Stockholms universitet OBS! Version: 27juli2015 Inst. för biologisk grundutbildning PRELIMINÄRT!! Schemaändringar kan förekomma. www.big.su.se Schema för BL3008 Cell- och molekylärbiologi 27 hp, HT 2015 KURSSTART: Måndag 31 augusti, kl. 09.15 i sal FB107 Namn Kod Rum Tel. epost Kursansvarig: Neus Visa NV F326 08-16 4111 neus.visa@su.se Lärare: Lärarförteckning med kontaktuppgifter meddelas senare (via Mondo). Lokaler: Föreläsningar: FB107 (Svante Arrhenius väg 21A) / Q211 Laborationer: E214, E224, D320 Grupparbete Grupprum, lokaler meddelas senare Räkneövningar Grupprum, lokaler meddelas senare Datasal D406 Litteratur: Carlson & Linder. Introduktion till mikrobiologi. 2:a uppl. Studentlitteratur 2012. Cooper & Hausman. The Cell: A Molecular Approach. 6:e uppl. Co-published by ASM Press and Sinauer Associates 2013. Escher & Saura. Genetik. 1:a uppl. Liber. 2009. Kursmoment: 1. Teori CMB-I, 9 hp (Theory CMB-I, 9 ECTS) 2. Teori CMB-II, 11 hp (Theory CMB-II, 11 ECTS) 3. Metoder, 7 hp (Methods, 7 ECTS) Kursens innehåll Efter en inledande beskrivning av cellen som fundamental bärare av livsprocessen, studeras: * Bakterie- och arkécellers uppbyggnad, metabolism, näringskrav och tillväxt. * Virusuppbyggnad och livscykler. * Antibiotika och antibiotikaresistensmekanismer samt deras uppkomst och spridning. * Genomets organisation, bevarande och evolution, inklusive DNA-replikation, uppkomst av mutationer samt DNA-reparation. * Bakteriegenetik. Transformation, transduktion, konjugation och kartläggning av bakteriegenom. * Det genetiska informationsflödet. Geners organisation, expression och reglering hos bakterier, arkéer, eukaryoter och virus. Syntes, mognad och sortering av proteiner. * Den eukaryota cellens funktionella organisation. Cellkärnan, organeller, fiberverk, biomotorsystem, plasmamembran, membrantransport och endocytos, celladhesion, extracellulär matrix, cellvägg och cell- cellkontakter. * Cellers tillväxtkontroll. Cellsignalering, signaltransduktion, cellcykeln, celldifferentiering, onkogener och cancer. * Cytogenetik. Mitos, meios och gametbildning. * Transmissionsgenetik: kvalitativa och kvantitativa karaktärer, koppling och gensamverkan, 1
pedigreeanalys, könsbundet arv. * Populationsgenetik. Genetisk variation och mikroevolutionära processer. * Human och klinisk genetik, inklusive immungenetik. * Cellen i ett evolutionsperspektiv. * Grundläggande metoder och experimentella verktyg inom mikrobiologi, genetik och molekylär cellbiologi, inklusive sterilteknik, transformation, cellfärgningsmetoder, cellodling, mikroskopi (ljusfälts-, faskontrast-, och fluorescensmikroskopi), detektion av proteiner och nukleinsyror i celler och extrakt, rekombinant DNA- teknologi, PCR och genetisk analys. Examination: Kursen examineras på följande vis: Kunskapskontroll av moment 1 och 2 sker genom skriftliga prov och moment 3 sker genom skriftliga redovisningar och deltagande i obligatoriska gruppdiskussioner. Kursens betygskriterier delas ut vid kursstart. För godkänt krävs lägst betygsgraden E, godkänt betyg på moment 3, godkända laborationer och muntliga redovisningar, samt deltagande i all obligatorisk undervisning. Tentamen: CMB-I 16 okt, 9:00-13:00, Ugglevikssalen CMB-II 18 dec, 9:00-13:00, Värtasalen