Avelsvärdering med index Erling Strandberg, inst för husdjursgenetik, SLU
Index i hundaveln Vad? Varför? Hur?
Vad är index?
Avel att välja de bästa hundarna till att bli föräldrar fast ännu hellre Att välja de hundar som ger bäst avkommor! Hur vet vi det? Gentest? Information om prestationer, sjukdomsresultat etc Kort sagt: AVELSVÄRDERING - INDEX
? Kärt barn har många namn Index Avelsindex BLUPindex Avelsvärde Hundens index för en (eller flera) egenskap(er) är en skattning av dess nedärvningsförmåga (avelsvärde), jämfört med genomsnittet i rasen.
Vad är index? Vad är index? Hundens skattade avelsvärde (index): Är en förutsägelse om hur hundens avkommor kommer att utvecklas i en viss egenskap - inte ett mått på vad avelshunden själv har för resultat Ger en uppfattning om vilket resultat man kan förvänta sig i kommande generationer av att använda den aktuella hunden i avel
Vad är index? Utnyttjar all tillgänglig information från släktingar Korrigerar för miljöfaktorer (t ex ålder, beskrivare) Simultan skattningsprocess, statistisk analys (BLUP = Best Linear Unbiased Prediction)
Varför? När är index användbart?
Hundens prestation påverkas av många faktorer Arv Motion Utfodring Kön Sedering Ålder Undersökningsår Födelsemånad
Suggors kullstorlek (medeltal 10 levande födda) Sugg -id kullstorl kullnr bettyp moder resultat systrar resultat antal systrar 1 12 1 galt 12 12 3 2 10 1 galt 10 9 2 3 11 1 semin 12 13 7 4 10 1 galt 11 10 5 5 14 2 galt 10 13 1
För vilka egenskaper? Komplexa egenskaper: Total fenotypisk variation Variation som uppkommit pga Faktorer vi inte kan greppa = slumpmässig miljövariation Variation som uppkommit pga olika arvsanlag = ärftlig variation Variation som kan korrigeras = systematisk miljövariation
Komplexa egenskaper Arvbarhet = Genetisk variation All variation
Arvbarhet Ett värde från 0 till 1 Hur stor del av variationen förklaras av arv Hur mycket av föräldrarnas fenotypiska överlägsenhet går i arv till avkomman
Arvbarhet (h 2 ) = regression av avkomma på föräldrar 3 Avkomma 2 h 2 = 0,3 1 0-3 -2-1 0 1 2 3 Föräldramedeltal -1-2 S R -3
Arvbarhet Ett värde från 0 till 1 Hur stor del av variationen förklaras av arv Hur mycket av föräldrarnas fenotypiska överlägsenhet går i arv till avkomman Hur mycket djurets egen fenotyp säger om avelsvärdet
Avelsvärde, avelsindex (A) 3 h 2 = 0.3 2 1 Lutning h 2 0-3 -2-1 0 1 2 3 Regressionslinje -1 Fenotypvärde Värden för enskilda djur -2-3
-4 Avelsvärde 4 3 h 2 =0,6 2 1 Fenotypvärde 0-4 -3-2 -1 0 1 2 3 4 1 2 3-1 -2-3
Arvbarhet Ett värde från 0 till 1 Hur stor del av variationen förklaras av arv Hur mycket av föräldrarnas fenotypiska överlägsenhet går i arv till avkomman Hur mycket djurets egen fenotyp säger om avelsvärdet Hur mycket information behövs för att få ett säkert avelsvärde
Säkerheten på avelsvärdena påverkas av arvbarheten Sant avelsvärde 4 3 2 Arvbarhet = 0,1 1 0-4 -3-2 -1 0 1 2 3 4 Skattat avelsvärde -1-2 -3-4
Säkerheten på avelsvärdena påverkas av arvbarheten Sant avelsvärde 4 3 Arvbarhet=0,6 2 1 0-4 -3-2 -1 0 1 2 3 4 Skattat avelsvärde -1-2 -3-4
Arvbarhet Ett värde från 0 till 1 Hur stor del av variationen förklaras av arv Hur mycket av föräldrarnas fenotypiska överlägsenhet går i arv till avkomman Hur mycket djurets egen fenotyp säger om avelsvärdet Hur mycket information behövs för att få ett säkert avelsvärde Hur lätt är det att avla för en egenskap
Vad behövs? Tillräckligt med data (fenotyp + härstamning) Mätmetoden/beskrivningen bör vara standardiserad och validerad Variation (fenotypisk och genetisk) i egenskapen Överensstämmelse mellan mål- och mätegenskap Enighet kring avelsmålet - vad vill vi uppnå?
1966 1968 1970 1972 1974 1976 1978 1980 1982 1984 1986 1988 1990 1992 1994 1996 1998 2000 2002 2004 2006 2008 2010 Varför skatta avelsvärden? Den genetiska trenden visar på förbättrad ledhälsa (HD) hos jämthund över tid 105 100 95 90 85 80 Genomsnittligt HD-index för jämthund
Exempel från varmblodig ridhäst, hoppning och dressyr 110 105 100 Show jumping Dressage 95 90 85 80 1960 1970 1980 1990 2000
Hur går det till?
Avelsvärdering Insamling av data Avelsvärdering Rangering Val av avelsdjur Avelsvärderingen görs om med det tidsintervall man bestämmer.
Index (avelsvärde) Reg.nr. Namn Index_NO Medelfel S61150/2009 SEAMIST ICE BLUE 133 11 S61145/2009 SEAMIST ARCTIC ICE 133 11 S61149/2009 SEAMIST ICE WARNING 133 11 S61151/2009 SEAMIST LAVENDER ICE 132 11 S17202/2009 SEAMIST ICE NOUGAT 131 11 S17199/2009 SEAMIST BLACK ICE 131 11 S61148/2009 SEAMIST ICE SPIRIT 131 11 S17203/2009 SEAMIST ON ICE 130 11 S18348/2003 SEAMIST SNOWSTAR 130 10 S17205/2009 SEAMIST ICE SONG 130 11 Medelvärdet i rasen är 100 Medelfelet anger säkerheten
Referenspopulation 150 Genetisk trend 140 130 120 110 Medelindex 100 90
Säkerhet Medelfelet anger indexets säkerhet Anger det intervall som hundens avelsvärde sannolikt ligger inom Reg.nr. Namn Index_NO Medelfel S61150/2009 SEAMIST ICE BLUE 133 11 Med 68 % sannolikhet inom intervallet 122-144
Säkerhet Säkerheten styrs av arvbarheten informationsmängden som knyter an till en viss individ (i form av släktingars fenotyper) Närmare släktingar påverkar mer Avkommor påverkar säkerheten mest
Förväntat index för en kull En kulls förväntade index är medelvärdet av föräldrarnas index: Hanen: 120 Tiken: 100 Kullens förväntade index: 110
Index i avelsarbetet Index ger en säkrare bedömning av individens avelsvärde Avelsurvalet bör baseras på indexvärdet snarare än fenotypen För en genetisk förbättring över tid bör parningskombinationens index vara bättre än genomsnittet i rasen (>100) Strategi för hur index ska användas behövs Indexvärden bör inkluderas som en del i RAS