PubMed (Public Medline) - sökmanual

Transkript

1 PubMed (Public Medline) - sökmanual Medicinska fakultetens bibliotek, Lund. Monica Landén PubMed/Medline är den största medicinska databasen och innehåller idag omkring 23 miljoner referenser till tidskriftsartiklar från hela världen. I vissa fall får man fram artiklarna i fulltext och i andra fall får man en referens till en tidskriftsartikel. För att få fram de mest relevanta artiklarna kan det vara en fördel att söka på MeSH-termer, de kontrollerade medicinska ämnesorden, via MeSH-database. Man kan översätta sina sökord till MeSH i Karolinskas svenska MeSH-databas: Fritextsökning Skriv ett eller flera sökord i sökrutan. PubMed kombinerar automatiskt orden med AND. Vid fritextsökning genomsöks alla fält i referenserna; MeSH, närliggande MeSH, titelfältet, författarfältet, abstract, tidskriftstitel o.s.v. Trunkering: Om man är osäker på hur ett ord stavas kan man söka trunkera ordet med en asterisk *. Heart* ger t.ex. träffar på heart, heartbeat etc. men ger inte träff på heart arrest. Hyp*tension ger träff på hypertension och hypotension. Frassökning: för att söka på en fras eller ett begrepp sätt citationstecken runt begreppet. OBS! Trunkering och frassökning stänger av automatisk länkning till MeSH-termer. Om flera olika booleska operatorer (AND-OR-NOT) används samtidigt bör parenteser användas t.ex. breast neoplasms AND nursing AND (sweden OR denmark) NOT hospice I vänsterspalten i träfflistan kan man begränsa sin sökning t.ex. språk, åldersgrupp, kön, typ av artikel samt hur gamla artiklarna får vara. Klicka på begränsningen för att aktivera den. Klicka på Show additional filters för att lägga till ytterligare begränsningar än vad som visas i listan. Begränsningen ligger kvar även vid en ny sökning. För att ta bort eller ändra limits klicka på Clear eller Clear All. I Advanced återfinns sökhistoriken för sökningarna. För att kunna kombinera olika sökord/sökningar kan det vara en fördel att söka på ett ord i taget och sedan kombinera sökorden i Search History. Sökning med MeSH-termer via MeSH-database Om man får för många träffar vid fritextsökning kan det vara en fördel att söka på orden som MeSH-termer. Man ska observera att en sökning med MeSH-termer utesluter alla nya referenser som ännu inte har blivit indexerade (PubMed in process). MeSH Database är en ämnesordlista där man söker fram sina sökord som MeSH-termer. Genom att söka på dessa kontrollerade ämnesord använder man sig av en vedertagen term för ett begrepp (vilket utesluter användandet av olika synonymer) och som överensstämmer med artikelns ämnesinnehåll. Man undviker härmed artiklar där sökordet bara nämns i abstract. Detta ökar möjligheten att finna relevanta artiklar. Det kan vara en fördel att söka fram ett sökord i taget, för att sedan göra olika kombinationer av sökorden. Titta gärna på MeSH-database tutorials: bildspel som visar hur man använder MeSH-database.

2 För att nå MeSH database skriv in ditt sökord i sökrutan välj sedan kategorin MeSH i rullgardinsmenyn till vänster om sökrutan. Klicka på Search för att komma till MeSH database. I vissa fall får man fram flera alternativa MeSH-termer. Välj den term som är mest relevant. Klickar du på MeSH-termen visas subheadings/aspektord och kan därmed begränsa sökningen. Det kan vara en fördel om man har ett brett ämne som ger många träffar. Är du intresserad av t ex läkemedelsbehandling när det gäller t ex bröstcancer väljer du subheading drug therapy. Är du intresserad av omvårdnad väljer du nursing eller psychology för psykologiska aspekter av bröstcancer eller någon annan aspekt. Väljer man mer än en subheading kombineras sökningen med OR. Breast neoplasms/nursing OR Breast neoplams/psychology. Man kan även välja Restrict Search to Major Topic headings only för att begränsa sökningen till artiklar som har detta sökord som huvudinnehåll. Do not include MeSH terms found below this term in MeSH hierachy innebär att underordnade MeSH-termer inte tas med i sökningen. Se sökordet i MeSH-trädet längre ner på sidan. Välj önskade alternativ. Klicka sedan på Add to search builder och sedan Search PubMed. En sökning görs nu i PubMed på sökordet som en MeSH-term.

