Mikrobiologi 4.5 hp (Gener, celler och populationer)

Transkript

1 Mikrobiologi 4.5 hp (Gener, celler och populationer) Hej och välkommen! Vi startar med obligatoriskt upprop måndag 20 januari kl. 9:15 i sal E314 där också övriga föreläsningar ges. Om du inte kan komma till uppropet, anmäl detta i förväg till BIG-kansliet! Kursen utgörs dels av schemalagd undervisning (föreläsningar och laborationer), dels av självstudier. Föreläsningarna är inte obligatoriska, men rekommenderas starkt, eftersom de tar upp information som inte finns med i kursboken. Dessutom är syftet med föreläsningarna att du ska få möjlighet att ställa frågor och diskutera. Laborationerna utgörs av några grundläggande övningar i mikrobiologisk metodik, som också visar hur mycket mikroorganismer det finns i vår omgivning och hur man kan gå tillväga för att identifiera dem. Laborationerna är obligatoriska och utförs individuellt. Laborationerna hålls i lab D320. Använd labrock när du laborerar (labrock kan lånas). För godkänd laborationskurs krävs förutom närvaro också godkända labbrapporten, som ska vara inlämnade via till labb assistenterna. På laborationskursen ges betygen G eller U. Kursen avslutas med en skriftlig tentamen den 5 februari där inga hjälpmedel är tillåtna. Den sjugradiga betygsskalan (A-F) tillämpas på teoridelen. För godkänt betyg på momentet Mikrobiologi 4,5 hp krävs lägst betyget E på teorin (60% rätt) samt godkända laborationer. Om du har frågor angående föreläsningar och laborationer kan du kontakta ansvariga föreläsare och assistenter. För övriga frågor kan du kontakta kursansvarig lärare. Hong Sjölinder, Kursansvarig lärare Department of Molecular Biosciences, WGI Svante Arrhenius väg 20C, E445 Telefon: , E-post: Hong.Sjolinder@su.se

2 Sjugradig betygsskala För betyget skall du ha minst A (utmärkt) 95 % av max- poängen på det skriftliga provet. B (mycket god) 85 % C (god) 75 % D (tillfredsställande) 65% E (tillräcklig) 60% Fx (otillräcklig) 50% F (helt otillräcklig) mindre än 50% Möjlighet till komplettering av betyget Fx upp till godkänt betyg ges inte på detta moment.

3 SCHEMA Mikrobiologi 4.5 hp ( ) (F): Föreläsning Vecka 4 Datum Tid Lokal Titel Föreläsare Måndag 20/1 09:15-10:00 E 314 Obligatoriskt upprop Birgitta Åkerman Fota, information om skåpen, dator Per Cronholm 10:40-11:00 Introduktion till kursen Hong Sjölinder 11: E 314 Information om biologistudierna: Björn Birgersson innehåll och upplägg 13:00-15:00 (F) E 314 Prokaryota cellers uppbyggnad (kap 3) Helena Aro Tisdag 21/1 13:00-15:00 (F) E 314 Bakteriers näringskrav och tillväxt Helena Aro (kap 2, 4) Onsdag 22/1 10:00-12:00 (F) Bakterieinfektion+Genetik (kap 5,8) Ann-Beth Jonsson 13:00-15:00 Virus (kap 13) Hong Sjölinder Torsdag 23/1 10:00-12:00 (F) E 314 Antibiotika, antibiotikaresistens (kap9) Sara Eriksson 13:00-15:00 (F) E 314 Arkéer (kap 11) Ann-Kristin Lindås Fredag 24/1 13: (F) E 314 Bakterier i människans tjänst (kap 10) Hong Sjölinder (utdelning av röret för eget prov) Vecka 5 Datum Tid Lokal Titel Måndag 27/1 9:00-12:00 D320 Laboration I (Grupp A) Labbassistenter 13:15-16:15 D320 Laboration I (Grupp B) Sterilteknik Isolering av mikroorganismer från eget prov Tisdag 28/1 9:00-12:00 D320 Laboration II (Grupp A) Labbassistenter 13:15-16:15 D320 Laboration II (Grupp B) Avläsning, morfologi Onsdag 29/1 9:00-9:15 D320 Omstryk av bakterier för gramfärgning (Grupp A) Labbassistenter 9:30-12:00 (F) E 314 Mikroorganismer och ekosystem Margareta Ohné (kap 1,6,7,12) 13:15-16:15 D320 Laboration III (Grupp A) Labbassistenter Gramfärgning, motilitet, mikroskopering,.. Torsdag 30/1 9:00-9:15 D320 Omstryk av bakterier för gramfärgning (Grupp B) Labbassistenter 13:15-16:15 D320 Laboration III (Grupp B) Labbassistenter Gramfärgning, motilitet, mikroskopering,.. Fredag 31/1 9:00-12:00 D320 Laboration IV (Grupp A) Labbassistenter 13:15-16:15 D320 Laboration IV (Grupp B) Avläsning, Sporfärgning och labbgenomgång

