Stockholms universitet Version: 140828 Inst. för biologisk grundutbildning Schemaändringar kan förekomma. www.big.su.se Schema för BL3008 Cell- och molekylärbiologi 27 hp, HT 2014 KURSSTART: dag 1 september, kl. 09.15 i sal E 306 Namn Kod Rum Tel. epost Kursansvarig: Neus Visa NV F326 08-16 4111 neus.visa@su.se Lärare: Lärarförteckning med kontaktuppgifter meddelas senare (via Mondo). Lokaler: Föreläsningar: E306 Svante Arrhenius v. 20C Laborationer: D306, D320, E224 Grupparbete lokaler meddelas senare Räkneövningar lokaler meddelas senare Datasal D406 Litteratur: Carlson & Linder. Introduktion till mikrobiologi. 2:a uppl. Studentlitteratur 2012. Cooper & Hausman. The Cell: A Molecular Approach. 6:e uppl. Co-published by ASM Press and Sinauer Associates 2013. Escher & Saura. Genetik. 1:a uppl. Liber. 2009. Kursmoment: 1. Teori CMB-I, 9 hp (Theory CMB-I, 9 ECTS) 2. Teori CMB-II, 11 hp (Theory CMB-II, 11 ECTS) 3. Metoder, 7 hp (Methods, 7 ECTS) Kursens innehåll Efter en inledande beskrivning av cellen som fundamental bärare av livsprocessen, studeras: * Bakterie- och arkécellers uppbyggnad, metabolism, näringskrav och tillväxt. * Virusuppbyggnad och livscykler. * Antibiotika och antibiotikaresistensmekanismer samt deras uppkomst och spridning. * Genomets organisation, bevarande och evolution, inklusive DNA-replikation, uppkomst av mutationer samt DNA-reparation. * Bakteriegenetik. Transformation, transduktion, konjugation och kartläggning av bakteriegenom. * Det genetiska informationsflödet. Geners organisation, expression och reglering hos bakterier, arkéer, eukaryoter och virus. Syntes, mognad och sortering av proteiner. * Den eukaryota cellens funktionella organisation. Cellkärnan, organeller, fiberverk, biomotorsystem, plasmamembran, membrantransport och endocytos, celladhesion, extracellulär matrix, cellvägg och cell- cellkontakter. * Cellers tillväxtkontroll. Cellsignalering, signaltransduktion, cellcykeln, celldifferentiering, onkogener och cancer. * Cytogenetik. Mitos, meios och gametbildning. * Transmissionsgenetik: kvalitativa och kvantitativa karaktärer, koppling och gensamverkan, pedigreeanalys, könsbundet arv. 1
* Populationsgenetik. Genetisk variation och mikroevolutionära processer. * Human och klinisk genetik, inklusive immungenetik. * Cellen i ett evolutionsperspektiv. * Grundläggande metoder och experimentella verktyg inom mikrobiologi, genetik och molekylär cellbiologi, inklusive sterilteknik, transformation, cellfärgningsmetoder, cellodling, mikroskopi (ljusfälts-, faskontrast-, och fluorescensmikroskopi), detektion av proteiner och nukleinsyror i celler och extrakt, rekombinant DNA- teknologi, PCR och genetisk analys. Examination: Kursen examineras på följande vis: Kunskapskontroll av moment 1 och 2 sker genom skriftliga prov och moment 3 sker genom skriftliga redovisningar. Kursens betygskriterier delas ut vid kursstart. För godkänt krävs lägst betygsgraden E, godkänt betyg på moment 3, godkända laborationer och muntliga redovisningar, samt deltagande i all obligatorisk undervisning. Tentamen: CMB-I Lör 18 okt, 13:00-17:00, Brunnsvikssalen CMB-II 19 dec, 13:00-17:00, G-salen Omtentamen: CMB-I 21 nov, 09:00-13:00, lokal meddelas senare CMB-II Meddelas senare Mondo: Närvarokrav: Relevant kursinformation kommer att finnas på Mondo från 1 september. Kursen innehåller fyra metodikblock med laborativa moment (MB1-MB4). Alla laborationer har obligatorisk närvaroplikt. Det är mycket viktigt att du pratar med kursassistenterna, om du behöver vara borta. Observera