Ettan Digester Bruksanvisning Översatt från engelska
Denna sida har avsiktligt lämnats tom
Innehållsförteckning Innehållsförteckning 1 Inledning... 1.1 Viktig användarinformation... 1.2 Gällande bestämmelser... 1.3 Instrument... 1.4 Kontrollprogram... 1.5 Användardokumentation... 2 Säkerhetsinstruktioner... 2.1 Säkerhetsinstruktioner... 2.2 Etiketter... 2.3 Förfaranden i nödsituationer... 2.4 Återvinningsinformation... 3 Installation... 3.1 Krav på lokalen... 3.2 Packa upp... 3.3 Transport... 3.4 Installera om Ettan Digester... 3.5 Anslutningar... 3.6 Inriktning av maskinvara... 3.7 Installera om Ettan Digester Control Software... 3.8 Reservdelar och tillbehör... 4 Drift... 4.1 Användningsöversikt... 4.2 Starta instrumentet... 4.3 Att starta kontrollsystemet... 4.4 Sätta upp en körning... 4.5 Redigera en metod... 4.6 Förberedelser före start... 4.7 Utföra en körning... 4.8 Rutiner efter en körning... 4.9 Programvaruverktyg... 5 Underhåll... 5.1 Service... 5.2 Utbytesrutiner... 5.3 Rengöring före planerat underhåll/service... 6 Felsökning... 7 Referensinformation... 7.1 Formulär för hälso- och säkerhetsdeklaration... 5 6 8 10 16 17 18 19 26 28 29 30 31 32 33 35 36 38 44 45 46 47 48 49 53 55 62 66 70 71 73 74 77 82 83 89 90 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 3
Innehållsförteckning Index... 92 4 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
1 Inledning 1 Inledning Manualens syfte Bruksanvisningen innehåller de anvisningar du behöver för att kunna installera, använda och underhålla på ett säkert sätt. Förutsättningar För att använda Ettan Digester på ett säkert sätt och enligt det avsedda syftet, måste följande förutsättningar uppfyllas: Du måste vara väl förtrogen med laboratorieutrustningen och veta hur biologiska material ska hanteras. Se till att du har förstått vad som händer i elektroforesprocessen. Du måste läsa säkerhetsinstruktionerna i kapitel 2 i denna bruksanvisning. Installera systemet enligt anvisningarna i kapitel 3 i denna bruksanvisning. I det här kapitlet Det här kapitlet innehåller viktig användarinformation och en allmän beskrivning av Ettan Digester och hur den är avsedd att användas. Sektion 1.1 Viktig användarinformation 1.2 Gällande bestämmelser 1.3 Instrument 1.4 Kontrollprogram 1.5 Användardokumentation Se sidan 6 8 10 16 17 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 5
1 Inledning 1.1 Viktig användarinformation 1.1 Viktig användarinformation Läs detta innan du använder produkten Alla användare måste läsa hela bruksanvisningen innan produkten installeras, används eller underhålls. Ha alltid bruksanvisningen tillgänglig vid användning av produkten. Använd inte produkten på andra sätt än vad som beskrivs i användardokumentationen. Om du gör det riskerar du att utsättas för fara som kan leda till personskada eller skada på instrumentet. Avsedd användning Ettan Digester är avsett att digerera hela proteiner i gelbitar av polyakrylamid och därefter extrahera de resulterande peptiderna före analys med MALDI-TOF masspektrometri. Ettan Digester är endast avsett för forskningsändamål och ska inte användas i kliniska behandlingar eller för diagnostiska ändamål. Säkerhetsanvisningar Denna användardokumentation innehåller säkerhetsanvisningar (VARNING, FÖRSIKTIG- HETSANVISNING och OBSERVATION) avseende säker användning av produkten. Se definitionerna nedan. VARNING VARNING indikerar en potentiellt farlig situation som om den inte undviks kan leda till allvarliga personskador eller dödsfall. Det är viktigt att inte fortsätta förrän samtliga nämnda förhållanden är uppfyllda och förstådda. 6 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
1 Inledning 1.1 Viktig användarinformation FÖRSIKTIG FÖRSIKTIG indikerar en farlig situation som, om den inte undviks, kan leda till lätta eller medelsvåra personskador. Det är viktigt att inte fortsätta förrän samtliga nämnda förhållanden är uppfyllda och förstådda. OBSERVERA OBSERVERA indikerar instruktioner som måste följas för att undvika skada på produkten eller på annan utrustning. Anmärkningar och tips Anm: Tips: En anmärkning används för information som är viktig för problemfri och optimal användning av produkten. Ett tips innehåller användbar information som kan förbättra eller optimera dina rutiner. Typografiska regler Hänvisningar till programvara markeras i texten med fet kursiv text. Menynivåer avgränsas med kolon. Exempelvis avser File:Open kommandot Open på menyn File. Maskinvaruenheter markeras i texten med fetstil (till exempel Power). Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 7
1 Inledning 1.2 Gällande bestämmelser 1.2 Gällande bestämmelser Det här avsnittet innehåller de direktiv och de standarder som uppfylls av Ettan Digester. Tillverkningsinformation Tabellen nedan sammanfattar erforderlig tillverkningsinformation. För ytterligare information, se dokumentet med EG-försäkran om överensstämmelse. Krav Tillverkarens namn och adress Innehåll GE Healthcare Bio-Sciences AB, Björkgatan 30, SE 751 84 Uppsala, Sweden Överensstämmelse med EU-direktiv Den här produkten uppfyller de europeiska direktiven som anges i tabellen genom att uppfylla motsvarande anpassade normer. En kopia av EG-försäkran om överensstämmelse finns att tillgå på begäran. Direktiv 2006/42/EC 2004/108/EC 2006/95/EC Titel Maskindirektivet (MD) Elektromagnetiskt kompatibilitetsdirektiv (EMC) Lågspänningsdirektivet (LVD) Internationella normer Standard EN 61010-1, IEC 61010-1, UL 61010-1, CAN/CSA-C22.2 nr 61010-1 EN 61326-1 Beskrivning Säkerhetskrav för elektrisk utrustning för mätning, kontroll och laboratorieanvändning SS-EN 61326-1 EMC-utsläpps- och immunitetskrav för elektrisk utrustning för mätning, kontroll och laboratorieanvändning Anmärkningar Anpassade till 2004/108/EC 8 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
