Peter Savolainen Docent. Det började med hund- kriminalteknik. Min forskning om hundhistoria. DNA- analys från hundhår!

Storlek: px

Starta visningen från sidan:

Download "Peter Savolainen Docent. Det började med hund- kriminalteknik. Min forskning om hundhistoria. DNA- analys från hundhår!"

Robert Falk
för 6 år sedan
Visningar:

1 -0-0 Hundens ursprung, historia och evolution Peter Savolainen Docent Kungl Tekniska Högskolan Stockholm Skolan för Bioteknologi Storskalig DNA- analys, främst: - Hundens ursprung och Ediga historia - Hund- kriminalteknik - I båda fallen studeras den geneeska variaeonen hos hund Min forskning om hundhistoria Ursprung, evolueon och Edigaste historia, Ell exempel: Var och när uppstod hunden mänsklig kultur antal ursprungsindivider spridning över världen genskillnader mellan hund/varg evolueon Baserat på prov av hundar från hela världen Analys: Summering/jämförelse av DNA- variaeonen Mellan hund i hela världen Mellan varg och hund - genförändringar Det började med hund- kriminalteknik DNA- analys från hundhår! Från kriminalteknik Ell hundhistoria Referensdatabas nödvändig, men inga DNA- data Ellgängliga(!): Skapa egen databas Nästan inget känt (99) om hundens ursprung och historia (Var, När, Hur många gånger?) Preliminär studie indikerade: Hundursprung kan avslöjas m.h.a. utökad provinsamling Studier av människans ursprung m.h.a. världsomspännande DNA- analys redan gjord Enda som behövdes: en global provsamling från hund Hundens ursprung, tillgänglig information l Arkeologi è Hund troligen första tamdjuret l Tidigare geneeska studier è Ursprung från vargen Återstående basala frågor: - Var? - När? - Hur många platser/dpunkter?

2 -0-0 DNA: en möjlig källa till information? Ledande teorier 99 Svar >ll basala frågor: Ursprung från Mellanöstern,,000-,000 år sedan och Edigaste ursprung - baserat på: gamla hundfynd, av jordbruk i Mellanöstern ca. 0,000 år sedan Var?: region med störst geneesk variaeon När?: molekylär klocka Hur många platser/4dpunkter?: samma/olika DNA- typer i olika regioner? - Spåra spridningen av hund Ellbaks Ell sin källa! Vad göra?:. Samla prover från hela världen! ( omöjligt?). Jämföra DNA- typer mellan alla regioner Ursprung från ﬂera platser 8,000-,000 år sedan - baserat på: gamla hundfynd från ﬂera olika ställen ungefär samedigt Återstående basala frågor: - Var? - När? - Hur många platser/dpunkter? Försöka samla prover av hund från hela världen, en galen idé? Provinsamling (99- pågående) >,000 prover globalt Kanske, men några lyckliga omständigheter: Kontaktad av en hundfanaeker med kontakter Enkel provsamling av hundhår Internet/ s hade just kommit Mellanöstern (Ardalan et al. 0) CA BLACK SEA 4 MEDITERRANEAN SEA SEA FC-BELT 6 AN SPI FERTILE CRESCENT PE RE RS N G U D LF IA SE A

3 -0-0 Hundens ursprung och spridning Ursprung: södra Östasien Hundar på södra Kinas landsbygd ProvsamlingsexpediEon i Kina ProvsamlingsexpediEon i Kina ProvsamlingsexpediEon i Kina

4 -0-0 Bakgrund: människans ursprung och spridning Moderna människan kunskap baserad på arkeologi och geneek Afrika år sedan 00- Spridning i Afrika Ut ur Afrika år sedan 00- tå Australien, Nya Guinea Sydasien 00- tå 00- tå 4

5 -0-0 Centralasien Europa tå 00- tå 00- tå Beringia Amerika 0 tå 0 tå tå tå tå 00- tå 00- tå Snabb spridning över Amerika Melanesien 0 tå 0 tå tå tå tå tå 00- tå 00-4 tå tå 0- tå 0- tå

6 -0-0 Madagaskar Polynesien och Nya Zeeland 0 tå 0 tå tå tå tå tå 00-4 tå tå tå 00-4 tå tå 0- tå 0- tå tå tå Island tå Grönland tå tå 0 tå tå 00 å 0 tå tå tå tå tå tå 00- tå 00-4 tå tå 4 tå tå tå 0- tå tå 0- tå tå tå Tidslinje 6må- 0tå: förmänniskor Australopitecus, H.erectus etc. 0tå: Modern människa i Afrika tå: Ut ur Afrika 0tå: första jordbruken (domes>cering av växter och djur) Sålunda, år sedan var vi jägare/samlare, sedan år jordbrukare Första steget mot modern civilisaeon tå DomesEcering, en central del av människans historia DomesEcerade växter och djur utgör nästan all vår föda Förutsämning för utvecklandet modern civilisaeon/ kultur/teknik Ändrade den globala demograﬁn Jordbrukande folk hade fördelar gentemot andra folk och spred sig på dessas bekostnad (t.ex. vita och indianer i Nordamerika) Uppstod i em fåtal områden, Edigast i Mellanöstern och Kina (varifrån världens två främsta kulturer spreds!) 6

