Kristallografi. De tre benen. Förr Nu Framtiden. Symmetri Röntgenstrålning Datorn



Relevanta dokument
Biologisk enfald. enheten i mångfalden. Anders Liljas Biokemi och Strukturbiologi

0. Lite om ämnet och kursen

Nobelpriset i kemi Lars Lövgren

MAX IV Vår nya ljuskälla. Åke Kvick, MAX-lab, Lund, Sweden

Gitter är endast en samling av identiska matematiska punkter som ger information om symmetri och enhetscell.

Vad uppfann Alfred Nobel?

IM2601 Fasta tillståndets fysik

Vågfysik. Ljus: våg- och partikelbeteende

Utställningstexter MINERALEN. Naturaliesamlingen Kieppi Viljo Nissinens mineralsamling

Laboration i röntgendiffraktion och laserdiffraktion för E

1. (a) (1 poäng) Rita i figuren en translationsvektor T som överför mönstret på sig själv.

Atomens uppbyggnad. Atomen består av tre elementarpartiklar: Protoner (+) Elektroner (-) Neutroner (neutral)

Vetenskapshistoria. Vi behandlar naturvetenskap. Vi gör en uppdelning efter olika ämnen. Uppdelningen är delvis kronologisk

( ) Räkneövning 3 röntgen. ( ) = Â f j exp -ir j G hkl

Atom- och kärnfysik! Sid i fysikboken

Till exempel om vi tar den första kol atomen, så har den: 6 protoner, 12 6=6 neutroner, 6 elektroner; atommassan är också 6 men masstalet är 12!

Atomens historia. Slutet av 1800-talet trodde man att man hade en fullständig bild av alla fysikaliska fenomen.

En resa från Demokritos ( f.kr) till atombomben 1945

Alla bilder finns på kursens hemsida

Kärnenergi. Kärnkraft

Experimentell fysik. Janne Wallenius. Reaktorfysik KTH

tentaplugg.nu av studenter för studenter

Proteinsyntesen. Anders Liljas Biokemi och strukturbiologi Lunds universitet

Lärarhandledning. Uppdrag Nobel ett pedagogiskt verktyg. Version 1.0

Marie Curie, kärnfysiker, Atomfysik. Heliumatom. Partikelacceleratorn i Cern, Schweiz.

Laboration 1: Diffraktion och kristallografi av okänd substans (Fe 2 P)

1. Kristallstruktur. Grunden för att första en stor mängd av material-egenskaper kommer från att förstå deras struktur

1. Kristallstruktur. Grunden för att första en stor mängd av material-egenskaper kommer från att förstå deras struktur

Vad skulle du vilja uppfinna?

tentaplugg.nu av studenter för studenter

Nobelpristagaren som försvann. Om hur en man från Örebro belönades med Nobelpris tack vare en lyckad konstruktionsblick och största noggrannhet.

BFL 111/ BFL 120 Fysik del B2 för Tekniskt Basår/ Bastermin

Föreläsning 5: Geometri

RÖNTGEN. Röntgen tog världens första röntgenbild på en människa år Det var en bild av hans hustrus, Anna UPPTÄCKTEN

En studie i symmetrigrupper

SPEKTROSKOPI (1) Elektromagnetisk strålning. Synligt ljus. Kemisk mätteknik CSL Analytisk kemi, KTH. Ljus - en vågrörelse

4-10 Rymdgeometri fördjupning Namn:..

ATOM OCH KÄRNFYSIK. Masstal - anger antal protoner och neutroner i atomkärnan. Atomnummer - anger hur många protoner det är i atomkärnan.

Kärnenergi. Kärnkraft

Vilken av dessa nivåer i väte har lägst energi?

1. Kristallstruktur Matematiska gitter

Förslag på praktikuppgifter på Naturhistoriska riksmuséet:

Föreläsning 3. Radioaktivitet, alfa-, beta-, gammasönderfall

Atomens uppbyggnad. Atomen består av tre elementarpartiklar: Protoner (+) Elektroner (-) Neutroner (neutral)

Diffraktion... Diffraktion (Kap. 36) Diffraktion... Enkel spalt. Parallellt monokromatiskt ljus gör att skuggan av rakbladet uppvisar en bandstruktur.