1 Inledning 1.2 Gällande bestämmelser Standard Beskrivning Anmärkningar SS-EN ISO 12100 Maskinsäkerhet - Allmänna konstruktionsprinciper - Riskbedömning och riskminskning Anpassade till 2006/42/EC FCC-utlåtande Ettan Digester uppfyller kraven i FCC 47, CFR-avsnitt 15b. Anm: Denna utrustning har testats och befunnits uppfylla gränserna för digital enhet av klass A, i enlighet med avsnitt 15 i FCC:s regelverk. Dessa gränser är avsedda att ge rimligt skydd mot skadliga störningar när utrustningen används i kommersiell miljö. Denna utrustning genererar, använder och kan utstråla radiofrekvensenergi och kan, om den inte installeras i enlighet med instruktionsboken, störa radiokommunikation på ett skadligt sätt. Användning av denna utrustning inom ett bostadsområde ger sannolikt upphov till skadliga störningar som användaren kommer att vara skyldig att åtgärda på egen bekostnad. CE-märkning CE-märkningen och motsvarande EU-försäkran om överensstämmelse är giltig för instrumentet när det: används som en fristående enhet, eller är anslutet till andra produkter som rekommenderas eller beskrivs i användardokumentationen och används i samma tillstånd som det levererades i från GE, förutom ändringar som framgår av användardokumentationen. Föreskriven lämplighet för ansluten utrustning All utrustning som ansluts till Ettan Digester måste uppfylla säkerhetskraven i SS-EN 61010-1/IEC61010-1 eller relevanta harmoniserade standarder samt installeras och användas i enlighet med tillverkarens anvisningar. Inom EU måste ansluten utrustning vara CE-märkt. Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 9
1 Inledning 1.3 Instrument 1.3 Instrument Om detta kapitel Detta kapitel innehåller en allmän beskrivning av Ettan Digester. Allmän beskrivning Ettan Digester-instrumentet är avsett för att digerera hela proteiner i gelbitar av polyakrylamid och därefter extrahera de resulterande peptiderna före analys med MALDI- TOF masspektrometri. Vid användning i kombination med Ettan Spot Picker kan proverna spåras (i en mikroplatta) med punktexcision genom hela digereringsprocessen. Proverna behandlas i mikroplattor med 96 brunnar. Upp till 4 mikroplattor (384 prover) kan digereras samtidigt. Systemkomponenter Ettan Digester-systemet består av följande komponenter: Ettan Digester-instrumentet: - Vätskehanterare med 8 nålar - 8-kanalig ventil Ettan Digester Control Software PC Skyddshölje (valfritt) Ettan Digester-teknik Ettan Digester är ett robotsystem som utformats för att preparera gelproppar för enzymatisk digerering av proteiner och efterföljande extraktion av peptider. Instrumentet har ett provnålshuvud som kan flyttas i x-, y- och z-riktning. Provnålshuvudet är anslutet till en 8-kanalig spädningsanordning med flera sonder. En 8-kanalig ventil med gemensamt utlopp används för att välja de olika flytande lösningsmedlen. Sköljningsstationen har två positioner för sköljning, en för ytlig sköljning av nålarna och en för djupsköljning. Den ytliga sköljningsstationen används för alla sköljningsprocedurer förutom sköljning efter enzymdispenseringen. 10 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
1 Inledning 1.3 Instrument Beskrivning av systemet 11 1 10 9 8 7 6 2 4 5 3 Del Beskrivning Del Beskrivning 1 Frontpanel 7 X-arm 2 Spädningsanordning med flera sonder 8 Sköljningsstation 3 Basplatta 9 Provnålshuvud 4 Y-arm 10 Z-arm 5 Mikroplattor 11 8-kanalig ventil 6 Enzymbehållare Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 11
1 Inledning 1.3 Instrument Frontpanel Del 1 2 3 4 Beskrivning Start-knapp Strömbrytarlampa LED-display Stop-knapp Indikatorer på frontpanelen Indikator Ström (omarkerad) Start LED-display Färg grön gul gul text Funktion Tänds när nätström är ansluten till instrumentet och strömbrytaren på bakpanelen är påslagen (i läge I). Tänds när man trycker på Start-knappen för att referensköra plockhuvudet. Visar aktuell status för Ettan Digester och eventuella felkoder allt eftersom de uppkommer. 12 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
1 Inledning 1.3 Instrument Knappar på frontpanelen Funktionsknapp Start Stop Funktion När Start-knappen trycks ned flyttas flersondshuvudet till referenspositionen. Den gula lysdioden lyser så länge knappen trycks ned. Start-knappen kan användas för att referensköra flersondshuvudet när vätskehanteraren slås på första gången eller när motorerna för flersondshuvudet har stängts av. När denna knapp trycks ned avbryter instrumentet omedelbart rörelsen och alla motorer slås ifrån. När man trycker på Stop-knappen slocknar den gula lysdioden i Start-knappen. Observera att Stop-knappen är mycket känslig. Undvik att röra den i onödan under en körning. Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 13
1 Inledning 1.3 Instrument El- och kommunikationsanslutningar 1 A 2 3 B 2 5 0 J 0 4 4 9 4 5 6 7 8 Del A Beskrivning 8-kanalig ventil 1 2 3 GSIOC-port för anslutning till vätskehanterare Inspänningsuttag, 24 VDC ROTATE/HOME (kontaktuttag) används ej 14 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
1 Inledning 1.3 Instrument Del B 4 5 6 7 8 Beskrivning Vätskehanterare GSIOC-port för anslutning till 8-kanalig ventil Fack för huvudsäkring Strömbrytare RS-232-port för anslutning till dator Strömingång Ansluta datorn Anslut den medföljande kommunikationskabeln mellan RS-232-porten på vätskehanteraren och COM1-porten på datorn. Dekal för kommunikationsinställningar Kontrollera att strömbrytarna SW1 och SW2 är inställda enligt bilden nedan. Switch 2 Etikett SW1 Värde Enhets-ID = 22 6 SW2 Baud = 19200 Läge = GSIOC Master Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 15
1 Inledning 1.4 Kontrollprogram 1.4 Kontrollprogram Ettan Digester Control Software är ett komplett program för kontroll och styrning av Ettan Digester. Programmet körs i operativsystemet Windows Microsoft. Ytterligare information om Ettan Digester Control Software finns i Ettan Digester Instrument Handbook eller Ettan Digester User Manual. 16 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
1 Inledning 1.5 Användardokumentation 1.5 Användardokumentation Användardokumentation Ettan Digester Bruksanvisning (denna handbok) Ettan Digester User Manual Ettan Digester Instrument Handbook EG-försäkran om överensstämmelse för Ettan Digester Innehåll Alla anvisningar som behövs för att handha och använda instrumentet på ett säkert sätt, inklusive en kortfattad systembeskrivning och grundläggande installationsoch underhållsanvisningar. Detaljerad systembeskrivning. Heltäckande användarhandledning med anvisningar om hur metodskapande, drift samt avancerat underhåll och avancerad felsökning. Innehåller teknisk information och grundläggande driftsinstruktioner för systemet. Dessutom ingår underhållsscheman liksom anvisningar för felsökning och användarunderhåll. Dokument i vilket tillverkaren försäkrar att produkten uppfyller och överensstämmer med de huvudsakliga kraven i tillämpliga direktiv. Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 17
