Läshänvisningar till UTVECKLING - från ägg till embryo våren 2018

Relevanta dokument
Ägg till embryo Dugga Platsnummer VIKTIGT ATT DU FYLLER I OCH LÄMNAR IN! TEXTA TACK. Efternamn. Förnamn. Personnummer

IDENTITETSBLAD Dugga

Ägg till embryo Dugga Platsnummer VIKTIGT ATT DU FYLLER I OCH LÄMNAR IN! TEXTA TACK. Efternamn. Förnamn. Personnummer

Ägg till embryo Dugga Platsnummer VIKTIGT ATT DU FYLLER I OCH LÄMNAR IN! TEXTA TACK. Efternamn. Förnamn. Personnummer

Ägg till embryo Dugga Platsnummer VIKTIGT ATT DU FYLLER I OCH LÄMNAR IN! TEXTA TACK. Efternamn. Förnamn. Personnummer

IDENTITETSBLAD Dugga

Molekylärbiologi: Betygskriterier

Rekommendationer för inläsning av läroboken Erlanson-Albertsson C och Gullberg U: Cellbiologi, Studentlitteratur 2007

Cellbiologi. Maria Ankarcrona Nov 2010

Tentamen i Molekylär Cellbiologi 9 p Namn: Personnummer: Plats nr: Inlämnad kl: ID kollad: Poäng: Betyg:

Tentamen. Lycka till! Medicin A, Molekylär cellbiologi. Kurskod: MC1004. Kursansvarig: Christina Karlsson. Datum Skrivtid 4h

Cellen och vävnader. Innehåll. Cellernas storlekar SJSE11 Människan: biologi och hälsa

Från cell till individ. Kap 2

CELLKÄRNAN INNEHÅLL CELLKÄRNAN. cellkärnan

Ägg till embryo Dugga Platsnummer VIKTIGT ATT DU FYLLER I OCH LÄMNAR IN! TEXTA TACK. Efternamn. Förnamn. Personnummer

Cellbiologi. Cellens delar (organeller)

Cellbiologi. Cellens delar (organeller)

Tentamen i Molekylär Cellbiologi 9 p Namn: Personnummer: Plats nr: Inlämnad kl: ID kollad: Poäng: Betyg:

Från cell till individ. Kap 2

Cellbiologi: Intracellulär sortering och cellsignalering

Kunskapsmål ht (reviderade )

Cell och vävnad. Grundämnena består av atomer Antalet protoner i kärnan avgör vilket ämne. En molekyl skapas av ett antal sammanbundna atomer

Delprov l, fredag 11/11,

STOCKHOLMS UNIVERSITET. Institutionen för biologisk grundutbildning. Tentamen i Molekylär cellbiologi 10 p Namn: _.. Personnummer:.

Anatomi-Fysiologi. Fundamentals of Anatomy and Physiology (8. uppl.), kap. 4: Dick Delbro. Vt-11

IDENTITETSBLAD Dugga

Cellen och vävnader. Innehåll. Cellernas storlekar 9/26/2013. RSJD11 Människokroppen: Anatomi, fysiologi, mikrobiologi och farmakologi I

Medicinsk grundkurs. Cellen och genetik. Datum

Cellen. Cellen. Celler. Cellen utgör den minsta strukturella och funktionella enheten i all levande materia. Vår kropp består av ca 70% vatten

Genetik. - cellens genetik - individens genetik. Kap 6

Resultat:... (Cellbiologi:... Immunologi...) Betyg...

DNA-molekylen upptäcktes DNA - varken protein, kolhydrat eller lipid.

Biomolekyler & Levande organismer består av celler. Kapitel 3 & 4

Intracellulära organeller, proteinmodifiering och transport, endo/exocytos Kap10 + delar av kap 13

Kromosomer, celldelning och förökning

CELLKÄRNAN. kap 9 + fig 16.24, s , fig i 4th edition Chromatin: s , th edition. INNEHÅLL

RNA-syntes och Proteinsyntes

Tentamen. Kurskod: MC1004. Medicin A, Molekylär cellbiologi. Kursansvarig: Christina Karlsson. Datum Skrivtid 4h

Den allra första cellen bakteriecellen prokaryot cell

Namn: Personnummer: Plats nr: Inlämnad kl: ID kollad: Poäng: Betyg: SKRIV NAMN PÅ ALLA SIDOR ÄVEN OM FRÅGAN LÄMNAS OBESVARAD.

