DNA replikation DNA RNA transkription RNA Protein translation Protein



Relevanta dokument
Cellbiologi: Intracellulär sortering och cellsignalering

Resultat:... (Cellbiologi:... Immunologi...) Betyg...

Cellen och biomolekyler

Biomolekyler & Levande organismer består av celler. Kapitel 3 & 4

Cellbiologi. Maria Ankarcrona Nov 2010

Cellbiologi. Maria Ankarcrona Nov

Cellbiologi. Cellens delar (organeller)

Resultat:... (Cellbiologi:... Immunologi...) Betyg...

Intracellulära organeller, proteinmodifiering och transport, endo/exocytos Kap10 + delar av kap 13

Kapitel Var är vi i kursen???

Ägg till embryo Dugga Platsnummer VIKTIGT ATT DU FYLLER I OCH LÄMNAR IN! TEXTA TACK. Efternamn. Förnamn. Personnummer

Tentamen. Lycka till! Medicin A, Molekylär cellbiologi. Kurskod: MC1004. Kursansvarig: Christina Karlsson. Datum Skrivtid 4h

IDENTITETSBLAD Dugga

Tentamen. Kurskod: MC1004. Medicin A, Molekylär cellbiologi. Kursansvarig: Christina Karlsson. Datum Skrivtid 4h

Biologi 2. Cellbiologi

Rekommendationer för inläsning av läroboken Erlanson-Albertsson C och Gullberg U: Cellbiologi, Studentlitteratur 2007

Från cell till individ. Kap 2

Cellbiologi. Cellens delar (organeller)

Medicinsk grundkurs. Cellen och genetik. Datum

Cellen. Cellen. Celler. Cellen utgör den minsta strukturella och funktionella enheten i all levande materia. Vår kropp består av ca 70% vatten

KARLSTADS UNIVERSITET

Övningstentafrågor i Biokemi, Basåret VT 2012

Tentamen i Molekylär Cellbiologi 9 p Namn: Personnummer: Plats nr: Inlämnad kl: ID kollad: Poäng: Betyg:

Namn:... Årskurs... Personnummer... Glöm inte skriva namn på immunologidelen också

Instuderingsfrågor till Cellbiologi av Charlotte Erlanson-Albertsson och Urban Gullberg

IDENTITETSBLAD Dugga

Poäng: Godkänt 35 p. Max 70 p.

Ägg till embryo Dugga Platsnummer VIKTIGT ATT DU FYLLER I OCH LÄMNAR IN! TEXTA TACK. Efternamn. Förnamn. Personnummer

Resultat:... (Cellbiologi:... Immunologi...) Betyg...

Ägg till embryo Dugga Platsnummer VIKTIGT ATT DU FYLLER I OCH LÄMNAR IN! TEXTA TACK. Efternamn. Förnamn. Personnummer

Kunskapsmål ht (reviderade )

Biologiska membran Kap 10 fig10-1, 15, 18, 19 & med tillhörande beskrivningar. Övrigt är repetition.

Från cell till individ. Kap 2

IDENTITETSBLAD Dugga

Från DNA till protein, dvs den centrala dogmen

DEN MINSTA BYGGSTENEN CELLEN

RNA-syntes och Proteinsyntes

Info r prov i cellbiologi Biologi B

Resultat:... (Cellbiologi:... Immunologi...) Betyg...

PROVGENOMGÅNG AVSNITT 1 BIOLOGI 2

Ägg till embryo Dugga Platsnummer VIKTIGT ATT DU FYLLER I OCH LÄMNAR IN! TEXTA TACK. Efternamn. Förnamn. Personnummer

Tentamen NMET2 HT2014 (7/ ) (Totalpoäng 56 p)

Från DNA till protein, dvs den centrala dogmen

Tentamen i Molekylär Cellbiologi

Transkription och translation. DNA RNA Protein. Introduktion till biomedicin Jan-Olov Höög 1

Cellbiologi med Immunologi Kursansvarig: Jacob Odeberg, KTH

Vad är MHC? MHC och TCR struktur. Antigen processering och presentation. Kursbok: The immune system Peter Parham

CELLSIGNALERING CELLSIGNALERING. alla levande celler tar emot och skickar signaler

Innehåll. Cellfysiologi och mikrobiologi. Humana cellers storlekar. Cellmembranets uppbyggnad Ambulans- och akutsjukvård

