Stockholms universitet Version: 1702016 Inst. för biologisk grundutbildning OBS! Schemaändringar kan förekomma www.big.su.se Schedule BL5001 START: Tuesday 21 March, kl. 10.00 in xxx Kursansvarig/course leader part I: Conservation at the gene and population levels 7.5 hp: Naomi Keehnen NK naomi.keehnen@zoologi.su.se Teachers: Anastasia Andersson AA anastasia.andersson@zoologi.su.se Sara Kurland SK sara.kurland@zoologi.su.se Peter Pruisscher PPR peter.pruisscher@zoologi.su.se Alyssa Woronik AW alyssa.woronik@zoologi.su.se Patricia Pečnerová PPA patricia.pecnerova@nrm.se Johanna von Seth JS johanna.vonseth@nrm.se Kursledare och lärare del II: Bevarande på art- och ekosystemnivå 7.5 hp: Kristin Löwenborg KL kristin.lowenborg@zoologi.su.se Teachers: Marianne Haage MH marianne.haage@zoologi.su.se Kristoffer Hylander KH kristoffer.hylander@su.se Guest lecturer Course structure The course consists of two parts: Part I: Conservation at the levels och genes and populations 7.5 ECTS Part II: Conservation at the levels of species and ecosystems 7.5 ECTS To pass the whole course you need to pass both parts. Language: The course will be given partly in English and partly in Swedish. Location: Lectures: xxx Svante Arrhenius v. 20C Norra husen Computer labs: xxx Svante Arrhenius v. 18B Norra husen (unless otherwise is stated) Literature part I: Frankham, R., Ballou, J.D., Briscoe, D.A.2004. A primer of conservation genetics. Cambridge University Press. Literature part II: Will be handed out during the course. Examination: Part I requires pass on five obligatory items (see below) + at the lowest grade E on the written exam. Part II: All excursions are obligatory. The lectures are an important part of the course, but not obligatory. Examination: Part I: written exam xxx kl. 9.00 12.30 Part II: written exam xxx kl. 10.00-14.00
Do not forget to register one week before the exams! Information about anonymous exams is found at http://www.big.su.se/_html/utbildningar/index_tentor.shtml Re-examination: Part I: xx 13.00-16.30 Part II: xx Obligatory: The below items are obligatory and must be carried out with grading pass (Godkänd). To pass the whole course you need to pass both parts. Part I: 1. Computer simulation workshop I and II 2. All workshops are obligatory 3. Computer lab pedigreeanalys och bevarandeavel 4. Inlämningsuppgift analys av populationsgenetiska dat 5. Tentamen (betygssätts i 7-gradig skala) Part II: 1. Excursions. 2. Group project 3. Individual project 4. Assignments 5. Written examination (graded according to a 7 point scale) Course website: https://sites.google.com/site/conbio2017/ Här kommer all information om kursen finnas, handouts, uppgifter, information. Inloggningsuppgifter till intern-sidan erhålls vid kursstart. Part II: Updates and information will be published on the Mondo-site. For current information regarding the schedule, always check Time Edit Betygskriterier: Övrigt: För att kursens ska godkännas krävs: 1. Godkänt på samtliga obligatoriska moment (se ovan). 2. Minst betyget E på den skriftliga tentamen i bevarande på gen- och populationsnivå 3. Minst betyget E på den skriftliga tentamen i bevarande på art- och ekosystemnivå Slutbetyget (A-E) på kursen bestäms av resultaten på skrivningarna. Betygsskala för A-F (används för att gradera de två skriftliga proven): För betyget A krävs minst 95% av den maximala poängsumman. För betyget B skall studenten ha minst 85% av den maximala poängsumman För betyget C skall studenten ha minst 75% av den maximala poängsumman För betyget D skall studenten ha minst 65% av den maximala poängsumman För betyget E skall studenten ha minst 60% av den maximala poängsumman För betyget Fx skall studenten ha minst 50% av den maximala poängsumman Vid mindre än 50% av den maximala poängsumman ges betyg F A = utmärkt B = mycket god C = god D = tillfredsställande E = tillräcklig Fx = otillräcklig F = helt otillräcklig Båda Fx och F är underkänt, vilket innebär att studenten måste göra om hela provet Kursen kräver självstudier på ej schemalagd tid. Kursplan och övrig information om kursen finns på hemsidan: https://sites.google.com/site/conbio2017/ (moment 1) samt på xxxx(moment 2).