DEN MINSTA BYGGSTENEN CELLEN

Ägg till embryo Dugga Platsnummer VIKTIGT ATT DU FYLLER I OCH LÄMNAR IN! TEXTA TACK. Efternamn. Förnamn. Personnummer

Cellbiologi. Maria Ankarcrona Nov

Cellen och vävnader. Innehåll. Kursmål SJSF11 Människan: biologi och hälsa

VI MÅSTE PRATA MED VARANDRA CELLENS KOMMUNIKATION

Namn:... Årskurs... Personnummer... Glöm inte skriva namn på immunologidelen också

Instuderingsfrågor till Cellbiologi av Charlotte Erlanson-Albertsson och Urban Gullberg

EMBRYOLOGI. Diploid 4N (Primär spermatocyt/oocyt) MEIOS I Haploid 2N (Sekundär spermatocyt/oocyt) MEIOS II Haploid 1N (Spermatid/oocyt).

Naturvetenskaplig fakultetsnämnd

1. Kombinera följande transportmekanismer med rätt påståenden. Skriv siffrorna 1 6 i tabellen nedan. (3 p) Påståenden

Resultat:... (Cellbiologi:... Immunologi...) Betyg...

Genetik I. Jessica Abbott

Poäng: Godkänt 35 p. Max 70 p.

Cellen och vävnader. Innehåll. Kursmål SJSE11 Människan: biologi och hälsa

Tidiga erfarenheter av arvets mysterier

Lärarhandledning gällande sidorna 6-27 Inledning: (länk) Läromedlet har sju kapitel: 5. Celler och bioteknik

Cellen och biomolekyler

Kodnummer: 1) Beskriv processerna som sker i replikationsgaffel (eng. replication fork)? (3)

Tentamen i Molekylär Cellbiologi

Cell och molekylärbiologi (BL3008) Omtentamen CMB-II (11 hp) Kod: Personnummer: Plats nr: Inlämnad kl: ID kollad: Poäng: Betyg:

CELLDELNING 1 MITOS EUKARYOT CELLDELNING. Eukaryot celldelning. 1. cellcykeln 2. mitos 3. cytokinesis

Resultat:... (Cellbiologi:... Immunologi...) Betyg...

Instuderingsfrågor avsnitten Molekylär genetik och Rekombinant DNA tekniker, MCB

Gener, genom och kromosomer , 6.6 och sid

KOMMENTARER TILL KAPITEL 9 OCH KAPITEL 16

Ladokkod: Tentamen ges för: Gsjuk15v. Namn: (Ifylles av student) Personnummer: (Ifylles av student) Tentamensdatum: Tid:

PROVGENOMGÅNG AVSNITT 1 BIOLOGI 2

Mitokondrier tillverkar ATP - adenosintrifosfat

Omtentamen Läkarutbildningen T1:B höstterminen (14)

LPP Nervsystemet, hormoner och genetik

Transkription och translation = Översättning av bassekvensen till aminosyrasekvens

Apoptos Kap 18. Alberts et al., Essential Cellbiology 4th ed, 2014 Apoptos kap 18, sid

KARLSTADS UNIVERSITET

Kap 26 Nukleinsyror och proteinsyntes. Bilder från McMurry

Schema för BL3008 Cell- och molekylärbiologi 27 hp, HT 2014

Epigenetikens biokemi, eller Kemisk modifiering av DNA och histonproteiner för att styra genuttryck

Celler består till cirka 80 procent av vatten. Resten av vikten är proteiner, fetter, kolhydrater som till exempel socker samt arvsmassan, DNA.

Schema för BL3008 Cell- och molekylärbiologi 27 hp, HT 2018

CELLDELNING, mitos, cellcykelreglering, meios

INSTITUTIONEN FÖR BIOMEDICIN

Genetik II. Jessica Abbott

Tentamen Reproduktion och utveckling, Åke Strids frågor:

Omtentamen Läkarutbildningen T1:B vårterminen 2006 Kodnr:

Kod: Personnummer: Plats nr: Inlämnad kl: ID kollad: Poäng: Betyg: SKRIV DIN KOD PÅ ALLA SIDOR ÄVEN OM FRÅGAN LÄMNAS OBESVARAD.

Använda kunskaper i biologi för att granska information, kommunicera och ta ställning i frågor som rör hälsa, naturbruk och ekologisk hållbarhet.

Från DNA till protein, dvs den centrala dogmen

Tentamen Reproduktion och Utveckling, a) Slidan och cervix innehåller två olika typer av epitelceller. Vilka och vad kännetecknar

Schema för BL3008 Cell- och molekylärbiologi 27 hp, HT 2015

BIMA46, Biomedicin: Molekylär cellbiologi, 10 högskolepoäng Biomedicine: Molecular Cell Biology, 10 credits Grundnivå / First Cycle

NUKLEINSYRORNAS UPPBYGGNAD: Två olika nukleinsyror: DNA deoxyribonukleinsyra RNA ribonukleinsyra

Resultat:... (Cellbiologi:... Immunologi...) Betyg...

