Index för HD och ED - hur har det gått? Sofia Malm

Transkript

1 Index för HD och ED - hur har det gått? Sofia Malm Avelskonferens SÄK, 12 augusti 2016

2 Pilotraser Golden, labrador, flatcoated, rottweiler, bernersennen sedan 2012 Jämthund och norsk älghund grå (gråhund) sedan 2013

3 13 nya indexraser från januari 2016 Ras American staffordshire terrier Boxer Bullmastiff Cane corso Collie, långhårig Dansk-svensk gårdshund Finsk lapphund Irländsk röd setter Leonberger Nova scotia duck tolling retriever Perro de agua espanol Samojedhund Storpudel Egenskap HD + ED HD HD + ED HD + ED HD HD HD + ED HD HD + ED HD HD HD HD

4 Vad tänker hon prata om idag? Vad är index? Varför skatta avelsvärden? HD-/ED-index i Avelsdata Hur har index använts i avelsarbetet?

5 Vad är index? Index Avelsindex Avelsvärde BLUP-index Hundens index för en (eller flera) egenskap(er) är en skattning av dess nedärvningsförmåga (avelsvärde), jämfört med genomsnittet i rasen.

6 Vad är index? Hundens skattade avelsvärde (index): Är en förutsägelse om hur hundens avkommor kommer att utvecklas i en viss egenskap, och inte ett mått på vad avelshunden själv har för resultat Ger en uppfattning om vilket resultat man kan förvänta sig i kommande generationer av att använda den aktuella hunden i avel

7 Vad är index? Utnyttjar all tillgänglig information från släktingar Korrigerar för miljöfaktorer (t ex ålder, kön) Simultan skattningsprocess, statistisk analys (BLUP = Best Linear Unbiased Prediction)

8 Vad är index? Avelsvärde: mått på individens nedärvningsförmåga Index: uttrycker det skattade avelsvärdet i förhållande till genomsnittet i rasen (referenspopulationen) INDEX: 100 genomsnittet i referenspopulationen > 100 förväntas lämna avkommor med bättre HD/ED status än genomsnittet < 100 förväntas lämna avkommor med sämre HD/ED status än genomsnittet

9 Vilka hundar ingår i referenspopulationen? Ska representera den genetiska nivån för HD/ED i den svenska populationen av aktuella hundar Omfattar hundar födda år n-6 till n-2 där n är aktuellt år (dvs för år 2016 hundar födda ) Inkluderar endast hundar med svenskt ursprung

10 Varför skatta avelsvärden? Röntgenundersökningen kan inte mäta den underliggande genetiska variationen avseende HD-kvalitet

11 Varför skatta avelsvärden? Hundar med samma röntgenresultat får olika HD-index A E D C B Skattat avelsvärde för HD

12 HD-index i andra länder BLUP-metoden används, den statistiska modellen skiljer sig något åt mellan länderna Indexvärdet och säkerheten i skattningen publiceras Medel = 100 (i Norden), men standardavvikelsen skiljer sig åt Definitionen av referenspopulationen skiljer sig åt Den genetiska nivån kan vara en annan Indexvärden är inte direkt jämförbara mellan länder

13 Index för HD och ED i Avelsdata Index skattas varje vecka och publiceras i Avelsdata Samtliga hundar födda år 2000 eller senare med eget resultat får HD-/ED-index Importerade/utländska hundar utan eget resultat i SKKs databas men med röntgade avkommor kan få index publicerat

14 Index för HD och ED i Avelsdata Index redovisas för varje hund Veterinärdata (aktuellt index) Kull/helsyskon (preliminärt kullindex samt aktuellt index) Kullar och avkommor (preliminärt kullindex samt aktuellt index) Preliminärt index redovisas vid provparning Index redovisas för varje ras under Hälsa Referenspopulationen (HD status och medelindex) Medelvärde (genetisk trend) Index visas i Listor

15 Hundar: Veterinärdata (aktuellt index) Mer information finns här! Missa inte tool-tip

16 Tool-tip för Medelfel Medelfelet är ett mått på säkerheten i det skattade indexet och anger inom vilket intervall (± medelfelet) hundens framtida HD-/ED-index med största sannolikhet kommer att ligga. Ett mindre medelfel indikerar ett säkrare index. För mer information se (i) knappen i övre vänstra hörnet.