2 Säkerhetsinstruktioner 2 Säkerhetsinstruktioner Om detta kapitel Det här avsnittet beskriver säkerhetsanpassning, säkerhetsetiketter och allmänna säkerhetsföreskrifter, förfaranden i nödsituationer, strömavbrott och återvinning av Ettan Digester-systemet. I det här kapitlet Sektion 2.1 Säkerhetsinstruktioner 2.2 Etiketter 2.3 Förfaranden i nödsituationer 2.4 Återvinningsinformation Se sidan 19 26 28 29 18 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
2 Säkerhetsinstruktioner 2.1 Säkerhetsinstruktioner 2.1 Säkerhetsinstruktioner Inledning Ettan Digester-systemet drivs med nätspänning och innehåller vätskor som kan vara hälsovådliga. Före installation, drift eller underhåll av systemet måste du vara medveten om de risker som beskrivs i denna handbok. Följ de anvisningarna som ges för att undvika personskada eller skador på utrustningen. Säkerhetsföreskrifterna i detta avsnitt är grupperade i följande kategorier: Allmänna försiktighetsåtgärder Användning av lättantändliga vätskor Personligt skydd Installation och förflyttning av instrumentet Systemdrift Underhåll Allmänna försiktighetsåtgärder VARNING Använd inte produkten på annat sätt än så som beskrivs i Användardokumentation för Ettan Digester. VARNING Endast personal som utbildats för uppgiften får använda och underhålla denna produkt. VARNING Använd endast tillbehör som medföljer eller som rekommenderas av GE. Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 19
2 Säkerhetsinstruktioner 2.1 Säkerhetsinstruktioner VARNING Använd inte Ettan Digester om den inte fungerar korrekt, eller om den har utsatts för skada, som till exempel: skada på elsladden eller kontakten skada orsakad av att apparaten har tappats skada orsakad av att vätska spillts ut på apparaten VARNING Användaren får inte öppna instrumentets höljen. Instrumentet innehåller elektriska ledningar som kan avge dödliga elstötar. Service och planerat underhåll ska utföras av personal som godkänts av GE. FÖRSIKTIG Avfallsslangarna och behållarna måste säkras och förslutas för att undvika oavsiktligt spill. Användning av lättantändliga vätskor VARNING Brandfara. Innan systemet startas ska du se till att det inte finns några läckor. VARNING En fläktkåpa eller liknande ventilationssystem ska installeras när lättantändliga eller skadliga ämnen används. 20 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
2 Säkerhetsinstruktioner 2.1 Säkerhetsinstruktioner Personligt skydd VARNING Använd alltid lämplig personlig skyddsutrustning vid användning och underhåll av denna produkt. VARNING Farliga substanser eller biologiska medel. Vid användning av farliga kemiska och biologiska ämnen måste alla lämpliga skyddsåtgärder vidtas. Bär exempelvis skyddsglasögon och handskar som skyddar mot de aktuella ämnena. Följ lokala och/eller nationella bestämmelser för säker användning och säkert underhåll av Ettan Digester VARNING Spridning av biologiska ämnen. Användaren måste på alla tillbörliga sätt undvika att sprida farliga biologiska ämnen. Anläggningen måste följa nationell praxis för biologisk säkerhet. Installation och förflyttning av instrumentet VARNING Matningsspänning. Se till att matningsspänningen i vägguttaget motsvarar matningsspänningen som anges på instrumentet innan nätsladden ansluts. VARNING Skyddsjord. Produkten måste alltid anslutas till ett jordat uttag. Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 21
2 Säkerhetsinstruktioner 2.1 Säkerhetsinstruktioner VARNING Nätsladd. Använd endast nätsladdar med godkända kontakter som levereras av eller är godkända av GE. VARNING Åtkomst till strömbrytare och elsladd med kontakt. Blockera inte åtkomsten till strömbrytaren och nätsladden. Strömbrytaren måste alltid vara lättåtkomlig. Elsladden med kontakt måste alltid vara lätta att koppla ur. FÖRSIKTIG Tungt föremål. Ettan Digester väger ca 40 kg. Det behövs minst två personer för att lyfta instrumentet. OBSERVERA Använd inte x- eller y-armarna som bärhandtag när du flyttar Ettan Digester, utan lyft alltid instrumentet i basen. OBSERVERA Om Ettan Digester har konfigurerats för 100 120 V, men ansluts till 220 240 V, kan instrumentet skadas allvarligt. Se till att korrekt säkringsfack installerats för spänningsintervallet. OBSERVERA Alla datorer som används med utrustningen måste uppfylla standarden IEC 60950 och installeras i enlighet med tillverkarens anvisningar. 22 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
2 Säkerhetsinstruktioner 2.1 Säkerhetsinstruktioner Systemdrift VARNING Farliga biologiska medel under körning. Vid användning av farliga biologiska medel, kör System CIP och Column CIP för att skölja hela slangsystemet med bakteriehämmande läsning (t.ex. NaOH) följt av en neutral buffertlösning och slutligen destillerat vatten, innan service och underhåll utförs. VARNING Undvik att spilla vätska på instrumentet. Om större volymer vätska tränger in innanför instrumenthöljet, och kommer i kontakt med de elektriska komponenterna, ska du omedelbart stänga av instrumentet och kontakta en auktoriserad servicetekniker. VARNING Övertryck. Blockera aldrig utloppsslangen med exempelvis stoppluggar eftersom det skapar ett övertryck och kan medföra personskador. VARNING Använd ENDAST slangsatser från GE för att se till att slangarnas tryckspecifikationer uppfylls. VARNING Under inga som helst omständigheter ska händer eller fingrar placeras under provsonden när instrumentet är igång. Provsonden kan tränga igenom huden. FÖRSIKTIG Nålarna rör sig över hela arbetsområdet för vätskehanteraren. Ta bort alla lösa föremål som placerats på Ettan Digester-enheten. Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 23
2 Säkerhetsinstruktioner 2.1 Säkerhetsinstruktioner FÖRSIKTIG Rörliga delar. När Ettan Digester börjar referenskörningsprocessen rör sig såväl nålar och sprutor som x/y/z-armen. Håll ett betryggande avstånd till dessa rörliga delar så att du inte skadas. OBSERVERA Kontrollera alla positioner (plattor, sköljningsstationer, enzymhållare) på instrumentet med hjälp av System Setup efter att Home phase utförts. OBSERVERA Var försiktig när du flyttar provnålarna. Om nålarna stöter på hinder, kommer motorn att omedelbart stängas av för att undvika allvarlig skada på instrumentet. Själva nålarna kan dock skadas om de kolliderar med ett hinder. Underhåll VARNING Ta inte bort instrumentets hölje. Det finns inga invändiga delar som kan underhållas av användaren och du löper dessutom risk att utsättas för högspänning. VARNING Koppla ifrån strömmen. Koppla alltid ifrån strömmen från instrumentet innan säkringar byts. VARNING Byt den felaktiga säkringen mot en av motsvarande typ för fortsatt skydd mot brand. 24 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
