Mikrobiologi 4.5 hp (Gener, celler och populationer) 2014-01-20--- 2014-02-05 Hej och välkommen! Vi startar med obligatoriskt upprop måndag 20 januari kl. 9:15 i sal E314 där också övriga föreläsningar ges. Om du inte kan komma till uppropet, anmäl detta i förväg till BIG-kansliet! Kursen utgörs dels av schemalagd undervisning (föreläsningar och laborationer), dels av självstudier. Föreläsningarna är inte obligatoriska, men rekommenderas starkt, eftersom de tar upp information som inte finns med i kursboken. Dessutom är syftet med föreläsningarna att du ska få möjlighet att ställa frågor och diskutera. Laborationerna utgörs av några grundläggande övningar i mikrobiologisk metodik, som också visar hur mycket mikroorganismer det finns i vår omgivning och hur man kan gå tillväga för att identifiera dem. Laborationerna är obligatoriska och utförs individuellt. Laborationerna hålls i lab D320. Använd labrock när du laborerar (labrock kan lånas). För godkänd laborationskurs krävs förutom närvaro också godkända labbrapporten, som ska vara inlämnade via e-mail till labb assistenterna. På laborationskursen ges betygen G eller U. Kursen avslutas med en skriftlig tentamen den 5 februari där inga hjälpmedel är tillåtna. Den sjugradiga betygsskalan (A-F) tillämpas på teoridelen. För godkänt betyg på momentet Mikrobiologi 4,5 hp krävs lägst betyget E på teorin (60% rätt) samt godkända laborationer. Om du har frågor angående föreläsningar och laborationer kan du kontakta ansvariga föreläsare och assistenter. För övriga frågor kan du kontakta kursansvarig lärare. Hong Sjölinder, Kursansvarig lärare Department of Molecular Biosciences, WGI Svante Arrhenius väg 20C, E445 Telefon: 08-16 40 60, 073 707 8684 E-post: Hong.Sjolinder@su.se
Sjugradig betygsskala För betyget skall du ha minst A (utmärkt) 95 % av max- poängen på det skriftliga provet. B (mycket god) 85 % C (god) 75 % D (tillfredsställande) 65% E (tillräcklig) 60% Fx (otillräcklig) 50% F (helt otillräcklig) mindre än 50% Möjlighet till komplettering av betyget Fx upp till godkänt betyg ges inte på detta moment.
SCHEMA Mikrobiologi 4.5 hp (2014-01-20 --- 2014-02-05) (F): Föreläsning Vecka 4 Datum Tid Lokal Titel Föreläsare Måndag 20/1 09:15-10:00 E 314 Obligatoriskt upprop Birgitta Åkerman Fota, information om skåpen, dator Per Cronholm 10:40-11:00 Introduktion till kursen Hong Sjölinder 11:00-12.00 E 314 Information om biologistudierna: Björn Birgersson innehåll och upplägg 13:00-15:00 (F) E 314 Prokaryota cellers uppbyggnad (kap 3) Helena Aro Tisdag 21/1 13:00-15:00 (F) E 314 Bakteriers näringskrav och tillväxt Helena Aro (kap 2, 4) Onsdag 22/1 10:00-12:00 (F) Bakterieinfektion+Genetik (kap 5,8) Ann-Beth Jonsson 13:00-15:00 Virus (kap 13) Hong Sjölinder Torsdag 23/1 10:00-12:00 (F) E 314 Antibiotika, antibiotikaresistens (kap9) Sara Eriksson 13:00-15:00 (F) E 314 Arkéer (kap 11) Ann-Kristin Lindås Fredag 24/1 