att närvarokravet även gäller laborationsgenomgångar, gruppdiskussioner och räkneövningar. Trots att föreläsningarna inte är obligatoriska vill vi starkt rekommendera Dig att delta också på dessa. De är avsedda att underlätta inläsningen av läroboken och inhämtandet av övriga kursmoment. CMB-I-9hp Dag Tid Lokal Grupp Aktivitet / Lärare 1/09 9:15-12:00 E306 Alla* Upprop, gruppindelning och introduktion till kursen / N. Visa 13:00-17:00 Alla Självstudier: läsning Cooper & Hausman (s.3-16) 2/09 9:00-12:00 E306 Alla F: Cellen i översikt / R. Karlsson 13:00-17:00 Alla Självstudier: läsning Cooper & Hausman (s.43-58) 3/09 9:00-12:00 E306 Alla F: Genetiken och den centrala dogmen / N. Visa 13:00-17:00 Alla Självstudier: läsning Escher&Saura (s. 22-31), Cooper&Hausman (s.103-10) 4/09 9:00-12:00 E306 Alla F: Bakteriens uppbygnad / H.Aro 13:00-15:00 E306 Alla Diagnostisk test 5/09 Självstudier 2
8/09 9:00-12:00 E306 Alla F. Bakteriens näringsliv och tillväxt / H.Aro 13:00-17:00 Alla* MB1: Laboration I 9/09 9:00-12:00 E306 Alla F: Systematik av bakterier / N. De Klerk 13:00-17:00 Alla* MB1: Laboration II 10/09 9:30-9:50 Alla* MB1: Laboration III 10:00-10:30 E306 Alla* Skrivuppgift: Introduktion / N. Visa 10:30-12:00 E306 Alla* F: Guide för vetenskapligt skrivande / C. Andréasson 13:00-17:00 Alla* MB1: Laboration III forts. 11/09 9:00-12:00 E306 Alla F: Bakterier i människans tjänst / H. Sjölinder 12/09 Självstudier 15/09 9:00-12:00 E306 Alla F. Virus. Generella egenskaper. Bakteriofager / A. Nilsson 13:00-17:00 Alla* MB1: Laboration IV 16/09 9:00-17:00 Alla* MB1: Laboration V 17/09 9:00-12:00 E306 Alla F: Antibiotika och antibiotikaresistens / S. Pathak 13:00-17:00 Alla* MB1: Laboration VI 18/09 9:00-12:00 E306 Alla F: Arkéer och eukaryota mikroorganismer / A.Ch. Lindås 13:00-16:00 E306 Alla Frågestund v. 36-38 19/09 9:00-12:00 E306 Alla F: Gener och genomorganisation- I / L. Wieslander 17:00 Alla* Inlämning av laborationsrapport MB1 22/09 9:00-12:00 E306 Alla F: Gener och genomorganisation- II / L. Wieslander 13:00-15:00 E306 Alla* Grupparbete Genteknik: Introduktionsföreläsning I / N. Visa 15:30-16:00 E306 Alla* MB2: Introduktion 23/09 9:00-12:00 D406 A-B* MB2: Dag 1 - Bioinformatik 9:00-12:00 C-F Grupparbete Genteknik: Självstudier 13:00-16:00 D406 C-D* MB2: Dag 1 - Bioinformatik 13:00-16:00 A-B, E-F Grupparbete Genteknik: Självstudier 24/09 13:00-16:00 Obs! FB 107 Alla F: DNA replikation och genetik i prokaryota celler / A.-B. Jonsson 25/09 9:00-12:00 E306 Alla 13:00-16:00 D406 E-F* MB2: Dag 1 - Bioinformatik F: DNA replikation och reparation i eukaryota celler / L. Wieslander 13:00-16:00 A-D* Grupparbete Genteknik: Diskussion I 26/9 9:00-12:00 E-F* Grupparbete Genteknik: Diskussion I 3
29/09 9:00-12:00 E306 Alla F: Transkription / A. Östlund Farrants 30/09 10:00-12:00 E306 Alla* Grupparbete Genteknik: Introduktionsföreläsning II / N. Visa 13:00-17:00 Alla Grupparbete Genteknik: Självstudier 1/1 9:00-12:00 E306 Alla F: Transkriptionsreglering / A. Östlund Farrants 13:00-17:00 A-F* MB2: Laboration Dag 2 2/10 9:00-12:00 E306 Alla F: RNA processing / L. Wieslander 13:00-17:00 A-F* MB2: Laboration Dag 3 3/10 9:00-12:00 E306 Alla F: Proteinsyntes / N. Visa 13:00-14:30 A-F* MB2: Laboration Dag 4 6/10 9:00-12:00 E306 Alla F: Reglering av proteinsyntes / N. Visa 13:00-17:00 A-C* Grupparbete Genteknik: Diskussion II 7/10 9:00-12:00 E306 Alla F: Mutationer / S. Åström 13:00-17:00 D-F* Grupparbete Genteknik: Diskussion II 8/10 9:00-17:00 Alla Självstudier 9/10 9:00-17:00 Alla Självstudier 13:00-17:00 E306 Alla Frågestund v. 39-41 10/10 9:00-17:00 Alla Självstudier 17:00 Alla* Inlämning av laborationsrapport MB2 * Obligatorisk närvaro Lördag 18/10 kl. 13:00-17:00 Skriftlig tenta CMB-I-9hp, Brunnsvikssalen CMB-II-11hp Dag Tid Lokal Grupp Aktivitet / Lärare 20/10 Självstudier 21/10 9:00-12:00 E306 Alla F: Membran / P. Ljungdahl 22/10 9:00-12:00 E306 Alla F: Cellkärnans funktionella organisation / L. Wieslander 23/10 9:00-12:00 E306 Alla F: Sekretoriska vägar / U. Theopold 24/10 Självstudier 4
