NPU-koder inom klinisk mikrobiologi

Transkript

1 NPU-koder inom klinisk mikrobiologi Rebecca Ceder, Christine Portin, Gunnar Nordin Användarmöte, Klinisk mikrobiologi Stockholm, 12 mars 2019

2 Översikt Varför behöver vi kodera mikrobiologiska analyser? Vad är en NPU-kod? Hur kan NPU-koder användas för att kodera mikrobiologiska svar? Vad blir effekten när vi börjar använda NPU-koder (och andra kodverk)? Hur kan mikrobiologerna hjälpa Sverige att bli bäst i världen på E-hälsa (Vision 2025)? 2

3 Hur ser ett svar ut för en urinodling? Exempel 1 3 Exempel hämtade från användningsfall i Inera projektet Laboratoriemedicin

4 Hur ser ett svar ut för en urinodling? Exempel 2 4 Exempel hämtade från användningsfall i Inera projektet Laboratoriemedicin

5 Hur ser ett svar ut för en urinodling? Exempel 3 5 Exempel hämtade från användningsfall i Inera projektet Laboratoriemedicin

6 Olika benämningar för samma sak? Undersökning Exempel 1 Exempel 2 Exempel 3 Hur benämns undersökningen? Urinodling (a) Urinodling Bakterieodl, urin Resultat Exempel 1 Exempel 2 Exempel 3 Hur skrivs resultaten? Proteus Mirabilis, Riklig växt Växt av Escherichia coli CFU/ml Escherichia coli >E5 CFU/ml Resistens Exempel 1 Exempel 2 Exempel 3 Hur benämns resistenstabellen? Resistensmönster Känslighet Resistensbestämning

7 Cosmic Asynja Visph/CGM J4 Journal III Medidoc Asynja visph Melior Infomedix NCS Cross Take Care( VAS Labsvar PM0 Linnéfiler (jornalsystem fertilitet) Cambio Galactic PMA Kopplingar mellan mikrobiologi-lis och andra system (mars 2018) System som de mikrobiologiska labsytement levererar data till Mikrobiologiskt labb, ort LIS idag (febr 2018) Skövde CGM Analytix x x x x x x x Karlstad CGM Analytix x x Västerås LabStudio X X Örebro Flexlab kemi (för mikrobiologisvar) x x x x Kalmar ADBakt x Uppsala CGM Analytix x Västerås Medical Suite X Eskilstuna CGM Analytix x x x Göteborg BaktLIS X X X Karolinska sjukhuset ADBakt x x x x x Borås ADBakt X X X Göteborg GMP X Karlskrona wwlab (ADBakt) Falun ADBakt X Linköping LabVantage Medical Suite Trollhättan ADBakt X X Örebro FlexLab mikro x Halmstad LabVantage Medical Suite x Jönköping LabVantage Medical Suite FoHM LabVantage Medical Suite Linköping LabVantage Medical Suite 7 Framtagen av Gunnar Nordin inom ramen för Inera projektet Laboratoriemedicin

8 Bakgrund: Vad beskriver en NPU-kod? En laboratorieundersökning kan beskrivas på följande sätt: Egenskap = Resultat x Måttenhet NPU-syntax (Nomenclature for Properties and Units) System Komponent;egenskapsslag =? måttenhet Glukosmätning i plasma Plasma Glukos; substanskoncentration = 12 mmol/l NPU/SWE-kod Förkortad nomenklatur Måttenhet Trivialnamn Kortnamn NPU02192 P Glukos;subst konc mmol/l P Glukos P Glukos Påvisande av RSV(RNA) i sekret från nasopharynx Sekret(Nasofarynx) Respiratoriskt syncytialvirus(rna); arbiträr koncentration(procedur) = Påvisad NPU/SWE-kod Förkortad nomenklatur Trivialnamn Kortnamn NPU18074 Sekr(Nasof) Respiratoriskt syncytialvirus(rna);arb konc(proc) Sekr(Nasof) RSV RNA Nasof RSV RNA

9 Nomenclature for Properties and Units (NPU): en gemensam laboratorieterminologi för Sverige, Norge och Danmark Terminologin ägs av International Federation for Clinical Chemistry and Laboratory Medicine«(IFCC) och International Union for Pure and Applied Chemistry«(IUPAC) I maj 2016 blev Equalis åter nationell förvaltare av NPU-terminologin. I Danmark och Norge är användningen av NPU-terminologin obligatorisk. 9 > koder