17 Hundar: Kull/helsyskon och för kullar och avkommor Preliminärt kullindex vid parning (statiskt värde) Individuellt index (kan ändras över tid)

18 Tool-tip för Preliminärt kullindex vid parning Preliminärt index för kullen beräknas som föräldradjurens genomsnittliga index för HD/ED vid parningstillfället, d v s som (index mor + index far)/2. Preliminärt index beräknas för kullar där båda föräldradjuren har ett indexvärde. För mer information om index se (i) knappen i övre vänstra hörnet.

19 Kullsyskon med samma HD-grad och olika index Hur kommer det sig att kullsyskon med samma HD/ED-status och utan röntgade avkommor kan få olika index?

20 Provparning: Preliminärt index Preliminärt index vid provparning kan ändras över tid om föräldradjurens index ändras

21 Tool-tip för Preliminärt index vid provparning Preliminärt index beräknas som genomsnittet av föräldradjurens index, d v s (index far + index mor)/2. Preliminärt index bör vara större än 100. =?

22 Observandum vid provparning Varningstriangel för provparningar där HD index < 100 (i raser med hälsoprogram för HD på nivå 3) Parningen följer inte SKK:s rekommendation att föräldradjurens genomsnittliga HD-index vid parningstillfället (preliminärt index för kullen) ska vara större än 100.

23 Raser: Hälsa/HD-index, referenspopulation Referenspopulation år 2016, inkluderar hundar födda HD-grad HD-index A 106 B 91 C 83 D 77 E 68

24 Raser: Hälsa/HD-index, referenspopulation Referenspopulation år 2016, inkluderar hundar födda HD-grad HD-index A 108 B 94 C 85 D 76 E 69

25 Raser: Hälsa/ED-index, referenspopulation Referenspopulation år 2016, inkluderar hundar födda ED-grad ED-index u.a

26 Raser: Hälsa/HD-index, medelvärde Genomsnittligt HD-index, visar genetisk förändring över tid

27 Raser: Hälsa/HD-index, medelvärde Genomsnittligt HD-index, visar genetisk förändring över tid

28 Raser: Hälsa/ED-index, medelvärde Genomsnittligt ED-index, visar genetisk förändring över tid

29 Raser: Listor/HD

30 Index i avelsarbetet Avelsurvalet bör baseras på indexvärdet istället för röntgenresultatet För en genetisk förbättring över tid bör parningskombinationens HD-index vara bättre än genomsnittet i rasen (>100) Se till parningskombinationens genomsnittliga index snarare än den enskilda individens ökad flexibilitet

31 Ändring i hälsoprogrammet, nivå 3 Hundar A, B eller C får användas i avel Rekommendationen att föräldradjurens genomsnittliga HD-index vid parningstillfället ska vara större än 100 Hundar med HD grad D eller E inte får användas i avel, oavsett HD-index För utländska avelsdjur gäller fortfarande att avelsdjuret ska ha HD grad A eller B För parningar med preliminärt kullindex under 100 skickas ett informationsbrev till uppfödaren

32 Ändring i hälsoprogrammet, nivå 3

33 Vad är en lämplig avelsstrategi? Olika förutsättningar i olika raser Selektionsintensiteten beror på vilka andra egenskaper som ingår i avelsmålet samt på populationsstrukturen Strategi för hur index ska användas behöver utarbetas Index för HD och ED bör inkluderas som en del i RAS Gör en konsekvensanalys innan restriktioner införs

34 Utvärdering av index i pilotraserna - Hur har index använts i avelsarbetet? Syfte Att utvärdera de avelsmässiga konsekvenserna av index för HD och ED i de 7 första pilotraserna Material I huvudsak data för hundar födda 2012 (2013) Jämfört med period före index. Senaste undersökningsresultatet för varje hund. Aktuellt/senaste index för varje hund.