CELLKÄRNAN INNEHÅLL CELLKÄRNAN. cellkärnan

VI MÅSTE PRATA MED VARANDRA CELLENS KOMMUNIKATION

KOMMENTARER TILL KAPITEL 9 OCH KAPITEL 16

Den allra första cellen bakteriecellen prokaryot cell

Signaltransduktion. Signalling by the membrane. Fosfatidylinositol och sekundära budbärare CMB

Kursbok: The immune system Peter Parham

Svar till övningstentafrågor i Biokemi, Basåret VT 2012

Så började det Liv, cellens byggstenar. Biologi 1 kap 2

Integrerad signaltransduktion

Tentamen i Molekylär Cellbiologi 9 p Namn: Personnummer: Plats nr: Inlämnad kl: ID kollad: Poäng: Betyg:

Från gen till protein. Niklas Dahrén

Genetik I. Jessica Abbott

Huden och Slemhinnan. Table of Contents. Pooyan Masarrat Vt- 13

Kromosomer, celldelning och förökning

Tentamen NMET2 VT2015 (17/4 2015) (Totalpoäng 55 p)

STOCKHOLMS UNIVERSITET. Institutionen för biologisk grundutbildning. Tentamen i Molekylär cellbiologi 10 p Namn: _.. Personnummer:.

CELLSIGNALERING CELLSIGNALERING. alla levande celler tar emot och skickar signaler

CELLDELNING 1 MITOS EUKARYOT CELLDELNING. Eukaryot celldelning. 1. cellcykeln 2. mitos 3. cytokinesis

DNA-molekylen upptäcktes DNA - varken protein, kolhydrat eller lipid.

Cellen och vävnader. Innehåll. Kursmål SJSF11 Människan: biologi och hälsa

Övningstentamen i Biologi 2, Basåret.

1. Vilket påstående förklarar bäst vad som menas med ett proteins sekundärstruktur?

Översikt metabolismen

Lärarhandledning gällande sidorna 6-27 Inledning: (länk) Läromedlet har sju kapitel: 5. Celler och bioteknik

Ägg till embryo Dugga Platsnummer VIKTIGT ATT DU FYLLER I OCH LÄMNAR IN! TEXTA TACK. Efternamn. Förnamn. Personnummer

Cellen och vävnader. Innehåll. Cellernas storlekar SJSE11 Människan: biologi och hälsa

BASÅRET KEMI B BIOKEMI VT PROTEINER OCH ENZYMER (sid )

Ladokkod: Tentamen ges för: Gsjuk15v. Namn: (Ifylles av student) Personnummer: (Ifylles av student) Tentamensdatum: Tid:

Cellen och vävnader. Innehåll. Kursmål SJSE11 Människan: biologi och hälsa

BIOLOGI. Vår fantastiska kropp

Proteiner. Biomolekyler kap 7

Proteiner. Kap 3,

De olika typer av T celler är specialiserade på att identifiera och bekämpa patogen på olika sätt.

CYTOSKELETT OCH CELLRÖRELSE

Kod: Personnummer: Plats nr: Inlämnad kl: ID kollad: Poäng: Betyg: SKRIV DIN KOD PÅ ALLA SIDOR ÄVEN OM FRÅGAN LÄMNAS OBESVARAD.

Cell och molekylärbiologi (BL3008) Omtentamen CMB-II (11 hp) Kod: Personnummer: Plats nr: Inlämnad kl: ID kollad: Poäng: Betyg:

Molekylärbiologi: Betygskriterier

BASÅRET KEMI B BIOKEMI VT METABOLISM (sid )

CELLBIOLOGI CELLBIOLOGI. Cellbiologi med Immunologi (3A1512) Kursansvarig: Jacob Odeberg, KTH

Tentamen Reproduktion och utveckling, Åke Strids frågor:

Apoptos Kap 18. Alberts et al., Essential Cellbiology 4th ed, 2014 Apoptos kap 18, sid

Stamceller För att få mer kött på benen

BAKTERIERNA, VÅRA VÄNNER

Tenta 1 Cellbiologi HT- 2016

Ägg till embryo Dugga Platsnummer VIKTIGT ATT DU FYLLER I OCH LÄMNAR IN! TEXTA TACK. Efternamn. Förnamn. Personnummer

Fig 1-29 Alla celler har utvecklats från samma urcell för ca 3,5 miljarder år sedan Fem kungadömen och Tre domäner