4 Vecka 6 Datum Tid Lokal Titel Måndag 3/2 13:00-14:00 E314 Frågestund (frivilligt) Hong Sjölinder (Frågorna svaras genom e-post också) Tisdag 4/2 Självstudier och förbereda labbrapporten Onsdag 5/2 09:00-13:00 TENTAMEN (i Brunnsviksalen) Labbrapporten inlämnas senast kl18 Skrivningsgenomgång informeras senare Omtentamen: Lördag 15/mars, 9:00-13:00, E 306 (* Anmälan till Mina studier senast 2 dagar innan omtentamen) Lärobok: Carlson och Linder (2012) Introduktion till Mikrobiologi (Studentlitteratur AB ISBN ) Lärare: Helena Aro, Helena.Aro@gmt.su.se Sara Eriksson, Sara.Eriksson@gmt.su.se Ann-Beth Jonsson, Ann-Beth.Jonsson@gmt.su.se Ann-Christin Lindås, Ann.Christin.Lindas@su.se Margareta Ohné, Margareta.Ohne@gmt.su.se Hong Sjölinder, Hong.Sjolinder@gmt.su.se Assistenter: Linda weyler (Linda.weyler@gmt.su.se), E 453,Tel Alice Sollazzo (Alice.sollazzo@su.se), E525,Tel Kun Wang (Kun.wang@su.se), E 551,Tel Lärare från BIG Birgitta Åkerman, , Birgitta@big.su.se Per Cronholm, , Per.Cronholm@big.su.se Björn Birgersson, , studierektor@big.su.se

5 Stockholms universitet Institutionen för biologisk grundutbildning preliminär Schema för Kurstid: Lokaler: Kursansvarig: Gener, celler och populationer, II Cellbiologi 6 februari februari 2014 Föreläsningar: E314 Laborationer: E314 Seminarier: E314 Rum Tel. Anki Östlund-Farrants AÖF F anki.ostlund@cellbio.su.se Lärare: Anki Östlund-Farrants Katharina Pawlowski Anders Nilsson AÖF KP AN F448 Assi Andreas Ring AR Litteratur: Sadava m fl: LIFE - The Science of Biology. Sinauer & Freeman. Datoranvändning: Registrera dig också som student till lärobokens resurs på nätet på sidan Närvaro: Närvaro på "laborationen" och "diagnostiskt test" är obligatoriska om det inte annat sägs.

6 Dag Tid Lokal Innehåll Lärare Torsdag 6 februari Fredag 7 februari E314 S: Den eukaryota cellen/dna till protein AÖF inläsning/eget arbete inläsning/eget arbete inläsning/eget arbete Måndag 10 februari Tisdag 11 februari Onsdag 12 februari Torsdag 13 februari Fredag E314 F: Energimetabolism, glukolys, mitokondriekp E314 diagnostisk test - DNA till protein E314 F: Energimetabolism, fotosyntesen, kloroplakp eget arbete E314 F: Cytoplasman och plasmamembranet AÖF E314 Lab, torr cellrörelse AR E314 S: Cellsignalering och cellcykel AÖF E314 Lab, torr cellrörelse?diagnostiskt test energar 9.15 E314 F: Mitos- meios och arv på molekylär nivå, AÖF E314 diskussion, frågestund på materialet/eget arbaöf Måndag 17 feb E314 frivilligt diagnostiskt test, cellcykel, cellsigar Eget arbete Tisdag 18 februari Onsdag 19 februari E314 F: Gener och transmissionsgenetik (kap. 9 oan E314 Övningsuppgifter E314 F: Genmodifierade organismer KP Eget arbete Torsdag 20 februari Fredag 21 februari E314 F: Genetisk variation och evolutionära mekanismer AN Eget arbete E314 Övningsuppgifter AN E314 Övningsuppgifter

7 Dag Tid Lokal Innehåll Lärare Måndag 24 februari Tisdag 25 februari inläsning inläsning Delprov II, E306

8 Populationers evolution & bevarande GCP - VT14 OBS: Ändringar kan förekomma Schema: Gener, celler och populationer VT 2014 Naturliga populationers evolution och bevarande 6 hp Kursen arrangeras av Avdelningen för populationsgenetik, Zoologiska institutionen, Stockholms universitet I kursen ingår statistik, populationsgenetik, bevaranegenetik och bevarandebiologi Kursperiod: Lärare: Lokaler: Hemsida: Litteratur: 26 februari - 21 mars Linda Laikre (LL) - kursledare Anastasia Andersson (AA) Peter Guban (PG) Lovisa Wenneström (LW) Karin Tahvanainen (KT) Föreläsningar: E314 Datorlaborationer: D406 och D334 Laboration: D456 rum D453, tel , linda.laikre@popgen.su.se rum D447, tel , anastasia.andersson@zoologi.su.se rum D458c, tel , peter.g.99@gmail.com rum D447, tel , lovisa.wennerstrom@zoologi.su.se rum D455, tel , karin.tahvanainen@popgen.su.se Sadava m fl: LIFE - The Science of Biology. 9th edition. Sinauer & Freeman. ISBN Främst kapitel 21 och 59 Kompendium och texter som laddas ner från kursens hemsida under kursens gång Valfri: Ordbok i statistik av Olle Vejde. Kan köpas av kursens lärare, pris 140 kronor Handouts kommer att finnas tillgängliga på kursens hemsida efter föreläsningstillfället. Av miljöhänsyn kopieras inga handouts eller andra stenciler upp. Obligatoriska moment: Datorlaborationer (kan göras självständigt hemma men protokoll ska lämnas in och godkännas) Examination: skriftlig dugga i statistik och skriftligt prov på övriga moment Självständigt arbete med inläsning, räkneövningar, datorlaborationer, etc. på icke-schemalagd tid förutsätts. Betygskriterier finns på kursens hemsida