Lokal pedagogisk planering för arbetsområdet genetik i årskurs 9

Mutationer. Typer av mutationer

Schema för BL3008 Cell- och molekylärbiologi 27 hp, HT 2015

Från DNA till protein, dvs den centrala dogmen

Planering i genetik och evolution för Så 9 Lag Öst. (Planeringen är preliminär och vissa lektionspass kan ändras)

Kontroll av genuttrycket på transkriptionsnivå

Transkription och translation. DNA RNA Protein. Introduktion till biomedicin Jan-Olov Höög 1

INSTITUTIONEN FÖR MARINA VETENSKAPER

5. Förmåga att använda kunskaper i biologi för att kommunicera samt för att granska och använda information.

Transkript:

CMB Education» Study Programme in Medicine» LasIndex» Lashanvisningarv18 Läshänvisningar till UTVECKLING - från ägg till embryo våren 2018 Läromedel I läshänvisningarna hänvisas till olika läromedel med bokstavsförkortningarna A, M och E. A - Alberts et al. "Essential Cell Biology", fjärde upplaga U - Ulfigs "Embryologi - en kortfattad lärobok", svenska upplagan 2012 E - embryologi sidor på http://www.embryology.ch/indexen.html Introduktionsföreläsningen - första dagen på kursmomentet På introduktionsföreläsningarna tas upp kursmomentets mål, innehåll, upplägg och examination. Streamed video - Discovery Channel - The ultimate guide to pregnancy. Ta gärna tid att titta på den här filmen i början av kursavsnittet - det ger en bra översiktsbild om människans tidigare utveckling hela vägen till födseln. Filmen är ca 50 min lång. Länk till filmen: https://www.youtube.com/watch?v=pgh7--1mvbo Läshänvisningar till "Från ägg till embryo"-föreläsningar Kursmomentet organiseras kring människans utveckling från könsceller till embryo vilket skapar en röd tråd. Upplägget på kursen är också enligt "spaced repetition", vilket ger bättre lärande. "Ägg till embryo"-föreläsningarna är delade i olika block enligt följande: Introduktion till Utvecklingsbiologi och Regenerativ medicin, Gametogenes och Fertilisering. De första veckorna i embryonal utveckling (Veckorna 1-3) Meios och variation, könsbestämning samt Neurulation och veckning. Molekylär utvecklingsbiologi - differentiering av stamceller, extremitetsuteckling, utveckling av kroppsaxlar Regenerativ medicin nu och iframtiden Introduktion till utvecklingsbiologi Centrala concept Grundläggande koncept och terminologi Olika faser i människans utveckling U: 51-52 Introduktion till regenerativ medicin Centrala concept Definition av regenerativ medicin Introduktion till sårläkning som en regenerativ process Gamotegenes och fertilisering Centrala concept Bildning av könsceller A: 645-657, U: 15-22, E: modul 3

Meios och dess olika faser Diploidi och haploidi Tidsskalan i bildning av könsceller Likheter och olikheter i gametogenes mellan män och kvinnor Befruktningens molekylära mekanismer A: 657, U:22-24, E:modul 4 Polyspermi Första fosterveckan Det tidiga embryots celldelningar och vandring från äggledare till livmoder behandlas. Viktiga stadier under denna utveckling är morula- och blastocyst-stadierna. Blastocystens implantation i livmoderväggen beskrivs, liksom problem vid ektopisk graviditet. Centrala koncept Embryots vandring från äggledare till livmoder (morulastadium; blastocyststadium) U: 25-26, E: modul 4 Blastocystens implantation i livmoderväggen U: 26-28, E: modul 5 och 6 Andra fosterveckan Denna föreläsning behandlar den andra veckan i embryots liv. Blastocystens implantation och inväxt i livmoderväggen beskrivs. Föreläsningen tar också upp embryots mer komplexa organisation, där två vävnadsskikt (groddblad) bildas och olika hålrum kommer att bildas och omge embryot. Det tidiga embryots olika celltyper: inre cellmassa, cytotrofoblaster och syncytiotrofoblaster U: 28-31, E: modul 7 Bildandet av lakuner och den tidiga blodcirkulationen U: 30-31 (bilderna), E: modul 7 Bildandet av två groddblad (epiblaster och hypoblaster) U: 28-31, E: modul 7 Bildandet av kroppshålor (amnion, primär och sekundär gulesäck, chorion) U: 28-31 Tredje fosterveckan Denna föreläsning behandlar den tredje veckan i embryots liv. Embryot utvecklas nu från att ha två groddskikt till att få tre olika groddskikt genom en process som kallas gastrulering. De tre groddskikten kallas ektoderm, mesoderm och endoderm och ger upphov till de olika organen och vävnaderna i den vuxna individen. Gastrulering; celler vandrar ned genom primitivstrimman U: 32-38, E: modul 7 Bildandet av de tre groddbladen (endoderm, mesoderm, ektoderm) U: 32-38, E: modul 7 Primitivknottran och bildandet av notokord, embryots mittaxel U: 32-38, E: modul 7 Olika typer av mesoderm: paraxialt, intermediärt, lateralt U: 35, E: modul 7 Bildandet av somiter ur paraxialt mesoderm. Somiternas utveckling till sklerotom, myotom, dermatom U:35 Meios och variation, könsbestämning Meios: skillnader mellan mitos och meios A: fig 19-7 Överkorsningar A:652-655 Könsbestämning Kromosomrubbningar till följd av problem i meios A: 656 U: 58-59 E: modul 11.2 och 11.4 Exempel på utvecklingsstörningar