Föreläsning 5 Att bygga atomen del II

Nobelpriset i kemi 2006

Mål och betygskriterier för no-ämnena (bi, fy, ke)

Eulers polyederformel och de platonska kropparna

Materialfysik vt Materials struktur 3.1 Allmänt om kristallstrukturer. Materiens tre (fyra) faser. Tre grundtillstånd

LAUE DIFFRAKTION. Teknisk fysik. Januari Innan laborationen är det viktigt att du läser detta labb-pm.

Periodiska systemet. Atomens delar och kemiska bindningar

Kemi. Fysik, läran om krafterna, energi, väderfenomen, hur alstras elektrisk ström mm.

Materialfysik vt Materials struktur 3.2 Metallers struktur

Kapitel 36, diffraktion

Lösningsförslag. Fysik del B2 för tekniskt / naturvetenskapligt basår / bastermin BFL 120 / BFL 111

Stora namn inom kärnfysiken. Marie Curie radioaktivitet Lise Meitner fission Ernest Rutherford atomkärnan (Niels Bohr atommodellen)

Trender och deras orsak atomradier, jonradier, joniseringsenergi, elektronaffinitet

1. Kristallstruktur. Grunden för att första en stor mängd av material-egenskaper kommer från att förstå deras struktur

Fysik, atom- och kärnfysik

7. Radioaktivitet. 7.1 Sönderfall och halveringstid

1.5 Våg partikeldualism

atomkärna Atomkärna är en del av en atom, som finns mitt inne i atomen. Det är i atomkärnan som protonerna finns.

Materia Sammanfattning. Materia

TENTAMEN I FASTA TILLSTÅNDETS FYSIK F3/KF3 FFY011

En snabb resa i tiden DEN NATURVETENSKAPLIGA VÄRLDSBILDENS FRAMVÄXT

Materialfysik 2010 Kai Nordlund. Ett kristallint ämne är ett där atomerna är ordnade i ett alltid helt lätt Men:

Radioaktivt sönderfall Atomers (grundämnens) sammansättning

3.2.1 Grundämnes-metallers struktur Materialfysik vt CuAg nanostructur ed alloy. 3. Materials struktur 3.2 Metallers struktur

3.2.1 Grundämnes-metallers struktur

Kapitel 10. Vätskor och fasta faser

Kapitel 10. Vätskor och fasta faser

KEMI 1 MÄNNISKANS KEMI OCH KEMIN I LIVSMILJÖ

Materialfysik vt Materials struktur 3.2 Metallers struktur

Laborationer i miljöfysik Gammaspektrometri

Hur mycket betyder Higgs partikeln? MASSOR! Leif Lönnblad. Institutionen för Astronomi och teoretisk fysik Lunds Universitet. S:t Petri,

Vad är allt uppbyggt av?

Övergångar mellan vibrationsnivåer i grundtillståndet. Infraröd spektroskopi

Hur funkar 3D bio? Laborationsrapporter Se efter om ni har fått tillbaka dem och om de är godkända!

Parbildning. Om fotonens energi är mer än dubbelt så stor som elektronens vileoenergi (m e. c 2 ):

Strålande vetskap, röntgen

Röntgenteknik. Vad är röntgenstrålning? - Joniserande strålning - Vad behövs för att få till denna bild? Vad behövs för att få till en röntgenbild?

Nobelväskans hemlighet

Varför kan det ta så lång tid på röntgen?

3D avbildning och deformationsanalys av inhomogena material med röntgenbaserad mikrotomografi och digital volymkorrelation

För tredje året i rad arbetar DNV och TE med ett ämnesövergripande. Nobeltema

lördag den 4 december 2010 Vad är liv?