Tidiga erfarenheter av arvets mysterier

2. Nämn fyra mekanismer varmed enzymaktivitet kan regleras och förklara i korthet vad de innebär.

Tentamen Biologi BI1112 Termin och år: Klockan:

Cellbiologi med Immunologi Kursansvarig: Jacob Odeberg, KTH

Proteiner. Biomolekyler kap 7

Transkript:

Cellbiologi en sammanfattning RNA - oftast info bärare, ibland struktur, ibland katalytisk. Uppbyggd a baserna: U, A, G, C. Protein - Ibland struktur, ibland katalys. Uppbyggd a aminosyror. Mutationer - Original genom Gen nyhet Intragenic mutation Gen duplikation + DNA-segment + + omfördelning Eukaryot har kärna, organeller och är ca 1000 ggr större än prokaryoter. Cellteorin - 1. Allt leande består a celler. 2. Cellen minsta enhet för autonomt li. 3. Celler uppkommer ur andra celler. Post-translationella modifieringarna klipper bort en bit a peptiden (principiell protolys), tillsätter cofaktorer, additions reaktioner t ex glykosylering, lipider. Centrala dogmat DNA replikation DNA RNA transkription RNA Protein translation Protein Genotyp (arsmassa) + miljö = fenotyp (obsererbart t ex egenskaper, utreende) Ortologer - 2 gener med gemensam förfäder gen Paralog - 2 gener som uppstått genom duplikation inom ett genom Homologer - relaterade gener Horisontell öerföring a gener t ex irus lämnar plasmider i ärdcell utbyte a gener, jämnför med sex. Protister - encelliga eukaryota organismer Endosymbiont teorin man tror att organeller som mitokondrier och kloroplaster frånbörjan ar bakterier som fagocyterades a eukaryoter men ble inte uppätna utan symbios uppstod. Plasma membran består a fosfolipider, glykolipider och kolesterol. De är asymmetriska (de tå lagrena har ofta olika lipidsammansättning). Fosfolipider en hydrofil del (glycerol + fosfat) och en hydrofob del (tå fettsyrosansar), ds amfipatisk. Det finns fyra olika fosfolipider i däggdjurs plasma membran: fosfatidyletanolamin, fosfatidylserin (insidan a PM, neg laddning, om det finns på utsidan leder det till apoptos), fosfatidylkolin och sfingomyelin. Ju fler omättade fettsyror desto mer lättflytande membran. Glykolipider sfingomyeliner fär fosfokolinet är utbytt med en eller flera sockermolekyler. Celebrosid = glykolipid med en glu eller gal. Gangliosid = glykolipid med grenade oligosackarider. Finns bara på utsidan a PM och är iktig för celligenkänning. Kolesterol en hydrofil OH grupp, en steroid ringsruktur och en opolär kolsans. Ju mer kolesterol desto mer lättflytande blir membranet. Membranproteiner kan ara integrala (går då genom lipidskicktet ofta ia α-helixar) eller perifiera (bundna till ytan a lipidskiktet). Kan solubiliseras med detergenter som då ersätter lipiderna. Transport öer cellmembran för att upprätthålla osmotisk balans, elektrokemisk potential = koncentrations gradient, iktig för nersignaler, näringsämnen och byggstenar måste in och afallsprodukter ut. Diffusion transport utan proteiner öer membran. Små molekyler som: O 2, CO 2, N 2, H 2 O, urea och små sockermolekyler. Transport passitransport kräer ej energi. Akti transport kräer energi, kan ske mot koncentrationsgradient. Primär akti transport får energin direkt från ATP (t ex Na + -K + pump). Sekundär akti transport då energi erbjuds i form a en koncentrationsgradient som bildats tidigare (t ex importen a glukos in i njur och tarmceller, glukospermeas).

