PubMed lathund 2018-07-19 Örebro universitetsbibliotek Medicinska biblioteket medbibl@oru.se 1
Skriv in dina söktermer och klicka på Du kan välja hur träffarna ska sorteras. T ex efter Best Match eller som här Most Recent. För att få se vad som har hänt bakom kulissen, titta på Search details. Search details finns i högerkanten. Har man många sökbegrepp syns kanske inte alla i rutan, klicka då på See more PubMed har sökt på begreppen vi skrev in som textord, men har också sökt på MeSH-termen sepsis och MeSH-termen treatment outcome. Har en MeSH-term underordnade termer så kommer även dessa med i sökningen. (Vi kommer att återkomma till MeSH lite senare.) 2
Begränsa med Filters Du kan begränsa din sökning genom att använda Filters (De ligger på vänster sida) Alla filter syns inte, fler begränsningar finns under rubriken Show additional filters. Klicka på Show additional filters för att välja t ex språk eller åldersgrupper. vill du begränsa med fler språk än engelska, får du först klicka på customize 3
Bocka i Ages och klicka på Show Klicka på Customize om du vill se fler åldersgrupper Du väljer vilket filter du vill använda genom att klicka på filtret Filtren ligger kvar och följer med till nästa sökfråga. Du måste aktivt ta bort dem genom att klicka på Clear all 4
Clipboard När du vill prova flera sökvarianter eller vet att du kanske måste lämna sökningen för ett tag, så kan du spara dina träffar tillfälligt på något som kallas Clipboard. De ligger kvar i åtta timmar. Bocka för de artiklar du är intresserad av och klicka på Send to välj Clipboard i Send to-rutan. Den finns längst uppe till höger i resultatfönstret De artiklar man har lagt på Clipboard får texten Item in clipboard 5
Gå till Clipboard när du vill se artiklarna du sparat Klicka på siffran Ett tips är att använda similar articles för att hitta fler artiklar Om du vill kan du sortera om de liknande artiklarna, så att du får de nyaste först 6
För att komma vidare kan man titta på vilka ämnesord artikeln fått. I Abstraktformatet finns MeSH termer mm under abstraktet. (MeSH Medical Subject Headings är PubMeds/Medlines ämnesord. Klicka på MeSH-termen. Använd PubMed för direktsökning, använd Add to Search om du vill söka på två av termerna direkt 7
Advanced I Advanced hittar du din sökhistorik, som det kan vara bra att spara om du ska redovisa din sökning eller vill göra om den senare. Använd också Advanced för att kombinera söktermer med AND, OR eller NOT. Sök på ett begrepp i taget. Gå sen till History under Advanced för att kombinera söktermer Klicka på #siffra och välj OR in builder, när du ska lägga ihop begrepp med OR 8
Därefter kan man kombinera resultatet av OR-kombinationen med huvudbegreppet, använd då AND. I det här fallet är Sepsis huvudbegreppet som kombineras med treatment outcome or mortality or prognosis or survival or long term outcome. Om du fått väldigt många träffar kan du även använda Advanced för att begränsa med ord i titeln. Klicka på Klicka på Add framför den sökfråga du vill begränsa och skriv i det ord du vill ska stå i titeln i fältet under. Glöm inte att ändra till Title-fältet 9
MeSH database (MeSH is NLM's controlled vocabulary used for indexing articles for MEDLINE/PubMed. MeSH terminology provides a consistent way to retrieve information that may use different terminology for the same concepts.) Om du vill söka efter MeSHtermer byter du från PubMed till MeSH i denna ruta. Klicka på det begrepp du vill ha information om. 10
I MeSHen kan man också välja subheadings Subheadings är aspektord som kan knytas till MeSHtermen som här mortality Klicka först på Add to search builder och sen på Search PubMed för att göra en sökning i PubMed på Mesh-termen sepsis med subheading mortality. Sökningen blir nu begränsad till artiklar som har fått ämnesordet sepis med aspektordet mortality, dvs man missar alla de nyaste artiklarna som ännu inte har hunnit få ämnesord. Därför bör man också göra en fritextsökning och titta på de nyaste artiklarna 11
