Kursansvarig/course leader part I: Conservation at the gene and population levels 7.5 hp:

Transkript

1 Stockholms universitet Version: Inst. för biologisk grundutbildning OBS! Schemaändringar kan förekomma Schedule BL5001 START: Tuesday 21 March, kl in xxx Kursansvarig/course leader part I: Conservation at the gene and population levels 7.5 hp: Naomi Keehnen NK Teachers: Anastasia Andersson AA Sara Kurland SK Peter Pruisscher PPR Alyssa Woronik AW Patricia Pečnerová PPA Johanna von Seth JS Kursledare och lärare del II: Bevarande på art- och ekosystemnivå 7.5 hp: Kristin Löwenborg KL Teachers: Marianne Haage MH Kristoffer Hylander KH Guest lecturer Course structure The course consists of two parts: Part I: Conservation at the levels och genes and populations 7.5 ECTS Part II: Conservation at the levels of species and ecosystems 7.5 ECTS To pass the whole course you need to pass both parts. Language: The course will be given partly in English and partly in Swedish. Location: Lectures: xxx Svante Arrhenius v. 20C Norra husen Computer labs: xxx Svante Arrhenius v. 18B Norra husen (unless otherwise is stated) Literature part I: Frankham, R., Ballou, J.D., Briscoe, D.A A primer of conservation genetics. Cambridge University Press. Literature part II: Will be handed out during the course. Examination: Part I requires pass on five obligatory items (see below) + at the lowest grade E on the written exam. Part II: All excursions are obligatory. The lectures are an important part of the course, but not obligatory. Examination: Part I: written exam xxx kl Part II: written exam xxx kl

2 Do not forget to register one week before the exams! Information about anonymous exams is found at Re-examination: Part I: xx Part II: xx Obligatory: The below items are obligatory and must be carried out with grading pass (Godkänd). To pass the whole course you need to pass both parts. Part I: 1. Computer simulation workshop I and II 2. All workshops are obligatory 3. Computer lab pedigreeanalys och bevarandeavel 4. Inlämningsuppgift analys av populationsgenetiska dat 5. Tentamen (betygssätts i 7-gradig skala) Part II: 1. Excursions. 2. Group project 3. Individual project 4. Assignments 5. Written examination (graded according to a 7 point scale) Course website: Här kommer all information om kursen finnas, handouts, uppgifter, information. Inloggningsuppgifter till intern-sidan erhålls vid kursstart. Part II: Updates and information will be published on the Mondo-site. For current information regarding the schedule, always check Time Edit Betygskriterier: Övrigt: För att kursens ska godkännas krävs: 1. Godkänt på samtliga obligatoriska moment (se ovan). 2. Minst betyget E på den skriftliga tentamen i bevarande på gen- och populationsnivå 3. Minst betyget E på den skriftliga tentamen i bevarande på art- och ekosystemnivå Slutbetyget (A-E) på kursen bestäms av resultaten på skrivningarna. Betygsskala för A-F (används för att gradera de två skriftliga proven): För betyget A krävs minst 95% av den maximala poängsumman. För betyget B skall studenten ha minst 85% av den maximala poängsumman För betyget C skall studenten ha minst 75% av den maximala poängsumman För betyget D skall studenten ha minst 65% av den maximala poängsumman För betyget E skall studenten ha minst 60% av den maximala poängsumman För betyget Fx skall studenten ha minst 50% av den maximala poängsumman Vid mindre än 50% av den maximala poängsumman ges betyg F A = utmärkt B = mycket god C = god D = tillfredsställande E = tillräcklig Fx = otillräcklig F = helt otillräcklig Båda Fx och F är underkänt, vilket innebär att studenten måste göra om hela provet Kursen kräver självstudier på ej schemalagd tid. Kursplan och övrig information om kursen finns på hemsidan: (moment 1) samt på xxxx(moment 2).

3 Moment 1: Conservation at the level of genes and populations Week 12 Tuesday xxxx Introduction to the course. NK 21 March xxxx Lecture: Genetics and Conservation Biology NK 22 March (Chapter 1) xxxx Lecture: Genetic diversity NK 23 March (Chapter 2) Räknestuga 1/Exercises 1 JS Friday xxxx Lecture: Evolutionary Genetics AW 24 March (Chapter 3) Week xxxx Lecture: Population genomics 27 March (Chapter 3, continued) Tuesday Lecture: Genetics & Extinction PPA 28 March (Chapter 5) xxxx Lecture: Genetic consequences of small PPR 29 March population size (Chapter 4) xxxx Computer simulation workshop: Genetic drift I & II PPR xxx Lecture & Workshop Ancient DNA & Conservation PPA 30 March Friday xxx Workshop on conservation planning PPR 31 March Week xxxx Lecture: Resolving taxonomic uncertainties NK 3 April (Chapter 6) Tuesday xxxx Workshop: Current work in conservation genomics NK 4 April Full day Studiebesök Sötvattenlab Drottningholm Joep de Leeuw 5 April Full day xxxx Ev. studiebesök räkna med fullt schemalagd dag. Studiebesök 6 April Kolmården (datum ej klart) Vargtema-dag (datum ej klart) Friday xxxx Lecture: Molecular genetics in forensics PPA 7 April (Chapter 9) 13:00-15:00 Räknestuga 2/Exercises 2 SK Week 15 Easter holiday!

4 Week April Red day Tuesday xxxx Föreläsning: Genetic principles for captive breeding AA 18 April (Chapter 8) xxxx Föreläsning: Studying genetic variation in the wild AA xxxx Datorlab: Pedigree-analys och bevarandeavel AA Inläsning, räkneövningar, etc. Friday xxxx Föreläsning: Fallstudier laxartad fisk SK 21 April xxxx Räknestuga 3/Exercises 3 SK Week April Tuesday 25 April 26 April 27 April Inläsning and hand in all räknestuga Inläsning Inläsning Inläsning Friday Written exam: Conservation at the levels of genes 28 April and populations

5 Moment 2: Conservation at the level of species and ecosystems Week 18 Day Time Room Innehåll Teacher 1 May Red day Tuesday Introduction to conservation ecology KL 02 May Conservation of mammals MH 03 May Conservation projects: handing out seminar assignments KL 04 May /seminar preparations Friday Conservation in forestry and agriculture KH 05 May 08 May /seminar preparations Tuesday Seminars: Presentations of assignments KL 09 May Information on projects Laws and conventions. Assignment. KL 10 May Funding of conservation projects. Assignment. KL 11 May Friday 12 May Excursion: Elecrofishing and inventory KL 15 May of Stone Loach (Barbatula barbatula) Bertil Borg Tuesday 16 May 17 May 18 May Friday Literature seminar: Ethics and conservation KL 19 May Re-examination part I Deadline submission of project reports 22 May Tuesday Guest seminar: Amphibian conservation in practice 23 May 24 May 25 May Red day Friday Presentations of projects KL 26 May

6 Conservation of ecosystems 29 May Tuesday 30 May 31 May 01 June Friday Written examination 02 June Friday Re-examination 09 June