2 Säkerhetsinstruktioner 2.1 Säkerhetsinstruktioner VARNING Enbart reservdelar och tillbehör som är godkända eller levererade av GE får användas vid underhåll och service av produkten VARNING Farliga kemikalier under körning. Vid användning av farliga kemikalier ska hela systemets slangar spolas med destillerat vatten före service och underhåll. FÖRSIKTIG Tryck alltid på Stop-knappen på instrumentets frontpanel och koppla ifrån huvudströmmen när sprutan sänkts, för att undvika skador under byte av pumpenhetens delar. Slå på strömmen igen när arbetet är slutfört och klicka på knappen Initialize instrument så att sprutan flyttas till referenspositionen. FÖRSIKTIG Stäng alltid av Ettan Digester och datorn innan du kopplar ifrån eller ansluter kablar. OBSERVERA Rengöring. Se till att hålla instrumentet torrt och rent. Torka regelbundet med en mjuk fuktig trasa och använd, om så är nödvändigt, ett milt rengöringsmedel. Låt instrumentet torka helt innan det används. Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 25
2 Säkerhetsinstruktioner 2.2 Etiketter 2.2 Etiketter I det här avsnittet beskrivs säkerhetsetiketter och etiketter med information om farliga ämnen som sitter på Ettan Digester-systemet. Se tillverkarens anvisningar för information om märkning av datorutrustningen. Etiketter på instrumentet Bilden nedan visar exempel på identifieringsetikett som finns på Ettan Digester-instrumentet. XX-XXXX-XX Code No: XXXXXXXX Serial No XXXXXXX Mfg Year: 2009 Ettan xxxx Voltage: Frequency: Power max: Fuse: Made in Sweden 28952336aa N12406 GE Healthcare Bio-Sciences AB 751 84 Uppsala Sweden Symboler som används på säkerhetsetiketter Etikett Betydelse Varning! Läs användardokumentationen innan systemet används. Öppna inga höljen och byt inga delar om du inte uttryckligen ombeds göra det i användardokumentationen. Systemet uppfyller kraven för elektromagnetisk utrustning (EMC) i Australien och i Nya Zeeland. Indikerar risk för att fastna med kroppsdelar mellan två av systemets delar. Iaktta försiktighet för att undvika skador. 26 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
2 Säkerhetsinstruktioner 2.2 Etiketter Etikett Betydelse Systemen uppfyller alla tillämpliga europeiska direktiv. Etiketter avseende farliga ämnen Etikett Betydelse Denna symbol indikerar att avfall från elektrisk eller elektronisk utrustning inte får lämnas som osorterat kommunalt avfall utan måste sorteras separat. Vänligen kontakta en av tillverkaren auktoriserad representant för information angående bortskaffandet av utrustning. Denna symbol indikerar att produkten innehåller farligt material som överskrider de gränser som fastställts i den kinesiska standarden SJ/T11363-2006, Requirements for Concentration Limits for Certain Hazardous Substances in Electronics (Gränsvärdeskrav ifråga om halter av vissa farliga ämnen i elektronik). Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 27
2 Säkerhetsinstruktioner 2.3 Förfaranden i nödsituationer 2.3 Förfaranden i nödsituationer Det här avsnittet beskriver hur man nödavstänger Ettan Digester-systemet. Det här avsnittet beskriver resultatet i händelse av strömavbrott. Förfaranden i nödsituationer Gör följande för att stoppa körningen i en nödsituation: Steg 1 2 3 Åtgärd I händelse av en nödsituation ska du trycka på Stop-knappen på frontpanelen på Ettan Digester. Instrumentet avbryter omedelbart rörelsen och alla motorer slås ifrån. Ställ vid behov om strömbrytaren till läge 0. Stäng av den 8-kanaliga ventilen genom att dra ut kontakten ur vägguttaget. Strömavbrott Strömavbrott för Ettan Digester kan leda till... Körningen avbryts omedelbart i ett obestämt läge. De data som har samlats in fram till strömavbrottet finns i Ettan Digester Control Software Datorn Ettan Digester Control Software-datorn stängs av i ett obestämt läge. Körningen avbryts omedelbart i ett obestämt läge. Följderna av ett strömvabrott beror på vilken enhet som har påverkats. Procedur för omstart Om systemet har stängts av på grund av strömavbrott, nödstopp eller processavbrott ska felen åtgärdas innan Ettan Digester startas om. Följ anvisningarna i avsnittet Sektion 4.2 Starta instrumentet, på sidan 48 för att starta om Ettan Digester. 28 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
2 Säkerhetsinstruktioner 2.4 Återvinningsinformation 2.4 Återvinningsinformation Utrustningen ska saneras före kassering och samtliga lokala föreskrifter ska följas. Kassering, allmänna instruktioner När Ettan Digester-systemet tas ur bruk ska de olika materialen separeras och återvinnas enligt nationella och lokala miljöföreskrifter. Återvinning av farliga ämnen Ettan Digester innehåller farliga ämnen. Detaljerad information finns hos din GE-representant. Kassering av elektrisk utrustning Avfall från elektrisk och elektronisk utrustning får inte kasseras som osorterat avfall utan måste lämnas på särskild plats. Kontakta en av tillverkaren auktoriserad representant för information angående bortskaffandet av utrustning. Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 29
3 Installation 3 Installation Ettan Digester-systemet installeras och testas av GE s servicepersonal efter leverans. Detta kapitel ger anvisningar om ominstallation, om du behöver flytta instrumentet till en annan plats. All utrustning som är ansluten till Ettan Digester måste uppfylla tillämpliga normer och lokala föreskrifter. Se Ettan Digester Instrument Handbook för detaljerad information om installationen. I det här kapitlet Sektion 3.1 Krav på lokalen 3.2 Packa upp 3.3 Transport 3.4 Installera om Ettan Digester 3.5 Anslutningar 3.6 Inriktning av maskinvara 3.7 Installera om Ettan Digester Control Software 3.8 Reservdelar och tillbehör Se sidan 31 32 33 35 36 38 44 45 30 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