Söker du på MeSH-termen Sepsis får du även med bl a Bacteremia och Shock, Septic eftersom det begreppet ligger under i träden. 12
Fulltext artiklar Om medicinska biblioteket har tidskriften i fulltext kommer RÖL-loggan att synas till höger i referensen. Klicka på loggan, du kommer nu till tidskriftens hemsida och kan skriva ut artikeln i pdf-format. I exemplet nedan syns förlagets egen logga och RÖL-loggan. De flesta bibliotek har länkservrar som man kan lägga upp som filter. Skulle Medicinska biblioteket inte ha tillgång till tidskriften, skicka en beställning till Medicinska biblioteket. 13
Skicka beställningar till Medicinska biblioteket från PubMedsökning klicka på send to och välj E-mail Fyll i e-mailadressen: medbibl@oru.se Kom ihåg att fylla i ditt namn och ev meddelanden till biblioteket i additional text -rutan 14
My NCBI Klicka på Sign in to NCBI och registrera dig om du inte gjort det tidigare 15
Detta är din ännu tomma My NCBI-sida. Klicka på Add filter for the selected database I den första kategorin finns ett antal populära filter; välj t ex Free Full Text 16
Välj ett filter med Med bibl:s fulltext tidskrifter Klicka på kategorin LinkOut och sök på orebro bocka i de två boxarna, Filter och Link Icon. I detta exempel har vi bockat för både Medicinska bibliotekets filter och Örebro universitetsbiblioteks filter. Har man anknytning till både Region Örebro län och Örebro universitet kommer man nu att få se vad som finns i fulltext på båda organisationerna. De flesta bibliotek har tillgång till en länkserver som man kan nå från PubMed. 17
Andra tillgängliga filter: Under kategorin Properties och subsets finns ett antal mycket användbara filter, t ex Systematic reviews, Medline 18
Spara sökningar mm i My NCBI Utför din sökning och klicka på Create alert för att bevaka ditt ämne. Eller gör det från Advanced-sidan Du kan välja att spara sökningen och söka av den när du själv vill eller ange att du vill ha uppdateringar via e-post. 19
klicka på save Du kan ändra hur ofta den stående sökningen skickas genom att gå in i My NCBI och klicka på kugghjulet 20
I My NCBI kan du även spara dina referenser från Clipboard för längre tid än åtta timmar. Öppna Clipboard, gå till Send-to och välj Collections hitta på ett namn för din Collection 21
EndNote-export Ska du exportera referensen till Endnote väljer du Citation manager och spara referenserna i en fil. Eller Fråga på Med bibl efter den speciella EndNote-lathunden eller hämta den på vår EndNote webbsida - https://www.oru.se/ub/skriv/referenshanteringsprogram/endnote/ 22
Clinical queries A search interface to find citations in the areas of: Clinical Study Categories: Find citations corresponding to a specific clinical study category. Systematic Reviews: Find citations for systematic reviews, metaanalyses, reviews of clinical trials, evidence-based medicine, consensus development conferences, and guidelines. Medical Genetics: Find citations related to various topics in medical genetics. 23
Single citation Om du letar efter en speciell artikel är Single Citation Matcher mycket användbar. I det här fallet har vi överfört tidskriftsförkortningen från Journal database och skrivit in ett författarnamn. 24
Advanced, 8 Begränsa, 3 Citation manager, 22 Clinical queries, 23 Clipboard, 5, 21 Collections, 21 Create alert, 19 E-mail, 14 Endnote, 22 Filter, 3, 16, 17, 18 Fulltext, 13, 17 History, 8 Kombinera, 8 MeSH, 2, 7, 10, 11 My NCBI, 15 Search details, 2 Send-to, 21 Similar articles, 6 Single Citation Matcher, 24 Skicka beställningar, 14 Spara, 19 Subheadings, 11 25