,6 aminosyror per varv i spiralen (vätebindningar mellan atom 1 och 13). Den hydrofoba effekten: hydrofoba grupper söker sig mot proteinets mitt medan polära och hydrofila aminosyror söker sig ut mot vattnet. Proteiner skrivs från -terminalen till -terminalen. Domäner är strukturella delar i ett protein som gruppar ihop sig. Subenheter är proteiner som med flera - och -terminaler. Proteinklasser Enzymer Reglerande proteiner Förrådsproteiner Transportproteiner Strukturproteiner Försvarproteiner Motorproteiner katalysatorer, proteaser tar isär proteiner hormoner och andra signalmolekyler lagrar ämnen, myoglobin lagrar syre hemoglobin som för ut syre till cellerna keratin i hud och naglar immunförsvaret, Ig (antikroppar) aktin och myosin i musklerna Protein rening Jonbytarkromatografi Används för att skilja proteiner med olika isoelektriskapunkter åt, isoelektriskpunkt = oladdat protein. Proteinets totala laddning beror på p p Isoelektrisk punkt Jonbytesgelen består av ämnen med laddade ligander tex: + Matrix 2 2 Matrix M 3 3 DEAE

3 Sambandet mellan proteiners laddning och p: A B batteri p Man ökar/minskar jonstyrkan (p) var efter tiden går. Man får då ut fraktioner med proteiner med olika iso-punker i olika provrör. Affinitets kromatografi Sefaros kula bensamidin ligand trypsin Liganden binder specifikt till proteinet. Bundet protein tas bort genom att ändra förhållandena så att elution sker (te x tillsats av fri ligand (ej rent protein som kommer ut), ändra p eller jonstyrka (salt)). Gelfiltrering Stor molekyl Liten molekyl kolonn Korsbundna polysackarider Skiljer proteiner med olika storlekar från varandra. Den stationära fasen är porösa kulor. Stora proteiner glider snabbt ut mallan kulorna. Små proteiner silas igenom kulorna och måste vandra en längre sträcka och det tar längre tid. Man kan variera kulornas poröshet efter vilka proteiner man ska separera. Gel elektrofores Är en analytisk och inte preparativ metod där man kan bestämma molvikter av proteiners subenheter. SDS-PAGE, SDS bryter alla icke-kovalenta bindningar denaturerar proteinerna. Alla proteinernas subenheter blir negativt laddad. Små proteiner vandrar snabbt igenom gelen.

4 - massa + Man kan även använda centrifugering eller saltlöslighet för att rena fram proteiner. DA, RA och flödet av genetisk information Molekylärbiologins centrala dogma: DA Transkription RA Translation Protein DA: Deoxiribos RA: Ribos Puriner (6+5 ring): Adenin Guanin 2 2

5 Pyrimidiner (6 ring): Thymin (DA) ytosin Uracil (RA) 2 3 ukleosid = bas + socker ukleotid = bas + socker + fosfat Replikering = syntes av en DA-kopia för celldelning, katalyseras av DA-plymeras RA ribonukleinsyra rra ribosom tra transfer (överför aa till mra) mra messenger (transkriptionen av DA) inton = sekvenser av DA som ej kodas för protein exon = sekvenser av DA som kodas för protein Protein syntetiseras på ribosomen enligt mra mall. Baserna kodar tre och tre för en aminosyra. Te x AUG = Met, GAA = Glu, A = Pro.

6 Enzymer: grundkoncept och kinetik Enzymer är proteiner som ökar hastigheten på reaktioner (till jämnvikt). De kan läsa av omgivningen och samordnar och reglerar. ytosol: Glykolys Pentosfosfat shunten Fettsyra syntes Enzymer sänker energi ribban: Båda: Glukoneogenesen Urea cykeln Mitokondriens matrix: itronsyra cykeln xidativ fosforylering β-oxidation av fettsyror Bildandet av ketonkroppar TS G S katalys aktiveringsenergi P spontan reaktion G = 0 vid jämnvikt G + RT ln Q = 0 vjv G = -RT ln [P]/[S] vjv G = T S E+S ES E+P Lock-and-key: då substrat och enzym passar precis från början. Induced fit: då enzymet förändrar sin form och anpassar sig efter substratet för att de ska passa ihop. Aktiv yta: reaktionskärl (oftast hydrofoba för man vill göra reaktionen ifrånvaro av vatten, endast L-isomerer i naturen). Apoenzym + cofaktor = holoenzym Michaelis Menten k 1 E+S ES E+P k- 1 k 2 V 0 = V max [S] [S] * K M V 0 = [P] / t = k [E], i början av reaktionen är [P] = 0 k 2 högt = snabb reaktion K M= konstant (units of concentration) V max = k 2 [E] tot k 2 / K M = specificitets faktor V max / 2 = K M

7 astigheten som funktion av substratkoncentrationen 0, ~V max 0, , Utan inhibitor 0, ~V max /2 Med inhibitor v (M/min) 0, , ,0005 0,001 0,0015 0,002 0,0025 0,003 0,0035 k M =0,0008 k M =0,0018-0, Substratkoncentrationen (M) substrat K o m p e t e t i v i n h i b a t o r I c kicke-kompetetiv e - k o m p e t e t i v i n hinhibitor i b a t o r substrat e n z y m e n z y m e n z y m A B kompetetiv inhibitor icke-kompetetiv inhibitor 1/V 1/V 1/V -1/K M utan inhibitor utan inhibitor 1/Vmax 1/[S] 1/[S] 1/[S] Samma V max ögre K M med inhibitor Samma K M Lägre V max med inhibitor Katalytiska strategier Serinproteaser: klyver specifika peptidbindningar (underlättar en svår reaktion). En katalytisk triad bestående av Asp 102, is 57 och Ser 195. hymotrypsin Trypsin Elastas - Val Val Klyver: stora alifatiska + laddade långa korta alifatiska (Arg/Lys)

8 Karbanhydras: inställer jämnvikten mellan koldioxid i lungorna och bikarbonat i blodet (göt en snabb reaktion snabbare). Till sin hjälp har den en Zn 2+ och tre is. Kinaser: Förflyttar en fosfatgrupp utan att den reagerar med vatten. Induced-fit motverkar ATP-hydrolys. ATP + S ADP + SP i Reglering: enzymer och hemoglobin Metabolism regleras genom styrning av: tillgång på substrat tillgång på enzym enzymers katalytiska aktivitet Allosteri /annan struktur): T-state Mindre aktiv Långsam Gynnas av inhibitor eterotrp effekt R-state Mer aktiv Snabb Gynnas av substrat omotrop effekt V 0 R-state Blandning av R & T T-state [S] eterotrop allosterisk effekt: (kommunikation mellan flera aktiva ytor) omotrp allosterisk effekt: T- inaktiv Bohre effekten: Protoner och koldioxid stabiliserar deoxyformen (T-state) av hemoglobin. ögre [ + ] mer deoxy B mer syre släpps till cellerna Reglering genom kovalent modifiering Fosforylering (kinase), on/off med hjälp av fosfat ATP ADP aktiv Pyruvat dehydrogenas Pyruvat dehydrogenas P inaktiv P i 2 Protelytisk aktivering (proteinspjälking, blodlevring, programmerad celldöd) Te x hymotrypsin, matspjälknings apparatens proteaser syntetiseras som inaktiva zymogener.

9 Kaskader: koordination och signalförstärkning Regulatoriska proteiner Binder substrat starkt E+S ES binder starkt här ofaktorer, vitaminer och kolohydrater ofaktorer Apoenzym + cofaktor = holoenzym Metaller: Löstbundna: Mg 2+, a 2+ och K + Kovalentbundna: Fe-S, Zn 2+, hemejärn oenzymer Löstbundna (cosubstrat): o A, AD + (in, reagerar, ut) Kovalentbundna (prostetiska grupper): FAD Zn 2+ är en metall som hjälper karbanhydras inställa jämnvikten mellan koldioxid och bikarbonat. ATP är en energibärare. Fe 3+ + e - Fe 2+ hemegrupp e - transport Vitaminer är ofta precurors till coenzymer: B 2 FAD, iacin AD, antioxidant. Energibärare: AD + (cosubstrat), ADP (cosubstrat) och FAD (prostetisk). Kolhydrater ( 2) + 2 koldioxid + vatten kolhydrat + syre Monosackarider: pentoser, hoxoser mfl. Disackarider: sukros, laktos, maltos Polysackarider: glykogen, stärkelse, cellulosa Kolhydrat + protein = glukoprotein Lipider, membran, kanaler och pumpar Lipider samlande benämning på naturligt förekommande organsika föreningar som kan isoleras ur växt- eller djurvävnad genom extraktion med opolära lösningsmedel som te x bensen. Fett är triacylgrycerider, dvs: en glycerol med tre fettsyror bundna till sig. Ett mättat fett har inga dubbelbindningar i kolkedjan, ett enkelomättat fett har en dubbelbindning och ett fleromättat fett har flera dubbelbindningar. Fettsyrekedjor är alltid i cis. 18 oktadekansyra (stearinsyra) 18 utan dubbelbindningar: 18:0 18 med 2 dubbelbindningar: 18:2 Dubbelbindning mellan 9 0ch 10: cis 9 16:1 cis 9 -hexadecenoat 3( 2) 5=( 2) 7 - Membranlipid: Fosfolipid 2 fettsyror fästa på en glycerol, och på den en fosfat och på fostfaten en alkohol. fettsyra fettsyra glycerol hydrofob hydrofil Fosfat Alkohol