Downs syndrom Klinefelters syndrom Turners syndrom Neurulation och veckning Denna föreläsning behandlar de processer som gör att ett nervsystem bildas hos embryot (neurulation). Nervsystemet bildas på embryots ryggsida från ektodermet som ett resultat av induktion från det underliggande mesodermet. Från den ursprungliga neuralplattan sluts sedan neuralröret, som kommer att bilda hjärna och ryggmärg. Från en grupp celler på neuralrörets ryggsida vandrar neurallistceller (neural crest cells) ut för att bilda en rad celltyper, bla nerver i det perifera nervsystemet, melanocyter samt många strukturer i ansiktet. Gälbågarna är viktiga strukturer som ligger till grund för ansiktets bildande. Neuralplattan bildas ovanpå notokorden och prekordalplattan U: 39-41, E: modul 7 Neuralröret sluts och bildar hjärna och ryggmärg (det centrala nervsystemet) U: 39-41, E:modul 7 Neurallistceller vandrar ut och differentierar till olika celltyper, bla nervceller, melanocyter, brosk och ben i huvudet U: 39-41, E: modul 7 Bildandet av gälbågar, utveckling av olika strukturer i ansiktet (översiktligt) U: 79 Missbildningar i samband med neurulation U: 69, E: modul 7.3 Embryots veckning, amnionhålans relativa ökning i storlek, gulesäck, navelsträng U: 37-38, E: modul 8 Missbildningar Spina bifida Läpp-, käk- och gomspalt Anläggning av organ Grundlänggande principer för olika organ och vävnader bildas under embryo- och fosterperioden och ur vilka groddskikt de kommer. Principer för induktion och andra interaktioner mellan vävnader som är nödvändiga för att vävnader ska bildas på ett korrekt sätt diskuteras. Missbildningar i samband med organanläggning tas upp under föreläsningarna. Något eller några av följande processer beskrivs översiktligt på föreläsningarna som exempel på organanläggning. På tentamen kommer inte detaljerna att examineras. Bildning av hjärta Bildning av musculoskeletala systemet Bildning av lunga Vasculogenes, angiogenes Bildning av tarm Bildning av njure och inre genitalia, induktion Sår och sårläkning - regenerativ medicin I kursmomentet ingår en primärvårdsplacering där, om möjligt, organiseras möjligheter att se olika typer av sår som är vanligt förekommande på vårdcentraler. På denna föreläsning tas upp cellulära processer som är centrala för alla regenerativa processer i kroppen: tillväxt, cellmigrering, differentiering samt olika typer av interaktioner mellan cellerna. Observera att fokus här är på de cellulära mekanismerna. Kliniska aspekter kring sår och sårläkning tas upp senare under läkarutbildningen.

Efter primärvårdsplacering sker en diskussion/seminarium tillsammans med en sårspecialist där erfarenheterna från primärvården diskuteras. Introduktion till kroppens vävnader Under föreläsningen tas olika vävnadstyper upp översiktligt. En vävnad är en samling celler som i en organism har liknande uppgifter. Ett organ består av vävnader och utgör en yttre eller inre kroppsdel med specifik funktion och form. Föreläsningen är en introduktion till de fyra grundläggande typer av vävnad, som bygger upp alla kroppens organ: 1. Epitelvävnad (yt- och körtelepitel) 2. Bindväv (= stödjevävnad) Egentlig bindväv (connective tissue proper) Fettvävnad Brosk Ben 3. Muskelvävnad Skelettmuskulatur Hjärtmuskulatur Glatt muskulatur 4. Nervvävnad Nervceller (neuron) Gliaceller (stödjeceller) Histologi (histo- = vävnad; -logi = lära) är läran om biologisk vävnad, studerad i ljus- eller elektronmikroskopi och genom histokemi. Med histokemiska metodiker kan vävnad färgas för identifiering av speciella vävnadsstrukturer eller celler. Läshänvisningar till histologi finns här: https://pingpong.ki.se/courseid/5729/content.do?id=3856163 Obs - histologidelen examineras inte i duggan för Utveckling - från ägg till embryo. Utvecklingsbiologins molekylärbiologi Dessa föreläsningar sammankopplar cell- och molekylärbiologisk kunskap med utvecklingsbiologi. Den ger grunden till en förståelse av de processer som ligger bakom utvecklingsbiologiska fenomen. Huvudprinciperna för signalering bör kunnas, men detaljkunskaper kommer ej att efterfrågas. Här kommer vi att åskådliggöra hur transkriptionsfaktorer och tillväxtfaktorer styr utvecklingen. Även kliniska frågor tas upp. Tillväxtfaktorer Receptorer Intracellulär cellsignalering Transkriptionsfaktorer Transgena djur Kroppsaxlar: kraniell-kaudal, dorsal-ventral, höger-vänster Segmentering Hox-gener Extremitetsutveckling

