Sydostasien- Mellanöstern- Europa. Y- kromosom Närbild av A, B och C (17,000bp) Distribution of DNA-typer

Storlek: px

Starta visningen från sidan:

Download "Sydostasien- Mellanöstern- Europa. Y- kromosom Närbild av A, B och C (17,000bp) Distribution of DNA-typer"

Britt-Marie Jakobsson
för 7 år sedan
Visningar:

1 Närbild av, B och C (1,000bp) Distribution of DN-typer = Europa = Mellanöstern = Östasien Mix av de tre DN- grupperna (,B,C) i alla delar av världen Liknande frekvenser av dessa tre grupper Ingen korrela@on mellan DN- typ och hundras = Varg Mycket homogen genpool i hela världen F Indika@on om varg- inkorsning i Skandinavien, Mellanöstern och Japan: 2% Men klart ﬂest DN- typer i södra Kina/ Sydostasien B C E D coyote Närbild av, B och C (1,000bp) Distribution av de 10 /B/C undergrupperna = Europa = Mellanöstern = Östasien = Varg F B C E 10 D coyote Sydostasien- Mellanöstern- Europa Y- kromosom a SY a N=23 Swsia a N=200 Europe a N=302 o i b c d j e f g n k m HG3 HG9 l HG HG HG h 2* 23* * * * 2 ll DN- varia@on i Sydostasien, mindre än 0% i Europa och Mellanöstern 29* 30* ll DN- varia@on i Sydostasien, mindre än 0% i Europa 1

2 Den enkla principen för hundens ursprung. EI exempel: Distribution av de 10 /B/C undergrupperna 10 vargar (av tusentals i denna popual@on) tämjdes, var och en med varsin DN- typ. Därför, 10 DN- typer nedärvdes från hund. Sålunda, de första hundarna hade totalt 10 DN- typer (en per individ ). När hundarna spreds från ursprungsområdet över världen förlorades några på vägen. Därför är det färre DN- typer ju större avstånd från startpunkten. 10 ntal ursprungsindivider Hundens ursprung och spridning SY a N=23 Swsia a N=200 Europe a N=302 Minst 1 enligt mtdn- varia@on, minst 13 enligt Y- kromosom Troligen åtskilliga hundra, kanske tusen vargar Dingo SY a N=23 Dingo nalys av kärn- DN (hela genomet) a N=233 Europe a N=302 Ursprung från en enda mtdn- typ 2

1-10-0 Korsning med varg Södra Kina basal mot varg Varg/hund- split: 33,000 år Global hund- expansion: 1,000 år - 1% i hundar Jämnt över Eurasien Högst i Mellanöstern: 1% Geografisk korrela@on öst-

gene@ska bas Litet @llskoi av varg- gener runtom Eurasien Cirka 10% extra gene@sk varia@on >0% @llskoi i Lapphund och Gråhund/Jämthund () Europeiska popula@onen har cirka 20-0% av den ursprungliga

3 Korsning med varg Södra Kina basal mot varg Varg/hund- split: 33,000 år Global hund- expansion: 1,000 år - 1% i hundar Jämnt över Eurasien Högst i Mellanöstern: 1% Geografisk korrela@on öst- väst Slutsatser lla typer av DN visar ungefär samma sak Hunden har bred gene@sk bas från sydostasia@sk varg Troligen åtskilliga hundra, kanske tusen vargar lla hundar i världen har ungefär samma gene@ska bas av varg- gener runtom Eurasien Cirka 10% extra gene@sk varia@on i Lapphund och Gråhund/Jämthund () Europeiska popula@onen har cirka 20-0% av den ursprungliga gene@ska varia@onen i Sydostasien Dingo har några få % av ursprungsvaria@onen Slutsatser (och spekulationer) om Hundens ursprung Hunden uppstod i Södra Kina 10,000-16,000 år sedan, från flera hundra vargar Möjlig mänsklig kultur (och hur/varför) indikerad: som ursprunget av jordbruk (ris) ursprung jordbruksrevolu@onen Hundratals domes@cerade vargar: en vik@g kulturell händelse, och många människor inblandade Notabelt: hund har all@d använts som mat i denna region: domes@cering: konsum@on av köiet allätare första steget i själv- domes@cering av varg Mer arkeologiska data behövs! Samt detaljerade gene@ska studier i Sydostasien Pang et al, Mol.Biol.Evol. Epub sept nalys av genförändringar varg- hund nalys av genförändringar varg- hund Selektions-analys identifierar 36 regioner E xelsson Nature 000, 1- (2013) doi: /nature1183 3

