Schema: Bevarandebiologi 15 hp, VT 2011 Kursen arrangeras av Avdelningen för populationsgenetik, Zoologiska institutionen, Stockholms universitet

Transkript

1 OBS: Ändringar kan bli aktuella Schema: Bevarandebiologi 15 hp, VT 2011 Kursen arrangeras av Avdelningen för populationsgenetik, Zoologiska institutionen, Stockholms universitet Anna Palmé (AP) - kursledare Linda Laikre () - kursansvarig Mija Jansson (MJ) Lovisa Wennerström (LW) Peter Guban (PG) Anastasia Eklund (AE) Bengt Karlsson (BK) Bodil Elmhagen (BE) Sven Jakobsson (SJ) Peter Hambäck (PH) rum F518, tel , anna.palme@popgen.su.se rum F520, tel , linda.laikre@popgen.su.se rum F511a, tel , mija.jansson@zoologi.su.se rum F511b, tel , lovisa.wennerstrom@zoologi.su.se rum F509, peter.g.99@gmail.com) rum F509, saphierwolf@hotmail.com bengt.karlsson@zoologi.su.se bodil.elmhagen@zoologi.su.se sven.jakobsson@zoologi.su.se peter.hamback@botan.su.se Gästföreläsare: Ann Dahlerus, Svenska Rovdjursföreningen Thord Fransson, Naturhistoriska riksmuseet Mats Amundin, Kolmårdens djurpark Anders Lekander, Lantrasforum Helena Olsson, Djurparkschef, Parken Zoo, Eskilstuna Jennie Westander, Forskningschef, Parken Zoo, Eskilstuna Studiebesök: Parken Zoo, Eskilstuna Fiskeriverkets Sötvattenslaboratorium, Drottningholm Lokaler: Föreläsningar D508 Datorlaborationer D334 Hemsida: Självstudier: Litteratur: Kursen förutsätter självstudier på icke-schemalagd tid Primack, R.B A primer of conservation biology. Sinauer Associates, Inc. Publishers Frankham, R., Ballou, J.D., Briscoe, D.A A primer of conservation genetics. Cambridge University Press. Båda böckerna går att köpa på Akademibokhandeln, Frescati. Litteraturhänvisningar: Obs - hänvisningarna är ungefärliga. Föreläsningarnas kronologi följer inte nödvändigtvis böckernas. Böckerna är ett viktigt komplement till föreläsningarna. Böckerna ger fördjupning och bredd inom vissa områden som vi inte kommer att hinna behandla så utförligt på kursen.

2

3 3. Vecka 12 3/21/2011 Måndag Introduktion av kursen AP Föreläsning: Introduktion till bevarandebiologi och bevarandegenetik Datorlab 1: Deterministiska processer som styr populationers genetiska sammansättning Litteratur: Primack kap. 1: 1-15, 34-54, 2, Frankham et al. kap 1 LW/AE 3/22/2011 Tisdag Föreläsning: Genomgång Datorlab 1. AP Föreläsning: Bevarandebiologi, bevarandegenetik, forts Datorlab 2: Stokastiska processers betydelse LW/PG Litteratur: Frankham et al. kap. 2, 1-21, kap 3 3/23/2011 Onsdag Inläsning, Räkneövningar Litteratur: Frankham et al. kap. 2, 1-21, kap 3 3/24/2011 Torsdag Föreläsning: Populations- och bevarandegenetik, forts Föreläsning: Genomgång av datorlab 2 AP Genomgång: Problemlösning 1 LW Litteratur: Frankham et al. kap 4 sid 52-59, /25/2011 Fredag Föreläsning: Populationsstruktur, små populationers genetik, pedigree-analys Föreläsning: Molekylära metoder AP Datorlab 3: Populationssystem. LW/PG Litteratur: Frankham et al. kap 4 sid 63-75, kap 6 Vecka 13 3/28/2011 Måndag Föreläsning: Genomgång Datorlab 3 AP Genomgång: Problemlösning 2 LW em Räkneövningar - självständigt arbete Litteratur: Frankham et al. kap 4 sid 59-65, kap 5 3/29/2011 Tisdag Föreläsning: Effektiv populationsstorlek. Avel av hotade djur Datorlab 4: Pedigree-analys MJ/LW Litteratur: Frankham et al. kap 5, 8