Proximal-distal utveckling, fibroblast growth factor Kraniell-kaudal utveckling Morfogener, Sonic Hedgehog, vitamin-a-syra Regenerativ medicin nu och i framtiden Regenerativ medicin definieras brett som innovativa terapiformer som bygger på förståelse av kroppens utvecklingsbiologiska mekanismer. Renegerativ medicin omfattar olika sätt att reparera, ersätta, eller regenerera skadade celler, vävnader eller organ. Exempel på denna utveckling är t. ex. metoder för att reparera eller ersätta skadad hjärtmuskulatur, hud, delar av nervsystemet eller pankreas hos diabetespatienter. På dessa föreläsningar diskuteras olika aspekter av regenerativ medicin.metoderna för att studera utvecklingsbiologi förfinas mycket snabbt, vilket gör det möjligt att nu studera frågor som genterapi, gendiagnostik och hur människans arvsmassa ser ut i detalj. Många av dessa frågor är etiskt komplicerade. Genterapi Gendiagnostik Kartläggning av den mänskliga arvsmassans utveckling Varför studera olika arter: flugor, maskar, grodor inom utvecklingsbiologi? Stamcellsforskning A:702-712 Sår och sårläkning Den här lektionen kretsar kring sårläkningens mekanismer - vad är "sår", vilka olika typer av sår finns det, hur läker såren. Observera att vi endast examinerar faserna i sårläkning ur ett cellbiologiskt perspektiv. Inga sårtyper examineras. Inför lektionen, fundera på följande: Olika typer av sår har man sett eller hört talas om. Hur vet kroppen om det finns en sår? Läker alla patienter eller sår lika fort? (Individuella skillnader? Ålder?) Finns det skillnader på sår i olika kroppsdelar när det gäller läkning? Vilka typer av sår är svårläkta? Exempel på sår som brukar läka fort? Finns det någonting som man göra för att hjälpa till med sårläkning? Vad händer när ett sår läks? (Cellulära processer) Vad menas med bra läkkött? Finns det på riktigt? Läshänvisningar till genetikföreläsningarna Gener i hälsa och sjukdom - föreläsningar med sjukhusgenetiker Dessa föreläsningar kopplar ihop grundläggande kunskaper i genetik med kliniken. Molekylär medicin på kliniken. Gentester. Genetisk variation i befolkningen, dess uppkomst och betydelse. Genetiska mekanismer vid olika sjukdomar.

Enkla och komplexa genetiska sjukdomar. Cellen, kärnan, kromosomer och DNA (A För generall översikt: sid 1-5, 15-23, och panel 1-2 på sidan 25 med djurcellen. För kromosomer och DNA: 171-184, 236, 495-497) Denna föreläsning ger en översikt av cellens uppbyggnad med fokus på kärnan. Kärnan innehåller många olika typer av molekyler. Förutom DNA och histoner, finns det polymeraser, DNA-reparationssenzymer och proteiner som reglerar genaktivitet eller modifierar RNA. Själva kärnhöljet består av två membranskikt. Specifika processer importerar och exporterar molekyler till och från kärnan. Cellen och dess organeller Kärnans uppbyggnad och funktion Kärnporkomplexets principiella uppbyggnad och roll i nukleocytoplasmatiska transportprocesser DNA-struktur och funktion Kromosomorganisation i cellkärnan Cellcykeln (A: 604-631) Denna föreläsning handlar om cellens reproduktiva cykel där den duplicerar sitt innehåll och delar sig. Detta behövs för att organismen skall kunna växa och utvecklas eller för att reparera skador, eller för förnyelse av vävnader. Cellcykeln och dess olika faser: interfasen, mitosfasen, cytokinesen, restriktionspunkten och kontrollpunkterna (checkpoints) i cellcykeln. Cellcykelns reglering via CDK (cyklin-beroende kinas) och cykliner. Regleringen av mängden cyklin via proteolys. Initiering av Mitos-fas med Mitos-fas CDK. Mitos-fasen, inklusive de olika delstegen. Cohesin och condensin Kärnmembranet under mitos. DNA-replikation (A: 197-211) Alla organismer måste duplicera sitt DNA före celldelning. Denna process kallas DNA-replikation och är mycket exakt, vilket gör att väldigt få fel uppstår i DNA-sekvensen. Begreppen semikonservativ, diskontinuerlig och dubbelriktad replikation samt begrepp som ledande och sackande sträng, replikationsgaffel, replikationsstartpunkt, replikationsbubbla, RNA-primer och Okazaki-fragment. Viktiga proteiner och deras funktion i replikationsprocessen; DNA-polymeraser, DNA-helikas, topoisomeraser och primas. Problematiken med att replikera telomererna (kromosom-ändarna) Telomerasets funktionssätt.

