5. Transkriptionell reglering OBS! Långsam omställning!



Relevanta dokument
Cellens energivaluta är främst ATP adenosintrifosfat. Finns även andra analoger till ATP, t ex UTP uridintrifosfat där kvävebasen adenin bytts mot

Integrerad signaltransduktion

Maria Nyström Jessica Leander Louise Danielsson. G-proteinet Ras. 3 juni Handledare: Hans Eklund

Svar: 3. a) Vid enzymkatalys binder enzymet in substratet/substraten till aktiva ytan. Närhet och orientering är förutsättning för katalys.

Signaltransduktion. Signalling by the membrane. Fosfatidylinositol och sekundära budbärare CMB

CELLSIGNALERING CELLSIGNALERING. alla levande celler tar emot och skickar signaler

Cellbiologi: Intracellulär sortering och cellsignalering

Cellen och biomolekyler

Tentamen i Biokemi 2, 7 juni Hur samverkar katabolismen och anabolismen i en cell? Vad överförs mellan dessa processer?

Anatomi -fysiologi. Anatomy & Physiology: Kap. 18 The endocrine system (s ) Dick Delbro. Vt-11

Översikt metabolismen

Citronsyracykelns reaktioner sker i mitokondriematrix. Mitokondrierna kan sägas vara cellens kraftstationer p g a den stora produktionen av ATP.

Styrning och samordning (kontroll och koordination) Nervsystemet vs hormonsystemet

Lite basalt om enzymer

Förläsningens innehåll. Cellsignalering och signaltransduktion. Cellsignalering

Delprov Dugga med svarsmallar Biokemi BI0968, 8:e dec 2008, Max poäng = 50 p. Preliminära betygsgränser: 3 = 27p; 4 = 35p; 5 = 43p.

Enzymer Farmaceutisk biokemi. Enzymet pepsin klyver proteiner i magsäcken till mindre peptider

Sluttentamen Biokemi BI1032, 14:e januari 2010, Max = 100 p. Preliminära gränser: 3 = 55p; 4 = 70p; 5 = 85p.

Översikt metabolismen

1. a) Markera polära och icke-polära delar i nedanstående molekyl. Vilken typ av ämne är det, och vad heter molekylen? (2p)

Resultat:... (Cellbiologi:... Immunologi...) Betyg...

Sluttentamen Bke2/KE0003, 28:e Oktober 2004, Max poäng = 89 p. Preliminär gräns för godkänd = 48 p (54 %).

Transkription och translation. DNA RNA Protein. Introduktion till biomedicin Jan-Olov Höög 1

Transkription och translation = Översättning av bassekvensen till aminosyrasekvens

Hierarkisk proteinstruktur. Hierarkisk proteinstruktur. α-helix Fig 3-4. Primärstruktur Fig 3-3

Frå n åminosyror till proteiner

KOMMENTARER TILL KAPITEL 7 OCH 8. Den centrala dogmen är gemensam för eukaryoter och prokaryoter.

Sluttentamen Bke2/KE0003, 29:e Oktober 2003, Max poäng = 94 p. Preliminär gräns för godkänd = 50 p (53 %).

Signaltransduktion och Receptorfarmakologi. Signaltransduktion och Receptorfarmakologi. RTE-Modellen

Sluttentamen Biokemi KE7001p3, 20 mars 2006, Max poäng = 75 p. Slutlig gräns för godkänd = 38 p (51 %).

Sluttentamen Biokemi KE7001p3, 15:e mars 2007, Max poäng = 76 p. Slutlig gräns för godkänd = 36 p (47 %).

Proteiner. Biomolekyler kap 7

Institutionen för Laboratoriemedicin

Proteiner. Kap 3,

Användning av kol och energikällor

Proteiner. Biomolekyler kap 7

CELLSIGNALERING CELLSIGNALERING. alla levande celler tar emot och skickar signaler

Från DNA till protein, dvs den centrala dogmen

TENTAMEN I MEDICINSK BIOKEMI (10 hp)

Sluttentamen Biokemi KE7001p3, 22 mars 2005, Max poäng = 70 p. Preliminär gräns för godkänd = 37 p (53 %).