Kanaler transportprotein som funkar som ett rör. Permeaser transportprotein som funkar som genom konformationsändringar. Bärare. Uniport ett ämne, symport tå ämnen åt samma håll, antiport tå ämnen åt olika håll. ER endoplasmatiskt ritikulum är ett transportnäterk a tunna membraner i cytoplasman för issa modifikationer och specifika slutdestinationer. Den ruffa sorten a ER har ribosomer fäst till sig, det har inte smooth ER. I membranerna finns också enzymer och andra proteiner. Är en förlängning a kärnans yttersta membran. Golgi apparaten här sker den post-translationella modifieringar t ex sätts glykos på för att skydda mot nedbrytning och möjliggöra interaktioner. Inpackning i esiklar sker här. Mitokondrier här sker cellandningen. Producerar energi (ATP). Har ett inner- och ett yttermebran. Har eget DNA och egna ribosomer. Kärnan DNA lagras här och RNA transkripteras. Har porer i membranet för in och ut transport. Ribosom RNA translateras till proteiner här. Det finns jätte många eftersom proteinsyntes är äldigt iktigt i celler. Flyter i cytoplasman eller binder till ER. Är mycket små. Lysosom nedbrytning sker här. Lågt ph 3-5 eftersom lytiska reaktioner lättare sker i sur miljö, detta är äen ett skydd om lysosomerna spricker och ph höjs. Peroxiosom bryter ner fettsyror, aminosyror och alkohol. Dessa reaktioner producerar äteperoxid som enzymet katalas bryter ner till syre och atten. Endosom för stadium till lysosomer. Transporterar ia ensocytos saker in i cellen för nedbrytning. Kloroplaster här sker fotosyntes i äxter. Innehåller en ätska (stroma) och grana (buntar a skior som heter tylakoider). Har eget DNA och kan dela sig själ. Extracellulära matrix är ett aancerat näterk a makro-molekyler som hjälper till att hålla ihop celler och änad. Förmedlar signaler genom att integrera med cellulära receptorer. Består till största delen a kolagen, proteoglycans som elastin och celladhesions proteiner som fibronectin och laminius. Kolagenfiber ett protein som är trihelixar (homo/heterotrimers) bestående a kollagen typ specifika α-kedjor. Var tredje aminosyra är en glycin för ingen annan får rum inuti spiralen. Fibrerna är långa, tunna och stela. Cytoskelett ansarar för cellens form, tilläxt, rörelse, mekanisk styrka, organell trafik och isärdragandet a kromosomer under mitosen. Består a (se nedan) filament som hålls samman a icke koalenta interaktioner. Aktin filament står för form, rörlighet och kontration. Uppbyggd a tå strå-helixar, monomererna och hela filamenten är polära. Är flexibla och förekommer mest id plasma membranet. Cofilin binder gamla ADP-bunda delar a aktin som bryts ner och ökar turner. Microtubuli filament särar på kromosomerna, står för rörlighet (cilia/flageller) och esikulär transport. Är uppbyggd a polära α och β heterodimerer, därför är hela filamentet polärt. Uppbyggda som ihåliga cylindrar som är ganska rigida. Dom är långa och raka och har oftast en ända fäst till en centrosom kring kärnan. Maps organsierar hur tight mt är packade i hopar. Intramediära filament står för stabilitet, cell-cell kontakt och signalering. Replika fibrer uppbyggda a långa monomerer med irrarr-ändar och lång α-helix i mitten. Sätts först ihop tå och tå och sedan flera ihop. Nukleation först sker en ihop samling a monomerer till kärnor oligomerer, det kallas nukleation. Sedan sker en elongering då filamentet äxer. Då jämnikt inställer sig sätts lika många monomerer på som tas a. Treadmilling ström eller flöde a monomerer. Gör så att filamenten kan förslytta sig. Dynamisk instabilitet och treadmilling kräer energi men är anändbart för att de kan göra snabba ändringar. Motor proteiner rör sig längst med cytoskelett filament och anänder energi från ATP. T ex dynein och kinesin. Sköter organell trafik och orsakar att filament glider mot arandra som leder till muskel kontraktioner och cell rörelse mha cilia (korta) och flageller (långa, 9+2). Rör sig mot/från + ände, olika binder olika filament och olika binder olika laster. Myosin är det protein som tillsammans med aktin filament orsakar muskel kontraktioner. Myosinets nedstickande "huud" fäster id aktinet. Sedan sträar den mot att böja sig och därigenom dra i aktinet. Därefter släpper myosinproteinet sitt grepp, rätar ut sig och är redo att fästa igen. Cell rörelse sker id embryouteckling, sårläkning och med immunsystemets celler. Efter signal utifrån sker en utäxt åt det håll cellen ska. Utäxten fäster med adhesion innan en ihopdragning/rörelse sker mha motorproteiner. Sist sker en upplösning a gamla adhesions kontakter. Virus är parasiter. DNA eller RNA inpackar i en kapsid a protein. Saknar egen ämnesomsättning. 0,4 nm stora är de största irusarna. Obilgata symbiat en eukaryotiskcell har fuserat och bildat symbios med prokaryotcell. T ex mitokontrier och kloroplaster. Fagocytos en cell äter upp t ex en annan cell eller irus. Bulktransport.