3 Installation 3.1 Krav på lokalen 3.1 Krav på lokalen Inledning OBSERVERA Om Ettan Digester har konfigurerats för 100 120 V, men ansluts till 220 240 V, kan instrumentet skadas allvarligt. Se till att korrekt säkringsfack installerats för spänningsintervallet. Krav på lokalen Innan Ettan Digester installeras eller flyttas ska du kontrollera att den nya installationsplatsen uppfyller nedanstående krav. Parameter Elström Krav 100 120 V ca ± 10 %, 50/60 Hz, enfas 220-240 V ca ± 10 %, 50/60 Hz, enfas Lufttemperatur Placering Luftfuktighet Plats +15 C till +32 C Placera instrumentet på en stabil och plan laboratoriebänk. Maximal relativ luftfuktighet 80 % (icke-kondenserande). Endast inomhusbruk. Anm: Se till att strömbrytaren på baksidan av instrumentet är lätt åtkomlig. Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 31
3 Installation 3.2 Packa upp 3.2 Packa upp Kontrollera utrustningen med avseende på skador innan montering och installation påbörjas. Dokumentera eventuella skador och kontakta den lokala GE-representanten. Ta bort band och emballage och placera utrustningen upprätt innan installationen påbörjas. 32 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
3 Installation 3.3 Transport 3.3 Transport FÖRSIKTIG Tungt föremål. Ettan Digester väger ca 40 kg. Det behövs minst två personer för att lyfta instrumentet. OBSERVERA Använd inte x- eller y-armarna som bärhandtag när du flyttar Ettan Digester, utan lyft alltid instrumentet i basen. Omflyttning Följ anvisningarna nedan om systemet behöver flyttas till ett annat rum: Steg 1 2 3 4 5 Åtgärd Stäng av Ettan Digester och datorn. Koppla ifrån alla kablar. Undvik mekanisk skada genom att installera armlåset som låser y-armen, se avsnitt Installera det mekaniska armlåset, på sidan 34. Placera försiktigt instrumentet, datorn och monitorn på en vagn. Flytta systemet till den nya platsen. Det mekaniska armlåset 1 4 3 2 2 5 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 33 6
3 Installation 3.3 Transport Del 1 2 3 4 Funktion Armlås Låsskruvar Spännskruv Y-arm Installera det mekaniska armlåset Följ anvisningarna nedan för att installera armlåset. Steg 1 2 Åtgärd Montera spännskruven som fixerar y-armen. Montera de två låsskruvarna som håller armlåset på plats. 34 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
3 Installation 3.4 Installera om Ettan Digester 3.4 Installera om Ettan Digester Placera instrumentet Steg 1 2 Åtgärd Välj en plats för Ettan Digester där det är möjligt att nå huvudströmbrytaren på vätskehanteraren. Ta bort armlåset. Om du behöver installera om Ettan Digester Control Software, se avsnittet Sektion 3.7 Installera om Ettan Digester Control Software, på sidan 44. Kontroll av systemstart Så här kontrollerar du att Ettan Digester fungerar på den nya platsen: Steg 1 2 3 4 5 6 Åtgärd Slå på huvudströmbrytaren på baksidan av vätskehanteraren och kontrollera att den 8-kanaliga ventilen matas via en särskild 24 VDC-adapter. Kontrollera att strömbrytarlampan tänds. Slå på strömmen till datorn. Starta Ettan Digester Control Software genom att välja All Programs:GE Healthcare:Ettan Digester Control Software från Windows Start-menyn. Klicka på OK på skärmen Homing om du vill starta referenskörningsproceduren där Ettan Digester Control Software-nålarna flyttas till referenspositionen. Kör Home Phase från servicefönstret under Tools/Service. Avstängning Följ anvisningarna nedan för att stänga av Ettan Digester och Ettan Digester Control Software. Steg 1 2 Åtgärd Stäng av Ettan Digester Control Software genom att välja File:Exit. Slå från strömbrytaren på vätskehanteraren. Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 35
3 Installation 3.5 Anslutningar 3.5 Anslutningar Kommunikation Anslut Ettan Digester i enlighet med elritningarna i avsnittet El- och kommunikationsanslutningar, på sidan 14. Se till att Ettan Digester Control Software är installerad på datorn. Ytterligare information om installation av programvaran finns i Sektion 3.7 Installera om Ettan Digester Control Software, på sidan 44. OBSERVERA Alla datorer som används med utrustningen måste uppfylla standarden IEC 60950 och installeras i enlighet med tillverkarens anvisningar. Elström Anslut nätsladden till ett jordat uttag som uppfyller specifikationerna i avsnittet Sektion 3.1 Krav på lokalen, på sidan 31. Under den ursprungliga installationen konfigureras Ettan Digester för ett specifikt spänningsintervall genom att lämpligt säkringsfack installeras. Innan instrumentet installeras om måste du se till att rätt säkringsfack för huvudspänningen på den nya platsen har installerats. Om du behöver ändra huvudspänningskonfiguration, se anvisningarna i Byta ut huvudsäkringarna, på sidan 79 vid installation av huvudsäkringar. Konfiguration av maskinvara Innan Ettan Digester tas i bruk för första gången måste systemkonfigurationen verifieras. Systemkonfigurationen utförs på två nivåer. 1 Maskinvaruinriktning, se avsnittet Sektion 3.6 Inriktning av maskinvara, på sidan 38. 2 Systemkonfiguration från Ettan Digester Control Software, Sektion 4.3 Att starta kontrollsystemet, på sidan 49. Systemkonfigurationen bör även verifieras: Om rörliga delar (såsom sondnålar) har bytts ut. Om en ny version av Ettan Digester Control Software har installerats. Efter ett strömavbrott. 36 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
3 Installation 3.5 Anslutningar Om Ettan Digester har flyttats till en ny plats. När Home phase-verktyget har körts. Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 37
3 Installation 3.6 Inriktning av maskinvara 3.6 Inriktning av maskinvara Först ska maskinvaran riktas in, dvs. basplattan ska riktas in i förhållande till x/y-armen och provnålarna ska riktas in i förhållande till basplattan. Följande steg utförs innan instrumentet slås på och Ettan Digester Control Software startas. Översikt av inriktning av basplattan Basplattan vilar på tre justerbara stöd. Stödet längst till vänster (märkt A i figuren nedan) ska inte justeras, för att säkerställa att basplattans höjd inte ändras. Stödens höjd kan justeras genom att tumhjulet vrids sedan skruven mitt på stödet lossats. Basplattans viktigaste delar Basplattan med nivåutjämningstöd A C, lutningsaxeln och kalibreringsverktygets positioner utmärkta: 1 2 3 A C + B + + 4 5 Del 1 2 3 4 5 Funktion Position för kalibreringsverktyg (3 positioner) (+) Mikroplattans skåra (8 positioner) Nivåutjämningstöd A Basplatta Lutningsaxel 38 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