1. Mätning av gammaspektra

Röntgenstrålning och Atomkärnans struktur

3.1 Kristallstruktur Matematiska gitter De 5 2-dimensionella gittren De 7 kristallsystemen och 14 Bravais-gittren i 3D

Prov Ke1 Atomer och periodiska systemet NA1+TE1/ /PLE

3. Kristallinitet. 3.1 Kristallstruktur I Matematiska gitter II Matematiska gitter I. 3.1 Kristallstruktur

Materialfysik vt Materials struktur 3.1 Allmänt om kristallstrukturer

TILLÄMPAD ATOMFYSIK Övningstenta 3

Försättsblad till skriftlig tentamen vid Linköpings Universitet

Mineral i jordens inre

Kemiskafferiet modul 3 kemiteori. Atomer och joner

1. Kristallstruktur. Grunden för att första en stor mängd av material-egenskaper kommer från att förstå deras struktur

NUKLEINSYRORNAS UPPBYGGNAD: Två olika nukleinsyror: DNA deoxyribonukleinsyra RNA ribonukleinsyra

Joniserande strålnings växelverkan Hur alstras röntgenstrålning och vad händer när den når och passerar människa?

Transkript:

Kristallografi De tre benen Symmetri Röntgenstrålning Datorn Förr Nu Framtiden

Kristallografi läran om kristallerna, ett ämne med nära anknytning till kemi, biologi, mineralogi och fysik. Ämnesområdet innefattar studiet av fasta, kristallina kroppar, lagarna för deras tillväxt och yttre form samt deras inre struktur, dvs. atomära uppbyggnad. tomt 1 ev elektroner

Kristallografi Göran Svensson Disputerade vid LTH 1989 Chalmers 930101 101231

Naturvetenskapliga år 2005-2014 FN (UNESCO) och IUCR 2005 Fysik 2006 Öknar och polarutbredning 2007 Polarområdena 2008 Geologi (planeten jorden) 2009 Astronomi 2010 Biologisk mångfald 2011 Kemi 2012 Hållbar energi 2013 Vatten 2014 Kristallografi 2015 Ljus www.iycr.org www.kristall2014.se

Carolina Rediva (Uppsala universitetsbibliotek) (Slut 4/5 2014) 6/4 Kristallklart på Nobelmuseum i Stockholm 23/4 Ytterby gruva

Två montrar om kristallografi De 7 kristallsystemen, hexagonala och trigonala Artikelserie i Kemivärlden under 2014 Lång artikel om kristallografi i Litofilen nr 1 2014 Utställning på bibliotek i höst?

Platonska kropparna 5 stycken Pytagoras (570-495 f.kr.) Euklides Elementa (ca 300 f.kr.) Tetrahedrit Diamant Tetraeder Kub Oktaeder Ikosaeder Dodekaeder

Vem var den första kristallografen? Johannes Kepler 1571-1630 Publicerad 1611

Supersaturation = Övermättnad

Symmetri Rotation 1 2 3 4 5 6 7.

Spegelplan Losec : S- och R-omeprazol Nexium: S-omeprazol Apelsin Citron

Rotation: 1 2 3 4 6 Rotoinversion: 1 2 m 3 4 6

Minsta lådan i en kristall, enhetscellen symmetri 1 2 3 st 2 3 6 4 4 st 3 7 kristallsystem

Kyanit(triklin) Natron (monoklin) Baryt (ortorombisk) Rutil (tetragonal) Kvarts (trigonal) Beryll (hexagonal) (Berylliumaluminiumsilikat) Halit (kubisk)

3-D 7 Kristallsystem 14 Bravaisgitter 32 Punktgrupper 11 Lauegrupper 230 Rymdgrupper Neumans princip: The symmetry elements of any physical property of a crystal must include the symmetry elements of the point group of the crystal

Nicolaus Steno (1638-1686) Den moderna geologins fader Stratigrafi och fossil Bibeln och Noaks ark (biskop) Lagen om konstanta vinklar

Upplösning ~λ Ljusmikroskop : ~ 40 µm C H : 0.95 Å (0.000095µm) C C : 1.54 Å Na Cl : 2.36 Å Ba Ba : 4.35 Å

Nutid! 1895 Röntgenstrålning 1896 Radioaktivitet 1897 Elektronen 1905 Relativitetsteorin 1917 Protonen 1932 Neutronen