10 Glukolipider består av en fettsera, en mellan del och den glukos eller galaktosdel. Kolesterol är en stereoid som skapar stabilitet i membranen. Består av en stor hydrofob del med ringstrukturer och en liten hydrofil del (en grupp). Rörelser av lipider i membran (hastighet ca 2 µm/sek): snabbt, lätt långsamt, svårt Membranproteiner: Alfa-helixar är vanliga i membran, beta-tunnor är lite mer ovanliga. Proteindelarna som går genom membran är hydrofoba ut mor membranet, och ofta hydrofila in mot tunneln. Endocytos: T LDL receptor T T T T T T T T T T kolesterol aminosyror LDL T T LDL bindning internalization lysosomal hydrolysis Pumpar: använder energi (ATP / ljus) för att transportera joner eller molekyler aktiv transport Kanaler: tillåter joner att snabbt passera genom membran, underlättar diffusion (utjämning av koncentrations skillnader) passiv transport En antiporter släpper in en sak åt ena hållet och en annan sak åt andra hållet. En symporter släpper över flera saker i samma rikting. Jonkanaler i nervimpulser drivs av koncentrations skillnader. Acetylkolinreceptor kanalerna (neurotransmitter) kan stängas och öppnas för att släppa ut acetylkolin i synaptic klyftan mellan axonerna under en nervimpuls. K a+ nervimpuls a+ nervimpuls K+ + +

11 Glykolys 1 glukos 2 pyruvat + 2 ATP + 2 AD glukos hexokinas ADP glukos glukos-6-fosfat galaktos G-6-P fosforglukosisomeras F-6-P fruktos-6-fosfat fruktos F-1,6-BP fosforfriktoskinas ADP GAP DAP fruktos-1,6-bisfosfat aldolas 1,3-BPG glyceraldehyd-3-fosfat dihydroxyacetonfosfat 3-PG GAP-dehydrogenas AD 1,3-bisfosfoglycerat AD 2-PG x 2 fosfoglyceratkinas ATP ATP PEP 3-fosfoglycerat fosfoglyceratmutas pyruvat 2-fosfoglycerat enolas 2 2 fosfoenolpyruvat pyruvatkinas ATP ATP pyruvat Vad händer med pyruvaten? 2 pyruvat 2 2 AD 2 acetaldehyd laktat acetyl o A etanol AD itronsyra cykeln Reglering av glykolysen sker allosteriskt med enzymet fosfofruktokinas. Glukagon inaktiverar glykolysen, och insulin aktiverar den.

12 Glykoneogenesen Syntes av glukos utifrån icke kolhydrat metaboliter som laktat (från muskler och röda blodkroppar), glycerol (från fett) och aminosyror (från mat / muskler). Sker vid svält, då du sover och vid långdistans träning. Är (nästan) glykolysen baklänges (andra enzymer ibland). glukos glukos-6-fosfatas G-6-P fosfatglukosisomeras F-6-P fruktos-1,6-fosfatas F-1,6-BP Annat enzym Annat enzym aldolas GAP DAP glycerol Vissa aminosyror går in i glykoneogenesen via oxaloacetat och pyruvat. Laktat går in via pyruvat. Alanin + α-ketoglutarat pyruvat + glutamat (mha alaninaminotransferas) ATP 2P ADP Biotinenzym + 2P biotinenzym + P i 2-biotinenzym + pyruvat oxaloacetat + biotinenzym Den huvudsakliga glukoneogenesen sker i levern. Reciprok reglering (samma typer av molekyler inhiberar och stimulerar) av glykolysen och glykoneogenesen. ATP, citrat, + och alanin inhiberar glykolysen. F-2,6-BP, AMP och F-1,6-BP stimulerar glykolysen. Glykoneogenesen inhiberas av F-2,6-BP, AMP och ADP, och stimuleras av citrat och acetyl o A. oris cykel (kroppen vinner tid, men får syre skuld som kräver ATP i ränta): lever blod muskler glukoneogenes glukolys glukos glukos 6 ATP 2 ATP pyruvat pyruvat laktat laktat

13 itronsyra cykeln är sker oxidation av kolhydrater, aminosyror och fett samt syntes av byggstenar för biosyntes. 3 AD, 1 FAD 2 och 1 GTP levereras till andningskedjan. 2 2 andas ut. ATP och AD inhiberar citronsyra cykeln. Intermediärer för biosyntes: itrat går till fettsyror och steroler. α-ketoglutarat bildar glutamat och vidare andra aminosyror och puriner. Succinyl o A går till porfyriner, heme och klorofyll. xaloacetat ombildas till aspartat och vidare till andra aminosyror och puriner. m oxaloacetatet går till glukoneogenesen måste oxaloacetat frådet fyllas på för att inte citronsyra cykeln ska avstanna (pyruvat + 2 A). Behövs då fyllas på med oxaloacetat från pyruvat. Fett brinner i kolhydraternas låga. xidativ fosforylering Sker i mitokondrierna (som de röda blodkropparna saknar). G = -nf E 0 E 0 = elektronpotential vid p 7 etc. F = faradays konstant = 23,06 kcal/mol n = antal e - transporterade E 0 ½ e ,82 AD e - AD -0,32 1,14 V G = -2 * 23,06 * 0,82 = -37,8

14 totalt 10 protoner / AD (4+2+4) Malat-aspartat skytteln Glycerol-fosfat skytteln Energi som erhålls vid total oxidation av glukos: Glykolysen 2 ATP 4 ATP 2 AD 10 AD = 10 * 2,5 = 25 ATP PD-komplexet 2 AD 2 FAD 2 = 2 * 1,5 = 3 ATP itronsyra cykeln 6 AD 32 ATP totalt (malat-aspartat skytteln) 2 FAD 2 30 ATP (glycerol-fosfat skytteln) 2 ATP Behovet av ATP styr hastigheten 2 som går åt ADP slut ADP tillsatts tid

15 Rotenon inhiberar komplex I, antimycin A inhiberar komplex III och o/k inhiberar komplex IV. Fotosyntesen ( 2) + 2 Ljusreaktion: 2 ½ e - e - :ADP ADP + :ADP ATP Mörkerreaktion: 2 2 Sker i kloroplasten: Förutsättningar för infångning av ljus: slutna rum (tylakoidrum) ljusreceptorer (klorofyll) biologiska membran (tylakoidmembran) redoxaktiva ämnen (AD) Klorofyll är en cyklisk tetrapyrrol med alternerade dubbelbindningar i ett konjugerade system. Mg i mitten.

16 alvin cykeln (sker i kloroplasternas stroma) 3 ATP, 2 ADP och 1 2 går åt per varv i alvin cykeln. Rubico är det enzym som katalyserar assimilationen av atmosfäriskt 2 till levande organismer. Finnas väligt många för de är så ineffektiva. Pentosfosfat shunten xidativ (fas 1) Glukos-6-fosfat Ribos-5-fosfat 2 ADP Ribos-5-fosfat Xylulos-5-fosfat GAP ( 3 ) S-7-P ( 7 ) Fruktos-6-fosfat E-4-P ( 4 ) Xylulos-5-fosfat Icke-oxidativ (fas 2) Fruktos-6-fosfat GAP

17 Glukos-6-fosfat dehydrogenas är det hastighetsbestämmande steget i pentosfosfat shunten. Pentosfosfat shunten skapar ADP (som behövs för fettsyra-, kolesterol- och nukleotidsyntes). Fruktos-6-fosfat och GAP är delar i glykolysen. Ribos-5-fosfat används för tillverkning av RA och DA (ATP, FAD, AD, oa). Sker i binjurar, lever, testiklar, äggstockar och i fettvävnaden. Glukos-6-fosfat + 2 ADP Ribos-5-fosfat + 2 ADP Glykogen Reglerar blodglukoskoncentrationen. Energi reserv vid hårt muskelarbete. 10% av levern är glykogen, 2% av musklerna är glykogen. Det är stora molekyler med många förgreningar. Glykogen glykogenfosforylas Glykogen n-1 Glukos-1-fosfat fosfoglukomutas Glukos-6-fosfat Glykolysen Pyruvat glukos-6-fosfatas i levern Glukos Pentosfosfat shunten Ribos + ADP I levern finns enzymet glukos-6-fosfatas som gör om glukos-6-fosfat till glukos som kan transporteras via blodet ut till bättre behövande celler. Detta enzym finns inte i musklerna. 2 + glukos-6-fosfat P i + glukos Det är en reciprok reglering av syntes och nedbrytning av glykogen. Syntes av glykogen: glukos-1-fosfat + UTP UDP-glukos UDP-glukos + glykogen n UTP + glykogen n+1 Den grenande strukturen (binder vatten) gör att den jättesnabb frisättning av glukos är möjlig. Adrenalin stimulerar nedbrytning av glykogen till glukos. Insulin stimulerar glykogen syntes. Glukos Glukos-6-fosfat Pentosfosfat shunten Ribos-5-fosfat + ADP Pyruvat Glykogen (överskott)

