Schema för BL3008 Cell- och molekylärbiologi 27 hp, HT 2018

istockholms universitet Version: 2018-06-08 Inst. för biologisk grundutbildning Schemaändringar kan förekomma. www.big.su.se PRELIMINÄRT Schema för BL3008 Cell- och molekylärbiologi 27 hp, HT 2018 KURSSTART: Måndag 3 september, kl. 09.15 i sal Namn Kod Rum Tel. E-post Kursansvarig: Anki Östlund Farrants AKÖF F447 08-16 4097 anki.ostlund@su.se Lärare: Lärarförteckning med kontaktuppgifter meddelas senare (via Mondo). Lokaler: Föreläsningar: Laborationer: Grupparbete Räkneövningar Datasal Grupprum, lokaler meddelas senare se schemat nedan D406 Litteratur: Carlson & Linder. Introduktion till mikrobiologi. 3:a uppl. Studentlitteratur 2012. Cooper & Hausman. The Cell: A Molecular Approach. 7:e uppl. Co-published by ASM Press and Sinauer Associates 2013. Escher & Saura. Genetik. 1:a uppl. Liber. 2009. Kursmoment: 1. Teori CMB-I, 9 hp (Theory CMB-I, 9 ECTS) 2. Teori CMB-II, 11 hp (Theory CMB-II, 11 ECTS) 3. Metoder, 7 hp (Methods, 7 ECTS) Kursens innehåll Efter en inledande beskrivning av cellen som fundamental bärare av livsprocessen, studeras: * Bakterie- och arkéacellers uppbyggnad, metabolism, näringskrav och tillväxt. * Virusuppbyggnad och livscykler. * Antibiotika och antibiotikaresistensmekanismer samt deras uppkomst och spridning. * Genomets organisation, bevarande och evolution, inklusive DNA-replikation, uppkomst av mutationer samt DNA-reparation. * Bakteriegenetik. Transformation, transduktion, konjugation och kartläggning av bakteriegenom. * Det genetiska informationsflödet. Geners organisation, expression och reglering hos bakterier, arkéer, eukaryoter och virus. Syntes, mognad och sortering av proteiner. * Den eukaryota cellens funktionella organisation. Cellkärnan, organeller, fiberverk, biomotorsystem, plasmamembran, membrantransport och endocytos, celladhesion, extracellulär matrix, cellvägg och cell- cellkontakter. * Cellers tillväxtkontroll. Cellsignalering, signaltransduktion, cellcykeln, celldifferentiering, onkogener och cancer. * Cytogenetik. Mitos, meios och gametbildning. * Mendelsk genetik: haploit och diploit arv, (könsbundet arv), geners funktion, kvalitativa och 1