Röntgenstrålning i kemins tjänst Röntgenbild DR. WILHELM KONRAD RÖNTGEN (1845-1923) Upptäckte röntgenstrålningen 1895 (fredagen den 8 november) och för det fick han det första Nobelpriset i fysik 1901 Datortomografi

Röntgenstrålning när seklet var ungt Radioaktiv hudkräm Thorium och radium För bra passning av skor Tre intensitetslägen: Hög (män), medel (kvinnor) och låg (barn)

Max von Laue, Nobelpris 1914 (fysik) Kristaller sprider röntgenstrålning Nobelpriset i fysik 1915 (fysik) Analys av kristallstrukturer med röntgenstrålning William Bragg (1862-1942) Lawrence Bragg (1890-1971)

Braggs lag

Weissenbergkamera

Fasproblemet h k l är en reflex h 0 -> 10 k 0 -> 10 l 0 ->10 10x10x10 = 1000 reflexer X,Y,Z = koordinater i enhetscellen

Herbert Hauptman och Jerome Karle, 1987 för deras avgörande insatser vid utveckling av direkta metoder för kristallstrukturbestämning Isabella Karle

Från kristall till struktur

DNA James Watson och Francis Crick (Maurice Wilkins) Nobelpriset i medicin 1962 Rosalind Franklin (1920-1958)

Filmtime Kristallväxning Kristall Kristallstruktur Egenskaper

Koksalt Perovskit

Minsta lådan i en kristall, enhetscellen symmetri 1 2 3 st 2 3 6 4 4 st 3 7 kristallsystem

Dan Shechtman, Nobelpris i kemi 2011 För upptäckten av kvasikristaller Jan Olov Bovin, Lund 1986 Ho,Mg, Zn-kristall (legering)

Tre olika typer av strålning Röntgenstrålning (sprids av elektroner) röntgenrör (billigt), finns flera på Chalmers synkrotron (mycket dyrt) MAX II i Lund Max IV i Lund (3 miljarder) Neutronstrålning (sprids av kärnan) mycket dyrt Studsvik avvecklades 2005 ESS i Lund 2020 (20 miljarder) ISIS utanför Oxford Elektronstrålning ger en direkt bild, upplösning ~ 1 Å påverkar ofta provet (MeV) Guld

Ada Yonath, 2009 (kemi) Strukturen och funktionen hos ribosomen med Venkatraman Ramakrishnan och Thomas Steitz Enzymet för proteinsyntes

Roger Kornberg, 2006 (kemi) Kartläggningen av hur DNA läses av RNA polymeras II (hur DNA läses av)

Roderick McKinnon 2003 (kemi) Jonkanaler som låter K + (kalium) passera men inte den mindre jonen Na + (natrium) Cellmembranet

John Walker, 1997 (kemi) klargörande av den enzymatiska mekanismen för syntes av adenosintrifosfat (ADP)

Johann Deisenhofer, Hartmut Michel och Robert Huber, 1988 (kemi) För bestämningen av den tredimensionella strukturen hos ett fotosyntetiskt reaktionscenter Johann Robert Hartmund Michael

Aaron Klug, 1982 (kemi) för hans utveckling av kristallografisk elektronmikroskopi och hans klarläggande av strukturen hos biologiskt viktiga nukleinsyra-proteinkomplex

Dorothy Crowfoot Hodgkin, 1964 (kemi) Insulin Penicillin Vitamin B 12 Vitamin B 12

Max Perutz, 1962 (kemi) Bestämde strukturen för hemoglobin Med frun Gisela på bal

John Kendraw, 1962 (kemi) Strukturen hos myoglobin

Maurice Wilkins, John Steinbeck, John Kendraw, Max Perutz, Francis Crick, James Watson (December 1962) Kommer kristallografer att behövas i framtiden?