35 Antal födda Numerär utveckling, antal födda hundar under perioden Berner sennenhund Rottweiler Flatcoated retriever Golden retriever Labrador retriever Jämthund Gråhund

36 Andel röntgade Andel HD-röntgade av födda, perioden % 70% 60% 50% 40% 30% 20% 10% 0% Berner Rottweiler Flatcoated Golden Labrador Jämthund Gråhund sennen Serie1 72% 66% 60% 59% 61% 36% 36%

37 Andel (%) Fenotypisk trend för HD hos jämthund 100,0 90,0 80,0 70,0 60,0 50,0 40,0 30,0 20,0 10,0 A + B A B C D + E Linjär (A + B) Linjär (D + E) 0,

38 Andel (%) Fenotypisk trend för HD hos gråhund 100,0 90,0 80,0 70,0 60,0 50,0 40,0 30,0 20,0 10,0 A + B A B C D + E Linjär (A + B) Linjär (D + E) 0,

39 Genomsnittligt HD-index Inkluderar hundar med preliminärt kullindex för HD samt eget undersökningsresultat i SKKs databas. Ras Antal Index HD SD Min Max Berner sennenhund ,8 8,5 66,4 113,8 Rottweiler ,4 9,2 66,2 116,6 Flatcoated retriever ,4 10,6 56,1 115,8 Golden retriever ,6 8,7 71,5 121,4 Labrador retriever ,2 9,5 65,3 118,5 Jämthund ,6 9,2 61,4 114,2 Gråhund ,5 11,6 66,5 121,4 Indikerar positiv utveckling över tid. Älghundsraserna högst medelvärden!

40 Spridning i HD-index för jämthund

41 Spridning i HD-index för gråhund

42 Medelfel HD-index hur säkra är skattningarna? Materialet omfattar hundar med preliminärt kullindex för HD samt eget undersökningsresultat i SKKs databas. Ras Antal Medelfel HD SD Min Max Berner sennenhund ,0 0,3 7,8 13 Rottweiler ,0 0,2 9,0 12,7 Flatcoated retriever ,0 0,3 9,0 13,5 Golden retriever ,8 0,3 6,5 12,6 Labrador retriever ,7 0,3 6,0 12,6 Jämthund 930 9,9 0,4 9,4 12,6 Gråhund ,1 0,4 9,7 12,7 Medelfelet påverkas av: - Arvbarheten för HD i respektive ras - Mängden information om HD-status hos släktingar

43 Avelsanvändning och HD-index - hänsyn till preliminärt kullindex? Genomsnittligt preliminärt kullindex för HD, antal och andel hundar med preliminärt kullindex samt kullindex under 100 Jämthund Födelseår Antal födda Antal med prel.index Andel med prel. index Genomsnitt prel. index Antal med prel. index under 100 Andel med prel. index under ,3% 102, ,3% ,0% 103, ,3% ,9% 103, ,7% Total/medel ,0% 103, ,0% Gråhund Födelseår Antal födda Antal med prel.index Andel med prel. index Genomsnitt prel. index Antal med prel. index under 100 Andel med prel. index under ,7% 102, ,1% ,6% 102, ,3% ,1% 103, ,0% Total/medel ,0% 102, ,0%

44 Preliminärt kullindex HD genomsnitt fördelat på HD-status Data omfattar hundar med preliminärt kullindex samt eget HD-resultat. Majoriteten av hundarna är födda under perioden 2013 till Jämthund Norsk älghund grå (gråhund) HD-grad Antal Andel Prel.index HD HD-index Antal Andel Prel.index HD HD-index A ,0% 104,0 106, ,8% 104,5 110,1 B ,7% 102,7 91, ,1% 102,2 94,1 C 55 5,9% 101,4 84, ,5% 101,9 84,3 D 19 2,0% 101,8 77,4 9 2,6% 103,2 80,1 E 3 0,3% 100,5 63,4 0 0,0% - - Visar på ett samband mellan hundens preliminära kullindex och dess HD-grad Hundar med HD-grad A kommer generellt ur kullar med högre preliminärt kullindex Litet underlag för hundar med måttlig eller grav HD

45 Preliminärt kullindex under/över 100 fördelning HD-status Jämthund HD-grad Preliminärt kullindex HD A B C D E Totalt Fria (A+B) HD (C+D+E) Andel HD (C+D+E) Under ,2% Över ,0% Gråhund HD-grad Preliminärt kullindex HD A B C D E Totalt Fria (A+B) HD (C+D+E) Andel HD (C+D+E) Under ,0% Över ,1% Risken för HD (grad C, D eller E) är större om kullen har ett preliminärt kullindex under 100.

