Styrelsemöte BBMRI.se 30/9-2013
Rapport från verksamheten
Minimum Information About Biobank data Sharing MIABIS 2.0
Samarbeten utanför Sverige MIABIS 2.0
National Genomics Infrastructure (NGI) -
Graz, Austria. September 16-18, 2013 1.BBMRI-ERIC Inauguration Conference 2. International Biobanking Summit II 3. BBMRI-LPC Forum Meeting
Founding Members of BBMRI-ERIC Austria Belgium Estonia France Germany Greece Malta Netherlands Sweden Official Observers of BBMRI-ERIC Norway Poland Switzerland
Vägen till BBMRI ERIC BBMRI prepatory phase började 1 February 2008 slutade 31 January 2011.
Vägen till BBMRI ERIC BBMRI prepatory phase började 1 February 2008 slutade 31 January 2011. 28 månader 7 Juli 2013 skickades ansökan in för BBMRI ERIC status.
Vägen till BBMRI ERIC BBMRI prepatory phase började 1 February 2008 slutade 31 January 2011. 28 månader 7 Juli 2013 skickades ansökan in för BBMRI ERIC status.
Vägen till BBMRI ERIC BBMRI prepatory phase började 1 February 2008 slutade 31 January 2011. 28 månader 7 Juli 2013 skickades ansökan in för BBMRI ERIC status. BBMRI-ERIC kommer antagligen vara startklar från Januari 2014 5 månader
Work program and budget for BBMR ERIC 2014 Fist Draft Prof. Jan-Eric Litton
SAB 18/9-2013 Kristian Hveem (Professor, HUNT research center, BBMRI.no, Norway) Gert-Jan B. van Ommen (Professor, Leiden University Medical Center, BBMRI.nl, The Netherlands) Fay Betsou (Chief Biospecimen Science, Integrated Biobank of Luxembourg, Luxembourg) Alison Spaull (Canadian Partnership for tomorrow Project, Canada/Scotland) Marianne K. Henderson (President ISBER, USA/National cancer institute, USA) Updates from the last meeting and advice regarding positioning of BBMRI.se, more specifically on the following questions Q1. How shall BBMRI.se be organized in work packages as it is now or in a new model, for example common services as BBMRI-ERIC? Q2. As you see it, what should BBMRI.se bring to BBMRI-ERIC? Q3. BBMRI-Nordic is provocative in some people s eyes- shall we continue? How to navigate? Q4. Other concerns or comments?
BBMRI.SE en enande svensk nationell infrastruktur för biobankning WP1 Projektledning WP2 & WP3 WP4 WP5 WP6 WP7 WP8 Insamling Samordna & harmonisera insamling av prov och data (befolkningskohorter & patientkohorter) Användning: Analys Optimera gränssnitt till analysresurser IT En enande nationell och Internationell IT-plattform Fysisk anläggning En effektiv nationell, storskalig provhanteringsplattform Etik Nationell expertis och forum för etiska frågor Finansiering Långsiktig finansiering Primär provmottagning på lokala biobanker och sjukhus över hela landet Central lagring & framplockning Kvävetankar (-190 C) lagrar ~ 100 miljoner rör = "hårddisk Automatisk framplockningsenhet i -80 C. = "processor och RAM-minne"
Prognos 2010-2014 TSEK BBMRI.se
SSB (BBMRI.se) och KI biobank KIBB (1 Q 2013) #studier 145 22 SSB (3Q 2013 #sampels 643 000 3 200000 #donatorer 162 000 140 000 #DNA 149 000 120 000 # antal uttag 256 000 40 000 SSB startade nov 2010 KIBB startade 2002