13:00-15.00 (F) E 314 Bakterier i människans tjänst (kap 10) Hong Sjölinder (utdelning av röret för eget prov) Vecka 5 Datum Tid Lokal Titel Måndag 27/1 9:00-12:00 D320 Laboration I (Grupp A) Labbassistenter 13:15-16:15 D320 Laboration I (Grupp B) Sterilteknik Isolering av mikroorganismer från eget prov Tisdag 28/1 9:00-12:00 D320 Laboration II (Grupp A) Labbassistenter 13:15-16:15 D320 Laboration II (Grupp B) Avläsning, morfologi Onsdag 29/1 9:00-9:15 D320 Omstryk av bakterier för gramfärgning (Grupp A) Labbassistenter 9:30-12:00 (F) E 314 Mikroorganismer och ekosystem Margareta Ohné (kap 1,6,7,12) 13:15-16:15 D320 Laboration III (Grupp A) Labbassistenter Gramfärgning, motilitet, mikroskopering,.. Torsdag 30/1 9:00-9:15 D320 Omstryk av bakterier för gramfärgning (Grupp B) Labbassistenter 13:15-16:15 D320 Laboration III (Grupp B) Labbassistenter Gramfärgning, motilitet, mikroskopering,.. Fredag 31/1 9:00-12:00 D320 Laboration IV (Grupp A) Labbassistenter 13:15-16:15 D320 Laboration IV (Grupp B) Avläsning, Sporfärgning och labbgenomgång
Vecka 6 Datum Tid Lokal Titel Måndag 3/2 13:00-14:00 E314 Frågestund (frivilligt) Hong Sjölinder (Frågorna svaras genom e-post också) Tisdag 4/2 Självstudier och förbereda labbrapporten Onsdag 5/2 09:00-13:00 TENTAMEN (i Brunnsviksalen) Labbrapporten inlämnas senast kl18 Skrivningsgenomgång informeras senare Omtentamen: Lördag 15/mars, 9:00-13:00, E 306 (* Anmälan till Mina studier senast 2 dagar innan omtentamen) Lärobok: Carlson och Linder (2012) Introduktion till Mikrobiologi (Studentlitteratur AB ISBN 9144048467 ) Lärare: Helena Aro, Helena.Aro@gmt.su.se Sara Eriksson, Sara.Eriksson@gmt.su.se Ann-Beth Jonsson, Ann-Beth.Jonsson@gmt.su.se Ann-Christin Lindås, Ann.Christin.Lindas@su.se Margareta Ohné, Margareta.Ohne@gmt.su.se Hong Sjölinder, Hong.Sjolinder@gmt.su.se Assistenter: Linda weyler (Linda.weyler@gmt.su.se), E 453,Tel 08-16 4201 Alice Sollazzo (Alice.sollazzo@su.se), E525,Tel 08-16 4157 Kun Wang (Kun.wang@su.se), E 551,Tel 08-16 4930 Lärare från BIG Birgitta Åkerman, 08-16 40 70, Birgitta@big.su.se Per Cronholm, 08-164825, Per.Cronholm@big.su.se Björn Birgersson, 08-164903, studierektor@big.su.se
Stockholms universitet Institutionen för biologisk grundutbildning preliminär Schema för Kurstid: Lokaler: Kursansvarig: Gener, celler och populationer, II Cellbiologi 6 februari 2014-25 februari 2014 Föreläsningar: E314 Laborationer: E314 Seminarier: E314 Rum Tel. Anki Östlund-Farrants AÖF F448 164097 anki.ostlund@cellbio.su.se Lärare: Anki Östlund-Farrants Katharina Pawlowski Anders Nilsson AÖF KP AN F448 Assi Andreas Ring AR Litteratur: Sadava m fl: LIFE - The Science of Biology. Sinauer & Freeman. Datoranvändning: Registrera dig också som student till lärobokens resurs på nätet på sidan http://www.thelifewire.com Närvaro: Närvaro på "laborationen" och "diagnostiskt test" är obligatoriska om det inte annat sägs.