kvantitativa karaktärer, koppling och gensamverkan, pedigreeanalys. * Inledande populationsgenetik och evolution - genetisk variation och mikroevolutionära processer. * Human och klinisk genetik, inklusive immungenetik. * Cellen i ett evolutionsperspektiv. * Grundläggande metoder och experimentella verktyg inom mikrobiologi, genetik och molekylär cellbiologi, inklusive sterilteknik, transformation, cellfärgningsmetoder, cellodling, mikroskopi (ljusfälts-, faskontrast-, och fluorescensmikroskopi), detektion av proteiner och nukleinsyror i celler och extrakt, rekombinant DNA- teknologi, PCR och genetisk analys. Examination: Tentamen: Omtentamen: Mondo: Närvarokrav: Kursen examineras på följande vis: Kunskapskontroll av moment 1 och 2 sker genom skriftliga prov och moment 3 sker genom skriftliga redovisningar och deltagande i obligatoriska gruppdiskussioner. Kursens betygskriterier delas ut vid kursstart. För godkänt krävs lägst betygsgraden E, godkänt betyg på moment 3, godkända laborationer och muntliga redovisningar, samt deltagande i all obligatorisk undervisning. CMB-I CMB-II CMB-I CMB-II Relevant kursinformation kommer att finnas på Athena. Kursen innehåller fyra metodikblock med laborativa moment (MB1-MB4). Alla laborationer har obligatorisk närvaroplikt. Det är mycket viktigt att du pratar med kursassistenterna om du behöver vara borta. Observera att närvarokravet även gäller laborationsgenomgångar, gruppdiskussioner och uppföljningsdiskussionen (). Trots att föreläsningarna inte är obligatoriska vill vi starkt rekommendera Dig att delta också på dessa. De är avsedda att underlätta inläsningen av läroböckerna och inhämtandet av övriga kursmoment. CMB-I (9 hp) Dag Tid Lokal Grupp Aktivitet / Lärare Mån v.36 3/9 9:15-12:00 E306 Alla* Upprop och introduktion till kursen / AKÖF 13:00-16:00 E306 Alla Inledning, livet molekyler/ AKÖF 9:00 Alla Självstudier: läsning Cooper & Hausman (s.3-16) Självstudier: läsning Cooper & Hausman (s.43-58) Självstudier: läsning Cooper&Hausman (s.103-117) Självstudier: läsning Escher&Saura (s. 22-31) 4/9 13.30-16:30 E306 Alla F: Cellen i översikt / R. Karlsson 9:00-12:00 E306 Alla F: Genetiken och den centrala dogmen / N. Visa 5/9 13:00-15:00 E306 Alla F: Guide för vetenskapligt skrivande / C. Andréasson 9:00-12:00 E306 Alla F: Mikrobiologi. Bakteriens uppbyggnad / A.-B. Jonsson 6/9 Alla självstudier 2

7/3 9:00-9.30:30 E306 Alla* Gruppindelning för lab och gruppdiskussioner 9:30 11:00 E306 Alla* Diagnostiskt test 11.00 12.00 E306 Alla Genomgång av Diganostiskt test 13.00 15.00 E306 Alla Genomgång av Diganostiskt test, fortsättning Mån 9:00-12:00 E306 Alla F: Bakteriens näringsliv och tillväxt / A-C. Lindås v37 10/9 13:00-17:00 lab Alla* MB1: Laboration I 11/9 9:00-12:00 E306 Alla F: Systematik av mikroorganismer- I / A-C. Lindås 13:00-17:00 lab Alla* MB1: Laboration II 9:00-9:30 lab Alla* MB1: Laboration III 9:30-12:00 E306 Alla F: Systematik av mikroorganismer- II / A-C. Lindås 12/9 13:00-17:00 lab Alla* MB1: Laboration III forts. 13/9 9:00-12:00 E306 Alla F: Antibiotika och antibiotikaresistens / K. Udekwu 13:00 Självstudier 14/9 Alla Självstudier Mån v.38 17/9 9:00-12:00 E306 Alla* Skrivuppgift: Introduktion och övningar / AKÖF 13:00-17:00 lab Alla* MB1: Laboration IV 18/9 9:00-17:00 lab Alla* MB1: Laboration V 19/9 9:30-12:00 E306 Alla självstudier 13:00-17:00 lab Alla* MB1: Laboration VI 20/9 9:00-12:00 E306 Alla F: Gener och genomorganisation- I / N. Visa 13:00-16:00 E306 Alla Frågestund första veckorna - mikrobiologi 21/9 9:00-12:00 E306 Alla F: Gener och genomorganisation- II / N. Visa 17:00 Alla* Inlämning av laborationsrapport MB1 Mån 9:00-12:00 E306 Alla F: Bakterier i människans tjänst / A-C. Lindås 24/9 13:00-15:00 E306 Alla* Grupparbete Genteknik: Introduktionsföreläsning I / U. Theopold 15:00- Alla Självstudier läsning Cooper & Hausman (s.118-134) Självstudier läsning Escher & Saura (s.341-358) 25/9 9:00-12:00 E306 Alla F. Virus. Generella egenskaper. Bakteriofager / A. Nilsson 13:00-13:30 E306 Alla* MB2: Introduktion 13:30-16:30 D406 AB* MB2: Dag 1 Primerdesign 13:30-16:30 CDEF Grupparbete Genteknik: Självstudier 26/9 9:00-12:00 Grupparbete genetik: självstudier 12:00-17:00 BÄR Information/aktiviteter 9.00-12.00 E306 Alla F: DNA replikation och genetik i prokaryota och eukaryota celler / K. Udekwu 27/9 13:00-15:00 E306 CD* MB2: Dag 1 Primerdesign ABEF Grupparbete Genteknik: Självstudier v. 39 3