Osmos utjämning a koncentrationsskillnader. Integrin Transduktion utbyte a t ex signaler mellan flera signalproteiner i en signaläg. Cell adhesion Adhesion junctions kan dras ihop, är flexibelt och dynamiskt pga aktinet som förankrar i cellerna. Desmosomes är stabila skelett ty de har intermediära filament som förankrar dem i cellerna. Gap junctions är tå connexons (med 6 subenheter ar) som skapar en kanal mellan cellerna. Molekyler mindre än 1000 Da kan passera, kanalerna är placerade i grupper. Cell-cell adhesion Tight junction (fusion a cellmembran) Adhesion junction, cadherins (aktinfilament + cadherins) Desmosomes, cadherins (intermediära filament + cadherins) Gap junctions, connexins (kanaler) cadherins Lg- like CAMs integrins selectins ICAM VCAM COH Homofiliska interaktioner Heterofiliska interaktioner Hemidesmosome (intermediära filament) Focal contact (aktin filament) Integral membrane proteoglycan integrins Basal lamina Cell-matrix adhesion Integriner är bidirectionally singal receptorer. Det finns en hel genfamilj med α och β integriner. Genfamilj grupp gener som är relaterade till arandra. Är mycket anliga hos högre organismer, t ex globiner i människor. Strukturdelen har delis eller helt olika egenskaper hos proteinerna. Affinitet (K M ) och omsättningshastighet arierar (ty olika beho). Enzym som passar bäst i olika organ finns då regulatoriska delen a genen (promotorn) påerkar transkiptas faktorn (TF). Homologa genensamt eolutioärt ursprung Fyogenetiskt träd isar släktskap Alinement jämnförelse a gensekenser. Geners packning id celldelning som kromosomer.

En kromosom intron exon 30 gener Tre gener Ca 98% a människans DNA är okodande. Anledningen är att människors DNA är: Dipoloid, repetetit DNA (strukturella t ex centroner), duplikationer (genfamiljer, identiska gener), stora kontroll regioner och introner. En gen Dubbelhelixen a DNA iras tå ar runt en nukleosom (oktamerisk histon) och då kallas det chromatin. Chromatinfibrer bildas som helixar. Sen isas kromosomerna i utecklad form, kondenserad form och sen en hel kromosom. RNA processing kontroll - Optionellt exon Mutally exklusi exon Optionellt intron Internal splice site Haploid enkel kromosom uppsättning (könsceller). Diploid dubbelkromosom uppsättning Zygot det befruktade ägget Celldelning anliga celler tål ca 50 delningar ty telomererna på kromosomernas ändar förkortas id arje delning. Stamceller har låg diffrentieringsgrad (ännu inte diffrentierad), har hög celldelningsfrekens (hög prolifieringspotential) och bearas (återskapar sig själ id arje delning). Progenitor ursprungscell för iss utecklings äg t ex mot epitelceller. Totipotent fullständig utecklingspotential. Kan bilda alla celltyper. Embryonala stamceller. Pluri-, omni-, multipotenta flera celltyper kan bildas. Hos äldre embryon och hos nyfödda. Uni-, momopotenta kan bara bilda en celltyp. Determinerat genom ett transplantationsförsök kan man undersöka ifall en cell är determinerad eller ej. Växter Deral änad ytterst Vaskulär änad ledningar Parenkymal änad /grundänad anligast Meristem stamceller Aplikat i ändarna a äxterna. Skott och rötter. Skottspets Organformation Central zon odifferentierat Periferal zon Organs zon Rib meristem stamceller Organs uteckling Vegetati diffretierad änad Det är ingen irreersibel diffrentiering a äxter- Varje äxtcell är totipotent.