Dag Tid Lokal Innehåll Lärare Torsdag 6 februari Fredag 7 februari 9.15-12.00 E314 S: Den eukaryota cellen/dna till protein AÖF 13.15-16.00 inläsning/eget arbete 9.15-12.00 inläsning/eget arbete 13.00-16.00 inläsning/eget arbete Måndag 10 februari Tisdag 11 februari Onsdag 12 februari Torsdag 13 februari Fredag 2014-02-114 9.15-12.00 E314 F: Energimetabolism, glukolys, mitokondriekp 13.00-15.00 E314 diagnostisk test - DNA till protein 9.15-12.00 E314 F: Energimetabolism, fotosyntesen, kloroplakp 13.00-16.00 eget arbete 9.15-12.00 E314 F: Cytoplasman och plasmamembranet AÖF 13.00-16.00 E314 Lab, torr cellrörelse AR 9.15-12.00 E314 S: Cellsignalering och cellcykel AÖF 13.00-16.00 E314 Lab, torr cellrörelse?diagnostiskt test energar 9.15 E314 F: Mitos- meios och arv på molekylär nivå, AÖF 13.15-14.00 E314 diskussion, frågestund på materialet/eget arbaöf Måndag 17 feb 9.15-12.00 E314 frivilligt diagnostiskt test, cellcykel, cellsigar 13.00-16.00 Eget arbete Tisdag 18 februari Onsdag 19 februari 9.15-12.00 E314 F: Gener och transmissionsgenetik (kap. 9 oan 13.00-17.00 E314 Övningsuppgifter 9.15-12.00 E314 F: Genmodifierade organismer KP 13.00-16.00 Eget arbete Torsdag 20 februari Fredag 21 februari 9.15-12.00 E314 F: Genetisk variation och evolutionära mekanismer AN 13.00-17.00 Eget arbete 9.15-12.00 E314 Övningsuppgifter AN 13.00-17.00 E314 Övningsuppgifter
Dag Tid Lokal Innehåll Lärare Måndag 24 februari Tisdag 25 februari 9.15-12.00 inläsning 13.00-16.00 inläsning 13.00-17.00 Delprov II, E306
2014-03-09 Populationers evolution & bevarande GCP - VT14 OBS: Ändringar kan förekomma Schema: Gener, celler och populationer VT 2014 Naturliga populationers evolution och bevarande 6 hp Kursen arrangeras av Avdelningen för populationsgenetik, Zoologiska institutionen, Stockholms universitet I kursen ingår statistik, populationsgenetik, bevaranegenetik och bevarandebiologi Kursperiod: Lärare: Lokaler: Hemsida: Litteratur: 26 februari - 21 mars Linda Laikre (LL) - kursledare Anastasia Andersson (AA) Peter Guban (PG) Lovisa Wenneström (LW) Karin Tahvanainen (KT) Föreläsningar: E314 Datorlaborationer: D406 och D334 Laboration: D456 http://www.popgen.su.se/gcp rum D453, tel 16 42 83, linda.laikre@popgen.su.se rum D447, tel 16 42 79, anastasia.andersson@zoologi.su.se rum D458c, tel 16 12 79, peter.g.99@gmail.com rum D447, tel 16 42 79, lovisa.wennerstrom@zoologi.su.se rum D455, tel 16 42 82, karin.tahvanainen@popgen.su.se Sadava m fl: LIFE - The Science of Biology. 9th edition. Sinauer & Freeman. ISBN 978-0-7167-7671-0 Främst kapitel 21 och 59 Kompendium och texter som laddas ner från kursens hemsida under kursens gång Valfri: Ordbok i statistik av Olle Vejde. Kan köpas av kursens lärare, pris 140 kronor Handouts kommer att finnas tillgängliga på kursens hemsida efter föreläsningstillfället. Av miljöhänsyn kopieras inga handouts eller andra stenciler upp. Obligatoriska moment: Datorlaborationer (kan göras självständigt hemma men protokoll ska lämnas in och godkännas) Examination: skriftlig dugga i statistik och skriftligt prov på övriga moment Självständigt arbete med inläsning, räkneövningar, datorlaborationer, etc. på icke-schemalagd tid förutsätts. Betygskriterier finns på kursens hemsida www.popgen.su.se/gcp