1-10-0 Selektion för ökad amylas-aktivitet nalys av genförändringar varg- hund Tydligaste resultat: Gener för matsmältning av kolhydrater mycket eﬀek@vare hos hund än varg!

4 Selektion för ökad amylas-aktivitet nalys av genförändringar varg- hund Tydligaste resultat: Gener för matsmältning av kolhydrater mycket hos hund än varg! Många gener beteende har förändrats E xelsson Nature 000, 1- (2013) doi: /nature1183 Ejer första ursprunget : yierligare detaljer om historia Dingons ursprung Spridning från södra Östasien Till ustralien och Oceanien Till merika Till Madagaskar Korsning med varg

5 1-10-0

6 Hundens ursprung historia: från ingen många detaljer! Ursprung: antal tämjda vargar, relaterad mänsklig kultur () anpassning : matsmältning och psyke Dingons ursprung Polynesien och ustralien Madagaskar merika OmfaIning av hund/varg- korsning Hundens ursprung historia: från ingen många detaljer! Ursprung: antal tämjda vargar, relaterad mänsklig kultur () Gene@sk anpassning : matsmältning och psyke Dingons ursprung Tidig hundhistoria Polynesien och ustralien Madagaskar merika OmfaIning av hund/varg- korsning Fram@den Mycket mer kommer! Ejer första ursprunget : yierligare detaljer om historia Dingons ursprung Spridning från södra Östasien Till ustralien och Oceanien Till merika Till Madagaskar Korsning med varg Dingons ursprung, slutsatser Ursprung från tamhund - från Östasien Troligtvis få ursprungsindivider Möjligen en enda introduk@on Introduk@on ~,000 år sedan Isolering från andra Européerna anlände Savolainen et al, P.N..S

7 Dingo SY a Dingo N=23 Hund- migra@oner a N=233 Europe N=302 a Ursprung från en enda mtdn- typ Distribution av de 10 /B/C undergrupperna Studeras genom fördelningen av mtdn- typer i världen. Den täta provtagningen över världen ger kunskap om geograﬁska fördelningen av mtdn- typer i t.ex. Östasien (10 grupper) och Europa (endast av dessa grupper). Ursprunget av hund i merika Fråga: Hur stor andel från före Kolumbus Hur mycket från Europa Fördelning av mtdn typer: Östasien har alla 10 haplogrupper, Europa endast Därför: om merikanska hundar har någon av de haplogrupperna som inte ﬁnns i Europa, så måste de härstamma från Östasien (introducerade via Berings sund) 10 Ursprunget av hund i merika: resultat merika: från sien i två vågor lla merikanska ursprungliga raser (ark@ska raser, Chihuahua, Mexikansk och Peruansk nakenhund) har icke- Europeiska DN- typer. Max 0-1% Europeisk inkorsning. Chihuahua har unik DN- typ delad endast med arkeologiska Mexikanska hundfynd. 2 popula@onsgrupper: rk@ska hundar och Mellan/Syd- merikanskahundar hade helt olika DN typer; separata ursprung. Mexikansk och Peruansk nakenhund delar många DN typer. Inget ursprung från amerikansk varg.