18 Fett metabolism Fettsyra syntes: Glukos Glukos-6-fosfat Pentosfosfat shunten Ribos-5-fosfat ADP Pyruvat Acetyl oa ADP Fettsyra A itrat mitokondrie citrat citrat cytosol acetyl oa acetyl oa oxaloacetat oxaloacetat pyruvat malat pyruvat ADP ADP 1. Transport av citrat /acetyl oa 2. Karboxylering acetyl oa + ATP malonyl oa + ADP + P i + + (hastighetsreglerande är acetyl oa karboxylas, kräver biotin) 3. Fettsyra syntes upp till 16, acetyl oa + malonyl oa fettsyra (acylgrupp acetyl oa) (+ 2 tills 16) 4. Elongering (ytterligare förlängning) i ER, det behövs minst 18 för att göra fett 5. Desaturering (gör dubbelbindningar = omättade fettsyror), essentiella fettsyror: omega 3 och 6 6. Triacylglycerol syntes (för lagring) med glycerol från glykolysen via DAP. Fettnedbrytning Från tarmen går en del fettsyror till musklerna, men det mesta går till fettväven och sedan till levern. I levern bildas och från tarmen kommer kylomikroner (blodfettskulor). Fett går först via lymfan sedan via blodet. Fettsyror går direkt ut i blodet. Det sker en enzymatisk (lipaser) nedbrytning av triacylglycerider i tarmen. Glukagon fäster vid receptorer i cellmembranet som signalerar via en kaskad så att triacylglycerol lipas aktiveras så att fettsyror bildas och går ut till blodet. Men för att långa fettsyror ska kunna komma in i mitokondrierna för β-oxidation måste de fästa vid carnitin och gå via ett translokas protein.

19 β-oxidation sker i mitokondrierna Acyl oa n FAD 2 Trans- 2 -enoyl oa 2 L-3-hydroxyacyl oa S-oA 3-ketoacyl oa AD Acyl oa n-2 + Acetyl oa 2,5 ATP/AD 17,5 ATP 1,5 ATP/FAD 2 10,5 ATP 10 ATP/acyl oa 80 ATP 108 ATP 2(aktivering) = 106 ATP palmoityl oa + 7 FAD + 7 AD + 7 oa acetyl oa + 7 FAD AD edbrytning av omättade fettsyror sker på samma sätt fast ytterligare 2 enzymsteg krävs för reducering av dubbelbindningar. edbrytning av udda fettsyror sker mha B 12 och bildar succinyl oa istället för acetyl oa. Ketonkroppar Produceras i levern vid svält. Fettsyror bryts ner. AD 2 Acetyl oa Acetoacetat smörsyra aceton Succinyl oa oa Acetoacetat Acetoacetyl oa 2 Acetyl oa Protein turnover number och aminosyra katabolism Aminosyror från mat eller intracellulärt. edbrytning och upptag av dietära proteiner: lumen tarmcell blod proteiner aminosyror aminosyror tri & dipeptider peptidas oligopeptider aminopeptidas Protein turnover: halveringstid Ubiqutin är ett enzym som talar om för cellerna vilka proteiner som ska brytas ner. Så kallat dödsprotein binder till proteinet för att markera. Markerad = dödsdömd. Det behövs dock flera ubiqutin för att få tillräckligt stark signal.

20 Vad händer med aminosyrorna? Aminosyra glutamat 4 + måste frigöras från kvävet innan energi och byggstenar kan bildas. 4 + giftigt. Transaminering Aminosyra + ketosyra katosyra + aminosyra (mha aminotransferas som är beroende av B 6 och PLP) Aspartat + α-ketosyra oxaloacetat + glutamat Alanin + α-ketoglutarat pyruvat + glutamat Deaminering 2 Glutamat Schiffbas intermediat α-ketoglutarat AD 4 + Ureabildning av 4 +. Alanin-glukos cykeln Urea cykeln Urea cykeln och citronsyra sykeln hör ihop då fumarat svspjälkar vatten och bildar malat. xaloacetat bildar med glutamat aspartat som går in i urea cykeln. Energi, ombildning till glukos och biosyntes sker av kol-skeletten. Glukogena aminosyror kan bilda glukos te x aspartat, tyrosin och alanin. Ketogena aminosyror kan inte bilda glukos te x leucin och lysin.

21 Aminosyra syntes Kväve fixering: xaloacetat aspartat aspargin, methionin, treonin, lysin, isoleucin Pyruvat alanin, valin, leucin Ribos-5-fosfat histidin PEP + E-4-P Fenylalanin, tyrosin, tryptofan α-ketoglutarat glutamat glutamin, prolin, arginin 3-PG serin cystein, glycin Aminosyror är även byggstenar i te x adrenalin och i AD.

Organisk kemi / Biokemi. Livets kemi

Organisk kemi / Biokemi. Livets kemi Organisk kemi / Biokemi Livets kemi Vecka Lektion 1 Lektion 2 Veckans lab Läxa 41 Kolhydrater Kolhydrater Sockerarter Fotosyntesen Bio-kemi 8C och D vecka 41-48 42 Kolhydrater Fetter Trommers prov s186-191

Läs mer

Cellen och biomolekyler

Cellen och biomolekyler Cellen och biomolekyler Alla levande organismer är uppbyggda av celler!! En prokaryot cell, typ bakterie: Saknar cellkärna Saknar organeller En eukaryot djurcell: Har en välavgränsad kärna (DNA) Har flera

Läs mer

Övningstentafrågor i Biokemi, Basåret VT 2012

Övningstentafrågor i Biokemi, Basåret VT 2012 Övningstentafrågor i Biokemi, Basåret VT 2012 1. Förklara kortfattat följande ord/begrepp. (4p) - gen - genom - proteom - mutation - kofaktor - prostetisk grupp - ATP - replikation Celler: 2. Rita en eukaryot

Läs mer

BASÅRET KEMI B BIOKEMI VT 2012. METABOLISM 224-249 (sid. 192-219)

BASÅRET KEMI B BIOKEMI VT 2012. METABOLISM 224-249 (sid. 192-219) BASÅRET KEMI B BIOKEMI METABOLISM 224-249 (sid. 192-219) Glukos har en central roll i metabolismen ett universalt bränsle för många olika organismer Protein Många vävnader är nästan helt beroende av glukos

Läs mer

Integrerad metabolism

Integrerad metabolism Integrerad metabolism Table of Contents Återkommande intermediärer... 2 Fosfat... 2 Aktiverade bärare... 2 NADH och NADPH... 2 NADPH... 2 Coenzym A... 2 Vägen till Acetyl CoA... 3 Glykogenes... 3 Glykogenolys...

Läs mer

BASÅRET KEMI B BIOKEMI VT 2012. PROTEINER OCH ENZYMER 174-190 (sid. 140-156)

BASÅRET KEMI B BIOKEMI VT 2012. PROTEINER OCH ENZYMER 174-190 (sid. 140-156) BASÅRET KEMI B BIOKEMI PROTEINER OCH ENZYMER 174-190 (sid. 140-156) Hur lätt blir det fel i strukturen? ganska stora skillnader i sekvens - ganska lika strukturer proteinerna är bara identiska i 27 av

Läs mer

VI-1. Proteiner VI. PROTEINER. Källor: - L. Stryer, Biochemistry, 3 rd Ed., Freeman, New York, 1988.

VI-1. Proteiner VI. PROTEINER. Källor: - L. Stryer, Biochemistry, 3 rd Ed., Freeman, New York, 1988. Proteiner VI. PTEINE VI-1 Källor: - L. Stryer, Biochemistry, 3 rd Ed., Freeman, New York, 1988. VI-2 Molekylmodellering VI.1. Aminosyra En aminosyra (rättare: α-aminosyra) har strukturen som visas i figur

Läs mer

1. a) Markera polära och icke-polära delar i nedanstående molekyl. Vilken typ av ämne är det, och vad heter molekylen? (2p)

1. a) Markera polära och icke-polära delar i nedanstående molekyl. Vilken typ av ämne är det, och vad heter molekylen? (2p) Tentamen med svarsmallar Biokemi BI0968, 8:e jan 2009, 09 15-14 00. Max poäng = 100 p. Slutliga gränser: 3 = 50%; 4 = 70%; 5 = 82%. 1. a) Markera polära och icke-polära delar i nedanstående molekyl. Vilken

Läs mer

Biologi 2. Cellbiologi

Biologi 2. Cellbiologi Biologi 2 Cellbiologi Frågor man kan besvara efter att ha läst cellbiologi Varför blir huden skrynklig om man ligger länge i badkaret? Varför dör man av syrebrist? Hur fäster celler till varandra i kroppen?

