Litteratursökning och referenshantering MATTHIAS BANK, MEDICINSKA FAKULTETEN, BIBLIOTEK & IKT 2017-01-26
Dagens upplägg Databassök Övning PubMed Repetition PubMed Strukturera frågeställningen Embase Web of Science
Upplägg (forts.) Referenshantering EndNote
Övning sök i PubMed Finns det vetenskaplig evidens att probiotiska bakterier, t.ex. lactobacilli, kan förebygga gastrointestinala sjukdomar - i möss? - i människan? Vilka specifika sjukdomar är det som kan förebyggas eller behandlas med probiotiska bakterier?
Diskutera i smågrupper Svårigheter när man söker i PubMed
Produceras av National Library of Medicine (NLM) Fritt tillgängligt Ca 25 miljoner referenser Bevakar cirka 5600 tidskrifter
Välj sökord Ta inte för många sökord Fritext i PubMed fungerar bra, PubMed korrigerar felstavningar bred sökning Använd MeSH (Medical subjet headings) för att fokusera sökningen/öka relevansen
Ämnesord - vad är MeSH? Det naturliga språket är mångfaldigt Vissa databaser har ett kontrollerat vokabulär synonymer mappas mot preferred terms Diabetes mellitus, type 1 Sudden-Onset Diabetes Mellitus; Diabetes Mellitus, Type I; IDDM; Insulin-Dependent Diabetes Mellitus 1 Artiklarna taggas/indexeras med preferred terms Relevansen av träffarna höjs
MeSH: exempel Lactobacillus
Mesh versus fritext MeSH: bra för bredare termer, t.ex. sjukdomar, celltyper, mikroorganismer, species Fritext: nya behandlingsmetoder, labbteknik, nya läkemedel
Logiska operatorer AND OR NOT Standardoperatorn är AND.
Filters i PubMed Studietyp, publikationstyp Abstract available Publikationsår Humans, animals Språk Åldersgrupper (för kliniska studier)
Före sökningen Tänk igenom ditt informationsbehov Är syftet att få en översikt över ett nytt, bredare område? hitta allt i ett avgränsat forskningsfält? hitta det senaste i ett avgränsat fält?
PICO strukturera frågeställningen P: Problem, population, etc. I: Intervention C: Comparison, control, jämförelse O: Outcome criteria, effektmått
Frågeställnings komponenter (PICO). SBU: Utvärdering av metoder i hälso- och sjukvården. Stockholm 2013.
Sökstrategi building blocks Steg 1 Steg 2 Steg 3 Kombinera termer med AND/OR AND Kombinera termer med AND/OR AND Kombinera termer med AND/OR
Övning, sök PubMed Användning av probiotiska bakterier mot gastrointestinala sjukdomar i människan vilka risker och säkerhetsaspekter finns det?
Strukturering Gastrointestinal diseases in humans Probiotics OR AND lactobacillus AND Risks, safety
Embase Innehåller 32 millioner litteraturreferenser inom humanmedicin och angränsande områden > 800 000 nya referenser/år Täcker ca. 8400 tidskrifter Klinisk och pre-klinisk medicin, cellbiologi Enastående täckning av läkemedelsforskning
Sökresultat Embase versus PubMed Sökterm Embase PubMed Neoplasms - breast neoplasms - intestinal neoplasms - lung neoplasms 3 428 000 365 000 274 000 268 000 2 588 000 216 000 168 800 173 000 Cardiovascular diseases - myocardial infarction 3 064 000 276 000 1 871 000 146 000 Multiple sclerosis 81 000 44 000 Quality of life 275 000 117 000
EmTree Embase ämnesordslista, innehåller 70 000 preferred terms och 290 000 synonymer Täcker även hela MeSH, automatisk mappning av MeSHtermer till Emtree-termer
Emtree versus MeSH Emtree MeSH
Sökuppgift Hitta litteratur om tillväxt egenskaper hos Escherichia coli Growth characteristics Hitta artikeln Juergensmeyer MA et al. Shaking alone, without concurrent aeration, affects the growth characteristics of Escherichia coli. Letters in Applied Microbiology, 2007 45, 179-183
Web of Science Interdisciplinär databas Bevakar ca 11000 tidskrifter Pearl growing strategi: Leta upp en viktig artikel (pärla) och kolla vilka andra artiklar som har citerat den Ämnessökning, fördelning av publikationerna över forskare tidskrifter institutioner länder
Sökuppgifter Web of Science Hitta artikeln Saarela M et al. Probiotic bacteria: safety, functional and technological properties. Journal of Biotechnology, 2000 84(3):197-215. Hur ofta har artikeln citerats? Leta upp artiklar om probiotiska bakterier där minst 1 författare har Lunds universitet som affiliering
Journal Citation Reports (JCR) Journal impact factor: Antalet citeringar delat på antalet publikationer IF for 2015, Trends in Microbiology
Litteraturreferenser Hoonhorst S, Timens W, Koenderman L, Lo Tam Loi A, Lammers J, Ten Hacken N, et al. Increased activation of blood neutrophils after cigarette smoking in young individuals susceptible to COPD: subtitle. Respiratory Research. 2014; 15(10): 1-10. Referenser - viktiga delar: Författare Titel Tidskrift Volym, häfte (evtl), sidnummer
EndNote Spara dina litteraturreferenser Spara fulltexter Referera korrekt i Word, bibliografi i Word
Till sist Har du frågor? Kontakta oss gärna vid infodisken eller via nätet. Telefon bibliotek BMC: 046-222 33 00 Personligt Matthias.Bank@med.lu.se