9 Datum Tid Lärare Vecka Onsdag Föreläsning: Introduktion. Inledning statistikdelen. Deskriptiv statistik. Population och stickprov LL Torsdag Datorlab Statistik 1: Deskriptiv statistik. Datorsal D406. OBS obligatoriskt moment, protokoll ska lämnas in och godkännas Föreläsning: Statistik: sannolikheter, normalfördelningen, binomialfördelningen Fredag Föreläsning: Statistik: binomialfördelningen, hypotesprövning PG, AA LL LL Datorlab Statistik 1, forts. Datorsal D334 PG Vecka Måndag Eget arbete, räkneövningar, inläsning Genomgång av Räkneövningar 1: statistik PG em Eget arbete, inläsning, räkneövningar Tisdag Föreläsning: Statistik: hypotesprövning LL Datorlab Statistik 2: hypotesprövning Datorsal D406 AA, PG Onsdag fm Eget arbete, inläsning, räkneövningar Genomgång av Räkneövningar 2: statistik PG Torsdag fm Inläsning Dugga - statistik. Sal: E306 vakt: KT, PG Fredag fm Inläsning kapitel 21 och 59 i LIFE Disputation i bevarandegenetik: Assessing inbreeding and loss of genetic variation in canids, domestic dog (Canis familiaris ) and wolf (Canis lupus ), using pedigree data. Sal: Nordenskiöldsalen, Geovetenskapens hus, Hus U, plan 3 Mija Jansson Vecka Måndag fm Inläsning kapitel 21 och 59 i LIFE Föreläsning: Populationgenetik och bevarandebiologi LL Återlämning av statistikdugga PG

10 Tisdag Föreläsning: Populationsgenetik och bevarandebiologi, forts Datorlab 3 Populationsgenetik: Mikroevolutionära processer. Datorsal D Onsdag Föreläsning: Att studera genetisk variation i naturliga populationer, introduktion till egen analys av genetiska data Datorlab 3 Populationsgenetik: Mikroevolutionära processer, forts. Datorsal D406 LL AA, PG AA PG Torsdag Skrivningsåterlämning GCPII Anki Östlund F Föreläsning: F-statistik, statistisk analys av genetiska data Omdugga Statistik PG AA em Eget arbete med analys av genetiska data Fredag fm Föreläsning på nätet - varg och genetik: fm Eget arbete med räkneövningar och analys av genetiska data Genomgång av Räkneövningar 3: populationsgenetik PG Datorlab 3 Populationsgenetik: tid för avslut av lab. AA/PG Vecka Måndag fm Eget arbete - analys av labdata em Föreläsningar: Bevarandegenetiska fallstudier Tema 1: Populationer där släktskap är känd Bevarande av hotade populationer i fångenskap LW Kartläggning av beteendevariation hos en ras med av bevarandevikt: gotlandskaninen Bensträckare Tema 2: Kartläggning av genetisk mångfald hos Östersjöns arter Föreläsning: Övervakning av genetisk variation med koppling till annan miljöövervakning - case study vitmärlan AA PG

11 Genetisk variation hos Östersjöns arter - vad vet vi? Varför är det viktigt? Tema 3: Bävervattsprojektet - unik genetisk övervakning Biologisk diversitet på populationsnivå - sympatriska populationer hos öring Genomgång av egen analys av genetiska data AA Tisdag Föreläsning: Bevarandebiologi - Fallstudier Sandra Jönsson, WWF Onsdag Inläsning Torsdag Inläsning Genomgång av räkneövningar 4: populationsgenetik PG Fredag Skrivning: populationsgenetik, bevarandebiologi KT, PG, AA Sal: E306 och E Omdugga 2 Statistik PG Sal: Bestäms senare Efter detta datum är nästa tillfälle till omdugga vid uppsamlingstillfället i juni. Därefter nästa år då kursen ges igen. LW AA Tisdag Omtenta: populationsgenetik, bevarandebiologi PG Sal: Ännu ej klart Efter detta datum är nästa tillfälle till omtenta är uppsamlingstillfället i juni, då kan både statistikduggan och skrivningen i populationsgenetik/bevarandebiologi kan skrivas.