BL 7010 Marin miljöövervakning HT 2009

Transkript

1 Kursinformation + kursschema BL 7010 Marin miljöövervakning HT 2009 Välkommen till kursen! Kursstarten är Mån 26/10, 09:15 i sal 127 Frescati Backe (Systemekologen). Här kommer ett (försenat förlåt!) preliminärt schema och lite information om kursens utformning och omfattning. Kursen är upplagd i tre huvuddelar. De första knappa tre veckorna (26/10-11/11 i Stockholm) består av föreläsningar och övningar i statistik och teoretiska aspekter på miljöövervakning. Syftet med denna del är att få en statistisk förståelse och verktyg för att själv kunna analysera miljöövervakningsdata. Den andra delen är fältmomentet på Askö marinbiologiska laboratorium i Trosa skärgård (V47, 16/11-20/11) där vi i fält genomför ett praktiskt arbete i miljöövervakning, som senare analyseras och redovisaa gruppvis. Vi reser dit den måndagen 16/11 med minibuss och bil till Stora Utterviks brygga för att därifrån hämtas med båt och hem fredagen 20/11. Om du inte tidigare har varit på Askö kan du läsa mer på Stockholms Marina Forskningscentrums hemsida Under den sista delen av kursen (23/11-15/1 i Stockholm) miljöövervakningsprogram som för närvarande bedrivs i Östersjön av de för projekten huvudansvariga forskarna och inbjudna föreläsare som arbetar med miljöövervakning på olika sätt i samhället ger sin syn på miljöövervakningen. Då fortsätter även bearbetningen och redovisningen av fältarbetet samt uppföljningsuppgifter på fältarbetet. Under denna tid fortsätter vi även med datoriserade tillämpningsövningar och individuella uppgifter som anknyter till vissa föreläsningarna. Vi läser och diskuterar även artiklar som behandlar centrala problem inom miljöövervakning och analys av fältdata. Hur tidskrävande de olika arbetsmomenten blir beror mycket på resultat och förkunskaper. Vi kan komma att göra omdispositioner i schemat för att använda tiden så effektivt som möjligt. Det är därför viktigt att du betraktar all schemalagd tid som undervisningstid. Undervisningen är mycket uppbyggd kring föreläsningarna i statistik och miljöövervakningsprogram. Obligatorisk kurslitteratur är bl.a. 6 dokument som kan laddas ned från Naturvårdsverkets hemsida, men som även kan delas även ut som utskrifter vid kursstart om det behövs: Broschyr Så mår havet Årsrapport om havet - Havet Här finns även Havet 2007 om du vill ha den: Planering och utformning av miljöövervakningsprogram Planering av undersökningar Beskrivande statistik och presentation Dataanalys och hypotesprövning för statistikanvändare

2 Dessutom rekommenderas någon av nedanstående referensböcker i statistik (eller motsvarande som du föredrar eller redan har): Experimental Design and Data Analysis for Biologist. Gerry P. Quinn and Michale J. Keough sidor. Kommentar: Relativt omfattande bok som ger en god överblick av ett ganska stort antal statistiska metoder som används och är uppskattad av många ekologer. Den innehåller mer än vad vi kommer ta upp på kursen, men som man kan ha stor nytta av om man behöver använda statistik i framtiden. Denna rekommenderas i första hand. Pris: 412 SEK på Bokus ( 20desogn%20and) Statistics Explained An introductory Guide for Life Scientist. Steve McKillup sidor. Kommentar: Relativt lättläst och pedagogisk introduktion till statistik, men som tyvärr inte tar upp riktigt alla metoder som vi kommer beröra på kursen. Pris: 229 SEK på Bokus ( plained) Practical Statistics for Field Biology. Jim Fowler, Lou Cohen & Phil Jarvis 1998, 2:nd edition. 259 sidor. Enligt innehållsförteckningen tar den upp det mesta (och lite till) av det vi kommer beröra på kursen. Har inte läst den själv, så jag har inget eget omdöme, men den har rekommenderats på kursen förra tidigare. Pris: 210 SEK på Bokus ( atistics%20for) Biometry. Robert R. Sokal and F. James Rohlf. 1995, 3 rd edition. 887 sidor. En klassiker, som många ekologer använder. Detaljerad genomgång av grunderna i statistik, med fokus på variansanalys. Saknar vissa metoder som används mycket nuförtiden så som Generalized Linear Models, Additive Models och Multivariate Analysis, men som tas upp i Quinn and Kreogh ovan. Pris: 500 SEK på Bokus ( 20rohlf) Vi kommer bla. att använda gratisprogrammet R för statistiska analyser ( Det finns mycket information om R tillgängligt på nätet som vi kommer att ha nytta av på kursen, men om du ändå vill ha en enkel introduktion för att snabbt lära dig använda R effektivt så rekommenderar jag (det finns säkert fler förslag): A beginner s Guide to R. Alain F. Zuur, Elena N. Ieno and Erik H. W. G. Meesters Kommentar: Förklarar hur man använder R utan att gå in särskilt mycket på statistiska tillämpningar. Pris: 483 SEK (Dyr!) på Bokus ( Eftersom det inte är långt kvar till kursstart rekommenderar jag att du beställer litteratur snarast eftersom det brukar ta ett tag inan den kommer, men det kommer inte vara någon katastrof om du inte har fått litteraturen till första dagen. Vi kommer att ha datorövningar i BIGs datorsalar och du behöver ditt SU-konto för att logga in. Se till att du har dina inloggningsuppgifter.