Epitelceller hud, matkanal, slemhinnor mm. Celler ut mot omginingen. Celldelningsaktiitet i epitelet fyller på med nya celler underifrån. I tarmarna behös nya celler för att kunna ta upp föda, de får utstå stora påfrestningar. Cellerna i tarmarna bildas i kryptor och puttas upp mot illius. Vänadsbildning beror på: frekens a cellbelning, trolighet för stamcellsdöd, trolighet att stamcells döttrar blir progenatorceller, tid för delningscykel a progenatorcell, trolighet för progenator celldöd, antal progenatorceller delningar innan celldiffrentiering och listid hos diffrentierade celler. Progenator Apoptos clean killing. Programmerad celldöd. Felaktiga, utslitna celler dödas. Modellorganismer Kontroll a genuttryck En cell uttrycker 5000-10000 gener. DNA 1. Transkriptions 2. RNA processing 3. RNA transport RNA transkriptas mrna kontroll kontroll (hur fort och lokaliseringskontroll mrna (hur många) och hur bra) (hur fort RNA till ribosom Inaktit mrna 5. mrna degradiations kontroll 4. Translations kontroll protein 6. Protein aktiitets kontroll Inaktit protein Vänad en grupp a celler med distinkt struktur och funktion. Kohesion ihop klistrade celler. Ytfaktorer, PM-proteiner. Polarisera celler olika miljöer skapas genom t ex hålrum. Iniduella celler uppleer olika miljöer. Genetisk programmering förstå ilka gener som ska ara på alt a. Vissa reersibla a/på, andra gener är irreersibla. Spatial kontroll läge Temporal kontroll rätt timing Från börja är alla celler a samma genotyp, men senare slås gener a/på. Homeotiska gener öergripande kontrollgener (TF). Påerkar ett stort antal gener under olika utecklingsstadier. Prolifieration tilläxt genom celldelning Diffrentiation handlar om cellspecifik genreglering. Celler med samma genotyp utecklar olika fenotyp. Det är en komplex process a cell-cell interaktioner. Determination celler går en speciell utecklingsäg. Ofta irreersibelt, men ibland reersibelt. Morfogenes formbildning. T ex anläggning a leer och hjärna som foster. Cellminne identitet för celler. Vet t ex att de är nerceller (leerceller behöer påminnas ofta ty de har dåligt cellminnne). Parakrina närliggande celler. Autokrina cellen själsignalerar. Patogener - saker man blir sjuka a t ex bakterier, sampar, maskar, irus mm. Måste markeras med t ex Ig för att fagocyteras a makrofager. Immunsystemet är ett försars system som skyddar kroppen. Består a innate (medfödda) immunförsaret och adaptie (anpassningsbara) immunförsaret. Om patogener kommer in i kroppen startar det medfödda systemet med att en fagocyternade cell bryter ner patogenen och presenterar fragment a den på sin yta. Sedan tar det anpassningsbara systemet öer då en T-cell aktieras genom att bindas till MCH-antigen komplex på den fagocyterande cellens yta. T-cellen klonar sig (alla kloner känner igen antigenet) och utecklas till olika T-celler (mördarceller och hjälparceller). T-mördarceller lämnar lymfknutan och börjar leta efter sitt antigen i kroppen, då den hittar det fäster den till målcellen som spricker och dör. T-hjälparceller II aktierar B-cellen, som börjar producera antikroppar riktade mot patogenen. T-hjälparcellen I aktierar makrofager. Innate är primitit och erkar lokalt, ospecifiserad och har inget minne. Eolutionärt utbrett hos djur, äxter och insekter. T ex hud, slemhinnor (sekret), kemiska substanser (proteaser i blod och lymfa), anti-mikrobiella peptider och fagocyterade celler. Försäkrar öerlenad till det adaptia försaret kan sättas in. Komplement systemet orsakar koncentrations obalans i patogenerna. Adaptie erkar i hela kroppen, äldigt specifikt, har ett minne (ny exposition för samma patogen leder till snabbare och starkare försar). Antigen presenterande celler - makrofag, monocyt, dendritisk cell och B-cell. Bryter ner patogen och presenterar fragment på sin yta. kärna cytosol

