Calicivirus och andra virus. Kjell-Olof Hedlund Enheten för Speciell Diagnostik Smittskyddsinstitutet

Transkript

1 Calicivirus och andra virus Kjell-Olof Hedlund Enheten för Speciell Diagnostik Smittskyddsinstitutet

2 Tarmen kan liknas vid ett kärl som lämpar sig mycket väl för virusodling

3 Ryhovs sjukhus drabbat av vinterkräksjukan Länssjukhuset Ryhov har drabbats av flera fall av vinterkräksjuka. Nu tvingas sjukhuset införa restriktioner på två avdelningar Ett hundratal patienter och vårdpersonal har drabbats hittills, säger Per-Erik Åbom, smittskyddsläkare i Jönköpings län. Musslor och ostron kan orsaka vinterkräksjuka Musslor och ostron kan innehålla bakterier och virus som orsakar exempelvis vinterkräksjuka hos människor. Det visar en ny studie som genomförts av docent Bodil Hernroth vid Kristinebergs marina forskningsstation i Fiskebäckskil, rapporterar Ekot. Varning för extrem kräksjuke-epidemi Var tionde svensk riskerar att smittas i höst Hundratusentals svenskar riskerar drabbas av en extremt smittsam och svår form av vinterkräksjuka i höst. - I värsta fall kan tio procent av befolkningen smittas, säger Smittskyddsinstitutets chefsmikrobiolog.

4 Virus som orsakar magsjuka Rotavirus Adenovirus Astrovirus Calicivirus Norovirus, vinterkräksjuka Sapovirus

5 What virus have you got? Single case, no epidemiology. Community: Adult: Calicivirus Child: Calicivirus, rotavirus, astrovirus, adenovirus. Health care: Adult: Calicivirus, rotavirus, astrovirus. Child: Calicivirus, rotavirus, astrovirus, adenovirus.

6 Spridning norovirus och rotavirus (Moreno-Espinosa et al, 2004)

7 Frekvens norovirus och rotavirus i olika åldersgrupper

8 Virus som orsakar magsjuka Rotavirus Mkt virus; lång utsöndringstid; stabil Adenovirus Mkt virus; mkt lång utsöndringstid; stabil Astrovirus Mkt virus; utsöndringstid dåligt känd; stabil Calicivirus Relativt mkt virus; ofta lång utsöndringstid; relativt stabil; mkt stor variation

9 Diagnostikutveckling i Sverige; norovirus Under diagnostik endast med elektronmikropskopi utvecklades PCR känslig realtids-pcr. Resultatet: Diagnostiken hittar nu norovirus i patientprov under mycket lång tid. Skärpt uppmärksamhet på nya varianter Immunologisk påvisning; ingen större succé i Sverige, men i Tyskland..

10 Vad är vinterkräksjuka? Winter vomiting disease. Utbrott av kräkningar/diarré orsakade av norovirus. Vanligaste orsaken till livsmedelsburna utbrott. Vanligaste orsaken till vårdrelaterad smitta. Vanligaste skälet till föräldrars oro för dagissmitta. Vanligaste sökordet på Vårdguiden. En av de mest stabila patogener som sprids inom vården.

11 Vinterkräksjukan i backspegeln. 1929; Zahorsky beskriver Winter vomiting disease. 1963; Justus Ström beskriver vinterkräkningarna i sin bok Akuta infektionssjukdomar. 1972; Kapikian et al beskriver Norwalk agent efter ett skolutbrott i Norwalk (Ohio). 1990; Norwalkvirusets hela genom publiceras i Science (Jiang et al.) ; Humana blodgruppsantigen fungerar som receptorer för norovirusinfektion (Marionneau et al).

12 Number of patients 600 Calicivirus in Sweden

13 Varför är norovirusinfektioner så vanliga? Låg infektionsdos. Motståndskraftiga mot desinfektionmedel /stabila i miljön. Stor human reservoar, utdragen virusutsöndring. Kortvarig stamspecific immunitet (veckor till månader). Många smittvägar. Stamdiversitet, genetisk plasticitet.

14 Norovirus kan spridas mycket effektiv i vården. Utsöndras i mycket stort antal. Lång utsöndringstid hos normalt friska personer. Kroniska bärare; (A)symtomatiska. Asymtomatiska bärare vid utbrott. Lång överlevnad i miljön. Svårsanerad.

15 Efter vintern började SMI kartlägga norovirus inom vården: Labrapporter: Landets samtliga laboratorier rapporterar sina norovirusfynd varje vecka. Utbrott inom vården: Vårdhygien rapporterar veckovis utbrott inom olika vårdformer. Typning av virusstammar: Molekylär karaktärisering av cirkulerande virusstammar.