Så började det Liv, cellens byggstenar. Biologi 1 kap 2

Övningstentafrågor i Biokemi, Basåret VT 2012

Från DNA till protein, dvs den centrala dogmen

Metabolism och energi. Hur utvinner cellen energi från sin omgivning? Hur syntetiserar cellen de byggstenar som bygger upp dess makromolekyler?

Medquiz Nutrition, metabolism & elimination HT 2012 MEDQUIZ. T2 Nutrition, metabolism & elimination

Svarsmall Tentamen NME Termin 2, 22 november 2013

STOCKHOLMS UNIVERSITET. Institutionen för biologisk grundutbildning. Tentamen i Molekylär cellbiologi 10 p Namn: _.. Personnummer:.

Biologi 2. Cellbiologi

Blodsockret regleras av insulin och glukagon. Niklas Dahrén

Omtentamen NME Termin 1 vt / (totalpoäng 47 p)

Tenta 1 Cellbiologi ht Grundbegrepp

Tentamen. Kurskod: MC1004. Medicin A, Molekylär cellbiologi. Kursansvarig: Christina Karlsson. Datum Skrivtid 4h

Tentamen NMET2 VT2015 (17/4 2015) (Totalpoäng 55 p)

Rättningsmall fråga 1: a) b) mellan N och Ca (0.5p); Ca och C (0.5p). c) vid ph 5: NH COOH (0.5p); vid ph 9: NH COO - (0.

hour Metabolism. Ett arbete i Biokemi kursen vt Sofia Bertolino Annlouise Mickelsen

Kursbok: The immune system Peter Parham

Instuderingsfrågor till Cellbiologi av Charlotte Erlanson-Albertsson och Urban Gullberg

Kapitel Var är vi i kursen???

Tentamen. Lycka till! Medicin A, Molekylär cellbiologi. Kurskod: MC1004. Kursansvarig: Christina Karlsson. Datum Skrivtid 4h

Hur celler får energi från föda (Alberts kap. 13) Introduktion

Biologiska membran Kap 10 fig10-1, 15, 18, 19 & med tillhörande beskrivningar. Övrigt är repetition.

Biomolekyler & Levande organismer består av celler. Kapitel 3 & 4

ENDOKRINOLOGI. Endokrinologi. Endokrinologi. Människokroppen Kap 6 sid

Protein. Struktur. Enzymer. Transport. kanaler och pumpar PROTEINER. Hormoner. syrabasbalans. Antikroppar. Vätskebalans

Insulin för muskeluppbyggnad OCH fettförbränning

Receptorer - tyrosinkinas

Proteiner Äggvitan består av proteinet ovalbumin. Farmaceutisk biokemi. Insulin är ett proteinhormon. Gly. Arg. Met. Cys. His. Gly.

Modifierat av ÅRö , ÅRö+BiA VÄTTERNRUNDAN. Seminarieuppgifter i medicinsk kemi för tandläkarstuderande seminarium 4-5

CELLKÄRNAN INNEHÅLL CELLKÄRNAN. cellkärnan

Tentamen i Medicinsk kemi för biomedicinare 2010:

Blodsockret regleras av insulin och glukagon. Niklas Dahrén

Proteinernas uppbyggnad, funktion och indelning. Niklas Dahrén

Proteinstruktur samt Hemoglobin

Grupp: Pyrola Sandberg, Hanna Norlin och Hanna Arvidsson Kurs: Biokemi VT 2003 Inlämningsdatum: Handledare: Hans Eklund

Felveckning och denaturering av proteiner. Niklas Dahrén

Neuronens Fysiologi 1

Medicin A, Fysiologi med anatomi och immunologi 15hp (prov 0101) Kurskod: MC1032. Kursansvarig: Gabriella Eliason. Totalpoäng: 83p