7 -0-0 DomesEceringscentra Främsta domesticeringsområdena 0 tå Mellanöstern: Vete, råg, ärtor får, get, ko,000 tå USA/Mexico: Squash, solros majs, bönor, kalkon,000 tå Kina: Ris, hirs, gris, kyckling 0,000 tå tå tå 00- tå 0- tå Anderna: Potatis, llama,000 tå Spridning av jordbruk (tamdjur och växter) Hunden är unik bland tamdjuren Det enda tamdjur (eller tamväxt ) som fanns på varje konenent innan modern Ed! har följt människan vart hon än färdats 0 tå tå tå 00- tå 0- tå Hunden är unik bland tamdjuren Det enda tamdjur (eller tamväxt ) som fanns på varje konenent innan modern Ed! har följt människan vart hon än färdats Hunden Det första tamdjuret(?) Enda (helt) domesecerade rovdjuret Enda tamdjuret som följde människan Ell alla konenenter Det utseendemässigt mest variabla däggdjuret

8 -0-0 Främsta domesticeringsområdena Mellanöstern: Vete, råg, ärtor får, get, ko,000 tå Kina: Ris, hirs, gris, kyckling 0,000 tå Vargen fanns överallt USA/Mexico: Squash, solros majs, bönor, kalkon,000 tå Anderna: Potatis, llama,000 tå Vi behöver prover från hela Eurasien och Nordamerika! >,000 prover globalt Hur ta reda på hundens ursprung m.h.a.dna?! Den enkla principen för ideneﬁering av hundens ursprung. Em exempel: Hundens ursprung och spridning Antag am varg tämjdes Ell hund på en enda plats. 0 vargar (av tusentals i denna populaeon) tämjdes, var och en med varsin DNA- typ. Därför, 0 DNA- typer nedärvdes från varg Ell hund. Sålunda, de första hundarna hade totalt 0 DNA- typer (en per individ ). När hundarna spreds från ursprungsområdet över världen förlorades några på vägen. Därför är det färre DNA- typer ju större avstånd från startpunkten. 8

9 -0-0 Tre typer av DNA Mitokondriellt DNA Ärvs på mödernet som en enhet Y- kromosomalt DNA (typ av kärn- DNA) Ärvs på fädernet som en enhet Kärn- DNA Ärvs från båda föräldrarna, blandas som kortlek i varje generaeon. Mitokondrie- och Y-kromosomalt DNA Nedärvning är maternell (mor till dotter/son) resp. paternell (far till son) Fördel Ärvs som en enhet utan rekombination Ett sant släktträd av de studerade individerna kan rekonstrueras från deras DNA-sekvenser Fylogenetiskt träd Fylogenetiskt träd Fem individer:.. TCTAAA. 4. AAAGAA. AAAGAC Fem individer:.. TCTAAA. 4. AAAGAA. AAAGAC Tid (AAAAAA) Tid (AAAAAA) TCTAAA AAAGAA AAAGAC TCTAAA AAAGAA AAAGAC Fylogenetiskt träd Fylogenetiskt träd Fem individer:.. TCTAAA. 4. AAAGAA. AAAGAC Fem individer:.. TCTAAA. 4. AAAGAA. AAAGAC Tid (AAAAAA) Tid (molekylär klocka) (AAAAAA) TCTAAA AAAGAA AAAGAC TCTAAA AAAGAA AAAGAC 9

10 -0-0 mitokondrie-träd för hund, 8bp = Europa = Mellan Östern = Östasien = Varg A Distribution av A, B och C A, B och C överallt, hos 98-00% av hundarna D, E, F regionalt, totalt % av alla hundar F B C E D coyote Tid Distribution av A, B och C och D,E,F Fördelning av hundraser S = Varg P = Pekinges S = Schäfer P P A S D S S P F P B D E F SP S C E D coyote Distribution of DNA-typer Mix av de tre DNA- grupperna (A,B,C) i alla delar av världen Liknande frekvenser av dessa tre grupper Ingen korrelaeon mellan DNA- typ och hundras Mycket homogen genpool i hela världen Tid Distribution of DNA-typer Mix av de tre DNA- grupperna (A,B,C) i alla delar av världen Liknande frekvenser av dessa tre grupper Ingen korrelaeon mellan DNA- typ och hundras Mycket homogen genpool i hela världen IndikaEon om varg- inkorsning i Skandinavien, Mellanöstern och Japan: geneeskt Ellskom % 0

Relevanta dokument

Sydostasien- Mellanöstern- Europa. Y- kromosom Närbild av A, B och C (17,000bp) Distribution of DNA-typer

Sydostasien- Mellanöstern- Europa. Y- kromosom Närbild av A, B och C (17,000bp) Distribution of DNA-typer 1-10-0 Närbild av, B och C (1,000bp) Distribution of DN-typer = Europa = Mellanöstern = Östasien Mix av de tre DN- grupperna (,B,C) i alla delar av världen Liknande frekvenser av dessa tre grupper Ingen