BIMA15 mikrobiologi VT18

Transkript

1 BIMA15 mikrobiologi VT18 Vecka 1. Bakteriell cellvägg. FL: Introduktion till kursen TBL Uppgifter Del 1 FL: Grundläggande bakteriologi FL: Cellväggens uppbyggnad Vecka 2. Bakteriell metabolism. FL: Bakteriell metabolism TBL: Gruppmöte 1 TBL: Readiness Assurance Tests (RATs) WS: Referenshantering 1 Vecka 3. Bakteriell Genreglering TBL: Planering för laboration X2 TBL Uppgifter Del 2 FL: Bakteriella strukturer FL: Bakteriell genreglering Vecka 4. Bakteriologilaboration Bakteriologilaboration Vecka 5. Bakteriologilaboration Laboration uppföljning FL: Akademiskt skrivande WS: Referenshantering 2 Inskick Delmål Vecka 6. Bakteriella genetiska element & strukturer S: Applikation av laboration i examinationsuppgift S: Kamratgranskning TBL: Gruppmöte 2 TBL: Readiness Assurance Tests (RATs) Vecka 7. Handledning och Kamratgranskning Tillämpning: Examinationsuppgift Inlämning av färdigt arbete för kamratgranskning Vecka 8. Avslutning Inlämning av Feedback på kamratgranskning Deadline för slutlig inlämning av examensuppgiften. Skickas in till Moodle.

2 Kurslitteratur Flera alternativ av kurslitteratur kan användas och diskuteras med kursledare innan start. I mikrobiologi rekommenderas Microbiology An Introduction (10-11th ed) av Tortora, Funke och Case. Mycket information kommer också att utvinnas via den medicinska datorbasen PubMed. Lärare OS Oonagh Shannon, IKVL, B14 oonagh.shannon@med.lu.se RL Rolf Lood, IKVL, B14 rolf.lood@med.lu.se MB Matthias Bank, ITK matthias.bank@med.lu.se MC Mattias Collin, IKVL, B14 mattias.collin@med.lu.se EB Eleni Bratanis, IKVL, B14 eleni.bratanis@med.lu.se FP Frida Petersson, IKVL, B14 frida.petersson@med.lu.se JD Jonatan Dereke, IKVL, B11 jonatan.dereke@med.lu.s 2

3 Lokaler för Gruppmöten. 25/1 22/2 A H1006 H1006 B H1007 H1007 C H1008 H1008 D H1018 H1018 E H1019 H1019 Undervisningsmoment FL = Föreläsning S = Seminarium WS = Workshop TBL = Team based learning RATs = Readiness Assurance Tests 3

4 Kunskapsmål Under kursmål 1 redogöra för human- och bakteriecellers övergripande morfologi och strukturella organisation samt mekanismer för transport av joner och molekyler över cellmembranet Att beskriva olika morfologier för bakterier Att redogöra för uppbyggnaden av cellväggar för både Gram-positiva och Gram-negativa bakterier Att redogöra för strukturella skillnader mellan LPS och LTA Att beskriva peptidoglykanlagrets uppbyggnad Att redogöra för skillnader i en bakteries cellstruktur och en human cell Att redogöra för andra strukturer på bakteriers yta, inkluderande pili och fimbrier Under kursmål 3 beskriva hur en gen ser ut och uttrycks samt förklara transkriptions- och translationsbegreppen och redogöra för likheter och skillnader mellan eu- och prokaryota celler Att redogöra för generella skillnader mellan en bakteriell kromosom och humana kromosomer Att redogöra för extrakromosomala element i bakterier (plasmider, bakteriofager, mobila genetiska element), samt exemplifiera hur dessa kan påverka bakteriens förmåga att överleva under olika förhållanden Att redogöra för generell genreglering i bakterier och uppbyggnaden av operon Att översiktligt beskriva hur mikrobiella element (plasmider, bakteriofag-dna) kan användas inom (molekylärbiologisk) forskning Under kursmål 6 redogöra för grundläggande metabola processer i cellen samt hur de samverkar och regleras Att beskriva anaerob och aerob respiration Att redogöra för bakteriell fermentering Att beskriva bakteriell fotosyntes och hur detta tillför energi Under kursmål 7 redogöra för grundläggande metodik vid rening och analys av DNA, proteiner och bakterier, samt immunkemiska visualiseringstekniker Att redogöra för olika sätt att växa bakterier Att känna till hur vi kan använda bakterier för att producera protein Under kursmål 9 redogöra för olika skaltyper, deskriptiv statistik, grundläggande statistiska analyser och hypotesprövningar Att känna till begrepp som median, medelvärde och normalfördelning i samband med mikrobiologiska frågeställningar 4