3 Ring gärna om du har några frågor om kursen eller andra praktiska detaljer. Hälsningar, Olle Hjerne, Kursledare Systemekologiska institutionen Stockholms Universitet Stockholm Tel , Mobil , Hem , E-post LOKALER: Frescati backe 127 (FB 127) BIG datasalar E 249 och D 334. Datorsal D 406 kan användas för eget datorarbete om dessa salar är upptagna KURSANSVARIG LÄRARE: OH = Olle Hjerne, Tel: , Mobil , E-post: olle@ecology.su.se ÖVRIGA LÄRARE Arbetsplats Telefon E-post AB = Anders Bignert NH Riksmuséet anders.bignert@nrm.se AR = Anna Roos NH Riksmuséet anna.roos@nrm.se AW= Anders Wallin Systemekologen, SU anders@ecology.su.se CBr = Clare Bradshaw Systemekologen, SU clare@ecology.su.se CBe = Christina Berglind Länstyrelsen christina.berglind@lansstyrelsen.se CH = Christoph Humborg Baltic Nest Inst. SU christop@mbox.su.se CL = Christer Lännergren Stockholm Vatten christer.lannergren@stockholmvatten.se GH = Görel Fornander Systemekologen, SU gorel@ecology.su.se HL = Helene Limén Riksdagens utredn helene.limen@riksdagen.se JG = Jonas Gunnarsson Systemekologen, SU jonas@ecology.su.se JW = Jakob Walve Systemekologen, SU jakob.walve@ecology.su.se HK = Hans Kautsky Systemekologen, SU hassek@ecology.su.se PSy= Peter Sylvander Systemekologen, SU peter@ecology.su.se SK = Susanne Kratzer Systemekologen, SU suse@ecology.su.se TE = Tina Elwing SMF, SU tina.elfwing@smf.su.se BETYGSÄTTNING: Från och med läsåret tillämpas en sjugradig målrelaterad betygsskala vid Stockholms universitet. Målrelaterade betyg innebär att betygsgränsen bestäms utifrån i förhand uppställda kriterier, utan hänsyn till en enskild studentgrupps prestationer. Den sjugradiga betygsskalan har fem godkända betygssteg (A, B, C, D, E) och två underkända (Fx, F).

4 Schema Marin miljöövervakning 2009 Dag Datum Tid Sal Aktivitet (F:Föreläsning, D:Datorövningar, G:Gruppaktivitet, H:Helgrupp) Lärare v 44 Introduktion + Tillämpad statistik Må 26/10 09:15-12:00 FB 127 F Kursintroduktion: Upprop, Välkommen, Presentation OH, AW, PS.. av kursen, Varför miljöövervakning? 13:00-16:00 FB 127 F Introduktion: Statistiska problem i försök och OH fältprovtagning Ti 27/10 09:15-12:00 FB 127 F Beskrivande statistik & hypotespröving OH 13:00-16:00 FB 127 F Utforska data och grafiska metoder OH On 28/10 09:15-12:00 E 249 F R introduktion OH 13:00-16:00 E 249 D Datorövningar PS To 29/10 hela dagen Eget arbete & inläsning Fr 30/10 09:15-12:00 FB 127 F Statistiska test för att påvisa skillnader 1 (t-test, OH ANOVA, randomization, mm) 13:00-16:00 E249 D Datorövningar PS v 45 Tillämpad statistik Må 2/11 09:15-12:00 FB 127 F Statistiska test för att påvisa skillnader 2 (t-test, OH ANOVA, randomization, mm) 13:00-16:00 E 249 D Datorövningar PS Ti 3/11 09:15-12:00 FB 127 F Statistiska test för att påvisa samband (korrelation, OH regression...) On 4/11 hela dagen Eget arbete & inläsning To 5/11 09:15-12:00 FB 127 F Modelvalidering OH Fr 6/11 09:15-12:00 FB 127 F Poweranalys + Icke linjära metoder 1 OH v 46 Tillämpad statistik + Miljöövervakning & introduktion till fältarbete Må 9/11 09:15-12:00 FB 127 F Poweranalys + Icke linjära metoder 2 OH Ti 10/11 09:15-12:00 FB 127 F Multivariatstatistik SW 13:00-16:00 D 334 D Datorövningar AW On 11/11 hela dagen Eget arbete & inläsning To 12/11 09:15-12:00 FB 127 F Övervakning av mjuka bottnar JG 13:00-13:45 FB 127 F Inför Askövistelsen - info och historik TE 14:00-16:00 FB 127 G Planering av fältförsök OH, GF Fr 13/11 09:15-12:00 FB 127 F Övervakning av hårda bottnar HK 13:00-16:00 FB 127 G Planering av fältförsök OH, AW v 47 Fältarbete Må 16/11 OBS! 07:00 FB Avfärd från Systemekologen mot Utterviks brygga OH, GF, AW 08:00-08:30 Båttransport Uttervik-Askö OH, GF, AW 08:00-18:00 Askö Fältarbete OH, GF, AW Ti 17/11 08:00-18:00 Askö Fältarbete OH, GF, AW On 18/11 08:00-18:00 Askö Fältarbete/resultatbearbetning OH, GF, AW To 19/11 08:00-18:00 Askö Fältarbete/resultatbearbetning OH, AW Fr 20/11 08:00-16:00 Askö Resultatbearbetning och sammanfattning av läget OH, AW 16:30 Hemresa