27/10 9:00-12:00 E306 Alla F: Organellstruktur och funktion - I / K. Pawlowski 28/10 9:00-12:00 E306 Alla F: Organellstruktur och funktion - II / K. Pawlowski 29/10 9:00-12:00 E306 F: Plasmamembran och cellvägg / P. Ljungdahl o K. Pawlowski 30/10 Självstudier 31/10 Självstudier 3/11 13.00-15.00 E306 A-F* MB3: Introduktion 15.15-17.00 A-F* MB3: Dag 1 4/11 9:00-12:00 E306 Alla F: Cellmotilitet - I / R. Karlsson 13:00-17.00 A-F* MB3: Dag 2 5/11 9:00-12:00 E306 Alla F: Cellmotilitet - II / R. Karlsson 13:00-17:00 A-B* MB3: Dag 3 (OBS!! Separat schema för varje grupp) 6/11 9:00-12:00 E306 Alla F: Extracellulär matris / R. Karlsson 13:00-17.00 C-D* MB3: Dag 3 (OBS!! Separat schema för varje grupp) 7/11 9:00-17.00 Självstudier 10/11 9:00-12:00 E306 F: Cellsignalering - I / C. Andréasson 13:00-17.00 E-F* MB3: Dag 3 (OBS!! Separat schema för varje grupp) 11/11 9:00-12:00 E306 F: Cellsignalering - II / P. Ljungdahl o K. Pawlowski 12/11 9:00-12:00 E306 F: Cellcykeln / A.K. Östlund Farrants 13:00-15:00 Alla MB3: Dag 3 (Reservtid) 13/11 9:00-12:00 E306 F: Cytogenetik: mitos och meios / C. Andréasson 13:00-14:00 Alla* MB3: Dag 4 14:15-17:00 E306 Alla Frågestund v. 43-45 14/11 17:00 Självstudier 17/11 9:00-12:00 E306 Alla F: Mendelsk genetik / N. Visa 18/11 10:00-12:00 E306 Alla* MB4: Introduktionsföreläsning 19/11 9:00-12:00 E306 Alla F: Genkartering / N. Visa 20/11 9:00-17:00 Självstudier 17:00 Alla* MB4: Inlämning av pre-lab frågeformulär 21/11 9:00-13:00 Omtenta CMB-I 14:00-17:00 Alla* MB4: Dag 1 5
24/11 9:00-12:00 E306 Alla F: Könsbestämning, dosskompensation, imprinting / N. Visa 13:00-18:00 Alla* MB4: Dag 2 (OBS!! Lång dag!!) 25/11 9:00-12:00 E306 Alla F: Genetisk variation och populationsgenetik / A. Nilsson 26/11 9:00-12:00 E306 Alla F: Kvantitativgenetik / A. Nilsson 13:00-17:00 A-F* G: Genetik Räkneövningar-I 27/11 9:00-12:00 E306 Alla F: Human genetik och genetiska sjukdomar / U. Theopold 28/11 10:00-12:00 Alla Frågestund v.46-48 13:00-16:00 Alla* MB4: Dag 3 1/12 9:00-12:00 E306 Alla F: Celldifferentiering / R. Karlsson 13:00-17:00 A-F* G: Genetik Räkneövningar-II 17:00 Alla Vetenskapligt skrivande: Inlämning av egen essä 2/12 9:00-12:00 E306 Alla F: Cancer / U. Theopold 13:00-14:00 Alla* MB4: Dag 4 3/12 9:00-12:00 E306 Alla F: Immungenetik / A.-L. Spetz 12:00- ARBETSMARKNADSDAGEN i Aula Magna 14:00-17:00 Alla* MB4: Dag 5 4/12 9:00-12:00 Alla* G: Genetik Räkneövningar-III 13:00-16:00 Alla* MB4: Dag 6 5/12 13:00-16:00 Alla* MB4: Dag 7 8/12 9:00-12:00 E306 Alla 13:00-17:00 Alla* MB4: Dag 8 F: Infektionsbiologi: bakterier och eukaryota mikroorganismer / A. Barragan 9/12 9:00-12:00 E306 Alla F: Infektionsbiologi: eukaryota virus / A.-L. Spetz 13:00-17:00 Alla* MB4: Dag 9 10/12 9:00-17:00 Alla Självstudier 11/12 13:00-16:00 E306 Alla Frågestund 13/12 9:00-17:00 Alla Självstudier 17:00 Alla* Inlämning av laborationsrapport MB4 15/12 17:00 Alla Vetenskapligt skrivande: Inlämning av utvärdering * Obligatorisk närvaro dag 19/12 kl. 13:00-17:00 Skriftlig tenta CMB-II-11hp, G-salen 6