Daniel Karlsson, univ.lektor, Institutionen för medicinsk teknik

Transkript

1 Daniel Karlsson, univ.lektor, Institutionen för medicinsk teknik

2 Big data is high-volume, high-velocity and high-variety information assets that demand cost-effective, innovative forms of information processing for enhanced insight and decision making. Gartner IT Glossary Big data is a term for data sets that are so large or complex that traditional data processing application software is inadequate to deal with them. Wikipedia

3 BIG DATA-metoder Statistiska metoder AI och maskininlärning Ex. naturligt-språk- och bildbehandling

4 + 1 GB text/dag (Uppsala) 1 genomsekv. = 6 GB 1 patologi WSI < 4 GB livslång journal

5 + 1 GB text/dag (Uppsala) 1 genomsekv. = 6 GB 1 patologi WSI < 4 GB livslång journal 70 läkarbesök/dag 8 kirurgiska ingrepp/dag läkemedelsdoser/dag

6 + 1 GB text/dag (Uppsala) 1 genomsekv. = 6 GB 1 patologi WSI < 4 GB livslång journal 70 läkarbesök/dag 8 kirurgiska ingrepp/dag läkemedelsdoser/dag 29 kliniker på US Olika format: Text, kodade data, kvantiteter, signaler, bilder, video,...

7 + 1 GB text/dag (Uppsala) 1 genomsekv. = 6 GB 1 patologi WSI < 4 GB livslång journal 70 läkarbesök/dag 8 kirurgiska ingrepp/dag läkemedelsdoser/dag 29 kliniker på US Olika format: Text, kodade data, kvantiteter, signaler, bilder, video,... The completeness of medication histories in hospital medical records BJCP 49(6) The medication history in the hospital medical record is often incomplete, as 25% of the prescription drugs in use is not recorded and 61% of all patients has one of more drugs not registered. Assessing the Accuracy of Administrative Data in Health Information Systems Medical Care 42(11): The correct primary diagnosis was recorded for 57% of visits. Thirteen percent of errors were caused by physician diagnostic error, 8% to missing encounter forms, and 22% to incorrectly entered data. Findings varied by condition and site but not by level of training. Accuracy of secondary diagnosis data (27%) was even poorer.

8 Douglas Johnston, Cleveland Clinic

9 Google Flu Trends Använda söktrender för att detektera influensa-utbrott (BIG) Data från Google och US CDC Vad korrelerar med förkylningssäsongen? high school basketball

10 Anxiety Disorder Aortic Aneurysm Arthroplasty - Hip, Total Replacemt Bone Disease CANCER Cancer Metastasis to Bone Cardiac Impairment CHEST MASS Chronic Lung Disease Depressed Mood DEPRESSION Diarrhea Elevated Blood Pressure Hair Follicle Inflammation w Abscess in Sweat Gland Areas HEALTH MAINTENANCE HYDRADENITIS HYPERTENSION Inflammation of the Large Intestine Intestinal Parasitic Infection Kidney Problems Causing a Decreased Amount of Urine to be Passed Lightheaded Low Amount of Calcium in the Blood Low Amount of Potassium in the Blood Malignant Neoplastic Disease Migraine Headache MIGRAINES Nausea and Vomiting Nephrosis PSYCH e-patient Dave and Google Health g-your-data-and-then-you-looked.html

11 kräver

12 Vad är small data? Detaljerad data om individen/patienten Assessing the Accuracy of Administrative Data in Health Information Systems Medical Care 42(11): The correct primary diagnosis was recorded for 57% of visits. Thirteen percent of errors were caused by physician diagnostic error, 8% to missing encounter forms, and 22% to incorrectly entered data. Findings varied by condition and site but not by level of training. Accuracy of secondary diagnosis data (27%) was even poorer.

13 Vad är small data? Detaljerad data om individen/patienten Patientdata är Alltid ofullständiga Ibland felaktiga Ofta dyra att samla in

14 Vad är small data? Detaljerad data om individen/patienten Exempel: blodtryck

15 Information om blodtrycksmätning

16 Information från laboratorieundersökningar

17 Histopatologisk information

18 Standardiserad information Två journalsystem kan idag endast undantagsvis utbyta någon information Diabetic retinal microaneurysm (disorder)

19 i2b2 - Informatics for Integrating Biology and Bedside Flera stora amerikanska universitetssjukhus Anonymiserad data Standardiserade data Text

20 SMART Health IT En standardiserad plattform för att utveckla hälso- och sjukvårdsappar som kan prata med sjukvårdens system

21 Och i Sverige År 2025 ska Sverige vara bäst i världen på att använda digitaliseringens och e-hälsans möjligheter regeringen.se Invånartjänster: HälsaFörMig, Journalen

22