MHC- Major histocompatibility complex, T-cells receptorer. Klass I finns p på alla celler med kärna. Klass II finns p på makrofager, dendritiska celler, B- celler. Presentera peptider derierade från inaderande patogener för T-celler. Lymfsystemet är parallellt med blodsystemet och förenas med det. Det är bara anitkroppar och lymfocyter som får gå i både lymfa, änad och blod. Lymfknutar filtrerar ut patogener och säller id t ex förkylning. T-celler precursor bildas a hemopoietiska stamceller i benmärgen och förs till thymuskörteln där den mognar. Vid aktiering a MCH-antigen komplex klonar cellen sig och issa utecklas till T-mördarceller (cytotoxic) som fäster till patogenen och dödar den genom att aktiera patogenen till apoptos. Andra utecklas till T HI (hjälparceller) som aktierar makrofager eller T HII som aktierar B-celler. B-celler tillerkar antikroppar. Precursorcell tillerkas i benmärgen. Olika icke-aktierade B-celler har långlistid, men aktieras a antigen och muterar till perfekt matchning a antigen. En klonal expansion a specifika B-celler följer som sekreterar antikroppar. Antikroppar binder till antigen som ett enzym binder till ett substrat. Hög affinitet och hög specificitet. Det är inga koalenta bindningar som håller ihop antikropp-antigen utan det är ätebindningar, elektrostatiska interaktioner, an der Waals och hydrofoba effekten. Vi har ca 10 9 olika antikroppar men endast 30 000 gener. Det är löst genom ariation i genomet som pusslar ihop bitar (exon-intron) på lite olika sätt. Består a tå tunga kedjor och tå lätta kedjor som binds samman med disulfidbryggor. I N-terminalerna på de fyra kedjorna finns ariabla regioner, i de ariabla regionerna finns tre hyperariabla regioner. Antigenet binder till de hyperariabla regionerna som är loopar. Immunoglobuliner glykoproteiner. Det finns fem klasser: G, A, M, D och E. Epitrop specifik region på antigen som binder till en antikropp eller T-cells receptor. Hapten liten molekyl t ex fenol, som endast är immunogen om den binder till en större molekyl. Monoklonala antikroppar Antigen injiceras i mus, som tillerkar antikroppar mot antigen. Lymfocyter som producerar de specifika antikropparna tas ur mjälten. Dessa fuseras med myelomceller (tumör B-celler) från mus, som ej bildar antikropp men kan odlas in itro. Hybridceller odlas i specialmedium där myelomceller inte kan äxa och lymfocyter dör naturligt efter 2 eckor. De öerleande antikroppsbindande hybridcellerna späds ut och cellinjer från enstaka celler etableras. Kloner föraras frysta och odlas id beho för att producera antikroppar med just denna specificitet. Intracellulär proteintransport det finns tre sätt att transportera proteiner med i cellen: transport in/ut från kärnan ia selektia porer, transmembran transport mellan cytosolen och mitokondrier, ER, kloroplaster och peroxiosomer samt esikulär transport mellan ER och golgi, endosomer, lysosomer och cellytan. Adresslappar korta aminosyra sekenser som berättar art proteinet ska. Det finns linjära och konformationsberoende adresslappar. Det finns kända adresslappar för t ex import/export till kärnan, import/export för mitokondrier eller tillbaka till ER. Gated transport in/ut från kärnan. Post-translationell (färdigt protein) transport genom dynamiska porkomplex i kärnamembranet. Proteiner större än 50 000 Da måste ha en adresslapp för att få komma in. NLS (nukleär lokaliserings signal) binder till olika receptorer. Transmembran transport amfipat helix i mitokondrie/kloroplast utgör adresslappar. Import öer mitokondriens ytter- och innermembran sker genom porer. Energikräande som drias a elektrokemisk gradient och ATP. Chaperoner i cytosol och matrix kan binda och hjälpa till med eckning. Ett maskerat, oeckat protein med signal sekens binder till receptorkomplex på mitokondriens yttermembran. Proteinet leds in i en por som går öer de båda membranen in i matrix. Var efter det kommer ut eckas det till (ibland efter post-translationella modifieringarna) funktionellt protein. Vesikulär transport proteiner tas in under tillerkning id ribosom. Protein syntes startar alltid på ribosomer i cytosolen. SRP (signal recognation particle) medierar proteintranslokation i ER. Proteintransport sker genom porkomplex i ER. Rätt eckade proteiner får lämna ER, de andra iks om eller bryts ner i proteasomen. Vesikulär transport sker med adresslappar och cytoskelett. Sekretion är antingen konstituti eller signal reglerad. Utsöndring ur cellen. Exocytos esikulär transport ut ur cellen. Receptor medierad endocytos ger specifikt upptag a substanser i mål celler. Om ingen annan signal går esiklarna till cellytan. Endocytos esikulär transport in i cellen. Ubiquitin dödsmärknings miniprotein. Proteasom bryter ner proteiner som är märkta a ubiqutin. Chaperoner hjälper till att ecka proteiner. Vissa binder och släpper under eckningen, andra binder under hela eckningen. Kallas ofta heat-shock proteiner. Cellsignalering kontaktberoende, paracrin (nära), neurotransmittorer eller endokrint (hormon). Det finns de som anänder ytreceptorer och andra anänder intracellulära receptorer (som är TF, ofta homo/heterodimerer, binder små hydrofoba ECSM som steroider, itamin D, thyroid, hormoner och retionider).