3 Installation 3.6 Inriktning av maskinvara Kalibreringsverktyget Del 1 2 3 4 5 6 Funktion Kalibreringsverktyg Kalibreringsverktygets hållare Kalibreringsstång Låsskruv Basplatta Tumhjul Procedur för inriktning av basplattan Proceduren för inriktning av basplattan består av 2 steg: Kalibrering av z-armens höjd. Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 39
3 Installation 3.6 Inriktning av maskinvara Justering av höjden av stöd B och C. Kalibrering av z-armens höjd Steg 1 2 3 4 Åtgärd Kontrollera att huvudströmbrytaren är avstängd. Lossa skruvarna som låser nivåutjämningstöd A och B. Flytta z-armen så att kalibreringsverktygets hållare är ovanför och ca 5 cm till vänster om nivåutjämningstöd A. För in kalibreringsverktyget i dess hållare och lossa skruven så att kalibreringsstången kan förflytta sig fritt och vilar på basplattan vid lutningsaxeln. Basplattans viktigaste delar visas i avsnittet Översikt av inriktning av basplattan, på sidan 38. Anm: Kalibreringsstångens plana ände ska vara vänd mot basplattans yta. 5 Dra åt skruven igen för att fastställa z-armens höjd ovanför basplattan. Avståndet till basplattan ges nu av det låsta kalibreringsverktyget, som används vid justering av stöd B och C. 6 Ta bort kalibreringsverktyget från hållaren. 40 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
3 Installation 3.6 Inriktning av maskinvara Justering av höjden för stöd B och C. Steg 1 2 3 4 5 6 7 8 Åtgärd Flytta z-armen till en position nära nivåutjämningstöd B längs lutningsaxeln. För in kalibreringsverktyget igen och kontrollera att dess spets befinner sig någonstans längs lutningsaxeln. Vrid tumhjulet på stöd B så att kalibreringsverktyget vilar med spetsen på basplattan och samtidigt med mässingsbussningen på kalibreringsverktygets hållare på z-armen. Ta bort kalibreringsverktyget från hållaren. Flytta z-armen så att låsskruven på stöd B kan dras åt. Flytta z-armen till positionen på mikroplattans skåra framför stöd C, se avsnittet Översikt av inriktning av basplattan, på sidan 38, och för in kalibreringsverktyget igen. Justera höjden på stöd C. Ta bort kalibreringsverktyget och dra åt skruven på stöd C. Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 41
3 Installation 3.6 Inriktning av maskinvara Justering av nålhöjd Det andra steget i maskinvarukonfigurationen är att justera de enskilda provnålarna i förhållande till den redan tidigare inriktade basplattan. Varje nål har sin egen fästskruv i nålhuvudet och kan därför justeras individuellt. 1 2 3 Del 1 2 3 Funktion Sexkantsnyckel, 1,5 mm Nålhuvud Z-arm Procedur för nåljustering Steg 1 2 Åtgärd Kontrollera att instrumentets strömbrytare är frånslagen. Lossa de åtta sexkantsskruvarna som låser fast nålarna (se avsnittet Justering av nålhöjd, på sidan 42). 42 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
3 Installation 3.6 Inriktning av maskinvara Steg 3 4 Åtgärd Flytta z-armen manuellt till en position för någon av mikroplattans skåror på basplattan. Sänk nålhuvudet så att nålarna lätt vidrör basplattan, se figuren nedan. Anm: Den tredje nålen från höger behöver justeras. 5 6 Lås alla nålarna i position genom att dra åt sexkantsskruvarna. Se till att alla skruvar fortfarande rör vid basplattan. Höj nålhuvudet och flytta x/y-armen till referenspositionen. Nålarnas spetsar är nu inriktade i förhållande till basplattan. Instrumentet kan nu slås på, och de återstående stegen i systemkonfigurationen kan utföras inifrån instrumentets styrprogram. Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 43
3 Installation 3.7 Installera om Ettan Digester Control Software 3.7 Installera om Ettan Digester Control Software Instrumentet levereras med alla nödvändiga program installerade. Följ stegen nedan om Ettan Digester Control Software måste installeras om (till exempel efter en hårddiskkrasch). Installationsprocedur Utför procedurerna i denna följd: Installera instrumentets programvara Installera Ettan Digester Control Software Ytterligare information finns i Ettan Digester Instrument Handbook. 44 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
3 Installation 3.8 Reservdelar och tillbehör 3.8 Reservdelar och tillbehör För korrekt och uppdaterad information om reservdelar och tillbehör, gå in på www.gelifesciences.com/2de Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 45
4 Drift 4 Drift Om detta kapitel Det här kapitlet beskriver hur du gör för att använda Ettan Digester. VARNING För tillämpliga säkerhetsmeddelanden, varningar och försiktighetsåtgärder, se Sektion 2.1 Säkerhetsinstruktioner, på sidan 19. I det här kapitlet Sektion 4.1 Användningsöversikt 4.2 Starta instrumentet 4.3 Att starta kontrollsystemet 4.4 Sätta upp en körning 4.5 Redigera en metod 4.6 Förberedelser före start 4.7 Utföra en körning 4.8 Rutiner efter en körning 4.9 Programvaruverktyg Se sidan 47 48 49 53 55 62 66 70 71 46 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
4 Drift 4.1 Användningsöversikt 4.1 Användningsöversikt Det normala arbetsflödet i Ettan Digester, efter att systemet slagits på, kan delas upp i följande steg: Steg 1 2 3 4 5 Åtgärd Tilldelning av ventilpositionerna Val av metodparametrar Förberedelse av systemet före start Val av typ av körningsläge Körning av digereringen Se Ettan Digester User Manual för digereringsprotokoll. Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 47
4 Drift 4.2 Starta instrumentet 4.2 Starta instrumentet VARNING Under inga som helst omständigheter ska händer eller fingrar placeras under provsonden när instrumentet är igång. Provsonden kan tränga igenom huden. Steg 1 2 Åtgärd Slå på vätskehanteraren med 8 nålar genom att ställa strömbrytaren i läge I. Slå på den 8-kanaliga ventilen genom att sätta i kontakten i vägguttaget. 48 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
4 Drift 4.3 Att starta kontrollsystemet 4.3 Att starta kontrollsystemet Steg 1 2 Åtgärd Sätt på monitorn, datorn och eventuellt en skrivare i enlighet med tillverkarens instruktioner. Vänta på att datorn ska starta. Starta Ettan Digester Control Software från Windows Start-meny. All Programs:GE Healthcare:Ettan Digester Resultat: En välkomstskärm visas i några sekunder medan programmet startas. Välkomstskärmen visar programvaruversionen och information om upphovsrätt. Efter välkomstskärmen visas en dialogruta för instrumentinitiering: Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 49