28/9 9:00-12:00 E306 Alla F: Mutationer och DNA repair / S. Åström F: 13:00-16:00 D406 EF* MB2: Dag 1 Primerdesign 13:00-16:00 grupprum ABC* Grupparbete Genteknik: Diskussion I Mån v. 40 1/10 9:00-17:00 självstudier 2/10 9:00-12:00 E306 Alla F: Transkription / A. Östlund Farrants 13:00-15:00 grupprum DEF* Grupparbete Genteknik: Diskussion I 3/10 9:00-12:00 E306 Alla Transkriptionsreglering / A. Östlund Farrants 13:00 15:00 E306 Alla* Grupparbete Genteknik: Introduktionsföreläsning II 9:00-12:00 E306 Alla F: RNA processing / N.Visa 4/10 9:00-17:00 E306 Alla Grupparbete Genteknik: Självstudier 5/10 9:00-12:00 E306 Alla F: Proteinsyntes / N. Visa Mån v. 41 8/10 9:00-12:00 Alla F: Reglering av proteinsyntes/n. Visa 13:00-17:00 lab A-F* MB2: Laboration Dag 2 9/10 9:00-12:00 grupprum ABC* Grupparbete Genteknik: Diskussion II 13:00-17:00 lab A-F* MB2: Laboration Dag 3 10/10 9:00-12:00 grupprum DEF* Grupparbete Genteknik: Diskussion II 13:00-15:00 lab A-F* MB2: Laboration Dag 4 11/10 9:00-17:00 Alla Självstudier 12/10 9:00-12:00 E306 Alla Frågestund v38 v41 17:00 A-F* Inlämning av laborationsrapport MB2 * Obligatorisk närvaro Skriftlig tenta CMB-I dagen den 17 oktober Sal? 4

istockholms universitet Version: 2017-08-14 Inst. för biologisk grundutbildning Schemaändringar kan förekomma. www.big.su.se PRELIMINÄRT Schema för BL3008 Cell- och molekylärbiologi 27 hp, HT 2018 KURSSTART: Måndag 23 september, kl. 09.15 i sal Namn Kod Rum Tel. E-post Kursansvarig: Anki Östlund Farrants AKÖF F447 08-16 4097 anki.ostlund@su.se Lärare: Lärarförteckning med kontaktuppgifter meddelas i kursmappen. Lokaler: Föreläsningar: Laborationer: Grupparbete Räkneövningar Datasal Grupprum, lokaler meddelas senare se schemat nedan Litteratur: Carlson & Linder. Introduktion till mikrobiologi. 3:a uppl. Studentlitteratur 2012. Cooper & Hausman. The Cell: A Molecular Approach. 7:e uppl. Co-published by ASM Press and Sinauer Associates 2013. Escher & Saura. Genetik. 1:a uppl. Liber. 2009 eller alternativ Kursmoment: 1. Teori CMB-I, 9 hp (Theory CMB-I, 9 ECTS) 2. Teori CMB-II, 11 hp (Theory CMB-II, 11 ECTS) 3. Metoder, 7 hp (Methods, 7 ECTS) Kursens innehåll Efter en inledande beskrivning av cellen som fundamental bärare av livsprocessen, studeras: * Bakterie- och arkéacellers uppbyggnad, metabolism, näringskrav och tillväxt. * Virusuppbyggnad och livscykler. * Antibiotika och antibiotikaresistensmekanismer samt deras uppkomst och spridning. * Genomets organisation, bevarande och evolution, inklusive DNA-replikation, uppkomst av mutationer samt DNA-reparation. * Bakteriegenetik. Transformation, transduktion, konjugation och kartläggning av bakteriegenom. * Det genetiska informationsflödet. Geners organisation, expression och reglering hos bakterier, arkéer, eukaryoter och virus. Syntes, mognad och sortering av proteiner. * Den eukaryota cellens funktionella organisation. Cellkärnan, organeller, fiberverk, biomotorsystem, plasmamembran, membrantransport och endocytos, celladhesion, extracellulär matrix, cellvägg och cell- cellkontakter. * Cellers tillväxtkontroll. Cellsignalering, signaltransduktion, cellcykeln, celldifferentiering, onkogener och cancer. * Cytogenetik. Mitos, meios och gametbildning. * Transmissionsgenetik: kvalitativa och kvantitativa karaktärer, koppling och gensamverkan, 1