Exracellulära signal molekyler hydrofoba. T ex kortliade hormoner som adrenalin eller långliade könshormoner. Reagerar med receptorprotein och signalen förs idare ia intracellulära signalproteiner. Intracellulära signalmolekyler små molekyler t ex Ca 2+, camp, DAG, IP 3 -. Intracellulära signalproteiner t ex proteinkinaser (påsättning a fosfor), proteinfosfataser (tar bort fosfor) och GTP-proteiner (GTP akti, GDP inakti). Signal komplex de intracellulära signalproteinerna sitter samman i ett komplex. Snabb öerföring med bra reception. Ytreceptorer det finns: jonkanalberoende (synaptisk reglering), G-proteinberoende (7-transmembranprotein, aktierar receptor, integrerar med ett målprotein som är bundet i PM. Målprotein är ett enzym eller en jonkanal. Interaktion mellan receptor och målprotein sköts ia ett G-protein) och enzymberoende (den aktierade receptorn fungerar som ett enzym eller aktierar ett enzym). G-protein binder till GDP som inakti. Är en heterotrimer med α, β och γ subenhet. Akti då byter ut GDP till GTP. α enhet släpper då från de andra och binder till målprotein, tills GTPase tar bort P i och proteinerna återgår till att ara inaktia. Det finns många olika typer; s, i, olf och t. Koleratoxin påerkar G-proteiner. camp cykliskt AMP fungerar som signalprotein. camp beroende proteinkinas = PKA. CRE camp responsie element (region på genen). CREB CRE-binding protein (transkriptas faktor). Deltar i bla i reglering a långtidsminne i hjärnan och hormonsyntes. camp-kaskaden - börjar med en molekyl adrenalin och slutar med 10 8 molekyler glukos-1-fosfat. Den är iktig för metabolisk mobilisering, fight flight respons. Caffein förlänger det aktia tillståndet i kaskaden. Fosfatidylinositol kaskaden PI öergår till PIP ia kinas, PIP till PIP 2 och sedan ia en fosforlipas bildas DAG och IP 3. IP 3 stimulerar Ca 2+ kanaler att öppna sig i ER. Då får man Ca 2+ i cytosolen som i sin tur stimulerar proteinkinasc. CaM Calmodulin. Ett Ca 2+ beroende protein som aktierar kinas. Ca 2+ - [Ca 2+ ] hålls låg i cytosolen (>10-7 M) eftersom liten höjning gör stor skillnad. Ca 2+ anänds i: pump i PM, Na + -Ca 2+ pump i PM, pump i ER membran, Ca 2+ -H + pump i mitokondriemembran och andra Ca 2+ bindande proteiner förutom CaM. Tyrosinkinas receptor en enzymberoende ytreceptor som autofosforyleras ia ATP > ADP. Det fosforylerade tyrosinkinas receptorn aktierar olika signalproteiner t ex Ras Ras - rat sanoma. Ras + GTP = aktit, och med GDP är det inaktit. Ras för signaler idare till bla MAP-kinas kaskaden. MAP-kinas kaskaden Mitogen Aktiated Protein. Signal kommer från Ras till MAP-kinas-kinas-kinas, som förs idare till MAP-kinas-kinas och tillsist ner till MAP-kinas. Vid are steg går en ATP åt. Ibland sitter MAPkinaserna ihop i ett komplex. Tå komponents system finns hos äxter och bakterier. En sensor med His autofosforyleras och aktieras. Reagerar med en regulator ars Asp öertar fosforn och sedan inhiberar olika gener eller styr en falgell motor. Ljus reglerad fytochrome rött ljus aktierar autofosforylering a fytochrome som sedan går in i kärnan och regulerar genuttryck. Infrarött ljus inaktierar proteinet. Cellcykeln

Kontroller sker id check-points, som ser till att cellen är redo för nästa steg i cykeln. Cyklin och CDK(cyklin beroende kinas). Cyklinproteinerna binder till CDK och reglerar funktionen på tå sätt: genom att både aktiera CDKs funktioner och att älja ut de proteiner i cellen som ska påerkas a CDK i de olika stadierna a cellcykeln.