4 Drift 4.3 Att starta kontrollsystemet Steg 3 Åtgärd Klicka på OK för att starta Homing-proceduren. FÖRSIKTIG Rörliga delar. När Ettan Digester börjar referenskörningsprocessen rör sig såväl nålar och sprutor som x/y/z-armen. Håll ett betryggande avstånd till dessa rörliga delar så att du inte skadas. Resultat: 1 2 3 Ettan Digester Control Software öppnas med standardmetodens parametrar inlästa. Ytterligare information om standardmetoder finns i Spara en metod, på sidan 53. 50 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
4 Drift 4.3 Att starta kontrollsystemet Huvudfönstret i Ettan Digester Control Software 1 2 4 3 Komponent 1 2 3 4 Beskrivning Inställning av metod Inställning av körningsläge Tilldelning av buffertledning/ventil Information om körningsstyrning och instrumentstatus (ytterligare information finns i Sektion 4.4 Sätta upp en körning, på sidan 53) Menyfältet i huvudfönstret innehåller följande menyer: Meny File Mode Beskrivning Denna meny används för att ladda/spara metoder och för att avsluta Ettan Digester Control Software. Denna meny används för att växla mellan sats- och manuellt läge. Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 51
4 Drift 4.3 Att starta kontrollsystemet Meny Setup Tools About Beskrivning Denna meny innehåller endast ett alternativ, System Setup, som öppnar fönstret System Setup. Från denna meny är det möjligt att granska metoder, utdatafiler, flöda Ettan Digester, visa systeminformation och utföra grundläggande underhållsåtgärder. På denna meny visas välkomstskärmen och information om upphovsrätt. Ytterligare information om huvudfönstrets menyfält finns i Ettan Digester User Manual. 52 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
4 Drift 4.4 Sätta upp en körning 4.4 Sätta upp en körning Tilldelning av ventilpositionerna Alla steg i digereringsprocessen använder en specifik ventilposition. Bufferten som flödar från varje ventilposition kan tilldelas i Valve Position Assignment-området i huvudfönstret. Denna information sparas tillsammans med en metod som uppmanar användaren att placera buffertledningar i lämpliga lösningar. Spara en metod När en metod har definierats i huvudfönstret kan den sparas och lätt öppnas vid framtida tillfällen. Steg 1 2 Åtgärd Välj File:Save Method. Resultat: Dialogrutan Save öppnas. Skriv in ett lämpligt filnamn för metoden. Klicka på Save. Resultat: Metoden sparas med filtillägget *.dig. Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 53
4 Drift 4.4 Sätta upp en körning Spara en standardmetod Det är möjligt att spara metoden som visas i huvudfönstret som standardmetod. Denna metod visas sedan automatiskt i huvudfönstret nästa gång Ettan Digester Control Software startas. Steg 1 2 Åtgärd Välj File:Save Method. Resultat: En meddelanderuta öppnas där du ombeds bekräfta att du vill skriva över standardmetoden. Klicka för att bekräfta. Resultat: Filen sparas nu automatisk med filnamnet default.dig. Öppna en metod Följ anvisningarna nedan för att öppna en tidigare sparad metod: Steg 1 2 Åtgärd Välj File:Save Method. Resultat: Dialogrutan Open visas. Lokalisera den erfordrade metodfilen. Klicka på Open. Resultat: Metoden visas i huvudfönstret. 54 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
4 Drift 4.5 Redigera en metod 4.5 Redigera en metod Metoden som visas i huvudfönstret är den metod som kommer att användas när man trycker på knappen Run. Det är därför viktigt att kontrollera att metoden är korrekt innan instrumentet körs. Det finns flera metodsteg som kommer att köras i den ordning som visas i tabellen nedan. Det är möjligt att hoppa över vilket som helst antal eller kombination av dessa steg under metoden. Metodsteg Remove liquid Wash 1, 2, 3 Dry Digest Sample Transfer Hold Enzyme Add Buffer Transfer Step 1, 2, 3 Beskrivning Avlägsnar en vätska som lämnats med proppen efter punktsökning. Avfärgar och balanserar proppen före tillsats av enzym och digerering. Väntetid för att gelproppen ska torka före digerering för att öka enzyminförande i proppen. Trypsin tillsatt till gelproppen. Möjlighet att tillsätta mer/annan buffert. Ett prov på digestionsblandningen kan överföras direkt till extraktionsplattan och tas till analys. Aktiv extraktion kan användas för att extrahera peptider från gelproppen. Provet kan när som helst avlägsnas från provplattan till extraktionsplatten till analys. Det finns även fyra Hold kryssrutor i metodinställningen. När metoden når ett Hold-läge som har kontrollerats går Ettan Digester permanent över i pausläge tills man trycker på knappen Continue. Varje steg i metodkörningen beskrivs mer i detalj i följande avsnitt. Avlägsna vätska Den här metoden avlägsnar all vätska som är kvar i mikroplattorna från punktsökning. Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 55
4 Drift 4.5 Redigera en metod Programvara kommando Skip Valve Pos Volume Beskrivning Hoppar över/inkluderar steget Avlägsna vätska. Ställer in den ventilposition som används för tvätt- och hydraulvätska när vätska aspireras från brunnarna. Ställer in volymen som ska avlägsnas från varje mikroplattsbrunn. Giltigt intervall är 0 till 350 µl. Tvätt 1, 2 och 3 Tvättningsstegen används huvudsakligen för avfärgning av gelpropparna. Varje tvättningssteg kan använda en annorlunda vätska och kan upprepas upp till 10 gånger. Kryssrutan Hold kan väljas (ej obligatorisk åtgärd) för att pausa instrumentet mellan stegen Remove Liquid och Wash. Programvara kommando Skip Beskrivning Hoppar över/inkluderar tvättningssteget. Varje steg kan hoppas över/inkluderas individuellt. Anm: Steget hoppas över om rutan har markerats. Cycles Volume Time Valve Pos Väljer antalet cykler som ska utföra de individuella tvättningsstegen. Väljer tvättningsvätskans volym, som ska dispenseras i varje brunn. Väljer tiden som gelproppen ska inkuberas i tvättningsvätskan innan den avlägsnas från brunnen. Väljer vilken ventilposition som ska användas vid dispensering av tvättningsvätska. 56 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
4 Drift 4.5 Redigera en metod Torkning Detta är steget efter tvättning. Kryssrutan Hold kan väljas (ej obligatorisk åtgärd) för att pausa instrumentet mellan stegen Wash och Dry. Detta steg används för att torka gelpropparna före tillsats av enzym. Detta steg kan utföras på ett av följande två sätt: Använd en vätska med hög halt av organiskt lösningsmedel (t.ex. 100 % acetonitril) som slutligt tvättningsprotokoll och lämna sedan kvar mikroplattorna på Ettan Digester och låt dem lufttorka. Typisk torkningstid är 60 till 90 minuter, beroende på lokaltemperatur och luftfuktighetsförhållandena (1 mm geltjocklek) Utför torkningen i extern torkningsutrustning, t.ex. en vakuumcentrifug. Programvara kommando Skip Beskrivning Hoppar över/inkluderar torkningssteget. Anm: Steget hoppas över om rutan har markerats. Time Väljer väntetiden för att gelpropparna ska torka. Torkningen kan avbrytas (genom att trycka på knappen Continue) om manuell inspektion av mikroplattorna visar att gelpropparna har torkats tillräckligt. Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 57
