2011-02-24 OBS: Ändringar kan bli aktuella Schema: Bevarandebiologi 15 hp, VT 2011 Kursen arrangeras av Avdelningen för populationsgenetik, Zoologiska institutionen, Stockholms universitet Anna Palmé (AP) - kursledare Linda Laikre () - kursansvarig Mija Jansson (MJ) Lovisa Wennerström (LW) Peter Guban (PG) Anastasia Eklund (AE) Bengt Karlsson (BK) Bodil Elmhagen (BE) Sven Jakobsson (SJ) Peter Hambäck (PH) rum F518, tel 16 42 79, anna.palme@popgen.su.se rum F520, tel 16 42 83, linda.laikre@popgen.su.se rum F511a, tel 16 42 37, mija.jansson@zoologi.su.se rum F511b, tel 16 14 10, lovisa.wennerstrom@zoologi.su.se rum F509, peter.g.99@gmail.com) rum F509, saphierwolf@hotmail.com bengt.karlsson@zoologi.su.se bodil.elmhagen@zoologi.su.se sven.jakobsson@zoologi.su.se peter.hamback@botan.su.se Gästföreläsare: Ann Dahlerus, Svenska Rovdjursföreningen Thord Fransson, Naturhistoriska riksmuseet Mats Amundin, Kolmårdens djurpark Anders Lekander, Lantrasforum Helena Olsson, Djurparkschef, Parken Zoo, Eskilstuna Jennie Westander, Forskningschef, Parken Zoo, Eskilstuna Studiebesök: Parken Zoo, Eskilstuna Fiskeriverkets Sötvattenslaboratorium, Drottningholm Lokaler: Föreläsningar D508 Datorlaborationer D334 Hemsida: Självstudier: Litteratur: www.popgen.su.se/bevbio Kursen förutsätter självstudier på icke-schemalagd tid Primack, R.B. 2008. A primer of conservation biology. Sinauer Associates, Inc. Publishers Frankham, R., Ballou, J.D., Briscoe, D.A.2004. A primer of conservation genetics. Cambridge University Press. Båda böckerna går att köpa på Akademibokhandeln, Frescati. Litteraturhänvisningar: Obs - hänvisningarna är ungefärliga. Föreläsningarnas kronologi följer inte nödvändigtvis böckernas. Böckerna är ett viktigt komplement till föreläsningarna. Böckerna ger fördjupning och bredd inom vissa områden som vi inte kommer att hinna behandla så utförligt på kursen.
3. Vecka 12 3/21/2011 Måndag 9 00-9 30 Introduktion av kursen AP 9 30-12 00 Föreläsning: Introduktion till bevarandebiologi och bevarandegenetik 13 00-15 00 Datorlab 1: Deterministiska processer som styr populationers genetiska sammansättning Litteratur: Primack kap. 1: 1-15, 34-54, 2, Frankham et al. kap 1 LW/AE 3/22/2011 Tisdag 9 30-10 30 Föreläsning: Genomgång Datorlab 1. AP 11 00-12 00 Föreläsning: Bevarandebiologi, bevarandegenetik, forts 13 00-15 00 Datorlab 2: Stokastiska processers betydelse LW/PG Litteratur: Frankham et al. kap. 2, 1-21, kap 3 3/23/2011 Onsdag Inläsning, Räkneövningar Litteratur: Frankham et al. kap. 2, 1-21, kap 3 3/24/2011 Torsdag 9 30-12 00 Föreläsning: Populations- och bevarandegenetik, forts. 11 00-12 00 Föreläsning: Genomgång av datorlab 2 AP 13 00-14 00 Genomgång: Problemlösning 1 LW Litteratur: Frankham et al. kap 4 sid 52-59, 63-75 3/25/2011 Fredag 9 30-12 00 Föreläsning: Populationsstruktur, små populationers genetik, pedigree-analys 13 00-14 00 Föreläsning: Molekylära metoder AP 14 00-15 30 Datorlab 3: Populationssystem. LW/PG Litteratur: Frankham et al. kap 4 sid 63-75, kap 6 Vecka 13 3/28/2011 Måndag 9 30-10 15 Föreläsning: Genomgång Datorlab 3 AP 10 30-12 00 Genomgång: Problemlösning 2 LW em Räkneövningar - självständigt arbete Litteratur: Frankham et al. kap 4 sid 59-65, kap 5 3/29/2011 Tisdag 9 30-12 00 Föreläsning: Effektiv populationsstorlek. Avel av hotade djur. 13 00-16 00 Datorlab 4: Pedigree-analys MJ/LW Litteratur: Frankham et al. kap 5, 8
4. 3/30/2011 Onsdag Eget arbete, inläsning, BIG-information 3/31/2011 Torsdag 9 30-10 20 Föreläsning: Genomgång av datorlab 4 LW 11 00-12 00 Föreläsning: Pedigree-analys för bevarande av hotade lantraser 13 00-15 30 Gästföreläsning: Bevarande av hotade husdjursraser LW/MJ Anders Lekander Litteratur: Frankham et al. kap 5, 8 4/1/2011 Fredag 9 00-10 30 Grupp 3: Laboration: start av proteinelektrofores 10 15-11 45 Grupp 3: Datorlaboration 5: analys av populationsgenetiska data 12 30-14 00 Föreläsning: F-statistik, statistisk analys av AP molekylärgenetisk data, tolkning av labresultat AP (delvis tillgänglig) 14 15-16 15 Grupp 3: Laboration: proteinelektrofores, forts. Litteratur: Labhandledning Vecka 14 4/4/2011 Måndag 8 30-10 00 Grupp 1: Laboration: start av proteinelektrofores 10 15-11 45 Grupp 2: Laboration: start av proteinelektrofores 10 15-11 45 Grupp 1: Datorlaboration 5: analys av populationsgenetiska data 14 15-16 15 Grupp 1: Laboration: proteinelektrofores, forts. 