Läs mer

Tentamen i Biokemi 2, 7 juni Hur samverkar katabolismen och anabolismen i en cell? Vad överförs mellan dessa processer?

Tentamen i Biokemi 2, 7 juni Hur samverkar katabolismen och anabolismen i en cell? Vad överförs mellan dessa processer? Kurs: BB1230 Tid: 08.00-13.00 Salar: FB51-53 Skriv namn och personnummer på alla blad Använd separat papper för varje fråga Tillåtna hjälpmedel: Inga Maxpoäng 60 p Godkänt (E) 30 p Komplettering (Fx) 28

Läs mer

ENERGI FLÖDEN AV MATERIAL OCH ENERGI ÄMNESOMSÄTTNINGEN

ENERGI FLÖDEN AV MATERIAL OCH ENERGI ÄMNESOMSÄTTNINGEN ENERG FLÖDEN AV MATERAL C ENERG ÄMNESMSÄTTNNGEN ÄMNESMSÄTTNNGEN KATABLSMEN Mage/tarm Cytosolen Mitokondrien Mitokondriens innermembran Fett fettsyror Betaoxidation Cellandning Kolhydrat glukos Glykolys

Läs mer

Översikt metabolismen

Översikt metabolismen Översikt metabolismen Glykolysen Glukoneogenesen Citronsyracykeln Andningskedjan Lipidmetabolism I Lipidmetabolism II Glykolysen Vad händer med Pyruvat Glukos Vidbrist på syre Vid tillgång på syre Citronsyracykeln

Läs mer

VI MÅSTE PRATA MED VARANDRA CELLENS KOMMUNIKATION

VI MÅSTE PRATA MED VARANDRA CELLENS KOMMUNIKATION VI MÅSTE PRATA MED VARANDRA CELLENS KMMUNIKATIN CELLENS KMMUNIKATIN MÅL MED DETTA AVSNITT När vi klara med denna lektion skall du kunna: Förklara följande begrepp: replikation, translation, transkription,

Läs mer

Proteiner 2012-10-22. Äggvitan består av proteinet ovalbumin. Farmaceutisk biokemi. Insulin är ett proteinhormon. Gly. Arg. Met. Cys. His. Gly.

Proteiner 2012-10-22. Äggvitan består av proteinet ovalbumin. Farmaceutisk biokemi. Insulin är ett proteinhormon. Gly. Arg. Met. Cys. His. Gly. Proteiner Farmaceutisk biokemi Gly Arg His Ala Lys His Met Gly Asn Pro Cys Phe Lys Maria Norlin Kjell Wikvall Insulin är ett proteinhormon Äggvitan består av proteinet ovalbumin Image: Simon Howden / FreeDigitalPhotos.net

Läs mer

Proteiner. Biomolekyler kap 7

Proteiner. Biomolekyler kap 7 Proteiner Biomolekyler kap 7 Generna (arvsanlagen) (och miljön) bestämmer hur en organism skall se ut och fungera. Hur? En gen är en ritning för hur ett protein skall se ut. Proteiner får saker att hända

Läs mer

Sluttentamen Bke2/KE0003, 29:e Oktober 2003, 09 00-15 00 Max poäng = 94 p. Preliminär gräns för godkänd = 50 p (53 %).

Sluttentamen Bke2/KE0003, 29:e Oktober 2003, 09 00-15 00 Max poäng = 94 p. Preliminär gräns för godkänd = 50 p (53 %). Sluttentamen Bke2/KE0003, 29:e Oktober 2003, 09 00-15 00 Max poäng = 94 p. Preliminär gräns för godkänd = 50 p (53 %). Besvara varje fråga på separat papper! Ange tydligt längst upp på varje papper både

Läs mer

Cellens energivaluta är främst ATP adenosintrifosfat. Finns även andra analoger till ATP, t ex UTP uridintrifosfat där kvävebasen adenin bytts mot

Cellens energivaluta är främst ATP adenosintrifosfat. Finns även andra analoger till ATP, t ex UTP uridintrifosfat där kvävebasen adenin bytts mot METABOLT SCHEMA: Cellens energivaluta är främst ATP adenosintrifosfat. Finns även andra analoger till ATP, t ex UTP uridintrifosfat där kvävebasen adenin bytts mot uracil. Dessa molekyler är så energirika

Läs mer

Proteiner. Biomolekyler kap 7

Proteiner. Biomolekyler kap 7 Proteiner Biomolekyler kap 7 Generna (arvsanlagen) (och miljön) bestämmer hur en organism skall se ut och fungera. Hur? En gen är en ritning för hur ett protein skall se ut. Proteiner får saker att hända

Läs mer

Sluttentamen Biokemi KE7001p3, 22 mars 2005, Max poäng = 70 p. Preliminär gräns för godkänd = 37 p (53 %).

Sluttentamen Biokemi KE7001p3, 22 mars 2005, Max poäng = 70 p. Preliminär gräns för godkänd = 37 p (53 %). Sluttentamen Biokemi KE7001p3, 22 mars 2005, 09 00-15 00 Max poäng = 70 p. Preliminär gräns för godkänd = 37 p (53 %). Ingen får lämna skrivsalen före 9:30. För toalettbesök måste du meddela skrivningsvakt

Läs mer

2003-06-03. 24-hour Metabolism. Ett arbete i Biokemi kursen vt. 2003. Sofia Bertolino Annlouise Mickelsen

2003-06-03. 24-hour Metabolism. Ett arbete i Biokemi kursen vt. 2003. Sofia Bertolino Annlouise Mickelsen 2003-06-03 24-hour Metabolism Ett arbete i Biokemi kursen vt. 2003 Sofia Bertolino Annlouise Mickelsen Handledare: Tom Taylor Supervisor: Stefan Knight Inlämnat: Den 3 juni 2003 24-hour metabolism, Vad

Läs mer

Frå n åminosyror till proteiner

Frå n åminosyror till proteiner Frå n åminosyror till proteiner Table of Contents Generellt om aminosyror... 2 Struktur och klassificering av aminosyror... 2 Alifatiska... 2 Aromatiska... 2 Polära, oladdade... 2 Positivt laddade... 2

Läs mer

Rättningsmall fråga 1: a) b) mellan N och Ca (0.5p); Ca och C (0.5p). c) vid ph 5: NH 3 + ------ COOH (0.5p); vid ph 9: NH 2 ------ COO - (0.

Rättningsmall fråga 1: a) b) mellan N och Ca (0.5p); Ca och C (0.5p). c) vid ph 5: NH 3 + ------ COOH (0.5p); vid ph 9: NH 2 ------ COO - (0. Tentamen Bke1, 10p, 25e Maj 1999. Riktmärke för godkänt 50% (53p av totalt 106 möjliga). Börja svara på varje fråga på ett nytt papper (detta underlättar rättningen av skrivningarna)! Glöm ej kodnummer

Läs mer

Från DNA till protein, dvs den centrala dogmen

Från DNA till protein, dvs den centrala dogmen Från DNA till protein, dvs den centrala dogmen DNA RNA Protein Biochemistry, kapitel 1 5 samt kapitel 29 31. Kapitel 2 5 samt 29 31 berörs även i kommande föreläsningar. Transkription och translation Informationsflödet

Läs mer

Lite basalt om enzymer

Lite basalt om enzymer Enzymer: reaktioner, kinetik och inhibering Biokatalysatorer Reaktion: substrat omvandlas till produkt(er) Påverkar reaktionen så att jämvikten ställer in sig snabbare, dvs hastigheten ökar Reaktionen

Läs mer

Svar: 3. a) Vid enzymkatalys binder enzymet in substratet/substraten till aktiva ytan. Närhet och orientering är förutsättning för katalys.

Svar: 3. a) Vid enzymkatalys binder enzymet in substratet/substraten till aktiva ytan. Närhet och orientering är förutsättning för katalys. 3. a) En enzymkatalyserad reaktion påverkas bland annat av mängden substrat. Ju högre halt av substrat, desto snabbare går reaktionen till jämvikt. Men vid tillräckligt höga halter av substrat så sker

Läs mer

Transkription och translation. DNA RNA Protein. Introduktion till biomedicin 2010-09-13. Jan-Olov Höög 1

Transkription och translation. DNA RNA Protein. Introduktion till biomedicin 2010-09-13. Jan-Olov Höög 1 Från DNA till protein, dvs den centrala dogmen DNA RNA Protein Biochemistry, kapitel 1 (delvis), kapitel 2 (ingående) samt kapitel 3 (delvis, kommer att behandlas mer) Transkription och translation Informationsflödet

Läs mer

Från DNA till protein, dvs den centrala dogmen

Från DNA till protein, dvs den centrala dogmen Från DNA till protein, dvs den centrala dogmen DNA RNA Protein Biochemistry, kapitel 1 5 samt kapitel 29 31. Kapitel 2 5 samt 29 31 berörs även i kommande föreläsningar. ph, kapitel 1, gås igenom i separata

Läs mer

5. Transkriptionell reglering OBS! Långsam omställning!

5. Transkriptionell reglering OBS! Långsam omställning! Reglering: 1. Allosterisk reglering Ex. feedbackinhibering en produkt i en reaktionssekvens inhiberar ett tidigare steg i samma sekvens 2. Olika isoformer i olika organ 3. Kovalent modifiering Ex. fosforylering

Läs mer

Sluttentamen Biokemi BI1032, 14:e januari 2010, Max = 100 p. Preliminära gränser: 3 = 55p; 4 = 70p; 5 = 85p.