4 Drift 4.5 Redigera en metod Digerering Detta är steget efter torkningssteget. En valfri Hold checkruta kan väljas för att pausa instrumentet mellan Dry- och Digest-steget. I detta steg tillsätts enzym till gelpropparna. Om enzymet tillsätts i en inaktiv form kan det aktiveras genom tillsats av en lämplig buffert. Det är även möjligt att överföra all eller en del av digestionslösningen från provplattan till extraktionsplattan. Programvara kommando Skip Enzyme Time (Enzyme) Valve Pos. (Enzyme) Beskrivning Hoppar över/inkluderar hela digeststeget. Väljer enzymvolym som ska tillsättas varje brunn. Enzymet kan tillsättas i en buffert där enzymet är aktivt (såsom 20 mm ammoniumkarbonat för trypsin) eller i en buffert som håller enzymet inaktivt (såsom 1mM HCl). Väljer inkubationstiden efter enzym tillsatts till alla brunnar. Detta är viktigast när enzymet tillsätts till gelpropparna i en buffert som gör enzymet inaktivt. Tiden som ställts in här är den tid som gelpropparna tar att fullständigt rehydratisera med enzymet. Väljer buffertvätskan som ska användas som hydraulvätska när enzymet överförs från enzymbehållaren till brunnarna. Om enzymet tillsätts till gelpropparna i en inaktiv form, är det viktigt att enzymlösningen inte är kontaminerad med en aktiverande buffert. 58 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
4 Drift 4.5 Redigera en metod Programvara kommando Add Buffer Beskrivning Hoppar över/inkluderar ytterligare buffert. Om enzymet tillsatts till gelpropparna i en lösning där det redan aktiverats, finns inget behov att tillsätta ytterligare aktiverande buffert. Anm: Om denna checkruta valts kommer bufferten att tillsättas till gelproppen. Volume (Add Buffer) Valve Pos. (Add Buffer) Time (Add Buffer) Transfer Volume (Transfer) Valve Pos. (Transfer) Väljer volymen buffertvätska som ska tillsättas varje brunn. Väljer vilken ventilposition som ska användas vid tillsats av enzymbuffert. Välj inkubationstid för digerering. Hoppar över/inkluderar överföring av delen från prov till extraktionsplatta. Ställer in volymen vätska som ska överföras från provplattan till extraktionsplattans brunnar. Anm: Om denna checkruta valts kommer provet att överföras till extraktionsmikroplattan. Väljer hydralvätskan när delen flyttas från provplattan till provplattan till extraktionsplattan. Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 59
4 Drift 4.5 Redigera en metod Provöverföring Detta är det sista steget. Kryssrutan Hold kan väljas (ej obligatorisk åtgärd) för att pausa instrumentet mellan stegen Digest och Sample Transfer. I detta steg extraheras peptider från gelpropparna efter enzymreaktionen. Extraktionsprocessen utförs i provplattan. Den resulterande peptidlösningen kan sedan antingen lämnas kvar i provplattan eller överföras till extraktionsplattan. Programvara kommando Skip Cycles Beskrivning Hoppar över/inkluderar hela överföringssteget. Väljer antal gånger som hela provöverföringsprocessen ska upprepas. För de individuella överföringsstegen kan följande parametrar specificeras: Step 1, 2, 3 Hoppar över/inkluderar steget (varje steg 1, 2 och 3 kan hoppas över/inkluderas individuellt). Anm: I detta fall kommer steget att utföras om checkrutan markerats. Volume (Add) Valve Pos. Väljer volymen buffert som ska tillsättas gelproppen. Väljer vilken buffert som ska tillsättas. 60 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB
4 Drift 4.5 Redigera en metod Programvara kommando Time Mix Cycles Mix volume Transfer Volume Cycles Beskrivning Ställer in inkubationstiden efter att vätska tillsatts. Väljer ett antal blandningscykler. Dessa används, tillsammans med inställningen för blandningsvolymen, för att blanda kombinationen av vätskor i mikroplattans brunn. Om ingen blandning krävs ska detta värde ställas in på 0. Ställer in vätskevolymen som ska undanträngas under varje blandningscykel. Om denna ruta är markerad kommer en specifik volym vätska att överföras från provplattan till extraktionsplattan. Ställer in volymen vätska som ska överföras från provet till extraktionsplattan. Väljer antalet cykler som de individuella extraktionsstegen ska utföra. Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB 61
4 Drift 4.6 Förberedelser före start 4.6 Förberedelser före start Lösningar Alla lösningar som ska användas under digerering bör filtreras genom ett sterilt 0,2 µmfilter till en ren flaska som nyligen sköljts med Milli-Q (eller likvärdigt medel). Detta reducerar starkt risken för damm (och därmed keratiner) i digereringsblandningen, vilket i så fall syns vid masspektrometri. Det är även nödvändigt att säkerställa att det finns tillräckligt med lösning för att gelpropparna ska kunna behandlas. Följande formel kan användas för att beräkna minsta volym lösning som krävs för en digereringskörning (alla värden i µl). Tvättbuffertar: 4000 (antal flödessteg) + [(dispenseringsvolym 8) (antal kolonner som ska köras) (antal cykler)] = Total volym som använts under metoden (µl) Enzymbuffert och provöverföringsbuffertar (extraheringsbuffertar): 4000 (antal flödessteg) + [(dispenseringsvolym 8) (antal kolonner som ska köras)] + 2 [(sköljningsvolym 8) (antal sköljningssteg) (antal kolonner som ska köras)] = Total volym som använts under metoden (µl) Denna volym representerar den minsta volym av varje buffert som kommer att förbrukas under digereringsmetsoden. En större volym än denna krävs för att täcka luftstenen på änden av varje buffertledning och för att flöda systemet. Enzymvolym Enzymvolymen som krävs för körningen av en sats beräknas av programmet och visas för användaren när han/hon trycker på Start-knappen, se avsnittet Sektion 4.7 Utföra en körning, på sidan 66. Volymen beräknas enligt följande formel: Min.volym för enzymkärl (µl): [(enzymvolym 8) antal kolonner som ska köras] enzymvolym + 500] Min.volym för enzymslang (µl): 62 Ettan Digester Bruksanvisning 28964985 AB