14 15-15 45 Grupp 2: Datorlaboration 5: analys av populationsgenetiska data 16 15-18 15 Grupp 2: Laboration: proteinelektrofores, forts. Litteratur: Labhandledning PG MJ (delvis tillgänglig) AP (delvis tillgänglig) 4/5/2011 Tisdag Egen analys av labresultat. Skriftlig redovisning lämnas/mailas till AP senast onsdag 6 april kl. 14.00. 4/6/2011 Onsdag Eget arbete Litteratur: Frankham et al. kap 1: 22-28, kap 9
5. 4/7/2011 Torsdag 9 30-12 00 Föreläsning: Demografi för sårbarhetsanalys AP 13 00-13 30 Presentation av projektarbeten AP 13 30-15 00 Genomgång: Problemlösning 3 AP Litteratur: Frankham et al. kap 5, sid 93-99 4/8/2011 Fredag 9 30-12 00 Övningsuppgift: Demografi 13 00-15 30 Föreläsning: Sårbarhetsanalys med Vortex AP/PG 15 45-17 00 Datorlab 6: Sårbarhetsanalys med Vortex AP/PG/AE Litteratur: Frankham et al. kap 5, sid 93-99 Vecka 15 4/11/2011 Måndag 9 30-12 00 Datorlab 6, forts.: Sårbarhetsanalys med Vortex AP/PG/AE 13 00-14 30 Genomgång: Problemlösning 4 AP 4/12/2011 Tisdag 9 30-11 00 Datorlab 6, forts.: Sårbarhetsanalys med Vortex AP/PG/AE 11 00-12 00 Datorlab 6: Redovisning AP/PG 13 00-14 30 Datorlab 6: Redovisning AP/AE 14 45-15 30 PHVA case study: CBSG Papua New Guinea workshop video AP Litteratur: Frankham et al. kap 5, sid 93-99 4/13/2011 Onsdag INLÄSNING 4/14/2011 Torsdag INLÄSNING 4/15/2011 Fredag 9 00-12 00 Skrivning Bevarandegenetik och bevarandebiologi KT/MJ mfl Vecka 16 PÅSKLOV Vecka 17 4/26/2011 Tisdag 9 00-12 00 Föreläsning: Introduktion till bevarandeekologi em Inläsning/projektarbete Litteratur: Fallstudier + Primack kap 1 16-33, 54-49, kap 2, 4-5 BK
6. 4/27/2011 Onsdag 9 00-12 00 Inläsning: Två bevarandebiologiska fallstudier em Diskussion om de två inlästa bevarandebiologiska fallstudierna 4/28/2011 Torsdag 9 00-10 30 Föreläsning: Bevarande av ängs- och hagmarker Litteratur: Primack kap 1 54-49, kap 4-5 BK AP 4/29/2011 Fredag 9 30-12 00 Föreläsning:Bevarandeekologi hos insekter BK 13 00-16 00 Diskussion: Etik och bevarande BK Litteratur: Primack kap 4-5 Vecka 18 5/2/2011 Måndag 8 00-17 30 Studiebesök: Parken Zoo, Eskilstuna: praktiskt bevarandearbete i djurparksvärlden Helena Olsson, Jennie Westander 5/3/2011 Tisdag 9 30-12 00 Föreläsning: Bevarandeekologi hos däggdjur BE em Inläsning Litteratur: Primack kap 4-5 5/4/2011 Onsdag 10 00-16 00 Studiebesök: Fiskeriverkets Sötvattenslaboratorium 5/5/2011 Torsdag 9 30-12 00 Föreläsning: Bevarandeekologi hos växter PH 13 00-16 00 Grupparbete om utdelade artiklar Litteratur: Primack kap 4-5 5/6/2011 Fredag 9 30-12 00 Grupparbete om utdelade artiklar 13 00-16 00 Föreläsning Bevarandeekologi hos fiskar SJ Litteratur: Primack kap 1 54-49, kap 4-5 Vecka 19 5/9/2011 Måndag 9 30-12 00 Redovisning av grupparbete BK em Inläsning/projektarbete 5/10/2011 Tisdag Eget arbete, inläsning, BIG-information 5/11/2011 Onsdag Vargtema 10 00-10 50 Föreläsning: Den svenska vargstammens 11 10-12 00 Föreläsning: Djurparkernas roll Mats Amundin 13 00-14 00 Föreläsning: Rovdjurens roll i ekosystemet SJ 14 15-15 30 Föreläsning: Bevarande av varg i Sverige Ann Dahlerus
7. 5/12/2011 Torsdag 9 30-16 00 Inläsning/Projektarbete 5/13/2011 Fredag 9 30-12 00 Litteraturseminarium BE em Föreläsning: Bevarandeekologi hos fåglar Thord Fransson Vecka 20 5/16/2011 Måndag Exkursion till Riddersholm BK 5/17/2011 Tisdag INLÄSNING 5/18/2011 Onsdag INLÄSNING 5/19/2011 Torsdag 9 00-14 00 Skrivning Bevarandeekologi och bevarandebiologi 5/20/2011 Fredag Projektarbete Vecka 21 5/23/2011 Måndag Projektarbete 5/24/2011 Tisdag Projektarbete 5/25/2011 Onsdag Projektarbete 5/26/2011 Torsdag 14 00 - Inlämning av projektarbete 5/27/2011 Fredag Förberedelse opposition/redovisning Vecka 22 5/30/2011 Måndag 8 30-16 00 Redovisning BK/AP mfl. 5/31/2011 Tisdag 8 30-16 00 Redovisning BK/AP mfl.