Framtiden Tidsupplöst Mätningar på verkliga system, in situ Nogrannare Mindre kristaller Rutinundersökning som IR, NMR och UV/VIS Kombination neutron röntgen (Lund) Elektronmikroskopi Databaser Teoretiska beräkningar Simuleringar

Sydsvenska Dagbladet 2014-03-27

< 1 miljon kr

Ser ni det här har jag dragit över tiden talat väldigt fort glömt hälften tekniken har krånglat

>20 Nobelpris har delats ut där kristallografi varit en mycket viktig del Öfver hela min återstående realiserbara förmögenhet förfares på följande sätt: Kapitalet av utredningsmännen realiseradt till säkra värdepapper skall utgöra en fond, hvars ränta årligen utdelas som prisbelöning åt dem som under det förlupna året hafva gjort menskligheten den största nytta. Räntan delas i fem lika delar som tillfalla: en del till den som inom fysikens område har gjort den vigtigaste upptäckt eller uppfinning; en del den som har gjort den vigtigaste kemiska upptäckt eller förbättring; en del den som har gjort den vigtigaste upptäckt inom fysiologiens eller medicinens domän; en del som inom litteraturen har produceradt det utmärktaste i idealisk rigtning; och en del åt den som har verkat mest eller best för folkens förbrödrande och avskaffande eller minskning av stående arméer samt bildande och spridande av fredskongresser.

Kristallstruktur från enkristalldata Krav Enkristall (fjärrordning) Strålning med en våglängd jämförbar med atom-atomavstånd Enkristalldiffraktometer (för datainsamling) Viss fingerfärdighet Datorkraft, kemisk intuition och kunskap, analysförmåga, nogrannhet, envishet mm

Kristallstruktur från enkristalldata Växa en kristall Kristallen skall bada i en röntgenstråle som är cirka 0,25 mm i diametar Lämplig kristallstorlek < 0,20 mm.

Kristallstruktur från enkristalldata Växa en kristall Kvarts, SiO 2, Trigonalt kristallsystem, rymdgrupp P3 2 2 Enhetscellen: a = 4.9128 Å, c = 5.4042 Å Cellens volym: 112.96 Å 3 Antal formelenheter i cellen: Z = 3 x/a y/b z/c Si1 +4 3a 0.4687(2) 0.00000 0.00000 OBS O1-2 6c 0.4121(4) 0.2656(4) 0.1186(2) Fraktionella koordinater Si O 1.598 Å Si O 1.621 Å Si Si 3.058 Å Si O Si 143.5 o Struktur

Kristallstruktur från enkristalldata Växa en kristall Montera Montera kristallen på en tunn glaspinne och sedan på ett goniometerhuvud Detta görs under mikroskåp Struktur

Kristallstruktur från enkristalldata Växa en kristall Datainsamlingen sker sedan med en diffraktometer. Montera Bestäm enhetscellen. Kolla kristallkvaliten. Därefter samlas data in. Kristall Detektor Datainsamling Röntgenrör Struktur

Kristallstruktur från enkristalldata Växa en kristall Montera Datainsamling Korrigera data Korrigera för Absorption Polarisation Geometriska faktorer Lista på reflexer (1000-tal) h k l Intensitet sigma Struktur 1 0 0 34.0 1.4 2 3-6 123.4 10.2 4 6 8 0.3 1.4

Kristallstruktur från enkristalldata Växa en kristall Intensiteter Struktur FASPROBLEMET Struktur Intensiteter (går bra) Montera Datainsamling Korrigera data Lös strukturen Lösning Försök att gissa/beräkna en trolig struktur (modell) eller delar av den. Kemisk intuition, kunskap, datorkraft mm mm Beräkna intensiteterna från modellen och jämför med de uppmätta Förbättra modellen Struktur Förfina strukturen tills R-värdet blir lågt, <5% R mätdata modelldata mätdata

Kristallstruktur från enkristalldata Växa en kristall Montera Datainsamling Korrigera data ANALYSERA Jämför med andra strukturer Struktur - egenskapsamband Det finns två sorters kvarts Högerkvarts Vänsterkvarts Lös strukturen Struktur Strukturen kan beskrivas som helixar av SiO 4 - tetraedrar som vrider sig åt höger eller vänster