Sluttentamen Biokemi BI1032, 14:e januari 2010, Max = 100 p. Preliminära gränser: 3 = 55p; 4 = 70p; 5 = 85p. Sluttentamen Biokemi BI1032, 14:e januari 2010, 09 15-15 00 Max = 100 p. Preliminära gränser: 3 = 55p; 4 = 70p; 5 = 85p. 1. a) Vilka är de 6 vanligaste grundämnena (atomslagen) i levande organismer? (1.5p)

Läs mer

Biomolekyler & Levande organismer består av celler. Kapitel 3 & 4

Biomolekyler & Levande organismer består av celler. Kapitel 3 & 4 Biomolekyler & Levande organismer består av celler Kapitel 3 & 4 Samma typer av biomolekyler i alla celler Proteiner och byggstenarna aminosyror Kolhydrater Lipider Nukleotider och nukleinsyror Dessa ämnesgrupper

Läs mer

Användning av kol och energikällor

Användning av kol och energikällor Bio 2. Biokemiska reaktioner och metabolism Liv Föröka sig, överföra information, energi från näringsmolekyler, anpassa sig till omgivningen För att leva och fortleva behöver cellen Kopiera och uttrycka

Läs mer

Tentamen med svarsmallar Biokemi BI1032, 13:e jan 2011, 09 15-15 00. Max poäng = 100 p. Slutliga betygsgränser: 3 = 52%; 4 = 70%; 5 = 85%.

Tentamen med svarsmallar Biokemi BI1032, 13:e jan 2011, 09 15-15 00. Max poäng = 100 p. Slutliga betygsgränser: 3 = 52%; 4 = 70%; 5 = 85%. Tentamen med svarsmallar Biokemi BI1032, 13:e jan 2011, 09 15-15 00. Max poäng = 100 p. Slutliga betygsgränser: 3 = 52%; 4 = 70%; 5 = 85%. 1. a) Vad krävs för att en (kemisk) reaktion ska kunna ske spontant?

Läs mer

KARLSTADS UNIVERSITET KEMI

KARLSTADS UNIVERSITET KEMI KARLSTADS UNIVERSITET KEMI TENTAMEN I BIOKEMI KEGAB0, KEGAH0, KEGABB, KEGAAK DATUM: 2016 08 22 TID: 8.15 13.15 Examinator: Maria Rova, tel. 054 700 1732 Hjälpmedel: Inga Kontrollera att Du fått rätt skrivning

Läs mer

Det gäller att vara tydlig!

Det gäller att vara tydlig! Slutprov Kemi 2 Organisk Kemi och Biokemi VT 2017 Maxpoäng = 67 För betyget E krävs att du uppnår 15 poäng För betyget C krävs att du uppnår 30 poäng varav 20 poäng för uppg. 20-27 För betyget A krävs

Läs mer

Svar till övningstentafrågor i Biokemi, Basåret VT 2012

Svar till övningstentafrågor i Biokemi, Basåret VT 2012 Svar till övningstentafrågor i Biokemi, Basåret VT 2012 1. - gen = en bassekvens i DNA, som innehåller information om aminosyrasekvensen för en polypeptidkedja, Se sidan 195 (161) i boken. - genom = allt

Läs mer

Cellens metabolism (ämnesomsättning)

Cellens metabolism (ämnesomsättning) Cellens metabolism (ämnesomsättning) Kap8 Sidor i boken: Enzymer: s223-230 Metabolism: s230-232, 243-261 (prio pdf) samf. s264, (262-263) Cellens ämnesomsättning (metabolism) Anabola reaktioner (uppbyggande)

Läs mer

Proteinstruktur samt Hemoglobin

Proteinstruktur samt Hemoglobin Proteinstruktur samt Hemoglobin Biochemistry Kapitel 2 Kapitel 3 Structure and Function of the Human Body Kapitel 12 Proteinstrukturer Primärstruktur - ordningen på aminosyrorna (peptidbindningen) Sekundärstruktur

Läs mer

Cellens metabolism (ämnesomsättning) Kap8 Sidor i boken Enzymer: Metabolism: , , ,257,

Cellens metabolism (ämnesomsättning) Kap8 Sidor i boken Enzymer: Metabolism: , , ,257, Cellens metabolism (ämnesomsättning) Kap8 Sidor i boken Enzymer: 223-230 Metabolism: 230-232, 243-249,252-253,257,259-261 Cellens ämnesomsättning (metabolism) Anabola reaktioner (uppbyggande) Katabola

Läs mer

Delprov Dugga med svarsmallar Biokemi BI0968, 8:e dec 2008, Max poäng = 50 p. Preliminära betygsgränser: 3 = 27p; 4 = 35p; 5 = 43p.

Delprov Dugga med svarsmallar Biokemi BI0968, 8:e dec 2008, Max poäng = 50 p. Preliminära betygsgränser: 3 = 27p; 4 = 35p; 5 = 43p. Delprov Dugga med svarsmallar Biokemi BI0968, 8:e dec 2008, 09 15-12 00. Max poäng = 50 p. Preliminära betygsgränser: 3 = 27p; 4 = 35p; 5 = 43p. 1. Tre viktiga grupper av biomolekyler är polymerer: proteiner,

Läs mer

Enzymer Farmaceutisk biokemi. Enzymet pepsin klyver proteiner i magsäcken till mindre peptider

Enzymer Farmaceutisk biokemi. Enzymet pepsin klyver proteiner i magsäcken till mindre peptider Enzymer Farmaceutisk biokemi Enzymet pepsin klyver proteiner i magsäcken till mindre peptider Enzymet CYP11A1, i t ex binjurar, testiklar och äggstockar, omvandlar kolesterol till könshormoner 1 Enzymet

Läs mer

Hastighet HOCH 2. *Enzymer är Katalysatorer. *Påverkar inte jämvikten

Hastighet HOCH 2. *Enzymer är Katalysatorer. *Påverkar inte jämvikten Enzymer, Katalys och Kinetik MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund Hastighet Reglerbarhet *Enzymer är Katalysatorer Påskyndar reaktioner utan att själv förbrukas. Kan ingå i delreaktioner men återbildas alltid

Läs mer

Så började det Liv, cellens byggstenar. Biologi 1 kap 2

Så började det Liv, cellens byggstenar. Biologi 1 kap 2 Så började det Liv, cellens byggstenar Biologi 1 kap 2 Liv kännetecknas av följande: Ordning- allt liv består av en eller flera celler Ämnesomsättning Reaktion på stimuli (retningar) Tillväxt och utveckling

Läs mer

Sluttentamen Biokemi KE7001p3, 15:e mars 2007, 09 15-15 00 Max poäng = 76 p. Slutlig gräns för godkänd = 36 p (47 %).

Sluttentamen Biokemi KE7001p3, 15:e mars 2007, 09 15-15 00 Max poäng = 76 p. Slutlig gräns för godkänd = 36 p (47 %). Sluttentamen Biokemi KE7001p3, 15:e mars 2007, 09 15-15 00 Max poäng = 76 p. Slutlig gräns för godkänd = 36 p (47 %). Öppna inte kuvertet förrän klartecken ges och allt lagts undan, utom tillåtna hjälpmedel

Läs mer

Sluttentamen Biokemi KE7001p3, 20 mars 2006, Max poäng = 75 p. Slutlig gräns för godkänd = 38 p (51 %).

Sluttentamen Biokemi KE7001p3, 20 mars 2006, Max poäng = 75 p. Slutlig gräns för godkänd = 38 p (51 %). Sluttentamen Biokemi KE7001p3, 20 mars 2006, 09 00-15 00 Max poäng = 75 p. Slutlig gräns för godkänd = 38 p (51 %). Ingen får lämna skrivsalen före 9:30. För toalettbesök måste du meddela skrivningsvakt

Läs mer

Biologiska membran Kap 10 fig10-1, 15, 18, 19 & med tillhörande beskrivningar. Övrigt är repetition.