Moment 1: Conservation at the level of genes and populations Week 12 Tuesday 10.00-12.00 xxxx Introduction to the course. NK 21 March 10.00-12.00 xxxx Lecture: Genetics and Conservation Biology NK 22 March (Chapter 1) 10.00-12.00 xxxx Lecture: Genetic diversity NK 23 March (Chapter 2) 13.00-15.00 Räknestuga 1/Exercises 1 JS Friday 10.00-12.00 xxxx Lecture: Evolutionary Genetics AW 24 March (Chapter 3) Week 13 10.00-12.00 xxxx Lecture: Population genomics 27 March (Chapter 3, continued) Tuesday 10.00-12.00 Lecture: Genetics & Extinction PPA 28 March (Chapter 5) 10.00-12.00 xxxx Lecture: Genetic consequences of small PPR 29 March population size (Chapter 4) 13.00-15.00 xxxx Computer simulation workshop: Genetic drift I & II PPR 10.00-16.00 xxx Lecture & Workshop Ancient DNA & Conservation PPA 30 March Friday 11.00-16.00 xxx Workshop on conservation planning PPR 31 March Week 14 10.00-12.00 xxxx Lecture: Resolving taxonomic uncertainties NK 3 April (Chapter 6) Tuesday 10.00-12.00 xxxx Workshop: Current work in conservation genomics NK 4 April Full day Studiebesök Sötvattenlab Drottningholm Joep de Leeuw 5 April Full day xxxx Ev. studiebesök räkna med fullt schemalagd dag. Studiebesök 6 April Kolmården (datum ej klart) Vargtema-dag (datum ej klart) Friday 10.00-12.00 xxxx Lecture: Molecular genetics in forensics PPA 7 April (Chapter 9) 13:00-15:00 Räknestuga 2/Exercises 2 SK Week 15 Easter holiday!
Week 16 17 April Red day Tuesday 10.00-12.00 xxxx Föreläsning: Genetic principles for captive breeding AA 18 April (Chapter 8) 10.00-11.00 xxxx Föreläsning: Studying genetic variation in the wild AA 13.00-15.00 xxxx Datorlab: Pedigree-analys och bevarandeavel AA Inläsning, räkneövningar, etc. Friday 09.00-10.00 xxxx Föreläsning: Fallstudier laxartad fisk SK 21 April 10.15-12.00 xxxx Räknestuga 3/Exercises 3 SK Week 17 24 April Tuesday 25 April 26 April 27 April Inläsning and hand in all räknestuga Inläsning Inläsning Inläsning Friday 9.00-12.30 Written exam: Conservation at the levels of genes 28 April and populations
Moment 2: Conservation at the level of species and ecosystems Week 18 Day Time Room Innehåll Teacher 1 May Red day Tuesday 10.00-12.00 Introduction to conservation ecology KL 02 May 10.00-12.00 Conservation of mammals MH 03 May 12.00-13.00 Conservation projects: handing out seminar assignments KL 04 May /seminar preparations Friday 10.00-12.00 Conservation in forestry and agriculture KH 05 May 08 May /seminar preparations Tuesday 10.00-15.00 Seminars: Presentations of assignments KL 09 May Information on projects. 10.00-12.00 Laws and conventions. Assignment. KL 10 May 10.00-12.00 Funding of conservation projects. Assignment. KL 11 May Friday 12 May Excursion: Elecrofishing and inventory KL 15 May of Stone Loach (Barbatula barbatula) Bertil Borg Tuesday 16 May 17 May 18 May Friday 10.00-12.00 Literature seminar: Ethics and conservation KL 19 May 13.00-16.30 Re-examination part I 17.00 Deadline submission of project reports 22 May Tuesday 10.00-12.00 Guest seminar: Amphibian conservation in practice 23 May 24 May 25 May Red day Friday 10.00-12.00 Presentations of projects KL 26 May
10.00-12.00 Conservation of ecosystems 29 May Tuesday 30 May 31 May 01 June Friday 10.00-14.00 Written examination 02 June Friday 10.00-14.00 Re-examination 09 June