3 Gör på motsvarande sätt för att få fram andra sökord som MeSH-termer. Se gärna MeSH-database tutorials: bildspel som visar hur man använder MeSH-database. Nästa steg blir att kombinera de olika sökorden. Kombinera olika sökord Search history. För att kombinera olika sökord klicka på Advanced under sökrutan för att få fram tidigare sökord eller kombinationer av sökord. I History har varje sökord/sökning fått ett nummer som kan kombineras med AND, OR eller NOT. Klicka på Add för de sökord du vill kombinera. Du kan ändra AND till OR eller NOT. Genom att klicka på Add to history visas hur många träffar du får genom kombinationen. För att få fram träfflistan med artikelreferenserna klicka på antalet träffar för sökningen under Items found alternativt klicka på Search för att komma direkt till träfflistan. Begränsa/filtrera sökresultatet Du kan begränsa din sökning genom att klicka på alternativen i träfflistans vänsterspalt t.ex. typ av artikel samt hur gamla artiklarna får vara. Begränsningen ligger kvar även när du gör en ny sökning. Ta bort eller ändra genom att klicka på Clear eller Clear all. Klicka på Show additional filters för att se samtliga begränsningar/filter. Kryssa i önskade begränsningar t ex Ages och klicka på Show. För att aktivera begränsningen i din sökning klickar du på den när den dyker upp i listan. Vill du lägga till ytterligare ålderskategorier klicka på more i listan. Med begränsningen Search Fields kan du välja i vilka fält sökningen ska göras t ex som ord i artikelns titel. OBS! Vid en sökning med filter utesluts nya artiklar som ännu inte hunnit bli indexerade i PubMed artiklar där det står [PubMed as supplied by publisher] eller [PubMed in process].

4 1. 2. Träfflistan Träfflistan visas i kronologisk ordning med de senaste publicerade referenserna först. Du kan välja att ranka dina sökträffar efter relevans genom att klicka på Sort by Relevance överst tillhöger. Klicka på den blåmarkerade titelreferensen för att få fram mer information om referensen. Du kan ändra utseendet på hela träfflistan genom att klicka på Display Settings. Väljer man Abstract och klickar på Apply visas de abstract som är tillgängliga i träfflistan. Genom att klicka på Publication Types, MeSH Terms får man även reda på vilken typ av artikel det är samt MeSH-termerna som beskriver artikelns innehåll. Hittar man en relevant träff är det klokt att se vilka MeSH som visas, för att få tips på andra MeSH-termer att söka på. Related Citations ger träffar på artiklar med motsvarande innehållsbeskrivande ämnesord. De mest relevanta träffarna visas först och är därför tidsmässigt blandade. OBS! Denna funktion bör inte användas när man gör en litteraturstudie, då redovisningen av artikelsökningen försvåras. LU Linker är en länk till LUBsearch där man kan se om artikeln finns tillgänglig i fulltext (=om Lunds universitet prenumererar på just den tidskriften) Man kan även pröva att klicka på tidskriftsikonen vid sidan om. Välj alltid att ta fram fulltextartikeln som en PDF-fil.

5 Samla utvalda referenser för att skriva ut, spara eller skicka som e-post Med Send to - Clipboard kan man tillfälligt spara referenser som man väljer ut i träfflistan. Bocka för intressanta referenser. Klicka på Send to och välj Clipboard och Add to Clipboard. De utvalda referenserna i Clipboard finns som en länk högst upp till höger i träfflistan eller i Search History (Advanced) som en sökning PubMed Clipboard. Obs! Referenserna i Clipboard försvinner automatiskt efter åtta timmars inaktivitet. I Clipboard kan du skriva ut dina valda referenser. Välj vilket format referenserna ska ha (summary, abstract, MEDLINE) i Display settings. Send to File skapar en fil som kan sparas på din dator. Bocka för de referenserna du vill spara. Välj vilket format referenserna ska ha och hur de ska vara sorterade. Klicka på Create File. Send to . Bocka för de referenser som du vill skicka. Välj vilket format referenserna ska ha och hur de ska vara sorterade. Klicka på . Spara sökningar och referenser. För att kunna spara sökningar och referenser i PubMed måste man först registrera ett eget konto. Klicka på Sign in to NCBI överst på sidan och sedan på Register for a NCBI account. Du kan få dina sparade sökningar uppdaterade via e-post (alerts). För du spara din sökning klicka på Save search under sökrutan alternativt klicka på numret på sökningen i sökhistoriken och välj alternativet Save in My NCBI. För att spara referenser bocka för de referenser du vill spara. Klicka på Send to och välj Collections och Add to Collections. Välj att skapa en ny Collection som du namnger eller lägg referenserna i en befintlig Collection. För att importera referenser till referenshanteringsprogram följ manualer för EndNote eller RefWorks som finns på bibliotekets hemsida. Andra funktioner på PubMeds startsida Clinical Queries är ett särskilt sökverktyg med inbyggt metodfilter för kliniska frågeställningar. Journals Database för att få fram det fullständiga namnet eller förkortningen på en tidskrifts namn. Finns på Pubmeds startsida. Man kan även få fram det fullständiga namnet genom att ställa markören över tidskriftens namn i träfflistan. Single Citation Matcher: är användbar när man t.ex. vill söka fram en referens som man hittat i en referenslista. Utifrån de uppgifter man har kan man välja att söka på tidskriftens namn, publiceringsår, volym, nummer, sidor. Man kan även söka på författarnamn och ord i artikelns titel. Finns på Pubmeds startsida.