16 Antal Fynd av norovirus per vecka Norovirus Norovirus Norovirus Norovirus Norovirus Norovirus Vecka

17 Antal fynd Antal rapporterade fynd av norovirus per säsong

18 Antal fynd per vecka Lokala variationer i norovirusfynden HS+KS Västra Götaland Umeå Malmö

19 Antal virusfynd under säsongen Jämförelse säsongerna och Malmö Göteborg Solna Huddinge Linköping Uppsala Borås Skövde Jönköping Halmstad Karlstad Umeå SMI Västerås Laboratorieort

20 Incidens per landsting; vecka (fynd/ invånare) Gotland Skåne Östergötland Västra Götaland Gävleborg Jönköping Värmland Uppsala Halland Stockholm Örebro Västmanland Södermanland Västernorrland Västerbotten Jämtland Kronoberg Dalarna Kalmar Norrbotten Blekinge

21 Antal fynd per vecka Åldersfördelning fynd av norovirus år 0-64 år

22 Belastningen på vården under säsongstopp diagnostiserade fall varje vecka sjuka rapporterade utbrott varje vecka ett par hundra pågående utbrott. Kostnader???

23 Rapporterade labfynd av norovirus England/Wales

24 Genogroups/genotypes of the human norovirus based on capside sequences Genogroup I Genotype Norwalk GI:1 Southampton GI:2 Desert Shield GI:3 Queen s Arms GI:4 Musgrove GI:5 BS 5/98 GI:6 Winchester GI:7 Sindlesham GI:8 GI:9-14 Genogroup II Genotype Hawaii GII:1 Melksham GII:2 Mexico GII:3 Lordsdale GII:4 Hillingdon GII:5 Miami GII:6 Leeds GII:7 Amsterdam GII:8 GII:9-17

25 Årsvarianter norovirus GII.4 samt övriga genotyper Antal typade stammar per månad b 2006a Icke GII.4

26

27

28 2010

29

30 Norovirussäsongen : Relativt tidig start. Ny dominant variant. Norovirus GII.4 variant 2010 blir helt dominerande. Började cirkulera sent förra säsongen, undantaget Skåne. Skapa stora bekymmer inom vården. Nya varianter ger höga rapporteringssiffror vartannat år.

31 Smittsamhet utan symtom? Volontärstudie (1994) 56% (28/50) med symtom. 26% (13/50) infekterade utan symtom. Sjukhusstudie (2004) under utbrottsäsong 26% (23/87) personal utan symtom; positiva med PCR. 33% (4/12) patienter utan symtom; positiva med PCR. Alla GII.4 Ingen misstanke om att dessa orsakade utbrott.

32 Klinisk bild vid olika genotyper av norovirus Friesema et al (2009) J Clin Virol 46; Men, liten studie, begränsad i tid! Kraftigare symtom (kräkning/illamående) vid GII.4 än andra (GI.3, GI.6, GIIb, GII.3, GII.7). Högre AR hos boende vid GII.4. Mer illamående/feber vid variant 2004 än 2006a. Stora skillnader i ct-värde gav ingen skillnad i AR eller symtom. Virusinnehåll ~100 större vid GGII infektion än vid GGI.

33 Viruskontamination inom en isoleringsenhet för immundefekta barn Inga bevis för gastroenterit hos patienter. Svabbprov togs från 11 ytor under 10 veckor. Virus påvisades i 20 svabbprov. Norovirus 6%. Rotavirus 10%. Kontaminerade platser var ofta knutna till föräldrars passage genom enheten.

34 Smittade bakelser 30 sjuka efter att ha ätit rosa bakelser. Rosa bakelser med mosade hallon, gröna med päronextrakt. Calicivirus hos de sjuka, hallonen skickas till Frankrike. Två typer av calicivirus påvisas i hallonen!

35 Smittöverföring av rotavirus Fekal-Oral Person-till-person smitta Objektsmitta (t ex leksaker) Aerosol Hög smittsamhet viruspartiklar är tillräckligt för smittöverföring upp till 10,000,000,000 viruspartiklar/ml utsöndras i avföringen Hög viabilitet, rotavirus kan överleva i veckor I tex kontaminerat vatten eller på objekt Asymtomatiska individer kan sprida smitta 3

36 Number of Patients Age and Serotypes; Rotavirus 30 G9 G4 G Age group

37 Number of patients Age of patients with sapovirus infection Period 1 (Oct 1994-Oct 2002) Period 2 (Nov 2002-July 2004)