Biologiska membran Kap 10 fig10-1, 15, 18, 19 & med tillhörande beskrivningar. Övrigt är repetition. Biologiska membran Kap 10 fig10-1, 15, 18, 19 & 24-27 med tillhörande beskrivningar. Övrigt är repetition. Membranproteiner kan bindas till lipidlagret genom hydrofoba interaktioner. Polypeptidkedjankan

Läs mer

Citronsyracykelns reaktioner sker i mitokondriematrix. Mitokondrierna kan sägas vara cellens kraftstationer p g a den stora produktionen av ATP.

Citronsyracykelns reaktioner sker i mitokondriematrix. Mitokondrierna kan sägas vara cellens kraftstationer p g a den stora produktionen av ATP. CITRONSYRACYKELN: Krebscykeln Trikarboxylsyrecykeln Citronsyracykelns reaktioner sker i mitokondriematrix. Mitokondrierna kan sägas vara cellens kraftstationer p g a den stora produktionen av ATP. Mitokondrierna

Läs mer

Proteinernas uppbyggnad, funktion och indelning. Niklas Dahrén

Proteinernas uppbyggnad, funktion och indelning. Niklas Dahrén Proteinernas uppbyggnad, funktion och indelning Niklas Dahrén Proteiner ü Namnet protein härstammar från det grekiska ordet protos som betyder den första. ü Anledningen 5ll namnet är a6 proteiner 7digt

Läs mer

1. a) Markera polära och icke-polära delar i nedanstående molekyl. Vilken typ av ämne är det, och vad heter molekylen? (2p)

1. a) Markera polära och icke-polära delar i nedanstående molekyl. Vilken typ av ämne är det, och vad heter molekylen? (2p) Tentamen med svarsmallar Biokemi BI0968, 8:e jan 2009, 09 15-14 00. Max poäng = 100 p. Slutliga gränser: 3 = 50%; 4 = 70%; 5 = 82%. 1. a) Markera polära och icke-polära delar i nedanstående molekyl. Vilken

Läs mer

Kapitel Var är vi i kursen???

Kapitel Var är vi i kursen??? Kapitel 11-14 Var är vi i kursen??? Kap 1-4 Celler, aminosyror, proteiner, enzymer Kap 5-7 DNA, Kromosomer, replikation, transkription, translation Kap 8-10 Gener och genom, kontroll, utveckling, analys

Läs mer

HEMTENTAMEN BIOKEMI 1, 6 hp 15-21 mars kl 9.00 2011 Grupp 2

HEMTENTAMEN BIOKEMI 1, 6 hp 15-21 mars kl 9.00 2011 Grupp 2 Bilaga 2 HEMTENTAMEN BIOKEMI, 6 hp 5-2 mars kl 9.00 20 Grupp 2 . a) Vid punkt (I) föreligger glycin främst i helt protoniserad form eftersom lösningens ph vid denna punkt är lägre än glycins båda pka-värden.

Läs mer

Ke2. Proteiner. Pär Leijonhufvud. Förstå proteinernas och aminosyrornas kemi och betydelse i levande organismer (och samhället) (alanin)

Ke2. Proteiner. Pär Leijonhufvud. Förstå proteinernas och aminosyrornas kemi och betydelse i levande organismer (och samhället) (alanin) Ke2 Proteiner Pär Leijonhufvud CC $\ BY: 26 februari 2014 C Kurs: Ke2, Åre gymnasium VT 2014 Ämne/område: Proteiner Mål: Förstå proteinernas och aminosyrornas kemi och betydelse i levande organismer (och

Läs mer

BASÅRET KEMI B BIOKEMI VT 2012

BASÅRET KEMI B BIOKEMI VT 2012 BASÅRET KEMI B BIOKEMI IngMarie Nilsson Biokemi och biofysik Plan 4 Rum 425 Tel. nr: 08-162728 E-post: ingmarie@dbb.su.se LABBAR Lab 11. Amylas lab Rum: K232/242 Huvudansvarig: Gabriela Danielsson Grupp

Läs mer

Institutionen för Laboratoriemedicin

Institutionen för Laboratoriemedicin Institutionen för Laboratoriemedicin VÄTTERNRUNDAN Skapat för Tandläkarutbildningen, Termin 1, Kemi av Hans-Erik Claesson 020903 Modifierat av Åke Rökaeus 050908, Birgitta Agerberth 030903, Märit Karls

Läs mer

Tentamen i Medicinsk kemi för biomedicinare 2010:

Tentamen i Medicinsk kemi för biomedicinare 2010: Tentamen i Medicinsk kemi för biomedicinare 2010: 1. Beskriv den molekylära strukturen på det vi i dagligt tal kallar fett (1 p) 2. Hur bryts stärkelse ned i saliven och magen? Kan även cellulosa brytas

Läs mer

Protein en livsviktig byggsten

Protein en livsviktig byggsten Protein en livsviktig byggsten Ingvar Bosaeus Enheten för klinisk nutrition Sahlgrenska universitetssjukhuset Göteborg KSLA 2015-02-19 Aminosyra Alpha Amino- grupp Fredrik Bertz Karboxyl- grupp 20 aa

Läs mer

Omtentamen KE0026, 10p, Max poäng = 76p. Preliminär gräns för G utan bonus = 57p.

Omtentamen KE0026, 10p, Max poäng = 76p. Preliminär gräns för G utan bonus = 57p. Omtentamen KE0026, 10p, 2003-07-04. Max poäng = 76p. Preliminär gräns för G utan bonus = 57p. Glöm ej kodnummer på varje blad! Skriv och rita tydligt! Lycka till! 1. Proteiner tillverkas på ribosomer genom

Läs mer

Cellbiologi: Intracellulär sortering och cellsignalering

Cellbiologi: Intracellulär sortering och cellsignalering Cellbiologi: Intracellulär sortering och cellsignalering Homira Behbahani 13/11 2009 Kl: 9-11a.m Homira.behbahani@ki.se Institutionen för neurobiologi, vårdvetenskap och samhälle (NVS) 2 Elektron Mikroskopbild

Läs mer

Medquiz Nutrition, metabolism & elimination HT 2012 MEDQUIZ. T2 Nutrition, metabolism & elimination

Medquiz Nutrition, metabolism & elimination HT 2012 MEDQUIZ. T2 Nutrition, metabolism & elimination MEDQUIZ T2 Nutrition, metabolism & elimination Innehåll MEDQUIZ... 1 Cellbiologi kap 6 Cellmembran... 2 Cellbiologi kap 8-12 Organeller... 3 Cellbiologi kap 25 Kolhydratmetabolismen... 3 Cellbiologi kap

Läs mer

Fig 1-29 Alla celler har utvecklats från samma urcell för ca 3,5 miljarder år sedan Fem kungadömen och Tre domäner

Fig 1-29 Alla celler har utvecklats från samma urcell för ca 3,5 miljarder år sedan Fem kungadömen och Tre domäner Kapitel 1-4 Kapitel 1 Introduction to Cells Fig 1-1 Komplexa levande organismer Några få grundämnen C + O + H Kolhydrater och fetter + N + S Proteiner + P Nukleinsyror (DNA och RNA) + spårämnen, metaller,

Läs mer

Metabolism och energi. Hur utvinner cellen energi från sin omgivning? Hur syntetiserar cellen de byggstenar som bygger upp dess makromolekyler?

Metabolism och energi. Hur utvinner cellen energi från sin omgivning? Hur syntetiserar cellen de byggstenar som bygger upp dess makromolekyler? Metabolism och energi Hur utvinner cellen energi från sin omgivning? Hur syntetiserar cellen de byggstenar som bygger upp dess makromolekyler? Intermediär metabolism Escherichia coli som exempel Fler än

Läs mer

TABELLSAMLING ATT ANVÄNDA I SAMBAND MED PROV I KEMI B

TABELLSAMLING ATT ANVÄNDA I SAMBAND MED PROV I KEMI B TABELLSAMLIG ATT AVÄDA I SAMBAD MED PRV I KEMI B ågra fysikaliska konstanter Atommassenheten 1u = 1,66 10 27 kg Elektronens massa m = 9,1096 10 31 kg Protonens massa m p = 1,6726 10 27 kg eutronens massa

Läs mer

Skrivning i termodynamik och jämvikt, KOO081, KOO041,

Skrivning i termodynamik och jämvikt, KOO081, KOO041, Skrivning i termodynamik och jämvikt, K081, K041, 2008-12-15 08.30-10.30 jälpmedel: egen miniräknare. Konstanter mm delas ut med skrivningen För godkänt krävs minst 15 poäng och för VG och ett bonuspoäng

Läs mer

Proteinstruktur och Hemoglobin

Proteinstruktur och Hemoglobin Proteinstruktur och Hemoglobin Biochemistry Kapitel 2 och 3 Structure and Function of the Human Body Kapitel 12 Proteinstrukturer Primärstruktur - ordningen på aminosyrorna (peptidbindningen) Sekundärstruktur

Läs mer

Frågor och svar till ordinarie tentamen för KE7001 period 4 (Biokemi, 10p) Totalpoäng: 70 p (23 frågor) Preliminär gräns för G: 37 p (53%)