pedigreeanalys, könsbundet arv. * Populationsgenetik. Genetisk variation och mikroevolutionära processer. * Human och klinisk genetik, inklusive immungenetik. * Cellen i ett evolutionsperspektiv. * Grundläggande metoder och experimentella verktyg inom mikrobiologi, genetik och molekylär cellbiologi, inklusive sterilteknik, transformation, cellfärgningsmetoder, cellodling, mikroskopi (ljusfälts-, faskontrast-, och fluorescensmikroskopi), detektion av proteiner och nukleinsyror i celler och extrakt, rekombinant DNA- teknologi, PCR och genetisk analys. Examination: Kursen examineras på följande vis: Kunskapskontroll av moment 1 och 2 sker genom skriftliga prov och moment 3 sker genom skriftliga redovisningar och deltagande i obligatoriska gruppdiskussioner. Kursens betygskriterier delas ut vid kursstart. För godkänt krävs lägst betygsgraden E, godkänt betyg på moment 3, godkända laborationer och muntliga redovisningar, samt deltagande i all obligatorisk undervisning. Tentamen: CMB-I 17 oktober CMB-II 19 december Omtentamen: CMB-I Lörd 11 nov, 09:00-13:00, lokal meddelas senare CMB-II Meddelas senare Athena: Närvarokrav: Relevant kursinformation kommer att finnas på Athena. Kursen innehåller fyra metodikblock med laborativa moment (MB1-MB4). Alla laborationer har obligatorisk närvaroplikt. Det är mycket viktigt att du pratar med kursassistenterna om du behöver vara borta. Observera att närvarokravet även gäller laborationsgenomgångar, gruppdiskussioner och uppföljningsdiskussionen ( 5/12). Trots att föreläsningarna inte är obligatoriska vill vi starkt rekommendera Dig att delta också på dessa. De är avsedda att underlätta inläsningen av läroböckerna och inhämtandet av övriga kursmoment. CMB-I (9 hp) Dag Tid Lokal Grupp Aktivitet / Lärare Mån v.42 15/10 Inläsning 16/10 Inläsning 17/10 TENTAMEN CMB I 18/10 9:00-12:00 E306 Alla F:Membran / P. Ljungdahl 13:00-16:00 E306 Alla F: Sekretoriska vägar/p. Ljungdahl 19/10 9:00-12:00 E306 Alla F: Organellstruktur och funktion I / E. Pesquet 2