5 v 48 Miljöövervakning + Bearbetning och delredovisning fältarbete Må 23/11 09:15-12:00 FB 127 F Överblick av miljöövervakning - internationellt till OH lokalt em G Resultatbearbetning av fältarbete Ti 24/11 hela dagen G Resultatbearbetning av fältarbete On 25/11 09:15-12:00 FB 127 H Resultatbearbetning av fältarbete 13:00-15:00 FB 127 H Redovisning fältarbete OH, AW, PS 15:00-16:00 FB 127 H Introduktion av uppföljningsuppgifter på fältarbetet OH To 26/11 09:15-12:00 FB 127 F Vattendirektivet TE 13:00-16:00 G Uppföljningsuppgifter fältarbetet Fr 27/11 09:15-12:00 FB 127 F Övervakning av pelagialen JW 13:00-15:00 FB 127 F Fjärranalysmetoder SK v 49 Miljöövervakning + Bearbetning fältarbete Må 30/11 09:15-12:00 FB 127 F Övervakning av radioaktivitet CBr em G Uppföljningsuppgifter fältarbetet Ass Ti 1/12 09:15-12:00 FB 127 F Övervakning av toppkonsumenter AR em D 334 D Tillämpningsövning OH On 2/12 hela dagen G Uppföljningsuppgifter fältarbetet To 3/12 09:15-12:00 FB 127 F Övervakning av miljögifter AB em Arbetsmarknadsdag (BIG) Ass Fr 4/12 09:15-12:00 FB 127 F Övervakning av fisk OH em D 334 D Tillämpningsövning OH v 50 Miljöövervakning + Redovisning fältarbete Må 7/12 09:15-12:00 FB 127 F MAREs beslutstödssytem & Baltic Sea Action Plan CH 13:00-16:00 FB 127 H Inlämning/redovisningav uppföljningsuppgifter OH fältarbetet Ti 8/12 09:15-12:00 FB 127 F Riksdagens perspektiv på miljöövervakning HL 13:00-16:00 FB 127 H Introduktion: Litteraturseminarium + Individuella OH inlämningsuppgifter On 9/12 hela dagen Eget arbete & inläsning To 10/11 09:15-12:00 FB 127 F Stockholm Vattens miljöövervakning CL em Eget arbete & inläsning Fr 11/12 09:15-12:00 FB 127 F Länstyrelsen roll inom miljöövervakningen Cbe 13:00-16:00 FB 127 Eget arbete & inläsning v 51 Miljöövervakning, Ekologisk modellering och Litteraturseminarium Må 14/12 09:15-12:00 FB 127 F Kustvattenvårdsförbunden (2 timmar) JW em Eget arbete & inläsning Ti 15/12 09:15-12:00 FB 127 F Ekologisk modellering OH 13:00-16:00 E 249 D Tillämpningsövning OH On 16/12 09:15-12:00 FB 127 F Ekologisk modellering OH 13:00-16:00 E 249 D Tillämpningsövning OH To 17/12 09:15-12:00 FB 127 H Litteraturseminarium AW, PS em Eget arbete & inläsning Fr 18/12 hela dagen Eget arbete & inläsning v 52-1 Julledigt v 2 Må 11/1 hela dagen Eget arbete & inläsning OH Ti 12/1 09:15-12:00 FB 127 H Frågor och repetition inför tentan, Inlämning av OH individuella uppgifter, kursutvärdering On 13/1 hela dagen Inläsning To 14/1 hela dagen Inläsning Fr 15/1 09:15-14:00 FB 127 H Tenta PS, AW

6