Frågor och svar till ordinarie tentamen för KE7001 period 4 (Biokemi, 10p) Totalpoäng: 70 p (23 frågor) Preliminär gräns för G: 37 p (53%) Frågor och svar till ordinarie tentamen för KE7001 period 4 (Biokemi, 10p) 2006-06-01 Totalpoäng: 70 p (23 frågor) Preliminär gräns för G: 37 p (53%) Fråga 1: Komplettera nedanstående dipeptid vid fysiologiskt

Läs mer

Specifika lärandemål

Specifika lärandemål Inst. för Med. Biokemi och Biofysik (MBB) Termin 1, Läkarprogrammet Den friska människan 1 (DFM1) Moment 1: Grundläggande struktur och utveckling - från ägg till embryo Avsnitt 1: Delavsnitt II: Systematisk

Läs mer

Tentamen. Kurskod: MC1004. Medicin A, Molekylär cellbiologi. Kursansvarig: Christina Karlsson. Datum 130814 Skrivtid 4h

Tentamen. Kurskod: MC1004. Medicin A, Molekylär cellbiologi. Kursansvarig: Christina Karlsson. Datum 130814 Skrivtid 4h Tentamen Medicin A, Molekylär cellbiologi Kurskod: MC1004 Kursansvarig: Christina Karlsson Datum 130814 Skrivtid 4h Totalpoäng: 86p Poängfördelning Johanna Sundin (fråga 1 8): 18p Ignacio Rangel (fråga

Läs mer

Frågor och svar till ordinarie tentamen för KE7001 period 4 (Biokemi, 10p) Totalpoäng: 70 p (24 frågor) Preliminär gräns för G: 37 p (53%)

Frågor och svar till ordinarie tentamen för KE7001 period 4 (Biokemi, 10p) Totalpoäng: 70 p (24 frågor) Preliminär gräns för G: 37 p (53%) Frågor och svar till ordinarie tentamen för KE7001 period 4 (Biokemi, 10p) 2005-06-02 Totalpoäng: 70 p (24 frågor) Preliminär gräns för G: 37 p (53%) Fråga 1: Komplettera nedanstående dipeptid vid fysiologiskt

Läs mer

BASÅRET KEMI B BIOKEMI VT 2012. Introduktion till cellens och organismers metabolism 211-223 (sid. 178-191)

BASÅRET KEMI B BIOKEMI VT 2012. Introduktion till cellens och organismers metabolism 211-223 (sid. 178-191) BASÅRET KEMI B BIOKEMI Introduktion till cellens och organismers metabolism 211-223 (sid. 178-191) VAD HÄNDER i EN CELL? Metabolism - för att uppehålla liv Metabolism - ämnesomsättning i en cell pågår

Läs mer

c) Hur förskjuts jämvikten av en tryckförändring? Motivera svaret. (2) Jämvikten förskjuts åt vänster om trycket ökar:

c) Hur förskjuts jämvikten av en tryckförändring? Motivera svaret. (2) Jämvikten förskjuts åt vänster om trycket ökar: 1. Dikvävetetraoxid sönderfaller vid upphettning till kvävedioxid. Temperaturen förutsätts vara så hög att alla ämnen i reaktionen är gasformiga. Reaktionen är endotermisk och går till jämvikt. a) Formulera

Läs mer

Tentamensuppgifter moment 2, organisk kemi.

Tentamensuppgifter moment 2, organisk kemi. UMEÅ UIVERSITET TETAME Kemiska Institutionen Tentamensdatum 2012-01-19 BE, KP Studiekurs: Kemi för miljö- och hälsoskyddsområdet, 15 hp. Kurskod: KE004 Tentamen: Moment 2, organisk kemi (sid 1-3) och Moment

Läs mer

MATSMÄLTNINGEN, NÄRINGSÄMNEN, CELLANDNING OCH FOTOSYNTESEN = KOST & HÄLSA

MATSMÄLTNINGEN, NÄRINGSÄMNEN, CELLANDNING OCH FOTOSYNTESEN = KOST & HÄLSA MATSMÄLTNINGEN, NÄRINGSÄMNEN, CELLANDNING OCH FOTOSYNTESEN = KOST & HÄLSA Läs mer: http://www.1177.se/skane/tema/kroppen/matsmaltning-ochurinvagar/matsmaltningsorganen/?ar=true http://www.slv.se/grupp1/mat-ochnaring/kostrad/

Läs mer

TENTAMEN I MEDICINSK BIOKEMI (10 hp)

TENTAMEN I MEDICINSK BIOKEMI (10 hp) KAROLINSKA INSTITUTET Biomedicinprogrammet (kandidat) TENTAMEN I MEDICINSK BIOKEMI (10 hp) MÅNDAGEN DEN 2 MARS 2009, 9.00-14.00. OBS! Texta tydligt! Efternamn:... Mappnr:... Förnamn:... Personnr:... Resultatsammanställning:

Läs mer

Föreläsning 17. Karbonylkolets kemi II Kapitel 17 F17

Föreläsning 17. Karbonylkolets kemi II Kapitel 17 F17 Föreläsning 17 Karbonylkolets kemi II Kapitel 17 1) Introduktion 2) Addition av starka nukleofiler 3) Estrar 4) Amider 5) Nitriler 6) Syraklorider 7) Praktisk användning 1. Introduktion Aldehyder och ketoner

Läs mer

Resultat:... (Cellbiologi:... Immunologi...) Betyg...

Resultat:... (Cellbiologi:... Immunologi...) Betyg... Tentamen i Cellbiologi med Immunologi KTH 28 Maj 2003 kl 9-13 Skriv svaren direkt i tentan. Vid behov använd extra blad Namn:... Årskurs... Personnummer... Glöm inte skriva namn och personnummer på immunologidelen

Läs mer

Tentamen NMET2 VT2015 (17/4 2015) (Totalpoäng 55 p)

Tentamen NMET2 VT2015 (17/4 2015) (Totalpoäng 55 p) Tentamen NMET2 VT2015 (17/4 2015) (Totalpoäng 55 p) SVAR PÅ FRÅGA 1-5 LÄGGS I SEPARAT MAPP 1) Redogör för den generella uppbyggnaden av ett cellmembran och beskriv kort funktionen hos de ingående molekylära

Läs mer

Energiomsättning. ATP utgör den omedelbara energikällan ATP+H 2 0 ADP+Pi+energi ATP. Energi Muskelarbete Jontransport Uppbyggnad

Energiomsättning. ATP utgör den omedelbara energikällan ATP+H 2 0 ADP+Pi+energi ATP. Energi Muskelarbete Jontransport Uppbyggnad Energiomsättning ATP utgör den omedelbara energikällan ATP+H 2 0 ADP+Pi+energi Energiprocesser Förbränning Spjälkning ATP ADP+Pi Energi Muskelarbete Jontransport Uppbyggnad Nedbrytning av ATP och PCr Alaktacida

Läs mer

Frågor om intermediärmetabolismen med svar till vissa frågor

Frågor om intermediärmetabolismen med svar till vissa frågor Institutionen för medicinsk biokemi och biofysik Biomedicinprogrammet Medicinsk biokemi 2011 Frågor om intermediärmetabolismen med svar till vissa frågor Bokhänvisning: Berg, Tymoczko & Stryer 6:e upplagan

Läs mer

Översikt metabolismen

Översikt metabolismen Översikt metabolismen Glykolysen Glukoneogenesen Citronsyracykeln Andningskedjan Lipidmetabolism I Lipidmetabolism II ATP adenosintrifosfat Cellens främsta energivaluta GTP Guanosintrifosfat Energirika

Läs mer

lördag den 4 december 2010 Vad är liv?

lördag den 4 december 2010 Vad är liv? Vad är liv? Vad är liv? Carl von Linné, vår mest kände vetenskapsman, delade in allt levande i tre riken: växtriket, djurriket och stenriket. Under uppväxten i Småland såg han hur lantbrukarna varje år

Läs mer

Släktskap mellan människa och några ryggradsdjur

Släktskap mellan människa och några ryggradsdjur Övning: Släktskap mellan människa och några ryggradsdjur sid 1 Övning Släktskap mellan människa och några ryggradsdjur En manuell jämförelse mellan hemoglobinets aminosyrasekvenser hos några organismer

Läs mer

Maria Nyström Jessica Leander Louise Danielsson. G-proteinet Ras. 3 juni 2003. Handledare: Hans Eklund

Maria Nyström Jessica Leander Louise Danielsson. G-proteinet Ras. 3 juni 2003. Handledare: Hans Eklund Maria Nyström Jessica Leander Louise Danielsson G-proteinet Ras 3 juni 2003 Handledare: Hans Eklund Inledning Detta projektarbete behandlar en del av den signalväg som initieras av tillväxthormon och avslutas

Läs mer

Vilka ämnen finns det i maten och hur använder kroppen dem?