DNA-reparation (A:211-219) Reparation av kromosomernas DNA är en ständigt pågående process och upprätthållandet av genetisk stabilitet är viktigt för en individs överlevnad. Denna föreläsning handlar om uppkomsten av mutationer samt cellernas sätt att reparera dessa förändringar i DNA. Uppkomst av förändringar i DNA-molekylen. Mutationstyperna och reparationssystemen i samband med DNA-replikation och i samband med påverkan från omgivningen. Viktiga proteiner och deras funktion i reparationsprocessen; DNA-glykosylas, helikas, endonukleas och DNA-polymeraser. Bas- och nukleotid excision reparation, mismatch excision reparation, reparation av dubbelsträngbrott Konsekvenser av mutationer för somatiska celler och för könsceller. Kopplingen mellan DNA-reparation och vissa ärftliga sjukdomar. Apoptos (A:633-641) Kroppen omsätter sina celler kontinuerligt i stor omfattning. När cellerna inte längre behövs, dör de på ett kontrollerat sätt. Denna process heter apoptos eller programmerad celldöd. Prokaspasaktivering och kaspaskaskaden (enligt figur 18-5). Extracellulär och intracellulär aktivering av apopotos. Dödsreceptorer. Mitogener, tillväxtfaktorer, överlevnadsfaktorer och deras roll i tillväxt och apoptos Skillnaden mellan akut nekros och apoptos. Transkription (A:223-232) Den här föreläsningen handlar om hur gener används i cellen. Detta sker genom tillverkning av budbärar-rna (mrna) i en process som heter transkription. Genernas uppbyggnad Olika komponenter i transkriptionsprocessen: RNA-polymeraser, den kodande strängen, promotorn, TATA-boxen och de omgivande DNA-sekvenserna samt deras biologiska relevans. Transkription av en dubbelsträngad DNA-molekyl till en enkelsträngad RNA-kedja och sammanfogning av nukleotiderna i en genetiskt bestämd ordningsföljd De tre huvudstegen i transkriptionsprocessen: initiering, elongering och terminering. Olika RNA-polymeraser och generella transkriptionsfaktorer. RNA-processning (A: 232-238)

Den molekyl som är resultat av transkription hos eukaryoter kallas primärt transkript (pre-mrna) och måste först modifieras innan den kan användas för proteinsyntes, vilket behandlas under denna föreläsning. Translation (A:238-253) Modifiering av pre-mrna i ändarna och modifieringarnas funktionella betydelse. Splitsningsprocessen (splicing) och dess betydelse för cellen. Nukleolen och organisationen av de ribosomala generna. Processning av ribosomalt RNA och bildningen av ribosomer. Translation innebär att mrna-molekylens genetiska information översätts till aminosyrasekvenser (proteiner) med hjälp av ribosomen. Principen för översättning av nukleotidspråket i mrna till aminosyraspråk i proteiner. Komponenterna i proteinsyntesen såsom mrna (capstrukturen, initierings-och termineringsdomänen), trna (antikodon-loop, och domän för aminosyrabindning), ribosomen (subenhetstruktur) samt polyribosomen. De aminosyraaktiverande enzymerna, translationsfaktorer, den makromolekylära sammansättningen av ribosomer. Mekanismen för eukaryot proteinsyntes: initiering, elongering och terminering. Antibiotikas påverkan på translation. Chaperoniner, proteosomernas funktion, ubiquitin Kromatinstruktur och epigenetik (A: 184-192, 279-280, 281F, 718) Kromatin består av DNA med associerade proteiner som påverkar DNAts veckning och gör det mer kompakt. Denna ihoppackning varierar, t. ex finns uttryckta gener i lösare packat DNA. Den minsta packningsenheten för kromatinet är nukleosomen. Epigenetik handlar om ärftlig information som inte är inkodad i DNA:ts nukleotidsekvens och denna föreläning tar upp kopplingen mellan kromatin och epigenetik. Kromosom, kromatin, eukromatin och heterokromatin. Kromatinets biokemiska komponenter, inkl. olika histoner. Förpackningen av DNA i kromatin, inkl. nukleosomens byggnad och uppkomsten av 30-nm fiber och loopar. Strukturen och funktionen av centromeren och telomeren. Histonmodifieringar och DNA-metylering Genreglering och signaltransduktion, totalt 2 timmar (A: 261-285, 526-538, 560-561) Celler i en multicellulär organism måste kommunicera flitigt med varandra. Därmed hanterar våra celler stora mängder information i form av inkommande och utgående signaler. Inkommande signaler aktiverar intracellulära signalvägar och dessa påverkar viktiga enzymer i cellen, eller reglerar geners aktivitet. Den här föreläsningen behandlar hur cellulära signaler fortplantas och hur genuttryck regleras.