8 Hundarnas Polynesien och ustralien Hundarnas Polynesien och ustralien Polynesien beboi 3,000 år sedan Språk och arkeologi indikerar ursprung från Södra Kina via Taiwan,000 år sedan Historiska frågeställningar: Polynesien beboi 3,000 år sedan Språk och arkeologi indikerar ursprung från Södra Kina via Taiwan,000 år sedan Historiska frågeställningar: Snabb spridning av folk och hela kulturpaketet via Taiwan Eller, långsam spridning och uppblandning av folk och kultur Snabb spridning av folk och hela kulturpaketet via Taiwan Eller, långsam spridning och uppblandning av folk och kultur Dingo: arkeologiska bevis 3,00 år sedan Dingo: arkeologiska bevis 3,00 år sedan Vår fråga: kom hundarna via Taiwan med människorna, eller blev de upplockade på vägen Kom dingon samma väg Hundarnas Polynesien och ustralien Hundarnas Polynesien och ustralien 3 6% 6 3% 29 % eller 3 3% 6 6% 29 0% % 3 3% 6 6% 29 0% % Hundarnas Polynesien och ustralien Peopling of Madagascar First populated 2,000 ya by Polynesians Human mtdn shows 0% sian and 0% frican types, thus later inﬂux from frica 3 6% 6 3% 29 % 3 0% 6 0% 29 0% 3 3% 6 6% 29 0% 3 8% 6 3% 29 19% % 8

9 Peopling of Madagascar Dog routes to Madagascar First populated 2,000 ya by Polynesians Human mtdn shows 0% sian and 0% frican types, thus later inﬂux from frica Our dogs brought to Madagascar by the Polynesians How much mix with frican dogs Dog routes to Madagascar Dog routes to Madagascar fr 100% sia 0% fr 100% sia 0% Dog routes to Madagascar Dog routes to Madagascar fr 100% sia 0% fr 100% sia 0% 9

1-10-0 Hund- varg korsningar Endast tre indika@oner (av

Grupp D och F = Europa = Mellan Östern = Östasien = Varg,

regionalt, totalt 2% av alla hundar F B C E D coyote Tid

skandinaviska inkorsningen (d1): Endast i

Cirka 0% har d1 (resten har, B och C) Indikerar stor

Hund- varg korsningar Endast tre indika@oner (av

Japan: Grupp F hiiad endast bland japanska hundar, samt

(alltså inkorsning, inte separat domes@cering av varg)

10 Hund- varg korsningar Endast tre (av mtdn) av hund- varg korsning, i Skandinavien, Mellanöstern och Japan. Indikerat av de regionala träd- grupperna D (d1, d2) och F Grupp D och F = Europa = Mellan Östern = Östasien = Varg, B och C överallt, hos % av hundarna D, E, F regionalt, totalt 2% av alla hundar F B C E D coyote Tid Hund- varg korsningar Endast tre indika@oner (av mtdn) av hund- varg korsning, i Skandinavien, Mellanöstern och Japan. Indikerat av de regionala träd- grupperna D (d1, d2) och F Den skandinaviska inkorsningen (d1): Endast i nordskandinaviska hundar (Lapphund och Grå- / Jämthund) Cirka 0% har d1 (resten har, B och C) Indikerar stor betydelse (selek@v fördel) för hundarna! Hund- varg korsningar Endast tre indika@oner (av mtdn) av hund- varg korsning, i Skandinavien, Mellanöstern och Japan. Indikerat av de regionala träd- grupperna D (d1, d2) och F Inkorsning i Mellanöstern indikerad också av genom- analys. Japan: Grupp F hiiad endast bland japanska hundar, samt arkeologiska japanska vargar Ursprung 00-2,000 år sedan (alltså inkorsning, inte separat domes@cering av varg) Hundar på södra Kinas landsbygd 10

Relevanta dokument

Peter Savolainen Docent. Det började med hund- kriminalteknik. Min forskning om hundhistoria. DNA- analys från hundhår!

Peter Savolainen Docent. Det började med hund- kriminalteknik. Min forskning om hundhistoria. DNA- analys från hundhår! -0-0 Hundens ursprung, historia och evolution Peter Savolainen Docent Kungl Tekniska Högskolan Stockholm Skolan för Bioteknologi Storskalig DNA- analys, främst: - Hundens ursprung och Ediga historia -