Vilka ämnen finns det i maten och hur använder kroppen dem? ÄMNENA I MATEN 1 Vilka ämnen finns det i maten och hur använder kroppen dem? 2 varifrån kommer egentligen energin? Jo från början kommer den faktiskt från solen. Solenergi blir till kemisk energi genom

Läs mer

Tentamen med svarsmallar Biokemi BI0741, 10:e jan 2008, Max poäng = 81 p. Slutlig gräns för godkänd = 42 p (52 %).

Tentamen med svarsmallar Biokemi BI0741, 10:e jan 2008, Max poäng = 81 p. Slutlig gräns för godkänd = 42 p (52 %). Tentamen med svarsmallar Biokemi BI0741, 10:e jan 2008, 09 15-14 00. Max poäng = 81 p. Slutlig gräns för godkänd = 42 p (52 %). 1. a) Vad krävs för att en (kemisk) reaktion ska kunna ske spontant? (1p)

Läs mer

Resultat:... (Cellbiologi:... Immunologi...) Betyg...

Resultat:... (Cellbiologi:... Immunologi...) Betyg... Cellbiologi del tentamen augusti 2005 1 Tentamen i Cellbiologi med Immunologi KTH 23 aug 2005 kl 9-13 Skriv svaren direkt i tentan. Vid behov använd extra blad Namn:... Årskurs/årgång... (typ I02, bio99,

Läs mer

Fråga nr. Sluttentamen Bke2/KE0003, 31:e Oktober 2001, Max poäng =123 p. Preliminär gräns för godkänd = 65 p (53%).

Fråga nr. Sluttentamen Bke2/KE0003, 31:e Oktober 2001, Max poäng =123 p. Preliminär gräns för godkänd = 65 p (53%). Sluttentamen Bke2/KE0003, 31:e Oktober 2001, 09 00-16 00 Max poäng =123 p. Preliminär gräns för godkänd = 65 p (53%). Svara på varje fråga på separat papper! Ange tydligt frågans nummer längst upp på sidan!

Läs mer

TENTAMEN I MEDICINSK BIOKEMI (10 hp)

TENTAMEN I MEDICINSK BIOKEMI (10 hp) KAROLINSKA INSTITUTET Biomedicinprogrammet (kandidat) TENTAMEN I MEDICINSK BIOKEMI (10 hp) MÅNDAGEN DEN 1 MARS 2010, 12.30-17.30. Kontrollera att alla sidor (1-14) och frågor (1-23) finns i mappen innan

Läs mer

Äter jag rätt när jag tränar?

Äter jag rätt när jag tränar? Kostens betydelse för prestation Äter jag rätt när jag tränar? Eva Blomstrand Individens allmänna kostvanor Intag före träning Intag under träning Intag efter träning Åstrandlaboratoriet, Gymnastik- och

Läs mer

Tentamen med svarsmallar Biokemi KE7001p3, 22:e mars 2005, Max poäng = 70 p. Preliminär gräns för godkänd = 37 p (53 %).

Tentamen med svarsmallar Biokemi KE7001p3, 22:e mars 2005, Max poäng = 70 p. Preliminär gräns för godkänd = 37 p (53 %). Tentamen med svarsmallar Biokemi KE7001p3, 22:e mars 2005, 09 00-15 00. Max poäng = 70 p. Preliminär gräns för godkänd = 37 p (53 %). 1. a) Vad är avståndet mellan två kovalent bundna kolatomer? (0.5p)

Läs mer

Föreläsning 5. Stereokemi Kapitel 6

Föreläsning 5. Stereokemi Kapitel 6 Föreläsning 5 Stereokemi Kapitel 6 1) Introduktion 2) Definition av begrepp 3) Stereokemi i verkligheten 4) Nomenklatur 5) Flera stereocenter 6) Ringsystem 7) Kirala molekyler utan stereocentra 1. Introduktion

Läs mer

Cellbiologi. Maria Ankarcrona Nov 2010

Cellbiologi. Maria Ankarcrona Nov 2010 Cellbiologi Maria Ankarcrona Nov 2010 1 Instuderingsfrågor (från den 15/11) 1. Beskriv uppbyggnaden av den eukaryota cellens cellmembran. 2. Vilken funktion fyller cellmembranet? 3. Ge exempel på fördelar

Läs mer

Cellbiologi. Maria Ankarcrona Nov 2010 1

Cellbiologi. Maria Ankarcrona Nov 2010 1 Cellbiologi Maria Ankarcrona Nov 2010 1 Prokaryot cell Eukaryot cell 2 Prokaryota celler-ingen cellkärna Eukaryota celler-komplexa celler med cellorganeller och cellkärna 3 Cellorganellerna Cellstrukturer

Läs mer

Proteiner. Kap 3,

Proteiner. Kap 3, Proteiner Kap 3, 3.1-3.5. Först lite repetition Proteiner är uppbyggda av kedjor av aminosyror. Sådana kedjor kallas... (Fig3-3). Proteinets struktur kan beskrivas på fyra olika nivåer: primärkvartärstruktur

Läs mer

Energi, katalys och biosyntes (Alberts kap. 3)

Energi, katalys och biosyntes (Alberts kap. 3) Energi, katalys och biosyntes (Alberts kap. 3) Introduktion En cell eller en organism måste syntetisera beståndsdelar, hålla koll på vilka signaler som kommer utifrån, och reparera skador som uppkommit.

Läs mer

Hur celler får energi från föda (Alberts kap. 13) Introduktion

Hur celler får energi från föda (Alberts kap. 13) Introduktion Hur celler får energi från föda (Alberts kap. 13) Introduktion Celler omvandlar energi från olika källor till ett fåtal former som är användbara som energivaluta i dess metabolism. Alla celler, från bakterie

Läs mer

Matkemi Kemin bakom matens näringsämnen

Matkemi Kemin bakom matens näringsämnen Matkemi Kemin bakom matens näringsämnen Kolhydrater Sockerarter (enkla och sammansatta) Stärkelser Cellulosa Bilden visar strukturformler för några kolhydrater. Druvsocker (glukos) Kolhydrater monosackarider

Läs mer

Övningstentamen i Biologi 2, Basåret.

Övningstentamen i Biologi 2, Basåret. Övningstentamen i Biologi 2, Basåret. Cellbiologi (15p) 1. Ge 4 kortfattade exempel på vad proteiner kan ha för funktioner i kroppen. (2p) Svar: De kan ha funktioner som: Struktur- cellmembran, kollagen

Läs mer

Sluttentamen med svarsmallar Bke2/KE0003, 31:e Oktober 2001, 09 00-16 00. Max poäng = 123 p. Preliminär gräns för godkänd = 65 p (53 %).

Sluttentamen med svarsmallar Bke2/KE0003, 31:e Oktober 2001, 09 00-16 00. Max poäng = 123 p. Preliminär gräns för godkänd = 65 p (53 %). Sluttentamen med svarsmallar Bke2/KE0003, 31:e Oktober 2001, 09 00-16 00. Max poäng = 123 p. Preliminär gräns för godkänd = 65 p (53 %). 1. Tre viktiga grupper av biomolekyler är polymerer. Ange vilka

Läs mer

Tentamen. Lycka till! Medicin A, Molekylär cellbiologi. Kurskod: MC1004. Kursansvarig: Christina Karlsson. Datum 120512 Skrivtid 4h

Tentamen. Lycka till! Medicin A, Molekylär cellbiologi. Kurskod: MC1004. Kursansvarig: Christina Karlsson. Datum 120512 Skrivtid 4h Tentamen Medicin A, Molekylär cellbiologi Kurskod: MC1004 Kursansvarig: Christina Karlsson Datum 120512 Skrivtid 4h Totalpoäng: 88p Poängfördelning Johanna Sundin: fråga 1-10: 18p Ignacio Rangel: fråga

Läs mer

Utmaningen. SEMINARIEUPPGIFTER och Instuderingsfrågor. TILL DFM1: MOMENT 2 (avsnitt 4-7) Namn: Grupp:

Utmaningen. SEMINARIEUPPGIFTER och Instuderingsfrågor. TILL DFM1: MOMENT 2 (avsnitt 4-7) Namn: Grupp: Medicinsk biokemi och biofysik Termin 1, Läkarprogrammet Den Friska Människan 1 (DFM1) Moment 2: Matsmältning och ämnesomsättning VT09 Utmaningen SEMINARIEUPPGIFTER och Instuderingsfrågor TILL DFM1: MOMENT

Läs mer

kolhydrat Kolhydrater är en grupp av organiska ämnen med stora molekyler som finns både i maten och i kroppen.

kolhydrat Kolhydrater är en grupp av organiska ämnen med stora molekyler som finns både i maten och i kroppen. Begreppen fotosyntes Fotosyntesen är reaktionen där växterna tar upp energi från solljuset och lagrar den i energirikt socker. Se bilden på sidan 189. Själva reaktionsformeln ser ut så här: vatten + koldioxid

Läs mer