Att samarbeta kring data för forskning Ulla Mörtberg Environmental Management and Assessment research group, KTH LifeWatch
Att samarbeta kring data för forskning Tillgång på data LifeWatch
soft tools Social process (Environmental) Systems Analysis methods and tools Strategic Environmental Assessment Environmental Impact Assessment Green Procurement Process Tools Prediction Tools Data hard tools Models Physical, chemical, meteorological Surface water, ground water Ecological Experiments Standards Environmental Management and Assessment research group, KTH
TILLGÅNG PÅ DATA?
Århuskonventionen Konventionen om: tillgång till miljöinformation, allmänhetens deltagande i beslutsprocesser, och rätt till rättslig prövning i miljöfrågor, Prop. 2004/05:65 i Sverige lagstiftning som ska garantera allmänhetens tillgång till miljöinformation
Trender för tillgången på miljödata Minskar Ökar
Development of global land-to-sea runoff data accessibility (377 most near-coastal monitoring stations in WMO s Global Terrestrial Network for River Discharge [GTN-R, 2005]) Green monitored/reported catchment area White unmonitored/unreported catchment area Hannerz, PhD thesis, 2008
Success story on data sharing ARCTIC DATA
Arctic data An improved bathymetric portrayal of the Arctic Ocean: Implications for ocean modeling and geological, geophysical and oceanographic analyses (Jakobsson et al. 2008)
Arctic data for download
Att dela data ger mer DISKUSSIONER OM METODER
Exempelvis hur ska man applicera modeller på förekomstdata? European Breeding Bird Atlas Climatic envelope models Proceedings of the National Academy of Sciences
Det pågår även andra LÄRPROCESSER
Lärprocesser modeller och prognoser baserade på olika typer av data Hans Rosling
Lärprocesser modeller och prognoser baserade på olika typer av data För vissa typer av data kräver även allmänheten tillgång på rådata många gör egna system och modeller Hans Rosling
Exempel på SAMARBETE KRING DATA FÖR FORSKNING
GBIF Global Biodiversity Information Facility
Lifemapper bygger på GBIF-data
Infrastruktur för forskning LIFEWATCH
Lifewatch Stora mängder biodiversitetsdata samlas fortlöpande in av forskare, miljöövervakare, inventerare och av skickliga enskilda personer med eget intresse Idag är all denna information spridd i ett stort antal skilda databaser
LifeWatch Europa Ett europeiskt initiativ för att Skapa ett nätverk av dataflöden och databaser med information om biologisk mångfald Göra data direkt tillgänglig för användare Med verktyg för analys, modellering och presentation som fritt kan nyttjas av forskare och andra aktörer Stärka biodiversitetsforskning
LifeWatch Europa Drivits inom EU:s 7:e ramprogram för forskning, under åren 2008-2010 i en planeringsfas, På gång - starta (förhoppningsvis) en omfattande konstruktionsfas under åren 2011-2013 och att därefter gå in i en driftsfas.
Svenska Lifewatch I första steget SLU, Umeå universitet, Göteborgs universitet, Lunds universitet, Naturhistoriska riksmuseet/gbif, SMHI och Fiskeriverket Vetenskapsrådet Ledning, samordning och huvudsakligt genomförare ArtDatabanken, SLU Självständigt gentemot Lifewatch Europa
Svenska Lifewatch Mål: Stärka forskning inom analyser och modellering av biologisk mångfald nationellt Bidra till att svensk forskning inom området ska kunna vara världsledande Knyta samman ett allt mer omfattande nätverk av dataleverantörer och användare i Sverige
Svenska Lifewatch Utbyggnadsfas 2011-2013: Uppbyggnad av nätverk av aktörer med ansvar för data, enas om standard inklusive taxonomi, dataformat, metadata, behörighet, mm Nätverk av databaser och webbtjänster parterna (data providers) gör sina data digitalt tillgängliga i ett gemensamt nätverk med gemensam webbingång, andra kan ladda in data Webbgränssnitt och analysverktyg Artportalen 2.0 (snart )
Svenska Lifewatch Webbgränssnitt riktat till forskare, kopplat till den nya generationen av Artportalen, som möjliggör för enskilda forskare att definiera egna variabler, mm Åtkomst till andras data, kartunderlag, omvärldsfaktorer och analysverktyg Möjlighet att själv bestämma när egna data ska bli tillgängliga för andra Attraktivt att skapa sin egen databas i Artportalen (istället för på lokal dator) Data blir långsiktigt säkerställda och återanvändbara
