Index för HD och ED Ett nytt verktyg i avelsarbetet

Transkript

1 Index för HD och ED Ett nytt verktyg i avelsarbetet Foto: Åsa Lindholm Sofia Malm

2 Vad är HD och ED? Två av de vanligaste ärftliga defekterna hos hund Tillväxtrubbningar i skelettet, orsakar artros i leden Kostsamt för hundägare Skattningar av arvbarheten varierar från runt 20% till 60%

3 Åtgärder för bättre ledhälsa Nivå 1: Centraliserad avläsning och registrering av röntgenresultat för HD och ED (screening) Nivå 2: Obligatoriskt med känd HD/ED status för föräldradjur Nivå 3: Endast hundar med normala höfter (A eller B) respektive armbågar får användas i avel Avelsprogram baserade på fenotypselektion

4 Non-affected (%) Har selektionen varit effektiv? Andelen hundar med normala höftleder har inte ökat nämnvärt Rottweiler Bernese Mountain Dog Birth year

5 Varför behövs index? Begränsade möjligheter att bedöma skillnader i höftledens kvalitet för HD-fria hundar Fenotypen (röntgenresultatet) påverkas av olika icke ärftliga faktorer (miljöfaktorer) Information enbart om individens egen fenotyp är ett osäkert mått på dess genotyp Hänsyn till information från släktingar kan systematiseras i ett HD-/ED-index

6 Varför behövs index? Röntgenundersökningen kan inte mäta den underliggande genetiska variationen A B C D E

7 Röntgenresultatet för HD ger information om senare kliniska problem och avlivning Kumulativ sannolikhet för en vet.vårdsskada, åtta år efter röntgen Ras Normal/ lindrig HD status Måttlig Kraftig Berner sennenhund 1.4% 23.5% 30.1% Schäfer 2.0% 19.3% 47.5% Golden retriever 0.5% 3.2% 26.4% Labrador retriever 1.3% 8.6% 17.9% Rottweiler 0.6% 10.9% 47.1%

8 Arvet har stor inverkan En stor del av variationen i HD-/ED-status kunde förklaras av genetiska skillnader goda möjligheter till förbättring genom avelsarbete HD och ED orsakas inte av samma gener avel mot HD kan inte förväntas minska förekomsten av ED, och vice versa

9 Arvet har stor inverkan Ras HD ED Rottweiler Berner sennenhund Golden retriever Labrador retriever Flatcoated retriever

10 Avelsvärdering med index Simultan skattningsprocess, statistisk analys (BLUP = Best Linear Unbiased Prediction) Utnyttjar all tillgänglig information från släktingar Eget resultat Föräldrar (och indirekt övriga släktingar) Avkomma Korrigerar för icke ärftliga faktorer (systematiska miljöeffekter)

11 Avelsvärdering med index Effekter i modellen: Kön Födelsemånad Undersökningsår Sederingssubstans (HD) Ålder vid röntgen Klinik*år Hund (genetisk effekt) Residual (övrigt)

12 Vad menas med avelsvärde och index? Avelsvärde: mått på individens nedärvningsförmåga Index: uttrycker det skattade avelsvärdet i förhållande till genomsnittet i rasen (referenspopulationen*) * svenska hundar födda , ändras årligen. INDEX: 100 genomsnittet i referenspopulationen > 100 förväntas lämna avkommor med bättre HD/ED status än genomsnittet < 100 förväntas lämna avkommor med sämre HD/ED status än genomsnittet

13 Spridningen i avelsvärden Standardavvikelsen (SD) för index ca 10, beroende på den genetiska variationen % SD 2SD Skattat avelsvärde för HD/AD

14 Skattning av HD-/ED-index medför: Ökad säkerhet i avelsvärderingen och möjlighet att skilja icke dysplastiska hundar åt Möjlighet att jämföra djur oberoende av t ex ålder vid röntgen, kön etc. Möjlighet att skilja på genetisk och fenotypisk trend

15 Hundar med samma röntgenresultat får olika HD-index E D C B A Skattat avelsvärde för HD

16 Index i Avelsdata Index redovisas för varje hund Veterinärdata (aktuellt index) Kull/helsyskon (preliminärt kullindex samt aktuellt index) Kullar och avkommor (preliminärt kullindex samt aktuellt index) Index redovisas för varje ras under Hälsa Referenspopulationen (HD status och medelindex) Medelvärde (genetisk trend) Preliminärt index redovisas vid provparning

17 Vilka hundar får index publicerat? Hundar födda från och med år 2000 Hunden själv är undersökt Utländska hundar krav på säkerhet (medelfel) i skattningen Information om medelfelet i skattningen publiceras tillsammans med indexet Foto: Åsa Lindholm

18 Säkerhet och medelfel Används som mått på hur säkert det skattade avelsvärdet är Arvbarhet: 0.40 Säkerhet med enbart eget resultat: 0.63 Säkerhet Medelfel* *För standardavvikelse = 15

19 Index är inget statiskt värde Ny information i form av röntgenresultat tillkommer Mer information högre säkerhet (lägre medelfel) Rutinmässig uppdatering 1 gång/vecka (varje helg)

20 Tool-tip för Index HD-/ED-index är en skattning av hundens avelsvärde för HD respektive ED. Rasens (referenspopulationens) genomsnittliga index är 100. Högre värden motsvarar bättre index. För mer information om index se (i) knappen i övre vänstra hörnet.