Olika nivåer för genreglering: via transkription, RNA-processning, mrna-transport, mrna-stabilitet, translation och proteinaktivitet. Regulatoriska DNA-sekvenser Kromatinets roll i samband med genreglering MikroRNA och RNAi Cellkommunikationens biologiska betydelse Endokrin, parakrin, synaptisk, kontakt och autokrin signalering Olika receptortyper: kärnreceptor, jonkanal, enzymkopplade eller G-proteinkopplade receptorer Hur inkommande signalen behandlas: förstärkning, integration, koordinering Olika tidsskalor på olika signalvägar Läshänvisningar till cellskelett och rörelse, extracellulära matrix och cell junctions, samt cellens organeller och cellens transportprocesser, Cellskelett och cellrörelse (A: 565-599) Alla eukaryota celler har ett cellskelett som består av intracellulära fibrer. Cellskelettet är viktigt för att ge cellerna form och stadga. Det är höggradigt dynamiskt och omformas lätt, vilket bl a är betydelsefullt för cellernas förmåga att röra sig. Utan cellskelett förlorar cellerna sina funktioner och kan inte överleva. Den principiella byggnaden av de tre olika typerna av filamentsystem, mikrotubuli, intermediära filament och mikrofilament samt deras molekylära uppbyggnad i relation till cellernas form, polarisation och plasmamembran. Cytoskelettets roll i organisationen av subcellulära organeller, samt i transporten av komponenter och organeller i cellerna. Skillnaden mellan cilier och mikrovilli och mekanismerna för rörelsefunktionerna i dessa strukturer. De molekylära principerna bakom kontraktion av tvärstrimmig muskulatur. Mekanismerna för cellmotilitet och cell-förflyttningar. Extracellulär matrix (A: 684-694) I alla flercelliga organismer finns en extracellulär matrix, som är en absolut nödvändig förutsättning för att flercelliga organismer över huvud taget kan finnas till. Den extracellulära matrixen består av en blandning av fibrer och mera löst organiserad grundsubstans. Den extracellulära matrixen ger stadga och styrka åt organismen, och samverkar med cellerna i vävnaderna så att de kan fungera normalt. Viktiga koncept: Redogöra för de olika komponenterna som bygger upp den extracellulära matrixen, struktur samt funktion.

Beskriva växelverkan mellan extracellulär matrix och celler. Redogöra för receptorer för extracellulära matrixkomponenter och deras interaktioner med cytoskelettet. Cell-cell interaktioner (celladhesion och cell junctions) (A: 694-702) I alla flercelliga organismer är det livsviktigt att cellerna samverkar med varandra. Det gör de på många olika sätt. Bl a bygger celler upp vävnader och organ. Detta kräver att celler kan känna igen varandra och binda sig till både andra celler och till extracellulär matrix. Detta fenomen kallas celladhesion och ombesörjes av celladhesionsmolekyler. I de färdigbildade vävnaderna organiseras vissa grupper av celladhesions-molekyler i strukturer, som kallas cell junctions, och som svarar för sammanbindning av angränsande celler. Viktiga koncept: Definition av celladhesion. De olika familjerna av celladhesionsmolekyler. Cellsortering och hur det leder till organisation av vävnader. Olika junctions, deras struktur, molekylära uppbyggnad och funktioner. Växelverkan mellan celladhesions-molekyler och cell junctions med cytoskelettet. Cellens interna struktur samt introduktion till biomembranstruktur (A:19-20, 487-493, 384-417) Både plasmamembranet och de membran som omger cellens organeller fungerar som en oigenomtränglig barriär för flertalet laddade molekyler. Detta är viktigt då det tillåter cellen att upprätthålla olika koncentrationer av molekyler i cytoplasman jämfört med den extracellulära omgivningen och med de olika organellerna. Utan dessa skillnader skulle inte cellen fungera. Men uppdelningen i olika rum skapar också ett behov av att kunna transportera molekyler igenom membran. I denna del är fokus på plasmamembranets sammansättning och på olika transportvägar genom membranet. Viktiga koncept: Transporten av små molekyler genom passiv- och faciliterad diffusion samt för principen för transporten genom jonkanaler. Na+-K+ -pumpens principiella uppbyggnad, funktion och betydelse. Begreppen symport, uniport och antiport. Förankringen och mobiliteten av proteiner i membranets lipidlager. Relationen mellan aktiv transport och jongradienter. Begreppet glykocalyx Det endoplasmatiska retiklet (A: 19-20, 488-491, 498-500) Endoplasmatiska retiklet (ER) är den organell där största delen av cellens lipid- och proteinsyntes sker. För att förstå cellens uppbyggnad är det av vikt att känna till ER:s struktur och hur proteintransport och -sortering sker inom ER:s vida nätverk. Viktiga koncept: Begreppen granulärt och slätt (agranulärt) ER, mikrosomer, signalsekvens, signalpeptid, SRP och signalpeptidas. Principen för proteinsortering från fria och ER-bundna ribosomer.