10 Hur hittar ni NPU-koder till era analyser idag? Innehåller > 5000 koder Mikrobiologiska analyser är uppdelade: Bakteriologi och Virologi

11 Hur skulle man kunna kodera ett odlingssvar? NPU-kod Förkortad nomenklatur Trivialnamn NPU06073 U(spec) Bakterie;taxon(proc) U Bakterieodling Resultat Fynd Snomed CT kod Vad är det som växer? Proteus Mirabilis Proteus mirabilis Hur mycket växer? Riklig växt riklig växt påvisad Provmaterial Snomed CT kod Vilket provmaterial användes? Urin urinprov Metodprincip Metod Snomed CT kod Vilken metod användes? Allmän odling allmän odling 11

12 Hur skulle man kunna kodera ett svar för resistensbestämning? NPU-kod Förkortad nomenklatur Trivialnamn NPU06044 Syst Mecillinam;känsl Mecillinam (SIR) NPU06011 Syst Cefadroxil;känsl Cefadroxil (SIR) NPU06047 Syst Trimetoprim;känsl Trimetoprim (SIR) NPU06048 Syst Nitrofurantoin;känsl Nitrofurantoin (SIR) NPU06049 Syst Ciprofloxacin;känsl Ciprofloxacin (SIR) Resultat Snomed CT kod S Sensitiv (känslig) mottaglig R Resistent resistent 12

13 Vad blir effekten när vi börjar använda NPU-koder? Svar/resultat kan skickas enhetligt till nationella tjänster vilket leder till högre kvalitet, patientsäkerhet och effektivitet. Minskad omkodering av svar/resultat vid insamling av data för t.ex. bevakning av antibiotikaresistens eller smittspårning. Förbättrad statistik för forskning, kvalitetsregister mm... 13

14 Journalen och Nationell Patientöversikt Journalen Journalen är en tjänst som gör det möjligt för invånarna att läsa journalinformation från hälso- och sjukvården via nätet. Invånarna når tjänsten genom inloggning i 1177 Vårdguidens e-tjänster. Nationell Patientöversikt Nationell patientöversikt, NPÖ, gör det möjligt för behörig vårdpersonal att med patientens samtycke ta del av journalinformation som registrerats hos andra regioner, kommuner eller privata vårdgivare. En helhetsbild av patienten som kan öka kvalitet i vård. Tillgång till information som minskar kostnader och tidskrävande dubbelarbete. Bättre verktyg för planering och samordning mellan vårdgivare

15 Projektet Laboratoriemedicin : fler informationsmängder nationellt Projektet Laboratoriemedicin på Inera ämnar att ge möjligheter för vårdpersonal och patienter att ta del av fler typer av laboratoriesvar än hittills i Nationell patientöversikt (NPÖ) och Journalen. Projektet startade i februari 2018 och pågick till mars Nu startar en pilot! Fokuserar på att också kunna visa svar för mikrobiologi samt komplexa immunologioch kemisvar. För att möjliggöra detta så krävs ett nytt tjänstekontrakt (informationsmodell). Ett stort fokus under projektet har varit att använda komplexa exempel från laboratorierna för att testa informationsmodellen, och att ha nära kontakt med en referensgrupp. En viktig del av projektets arbete är att standardisera användningen av termer och begrepp i provsvaren Visning av svar är också ett delmål. Projektet har redan visat på vikten av att informatiker har en nära samverkan med experter från verksamheten. Projektledare: Marjan Akhavan Sadeghi, Inera

16 Vision e-hälsa 2025 Vision e-hälsa 2025 År 2025 ska Sverige vara bäst i världen på att använda digitaliseringens och e-hälsans möjligheter i syfte att underlätta för människor att uppnå en god och jämlik hälsa och välfärd samt utveckla och stärka egna resurser för ökad självständighet och delaktighet i samhällslivet. Visionens nyckelområden: Regelverk Enhetligare begreppsanvändning Koder, begrepp, termer och strukturer som används ska vara enhetliga för att möjliggöra det informationsutbyte som behövs för att säkerställa kvalitet och säkerhet Standardiseringfrågor 16 Information från:

17 Hur kan mikrobiologerna hjälpa Sverige att bli bäst i världen på E-hälsa (Vision 2025)? Föra en diskussion inom professionen på vilket man bäst koderar analyser för att kunna skicka svar nationellt på ett harmoniserat och säkert sätt. Vilken nivå av kodering behöver vi? Börjar vi detta omfattande arbete nu så har vi mycket att vinna i längden! men det kommer att ta tid. Interaktionen mellan professionen och informatiker är väldigt viktig. 17