Svenska Lifewatch Gemensam analysplattform Data görs öppet tillgänglig genom att webbtjänster kopplas till primärdatabaserna Analysverktyg för rumsliga och tidsmässiga analyser samt prediktionsmodeller Kan ladda upp egna data och kartor Omvärldsfaktorer som klimatdata från SMHI Metadata, instruktioner, användarstöd
resurser
Webbtjänster, standarder, autentisering e-infrastruktur resurser
Analyser, modeller (applikationer) Webbtjänster, standarder, autentisering hopfogning e-infrastruktur resurser
e-laboratorium Forskarens analyser & presentationer e-service Datauttag & presentationer (fördef. sekvens.) Analyser, modeller (applikationer) Webbtjänster, standarder, autentisering hopfogning e-infrastruktur resurser
LifeWatch e-laboratorium Forskarens analyser & presentationer e-service Datauttag & presentationer (fördef. sekvens.) Analyser, modeller (applikationer) Webbtjänster, standarder, autentisering hopfogning e-infrastruktur resurser
Svenska Lifewatch Exempel på e-service Bioklimatiska modeller för arters utbredning nu och med ett förändrat klimat Arters populationsutveckling över tiden Artrikedom i olika områden, t.ex. av arter knutna till viss biotop eller påverkade av specifik faktor Risk för algblomning i sjöar eller hav
Svensk struktur vision SEIS GBIF LifeWatch Europa GEOSS ETC-BDC Artfakta Klimat, mark, kem-fys, ekologi Svenska LifeWatch Analysportal Presentations- & analysverktyg, arbetsflöden Standarder, inkl. taxonomi (INSPIRE, TDWG) GIS topografi, satellit, tematiskt Web-service Forsknings- DB Web-service Statliga DB Web-service Musei- DB Web-service Artportalen Web-service Andra DB Ekologisk forskning, LTER & FOMA Statlig övervakning Taxonomisk forskning Frivilliga observatörer Konsultfirmor Andra
27 miljoner observationer av 22 300 arter 17 000 nya observationer rapporteras/dag 250 000 bilder på 7 550 arter
Artportalen 2.0 En och samma portal för alla grupper Koll före rapportering Görs tillsammans med Norge Första version juni 2011
Artportalen 2.0 Fritt tillägg av nya parametrar intressant för forskare och forskarstuderande Möjlighet att styra visning Valideringsverktyg
Webbtjänster Programvara för kommunikation mellan datorer Kan transformera data till standard Olika typer: SOAP, Tapir och OGC
Karttjänster WMS och WFS för kartor och GIS-lager
REST-tjänster hämtar tillämpningar från andra hemsidor genom url:s, t.ex. Kartor (Google, Länskartor)
Klient för R-statistik
Verktyg för att ladda upp egna artlistor Verktyg för att ladda upp egna kartor och polygoner Carychium minimum Carychium tridentatum Acroloxus lacustris Galba truncatula Buccinum truncatulum Lymnaea stagnalis Pseudosuccinea Pseudosuccinea columella Radix auricularia Radix balthica Radix ovata Radix labiata Radix peregra Lymnaea peregra Stagnicola corvus Stagnicola fuscus Stagnicola palustris Myxas glutinosa Omphiscola Omphiscola glabra Physa fontinalis Physella acuta Physella heterostropha Aplexa hypnorum Planorbidae Gyraulus crista Gyraulus laevis Gyraulus riparius Gyraulus acronicus Gyraulus albus Gyraulus parvus Anisus spirorbis Anisus leucostoma Anisus vorticulus Anisus leucostoma Anisus septemgyratus Anisus vortex Bathyomphalus contortus Helisoma duryi Hippeutis complanatus
Verktyg för att beräkna förekomstarea och utbredningsområde Verktyg för att ställa frågor inom polygoner
Verktyg för spatial statistik, t.ex. antal i olika områden
Verktyg för beräkning av långsiktiga trender Foto: Daniel Flordal
Åtkomst till Artfaktadatabas Parameteriserade ekologiska artattribut (>2000 faktorer) T.ex. biotop- och substratpreferenser, livshistorieegenskaper, rödlistestatus, påverkansfaktorer, länsförekomster, artfaktablad
Artförekomst i förhållande till områden med specifika biotoper Ädellöv Tall Gran
Biodiversitetsportalen En samlad portal varifrån allt nås Alla tillämpningar Metadata Manualer & instruktioner Allmän information om projektet
Svenska Lifewatch ska erbjuda En kraftfull e-infrastruktur för biodiversitetsforskning Standarder & dataformat Administration av användare Metadata, tekniska kringdata Öppen tillgång till databaser, modeller och resultat Systematik och taxonomi Observationsdata hantering Observationsdata analys och bearbetning Artfakta och klimatdata m.fl. omvärldsvariabler Lätt tillgängliga resurser Användarstöd Kommunikation & utbildning