Aminosyror ökar träningseffekten

Medicin A, Medicinsk temakurs 2, 30 högskolepoäng Tema Nutrition/Metabolism/Elimination

Molekylärbiologins centrala dogma

Receptorer - kinaser. Receptorer med kinas aktivitet. Cellsignalering. Celler är beroende av olika signaler (A-G) som kommer utifrån

VI MÅSTE PRATA MED VARANDRA CELLENS KOMMUNIKATION

Tentamen NME T2 (datum: 22/ ) maxpoäng (84p)

Svar till övningstentafrågor i Biokemi, Basåret VT 2012

Cellcykeln. Cellcykelreglering. Signaler för reglerad celldelning. Skall cellen dela sig på nytt? Molekylär kontroll av cellcykeln CMB

Intracellulära organeller, proteinmodifiering och transport, endo/exocytos Kap10 + delar av kap 13

RNA och den genetiska koden

Farmakodynamik och Farmakokinetik

ATP. Adenosin-Tri-Phosfat Utgör cellernas omedelbara bränsle Kroppens ATP-förråd: g Dygnsbehov: ~75 % av kroppsvikten

Träningsfysiologi. Energi. Kolhydrater. Fett MUSKELGLYKOGEN UNDER ARBETE. Korsbryggecykeln. Snabb tillgång och lätt för cellerna att använda

2. Nämn fyra mekanismer varmed enzymaktivitet kan regleras och förklara i korthet vad de innebär.

RNA-syntes och Proteinsyntes

Omtentamen Läkarutbildningen T1:B vårterminen 2006 Kodnr:

Fig 1-29 Alla celler har utvecklats från samma urcell för ca 3,5 miljarder år sedan Fem kungadömen och Tre domäner

Proteinstruktur och Hemoglobin

Biologisk katalysator

Olika fettsyrors påverkan på insulinresistensen. Niklas Dahrén

Cellens metabolism (ämnesomsättning)

Transkript:

Reglering: 1. Allosterisk reglering Ex. feedbackinhibering en produkt i en reaktionssekvens inhiberar ett tidigare steg i samma sekvens 2. Olika isoformer i olika organ 3. Kovalent modifiering Ex. fosforylering 4. Proteolytisk aktivering Ex. zymogenaktivering vissa enzymer bildas som inaktiva förstadier 5. Transkriptionell reglering OBS! Långsam omställning!

Kovalent modifiering: Två typer: REVERSIBEL oftast fosforylering aktiviteten sätts på och stängs av IRREVERSIBEL Ex. koppling av ubiquitin till proteiner som ska brytas ner koppling av lipider till vissa proteiner för att de ska fästa i plasmamembranet Fosforyleringar: Aminosyror som innehåller hydroxylgrupp i sin sidokedja kan fosforyleras: - serin - treonin - tyrosin Ett enzym som katalyserar fosforylering av ett annat protein kallas KINAS. Ett enzym som katalyserar defosforylering av ett annat protein kallas FOSFATAS.

Hur kan fosforylering/defosforylering vara så effektivt när det gäller att reglera ett enzyms aktivitet? Fosforylering två negativa laddningar införs i strukturen de elektrostatiska interaktionerna inom proteinet störs ändrad proteinstruktur AKTIVITETEN PÅVERKAS En fosfatgrupp kan bilda tre eller flera vätebindningar förändrad struktur AKTIVITETEN PÅVERKAS ATP är donator av fosfatgruppen energi tillförs jämvikten mellan proteinets olika konformationer kan förskjutas AKTIVITET- EN PÅVERKAS

Hormoner: hormoner (grekiska hormō n, presens particip av horma ō 'sätta i rörelse', 'pådriva', 'egga'), molekyler som bildas och frisätts från endokrina celler och som utövar en biokemisk verkan på andra celler. www.ne.se/hormoner Exempel på hormoner som påverkar metabolismen: Adrenalin (epinefrin) Tyrosinderivat Bildas i binjuremärgen Stimulerar hjärtmuskeln och påverkar glykogen- och fettmetabolismen