21 Tool-tip för Medelfel Medelfelet är ett mått på säkerheten i det skattade indexet och anger inom vilket intervall (± medelfelet) hundens framtida HD-/ED-index med största sannolikhet kommer att ligga. Ett mindre medelfel indikerar ett säkrare index. För mer information se (i) knappen i övre vänstra hörnet.

22 Tool-tip för Preliminärt kullindex vid parning Preliminärt index för kullen beräknas som föräldradjurens genomsnittliga index för HD/ED vid parningstillfället, dvs som (index mor + index far)/2. Preliminärt index beräknas för kullar där båda föräldradjuren har ett indexvärde. För mer information om index se (i) knappen i övre vänstra hörnet.

23 Tool-tip för Preliminärt index vid provparning Preliminärt index beräknas som genomsnittet av föräldradjurens index, d v s (index far + index mor)/2. Preliminärt index bör vara större än 100.?

24 Obs ervandum vid provparning Varningstriangel för provparningar i raserna rottweiler och berner sennenhund där HD index < 100: Parningen följer inte SKKs rekommendation att föräldradjurens genomsnittliga HD-index vid parningstillfället (preliminärt index för kullen) ska vara större än 100.

25 Referenspopulationen Ska representera den genetiska nivån för HD/ED i den svenska populationen av aktuella hundar Genomsnittligt index i referenspopulationen sätts till 100 Omfattar hundar födda år n-6 till n-2 där n är aktuellt år (dvs för år 2012 hundar födda ) Inkluderar endast hundar med svenskt ursprung

26 Medelvärde HD-/ED-index Visar genomsnittligt HD-/ED-index för hundar födda respektive år Inkluderar hundar med publicerat index Visar den genetiska trenden från år 2000 Stigande kurva innebär en förbättring av genetisk nivå för HD/ED över tid, och vice versa

27 Index i avelsprogrammet Avelsurvalet bör baseras på indexvärdet! Förändring av nuvarande hälsoprogram för HD (nivå 3) i raser för vilka index införs Hundar med HD-status D eller E utesluts ur avel För övriga bör parningskombinationens HD-index vara bättre än genomsnittet i rasen (>100)

28 Index i avelsprogrammet HD-/ED-index bör inkluderas som en del i RAS Strategi för hur index ska användas behövs Selektionsintensiteten beror på vilka andra egenskaper som ingår i avelsmålet samt på populationsstrukturen Gör en konsekvensanalys innan restriktioner införs Hunden består av mer än höfter och armbågar!

29 Index för HD och ED i andra länder Finland: Index för HD och ED infördes år 2002, skattas idag för HD i 35 raser och ED i 5 raser. Uppdateras 6 ggr/år Norge: Index för HD infördes år 2008 för 32 raser. Uppdateras 4 ggr/år Danmark: Nya index för HD (BLUP) infördes år 2010, skattas för 25 raser. Uppdateras varje månad Tyskland: Index för HD sedan flera år, bl a för schäfer. OBS omvänd skala jämfört med nordiska länder

30 Index för HD och ED i andra länder BLUP-metoden används, den statistiska modellen skiljer sig något åt mellan länderna Indexvärdet och säkerheten i skattningen publiceras på webben Medel = 100 men standardavvikelsen skiljer sig åt Definitionen av referenspopulationen skiljer sig åt Den genetiska nivån kan vara en annan Indexvärden är inte jämförbara mellan länder!

31 Arbetsgång och tidsplan (fas II) Städning av existerande dubbletter samt rutiner för att undvika nya Genetiska analyser av HD och ED i fler raser Förslag på ytterligare raser som bör få index för HD (och ED) Dialog med ras- och specialklubbar Testkörningar Möjligen lansering av index för ytterligare några raser från årsskiftet 2012/13

32 För vilka raser kan index bli aktuellt? Tillräckligt många röntgade Rasen har krav på känd HD-/ED-status Variation i HD-/ED-status Andra faktorer: Hur omfattande är problemet i rasen? Vilken är den kliniska betydelsen av HD/ED i rasen?