Mån v.43 22/10 9:00-12:00 E306 Alla F: Organellstruktur och funktion II / E. Pesquet 23/10 9:00-12:00 E306 Alla F: Plasmamembranet/ P Ljungdahl 24/10 9:00-12:00 E306 Alla F: Cellkärnans funktionells organisation / AKÖF 25/10 Självstudier 26/10 självstudier Mån 9.00 13.00 E306 Alla F: Cellmotilitet - I / R. Karlsson v.44 29/10 13:00-17:00 lab A-F* MB3: Introduktion, Laboration DAG 1 13:00-17:00 lab C-D* MB3: Laboration DAG 4 (se separat schema) 9:00-12:00 E306 Alla F: Cellmotilitet-II / R. Karlsson 30/10 13:00 17:00 lab E-F* MB3: Laboration DAG 2 9:00-12:00 E306 Alla F: Extracellulär matrix / R. Karlsson 31/10 13:00-17:00 lab A-F* MB3: Laboration DAG 3 9:00-17:00 A-F* MB3: Laboration DAG 4 (se separat schema) 1/11 9:00-12:00 E306 Alla F: Cellsignalering I / C. Andréasson 2/11 13:00 14:15 lab A-F* MB3: Laboration DAG 4 - Reservtid Mån v. 45 5/11 10:00-12:00 E306 Alla* F: Cellsignalering II / E. Pesquet 9:00-12:00 E306 Alla F: Cellcykeln / AKÖF 6/11 13:00-14:00 E306 A-F* MBD 3: Laboration, genomgång DAG 5 7/11 9:00-12:00 E306 Alla F: Apoptos Autofagi / S. Büttner 8/11 Självstudier 9:00-12:00 E306 Alla F: Mitos-Meios / C. Andreasson 9/11 Mån v. 46 12/11 9:00-12:00 E306 Alla F: Mendelsk genetik / S. Büttner 3

13/11 9:00-12:00 E306 Alla F: Genkartering / S. Büttner 14/11 9:00-17:00 Självstudier 15/11 9:00-12:00 E306 Alla F: Könsbestämning, doskompensation, imprinting/ S. Büttner 13:00-15:00 E306 A-F* MB4: Introduktion / A. Nilsson 16/11 9:00-12:00 lab A-F* MB4: Laboration DAG1 Mån v. 47 19/11 9:00-12:00 E306 Alla F: Genetisk variation och populationsgenetik / A. Nilsson 13:00-17:00 lab A-F* MB4: Laboration DAG 2 20/11 9:00-12:00 E306 Alla F: Kvantitativ genetik / A. Nilsson 13:00-17:00 lab A-F G: Genetik: Räkneövningar I 21/11 9:00-12:00 E306 Alla F: Genomforskning och genfunktion / AKÖF 13:00-15:00 lab A-F G: Genetik: Räkneövningar II 22/11 9:00-12:00 E306 Alla Frågestund genetik 13:00 17:00 lab A-F G: Genetik, Räkneövningar III 23/11 9:00-13:00 lab A-F* MB4: Laboration DAG 3 Mån v. 48 26/11 Självstudier 27/11 9:00-13:00 E306 Alla F: Celldifferentiering/ M. Mannervik 13:00-17:00 lab A-F* MB4: Laboration DAG 4 28/11 9:00-12:00 E306 Alla F: Nervcellens signallering och funktion? 13:00-15:00 lab A-F* MB4: Laboration DAG 5 29/11 Självstudier 30/11 10:00-12:00 E306 Alla F: Eukaryota virus / A. Nilsson 13:00-17:00 lab A-F* MB4: Laboration DAG 6 Mån v. 49 3/12 9:00-12:00 E306 Alla F: Immunologiska celler / E Sverremark Ekström 13:00-17:00 lab A-F* MB4: Laboration DAG 7 4/12 9:00-12:00 E306 Alla F: Infektionsbiologi/ A. Barragan 5/12 Självstudier 17:00 Inlämning av der vetenskapligt skrivande 4

6/12 9:00-12:00 E306 Alla F: Cellens och organismers metabolism / T. Bengtsson 13:00-17:00 lab A-F* MB4: Laboration DAG8 7/12 9:00-13:00 E306 A-F* MB4: DAG 9 14:00-16:00 Alla Frågestund Mån v. 50 10/12 9:00-12:00 E306 Alla F: Cellulär toxikologi? 11/12 9:00-12:00 E306 Alla Cancer / U. Theopold 12/12 9:00-12:00 grupprum A-F* METODER: Upföljningsdiskussion 13.00-15.00 E306 Alla Frågestund 17:00 MB4: Inlämning av laborationsrapport 13/12 Inläsning 14/12 Inläsning Mån v. 51 17/12 Inläsning 18/12 Inläsning 19/12 Tentamen * Obligatorisk närvaro Skriftlig tenta CMB-II dagen den 19 december 5