46 Parningskombinationer HD och genomsnittligt preliminärt kullindex Jämthund Parningskombination Antal Andel Prel.index HD A*A ,4% 105,5 A*B eller B*A ,3% 98,9 B*B 66 1,2% 93,4 Någon förälder grad C 38 0,7% 98,4 Någon förälder grad D* 16 0,3% 98,0 * Ej i enlighet med SKKs regelverk

47 Parningskombinationer HD och genomsnittligt preliminärt kullindex Gråhund Parningskombination Antal Andel Prel.index HD A*A ,8% 107,0 A*B eller B*A ,3% 100,1 B*B 62 3,3% 92,1 Någon förälder grad C 69 3,6% 93,9 Någon förälder grad D 0 0,0% -

48 Andel röntgade Andel ED-röntgade av födda, perioden % 70% 60% 50% 40% 30% 20% 10% 0% Berner sennen Rottweiler Golden Labrador Jämthund Serie1 74% 66% 58% 61% 17% Före 2005 finns under 100 röntgade hundar per år Fr o m 2009 finns runt röntgade per år (av födda årligen) Andel röntgade perioden är 33 %

49 Andel Fenotypisk trend för ED hos jämthund 100,0 90,0 80,0 70,0 60,0 50,0 40,0 30,0 20,0 10,0 0,0 Fenotypisk trend ED, jämthund u.a. grad 1-3

50 Genomsnittligt ED-index Inkluderar hundar med preliminärt kullindex för ED samt eget undersökningsresultat i SKKs databas. Ras Antal Index ED SD Min Max Berner sennenhund ,5 6,9 68,5 109,9 Rottweiler ,6 7,9 70,2 114,9 Golden retriever ,2 8,1 63,5 115,8 Labrador retriever ,7 7,7 57,3 110,4 Jämthund ,4 6,3 65,1 110,9 Indikerar positiv utveckling över tid

51 Spridning i ED-index för jämthund

52 Medelfel ED-index hur säkra är skattningarna? Materialet omfattar hundar med preliminärt kullindex för ED samt eget undersökningsresultat i SKKs databas. Ras Antal Medelfel HD SD Min Max Berner sennenhund ,4 0,3 8,1 12,2 Rottweiler ,5 0,2 8,5 12,8 Golden retriever ,6 0,3 7,3 12,8 Labrador retriever ,7 0,3 7,0 12,8 Jämthund ,7 0,3 11,2 14,1 Medelfelet påverkas av: - Arvbarheten för ED i respektive ras - Mängden information om ED-status hos släktingar

53 Avelsanvändning och ED-index - hänsyn till preliminärt kullindex? Genomsnittligt preliminärt kullindex för ED, antal och andel hundar med preliminärt kullindex samt kullindex under 100 Jämthund Födelseår Antal födda Antal med prel.index Andel med prel. index Genomsnitt prel. index Antal med prel. index under 100 Andel med prel. index under ,1% 101, ,6% ,0% 101, ,5% ,2% 101, ,4% Total/medel ,1% 101, %

54 Preliminärt kullindex ED genomsnitt fördelat på ED-status Data omfattar hundar med preliminärt kullindex samt eget ED-resultat. Majoriteten av hundarna är födda under perioden 2013 till Jämthund ED-grad Antal Andel Prel.index ED ED-index u.a ,3% 102,3 102,6 Grad ,2% 101,2 88,0 Grad ,3% 101,5 79,4 Grad ,2% 102,0 73,1

55 Preliminärt kullindex under/över 100 fördelning ED-status Jämthund ED-grad Preliminärt kullindex ED u.a Totalt ED (grad 1-3) Andel ED (grad 1-3) Under ,6% Över ,5% Risken för ED (grad 1-3) är större om kullen har ett preliminärt kullindex under 100.

56 Parningskombinationer ED och genomsnittligt preliminärt kullindex Jämthund Parningskombination Antal Andel Prel.index ED u.a. * u.a ,8% 102,4 u.a. * grad ,7% 94,8 u.a. * grad ,5% 91,6

57 Planer och förhoppningar för framtiden HD-/ED-index i fler raser, tidigast 2018 Karelsk björnhund tänkbar för HD-index, på gränsen antalsmässigt Mentalindex för fler raser (i första hand brukshundraserna) Utbyte av data mellan nordiska länder, skulle möjliggöra nordiska index Internationellt forskningsprojekt om avelsvärdering

58 Mer information på skk.se!

59 Informationsartikel om index