Bildningen av ett sekretoriskt protein från mrna-nivån fram till dess frisättning i ER-lumen. Redogöra för viktiga protein-modifikationer i ER. Redogöra för exporten av proteiner och lipider från ER. Proteindisulfidisomeras. Syntesen av lipider i ER. Mitokondrier och peroxisomer (A:16-18, 451-452, 497-498, 19, tabell 15-1, 490, 498) I mitokondrien produceras huvudparten av den energi som cellen kräver för sitt fortlevande. Här presenteras mitokondriens ursprung, organisation och funktion. Som alla organeller kräver mitokondrien specifika enzymer för att kunna fungera, dessa importeras från cytoplasman in i mitokondrien med hjälp av en speciell mekanism. I peroxisomen sker oxideringsprocesser vilka bland annat är viktiga för detoxifiering av olika giftiga molekyler. Denna organell är även viktig för syntes av speciella fosfolipider som krävs för myelinering av nervceller. Strukturen, organisationen och funktionen av mitokondrien. Principen för importen av proteiner till mitokondrier. Bildningen av mitokondrier. Evolutionen av mitokondrien. Organisation och expression av det humana mitokondriegenomet. Ärtfliga sjukdomar relaterade till mutationer i mitokondriellt DNA. Strukturen och funktionen av peroxisomer i animala celler. Golgi, vesikulär transport samt lysosomen (A: 503-521) Golgikomplexet är den organell som tar emot proteiner som ursprungligen kommer från ER. I denna del är fokus på Golgikomplexets struktur och på hur proteiner transporteras, modifieras och sorteras för att sedan forslas vidare till andra organeller, till plasmamembranet eller ut ur cellen. Utan denna sortering skulle inte organellernas, därmed cellens, struktur bevaras. För att upprätthålla skillnaderna mellan cellens olika organeller transporteras membranvesikler mellan cellens olika rum. Detta avsnitt behandlar dessa vesiklers formering och de bäst kända vesikel-transportvägarna. Vi kommer att gå igenom exocytosen, det vill säga vesikel-transportvägen från Golgi till plasmamembranet och cellens utsida. Lysosomen är den organell där nedbrytning av olika makromolekyler sker. Utan en sådan nedbrytning skulle avfallsprodukter ansamlas i cellen. I denna del behandlas lysosomens uppbyggnad och de olika transportvägar som för material till lysosomen. En av dessa vägar är den endocytotiska vesikeltransportvägen som för material från plasmamembranet och cellens utsida in i cellen. Beskriva Golgikomplexet och definiera begreppen cis-golginätverk, Golgistack och trans-golginätverk. Sortering och transport av proteiner från Golgikomplexet. Glykosylering i Golgikomplexet, speciellt markeringen av lysosomala proteiner före transport till lysosomen Reglerad och konstitutiv sekretion. Begreppen klatrin-täckta och COP-täckta vesikler.

Inkorporeringen av proteiner till klatrin-täckta vesikler för endocytos och exocytos. Den s. k. SNARE-hypotesen gällande fusionen vesikler med andra membraner. Begreppen lysosom, endocytos, endosom, fagocytos, pinocytos, transcytos, fagosom, och autofagi. Organisationen av lysosomen. Det låga ph:t i endosomerna och lysosomerna och fördelen med detta. Lysosomens bildning och dess funktion. Receptorförmedlad endocytos. Topic revision: r4-2018-01-10 - MattiNikkola