Glukagon Polypeptidhormon 29 aminosyror Bildas i bukspottkörteln Stimulerar glykogennedbrytning hämmar glykogensyntes Stimulerar fettsyranedbrytning hämmar fettsyrasyntesen Insulin Polypeptidhormon 51 aminosyror Bildas i bukspottkörteln Stimulerar glykogensyntes hämmar glykogennedbrytning Stimulerar fettsyrasyntes hämmar fettsyranedbrytning Tillsammans ser glukagon och insulin till att blodsockernivån hålls inom rimliga gränser:

Signaltransduktion: Ett led av händelser som leder fram till ett fysiologiskt svar Grundläggande principer: 1. Frisättning av primary messenger Ex. hormon 2. Mottagning av den primära signalen RECEPTOR Hormonet fungerar som en ligand till en receptor. När liganden binder till receptorn förändring av receptorns tertiär- och kvartärstruktur bildande av second messenger 3. Frisättning av second messenger Vanliga: camp, cgmp, Ca 2+, inositol- 1,4,5-trisfosfat (IP 3 ), diacylglycerol (DG) Konsekvenser: - Amplifiering: en receptor flera second messengers - Begränsat antal olika second messengers frisättning av en messenger kan ske genom olika stimuli och signaler kan misstolkas

4. Aktivering av effektorer som ger fysiologiskt svar Ex. pumpar, enzymer, genaktivering. 5. Terminering Signalen måste nollställas och effektorerna återgå till ursprunglig aktivitet så att cellen blir mottaglig för nya signaler.

Hur stängs signalen av? G α -enheten har GTPas-aktivitet d v s kan själv omvandla GTP till GDP. G α -GDP associeras återigen med G β G γ -enheten och därmed är G-proteinet inaktivt till nästa aktiveringssignal kommer. Även receptorn måste nollställas : - Liganden dissocierar - Inbindning av proteinet arrestin till receptorn

AMPLIFIERINGAR * Varje receptor kan aktivera många G-proteiner G-proteinerna aktiverar adenylatcyklas * Varje adenylatcyklas bildar flera camp Två camp aktiverar PKA * Varje PKA kan fosforylera flera proteiner KASKAD!!!!

Glykogen: Grenad glukospolymer med förgrening vid ca var tionde glukosenhet Varför viktigt med förgreningar? Många angreppspunkter vid syntes och nedbrytning Löslighet Glykogen finns i musklerna - lättåtkomlig energikälla och i levern - reglerar blodsockerhalten

Hormonell reglering av glykogenmetabolismen: Generellt: Enskilda celler: Allosteriska effektorer Hela organismens bästa: Hormonell reglering Nedbrytning: Glykogen n + P i glukos-1-fosfat + glykogen n-1 Enzym: Glykogenfosforylas Glykogenfosforylas finns i två former: aktivt fosforylas a inaktivt fosforylas b I vilande muskler finns främst fosforylas b som omvandlas till fosforylas a genom fosforylering efter hormonsignal för att ge energi för muskelarbete. (Fig. 21.16) Avstängning: Energibehoven är täckta Hormonsignalen har ebbat ut Fosforylaskinas och glykogenfosforylas defosforyleras av ett fosfatas inaktivering (fosforylas b återbildas)

Syntes: UDP-glukos + glykogen n UDP + glykogen n+1 Enzym: Glykogensyntas Glykogensyntaset finns också i två former: aktiv a-form inaktiv b-form aktiv a-form inaktiv b-form FOSFORYLERING Notera; Nedbrytning och syntes sker ALDRIG samtidigt! Samma hormoner som ser till att nedbrytningen aktiveras stänger av syntesen. Proteinfosfatas 1 (PP1) spelar en nyckelroll för att ändra vilken process som är aktiv.