4 4. 3/30/2011 Onsdag Eget arbete, inläsning, BIG-information 3/31/2011 Torsdag Föreläsning: Genomgång av datorlab 4 LW Föreläsning: Pedigree-analys för bevarande av hotade lantraser Gästföreläsning: Bevarande av hotade husdjursraser LW/MJ Anders Lekander Litteratur: Frankham et al. kap 5, 8 4/1/2011 Fredag Grupp 3: Laboration: start av proteinelektrofores Grupp 3: Datorlaboration 5: analys av populationsgenetiska data Föreläsning: F-statistik, statistisk analys av AP molekylärgenetisk data, tolkning av labresultat AP (delvis tillgänglig) Grupp 3: Laboration: proteinelektrofores, forts. Litteratur: Labhandledning Vecka 14 4/4/2011 Måndag Grupp 1: Laboration: start av proteinelektrofores Grupp 2: Laboration: start av proteinelektrofores Grupp 1: Datorlaboration 5: analys av populationsgenetiska data Grupp 1: Laboration: proteinelektrofores, forts Grupp 2: Datorlaboration 5: analys av populationsgenetiska data Grupp 2: Laboration: proteinelektrofores, forts. Litteratur: Labhandledning PG MJ (delvis tillgänglig) AP (delvis tillgänglig) 4/5/2011 Tisdag Egen analys av labresultat. Skriftlig redovisning lämnas/mailas till AP senast onsdag 6 april kl /6/2011 Onsdag Eget arbete Litteratur: Frankham et al. kap 1: 22-28, kap 9

5 5. 4/7/2011 Torsdag Föreläsning: Demografi för sårbarhetsanalys AP Presentation av projektarbeten AP Genomgång: Problemlösning 3 AP Litteratur: Frankham et al. kap 5, sid /8/2011 Fredag Övningsuppgift: Demografi Föreläsning: Sårbarhetsanalys med Vortex AP/PG Datorlab 6: Sårbarhetsanalys med Vortex AP/PG/AE Litteratur: Frankham et al. kap 5, sid Vecka 15 4/11/2011 Måndag Datorlab 6, forts.: Sårbarhetsanalys med Vortex AP/PG/AE Genomgång: Problemlösning 4 AP 4/12/2011 Tisdag Datorlab 6, forts.: Sårbarhetsanalys med Vortex AP/PG/AE Datorlab 6: Redovisning AP/PG Datorlab 6: Redovisning AP/AE PHVA case study: CBSG Papua New Guinea workshop video AP Litteratur: Frankham et al. kap 5, sid /13/2011 Onsdag INLÄSNING 4/14/2011 Torsdag INLÄSNING 4/15/2011 Fredag Skrivning Bevarandegenetik och bevarandebiologi KT/MJ mfl Vecka 16 PÅSKLOV Vecka 17 4/26/2011 Tisdag Föreläsning: Introduktion till bevarandeekologi em Inläsning/projektarbete Litteratur: Fallstudier + Primack kap , 54-49, kap 2, 4-5 BK

6 6. 4/27/2011 Onsdag Inläsning: Två bevarandebiologiska fallstudier em Diskussion om de två inlästa bevarandebiologiska fallstudierna 4/28/2011 Torsdag Föreläsning: Bevarande av ängs- och hagmarker Litteratur: Primack kap , kap 4-5 BK AP 4/29/2011 Fredag Föreläsning:Bevarandeekologi hos insekter BK Diskussion: Etik och bevarande BK Litteratur: Primack kap 4-5 Vecka 18 5/2/2011 Måndag Studiebesök: Parken Zoo, Eskilstuna: praktiskt bevarandearbete i djurparksvärlden Helena Olsson, Jennie Westander 5/3/2011 Tisdag Föreläsning: Bevarandeekologi hos däggdjur BE em Inläsning Litteratur: Primack kap 4-5 5/4/2011 Onsdag Studiebesök: Fiskeriverkets Sötvattenslaboratorium 5/5/2011 Torsdag Föreläsning: Bevarandeekologi hos växter PH Grupparbete om utdelade artiklar Litteratur: Primack kap 4-5 5/6/2011 Fredag Grupparbete om utdelade artiklar Föreläsning Bevarandeekologi hos fiskar SJ Litteratur: Primack kap , kap 4-5 Vecka 19 5/9/2011 Måndag Redovisning av grupparbete BK em Inläsning/projektarbete 5/10/2011 Tisdag Eget arbete, inläsning, BIG-information 5/11/2011 Onsdag Vargtema Föreläsning: Den svenska vargstammens Föreläsning: Djurparkernas roll Mats Amundin Föreläsning: Rovdjurens roll i ekosystemet SJ Föreläsning: Bevarande av varg i Sverige Ann Dahlerus

7 7. 5/12/2011 Torsdag Inläsning/Projektarbete 5/13/2011 Fredag Litteraturseminarium BE em Föreläsning: Bevarandeekologi hos fåglar Thord Fransson Vecka 20 5/16/2011 Måndag Exkursion till Riddersholm BK 5/17/2011 Tisdag INLÄSNING 5/18/2011 Onsdag INLÄSNING 5/19/2011 Torsdag Skrivning Bevarandeekologi och bevarandebiologi 5/20/2011 Fredag Projektarbete Vecka 21 5/23/2011 Måndag Projektarbete 5/24/2011 Tisdag Projektarbete 5/25/2011 Onsdag Projektarbete 5/26/2011 Torsdag Inlämning av projektarbete 5/27/2011 Fredag Förberedelse opposition/redovisning Vecka 22 5/30/2011 Måndag Redovisning BK/AP mfl. 5/31/2011 Tisdag Redovisning BK/AP mfl.