5 Färdigheter och förmåga Under mål 1 planera, utföra, dokumentera och skriftligt sammanfatta laborativt arbete Att i samråd med handledare planera, utföra, dokumentera och skriftligt sammanfatta ett mikrobiologiskt arbete Under mål 2 söka vetenskaplig litteratur, samt hantera referenshanteringsprogram Att självständigt söka vetenskaplig litteratur till stöd för påståenden i den mikrobiologiska rapporten, och hantera referenserna med ett referenshanteringsprogram Under mål 3 statistiskt analysera och presentera egna data Att sammanställa egna data från laborativt arbete i en rapport Att använda statistiska tankesätt för att beskriva hur erhållit material är fördelat 5

6 Vecka 1. Bakteriell cellvägg V3 Mån 15/1 Tis 16/ FL: Introduktion till kursen och examinationsarbetet GK OS FL: Grundläggande bakteriologi GK RL Ons 17/1 Tors 18/ FL: Cellväggens uppbyggnad GK RL Fre 19/1 6

7 Vecka 2. Bakteriell metabolism V4Mån 22/1 Tis 23/ FL: Metabolism GK MC Ons 24/1 Tors 25/ Gruppmöte 1 Grupprum RATs och diskussion C144 OS/FP Fre 26/ Referenshantering och artikelsökning grupp 1 H Datorsal MB Referenshantering och artikelsökning grupp 2 H Datorsal MB 7

8 Vecka 3. Bakteriell genreglering, förberedelser inför lab V5 Mån 29/1 Tis 30/ Tillämpning 1 Mikrobiologi laboration Planering C315 OS/FP/EB FL: Bakteriella Strukturer GK RL Ons 31/1 Tors 1/ SI I1251/ FL: Bakteriell genregulering Fernström RL Planering och Protokoll till laboration B235 OS/EB/FP Fre 2/2 8

9 Vecka 4. Bakteriologilaboration V6 Mån 5/2 Tis 6/ Lab dag 1 1 LabBio OS/FP/EB Lab Dag 1 2 LabBio OS/FP/EB Ons 7/2 Tors 8/ Lab Dag 2 1 LabBio OS/FP/EB Fre 9/ Lab Dag 2 2 LabBio OS/FP/EB 9

10 Vecka 5. Applikation av din laboration V7 Mån 12/2 Tis 13/ Lab uppföljning Lab uppföljning 1 2 LabBio LabBio FL: Akademisk skrivande GK Studieverkstaden Ons 14/2 Tors 15/ Referenshantering workshop C315 JD Fre 16/2 Delmål inlämning Metoder & Resultat 10

11 Vecka 6. Bakteriella strukturer & genetiska element V8 Mån 19/2 Tis 20/ SI I1251/ S: Applikation av din laboration C315 OS/FP/EB WS: Kamratgranskning C315 JD Ons 21//2 Tors 22/ Gruppmöte 2 Grupp RATs och diskussion C315 OS/FP Fre 23/2 11

12 Vecka 7. Handledning av Examinationsuppgift och Kamratgranskning V9 Mån 26/2 Tis 27/ Tillämpning/Handledning av examinationsuppgift C333 OS SI I1251/53 Ons 28/2 Tors 1/ Deadline: Lämna arbete för kamratgranskning Fre 2/3 12

13 Vecka 8. Inlämning laborationsrapport 5/3 6/ Deadline: Kamratgranskning klar 9/ Deadline: Inlämning Examinationsuppgift 13

14 Gruppindelning under TBL och kamratgranskare TBL grupper Labgrupp A B C D E 14

15 Examination Examination av kunskapsmålen görs framförallt via det skriftliga arbetet (laborationsrapporten), där även ytterligare frågor ska diskuteras i anknytning till laborationen. I detta arbete är det viktigt att samtliga kunskapsmål är uppnådda och att det finns en ordentlig motivering om varför man själv tycker att man uppnått kunskapsmålen. Det är också viktigt att det är strukturellt välskrivet och vetenskapligt korrekt, dvs att det styrks av vetenskapliga fakta. Bedömningsmallen ska vara till stor hjälp för att uppnå samtliga kriterier och ni har också ansvar som kamratgranskare att hjälpa varandra att höja kvaliteten på arbetena. Om man efter kompletteringen inte uppnår samtliga kriterier ligger ett tillfälle i slutet av augusti för uppsamlingstentamen av de kursmål som man inte lyckats uppnå. Vi genomför även tester med flervalsfrågor (så kallade Readiness Assurance Tests) individuellt (irats) och i grupp (trats). irats kommer att bedömas formativt och summativt. 15