Nationell profil med prospektiva kohorter som bara växer och växer inom BBMRI.se Storskaliga kohorter # planerade individer Region LifeGene 200K Stockholm + EpiHealth North 150K Uppsala EpiHealth South 150K Skåne Karma breast cancer 100K Stockholm (+Skåne) Sthm-2 prostate cancer 100K Stockholm Scapis CV 30K Göteborg + national Malmö Kost Cancer 18K, complete Malmö Malmö Förebygg. Med 22K, complete Malmö Sthm-3 prostate cancer 200K Stockholm BBMRI.se standards : Enhetlig provhantering och data standard Open Access Program
Nationella kliniska studier Nationalla kvalitetsregister Multiple Sclerosis (IMSEII) Bipolar Disease 1 Rheumatoid Arthritis Myelo Dysplastic Syndrome Chronic Lymphoid Leukemia Andra studier Pre-Rheumatoid Arthritis Rheumatoid Arthritis (NordStar) Artros Anorexi Bipolar Disease 2 Autism Twin Study Prostate Cancer prediction Arrhythmia Njur o Lung cancer Autoimmune studie Status Pågår Pågår Pågår Pågår Pilot startat Status Pågår Pågår Pågår Pågår Pågår Pågår Planering Planering Planering Planering
BBMRI.se nationella nätverk för provhantering Node Status Launch Stockholm, SSB hub Utveckling och lagring av nationella prover Nov 2010 Göteborg Nya lokaler Feb 2012 Skåne Reformatering av gamla prover Nov 2011 Umeå Ombyggnad av nya lokaler 1Q2013 Örebro Nya lokaler 2Q2013 Linköping Nya lokaler 3Q2013 BBMRI.se finansierar provhantering och robotar Noderna använder BBMRI.se prov & data format Noderna står för lokaler och personal Noderna deltager i BBMRI.se utveckling Noderna bidrar med nya studier inom BBMRI.se
SMI överlåter vävnadsprover till BBMRI.se
Implementering av BBMRI.se Nationella Cytologi Biobankning: Status Nationell Cytologi Biobankning nu i 12 landsting
Implementering av BBMRI.se Nationella Cytologi Biobankning: Status Nationell Cytologi Biobankning nu i 12 landsting Kommer antagligen införas i; Norge Skottland Danmark
BBMRI.se Webinar Synliggör verksamheten och sprider information runt hela landet på ett enkelt sätt Lockar nya gruppar att ta del av BBMRI.se resurser och verktyg Initialt ett brett anslag på ämne - samarbete med vården, samarbete med industrin Storytelling kring BBMRI.se verktyg: användarna i fokus
Webinar - vilka målgrupper når vi? biobank WEBINAR Universitet Industri Beslutsfattare Kliniker Biobanksforskning Media Patienter Internationella regelverk Nationella regelverk
biobank WEBINAR 9 nov 11.00 prel; Biobanker och kvalitetsregister 6 dec 11.00 prel; ISIS
BiobankCloud EU FP7 infrastructure for sensitive Big Data BBMRI.se and; Royal Institute of Technology, Sweden Humbolt University, Berlin Charité Universitätsmedizin, Berlin Fundação Faculdade de Ciências da Universidade de Lisbon
Start research project Find samples Experimental design Run experiment Store raw data and sample data Analyze data Storage Facility (SNIC, EUDAT ) Parallel computing facility (PDC, BiobankCloud ) Store process data Experiment results Share data Lab notebook and documents Internet
BBMRI.se
Nationellt samordningsråd: Mats Karlsson (Örebro), Lars Lind (Uppsala), Lauren Lissner Åsa Torinsson (Göteborg), Lennart Eriksson (Stockholm), Ingvar Bergendahl (Umeå), Peter Nilsson (Lund/Malmö), Peter Söderkvist (Linköping), Sonja Eaker Fält (NBR); Senaste möte 16/10 2012
Nationellt samordningsråd: Mats Karlsson (Örebro), Lars Lind (Uppsala), Lauren Lissner Åsa Torinsson (Göteborg), Lennart Eriksson (Stockholm), Ingvar Bergendahl (Umeå), Peter Nilsson (Lund/Malmö), Peter Söderkvist (Linköping), Sonja Eaker Fält (NBR);
BBMRI.se