Datum Tid Lärare Vecka 9 2014-02-26 Onsdag 13 00-15 30 Föreläsning: Introduktion. Inledning statistikdelen. Deskriptiv statistik. Population och stickprov LL 2014-02-27 Torsdag 9 30-12 00 Datorlab Statistik 1: Deskriptiv statistik. Datorsal D406. OBS obligatoriskt moment, protokoll ska lämnas in och godkännas. 13 00-15 30 Föreläsning: Statistik: sannolikheter, normalfördelningen, binomialfördelningen 2014-02-28 Fredag 10 30-12 15 Föreläsning: Statistik: binomialfördelningen, hypotesprövning PG, AA LL LL 13 00-16 00 Datorlab Statistik 1, forts. Datorsal D334 PG Vecka 10 2014-03-03 Måndag 9 00-11 00 Eget arbete, räkneövningar, inläsning 11 00-12 00 Genomgång av Räkneövningar 1: statistik PG em Eget arbete, inläsning, räkneövningar 2014-03-04 Tisdag 10 00-12 15 Föreläsning: Statistik: hypotesprövning LL 13 15-17 00 Datorlab Statistik 2: hypotesprövning Datorsal D406 AA, PG 2014-03-05 Onsdag fm Eget arbete, inläsning, räkneövningar 13 00-14 30 Genomgång av Räkneövningar 2: statistik PG 2014-03-06 Torsdag fm Inläsning 13 00-15 30 Dugga - statistik. Sal: E306 vakt: KT, PG 2014-03-07 Fredag fm Inläsning kapitel 21 och 59 i LIFE 13 00-15 00 Disputation i bevarandegenetik: Assessing inbreeding and loss of genetic variation in canids, domestic dog (Canis familiaris ) and wolf (Canis lupus ), using pedigree data. Sal: Nordenskiöldsalen, Geovetenskapens hus, Hus U, plan 3 Mija Jansson Vecka 11 2014-03-10 Måndag fm Inläsning kapitel 21 och 59 i LIFE 13 00-15 30 Föreläsning: Populationgenetik och bevarandebiologi LL 15 30 - Återlämning av statistikdugga PG
2014-03-11 Tisdag 10 00-12 00 Föreläsning: Populationsgenetik och bevarandebiologi, forts. 13 00-15 00 Datorlab 3 Populationsgenetik: Mikroevolutionära processer. Datorsal D406 2014-03-12 Onsdag 10 00-12 00 Föreläsning: Att studera genetisk variation i naturliga populationer, introduktion till egen analys av genetiska data 13 00-16 00 Datorlab 3 Populationsgenetik: Mikroevolutionära processer, forts. Datorsal D406 LL AA, PG AA PG 2014-03-13 Torsdag 12 15-12 45 Skrivningsåterlämning GCPII Anki Östlund F 12 45-13 45 Föreläsning: F-statistik, statistisk analys av genetiska data 14 00-16 30 Omdugga Statistik PG AA em Eget arbete med analys av genetiska data 2014-03-14 Fredag fm Föreläsning på nätet - varg och genetik: http://www.ur.se/produkter/164085-ur-samtiden-hurmanga-vargar-behover-vi-hur-manga-vargar-ar-lagom fm Eget arbete med räkneövningar och analys av genetiska data 13 00-14 15 Genomgång av Räkneövningar 3: populationsgenetik PG 14 30-16 00 Datorlab 3 Populationsgenetik: tid för avslut av lab. AA/PG Vecka 12 2014-03-17 Måndag fm Eget arbete - analys av labdata em Föreläsningar: Bevarandegenetiska fallstudier Tema 1: Populationer där släktskap är känd 13 00-13 30 Bevarande av hotade populationer i fångenskap LW 13 30-13 50 Kartläggning av beteendevariation hos en ras med av bevarandevikt: gotlandskaninen Bensträckare Tema 2: Kartläggning av genetisk mångfald hos Östersjöns arter 14 00-14 15 Föreläsning: Övervakning av genetisk variation med koppling till annan miljöövervakning - case study vitmärlan AA PG
14 15-14 45 Genetisk variation hos Östersjöns arter - vad vet vi? Varför är det viktigt? Tema 3: Bävervattsprojektet - unik genetisk övervakning 14 45-15 10 Biologisk diversitet på populationsnivå - sympatriska populationer hos öring 15 20-16 00 Genomgång av egen analys av genetiska data AA 2014-03-18 Tisdag 9 30-12 00 Föreläsning: Bevarandebiologi - Fallstudier Sandra Jönsson, WWF 2014-03-19 Onsdag Inläsning 2014-03-20 Torsdag Inläsning 13 00-14 30 Genomgång av räkneövningar 4: populationsgenetik PG 2014-03-21 Fredag 9 00-12 00 Skrivning: populationsgenetik, bevarandebiologi KT, PG, AA Sal: E306 och E314 13 00-15 30 Omdugga 2 Statistik PG Sal: Bestäms senare Efter detta datum är nästa tillfälle till omdugga vid uppsamlingstillfället i juni. Därefter nästa år då kursen ges igen. LW AA 2013-04-08 Tisdag 9 00-12 00 Omtenta: populationsgenetik, bevarandebiologi PG Sal: Ännu ej klart Efter detta datum är nästa tillfälle till omtenta är uppsamlingstillfället i juni, då kan både statistikduggan och skrivningen i populationsgenetik/bevarandebiologi kan skrivas.