Omtentamen: CMB-I 20 nov, 09:00-13:00, lokal meddelas senare CMB-II Meddelas senare Mondo: Närvarokrav: Relevant kursinformation kommer att finnas på Mondo. Kursen innehåller fyra metodikblock med laborativa moment (MB1-MB4). Alla laborationer har obligatorisk närvaroplikt. Det är mycket viktigt att du pratar med kursassistenterna, om du behöver vara borta. Observera att närvarokravet även gäller laborationsgenomgångar, gruppdiskussioner och uppföljningsdiskussionen ( 10/12 kl 13-15). Trots att föreläsningarna inte är obligatoriska vill vi starkt rekommendera Dig att delta också på dessa. De är avsedda att underlätta inläsningen av lärobokerna och inhämtandet av övriga kursmoment. CMB-I (9 hp) Dag Tid Lokal Grupp Aktivitet / Lärare Mån v.36 31/8 9:15-12:00 FB107 Alla* Upprop, gruppindelning och introduktion till kursen / N. Visa 14:00-17:00 FB107 Alla F: Cellen i översikt / R. Karlsson 1/9 Alla Självstudier: läsning Cooper & Hausman (s.3-16) Självstudier: läsning Cooper & Hausman (s.43-58) Självstudier: läsning Escher&Saura (s. 22-31) 2/9 9:00-12:00 FB107 Alla F: Genetiken och den centrala dogmen / N. Visa 13:00-14:00 FB107 Alla Studieteknik / N. Visa och L. Wieslander 14:00- FB107 Alla Självstudier: läsning Cooper&Hausman (s.103-117) 3/9 9:00-12:00 FB107 Alla F: Mikrobiologi. Bakteriens uppbyggnad / A.-B. Jonsson 13:00-14:00 FB107 Alla Diagnostisk test 2
4/9 Alla Självstudier Mån v.37 7/9 9:00-12:00 FB107 Alla F: Bakteriens näringsliv och tillväxt / A.Ch. Lindås 13:00-17:00 lab Alla* MB1: Laboration I 8/9 9:00-12:00 FB107 Alla F: Systematik av mikroorganismer- I / A.Ch. Lindås 13:00-17:00 lab Alla* MB1: Laboration II 9/9 9:30-9:50 Alla* MB1: Laboration III 10:00-12:00 Alla Självstudier 13:00-17:00 lab Alla* MB1: Laboration III forts. 10/9 9:00-12:00 FB107 Alla F: Systematik av mikroorganismer- II / A.Ch. Lindås 11/9 Alla Självstudier Mån v.38 14/9 9:00-12:00 FB107 Alla F: Antibiotika och antibiotikaresistens / K. Udekwu 13:00-17:00 lab Alla* MB1: Laboration IV 15/9 9:00-17:00 lab Alla* MB1: Laboration V 16/9 9:00-12:00 FB107 Alla F: Bakterier i människans tjänst / A.Ch. Lindås 13:00-17:00 FB107 Alla* MB1: Laboration VI 17/9 10:00-10:30 FB107 Alla* Skrivuppgift: Introduktion / N. Visa 10:30-12:00 FB107 Alla* F: Guide för vetenskapligt skrivande / C. Andréasson 13:00-16:00 FB107 Alla Frågestund v. 36-38 18/9 9:00-12:00 FB107 Alla F: Gener och genomorganisation- I / L. Wieslander 17:00 Alla* Inlämning av laborationsrapport MB1 Mån v. 39 21/9 9:00-12:00 FB107 Alla F: Gener och genomorganisation- II / L. Wieslander 13:00- Alla Självstudier läsning Cooper & Hausman (s.118-134) Självstudier läsning Escher & Saura (s.341-358) 22/9 10:00-12:00 FB107 Alla* Grupparbete Genteknik: Introduktionsföreläsning I / N. Visa 13:00-13:30 FB107 Alla* MB2: Introduktion 13:30-16:30 D406 AB* MB2: Dag 1 Bioinformatik 13:30-16:30 CDEF Grupparbete Genteknik: Självstudier 23/9 9:00-12:00 FB107 Alla F: DNA replikation och genetik i prokaryota celler / K. Udekwu 12:00-17:00 BÄR Information/aktiviteter 24/9 9:00-12:00 FB107 Alla F. Virus. Generella egenskaper. Bakteriofager / A. Nilsson 13:00-16:00 D406 CD* MB2: Dag 1 Bioinformatik 13:00-16:00 AB Grupparbete Genteknik: Självstudier 25/9 9:00-12:00 D406 EF* MB2: Dag 1 Bioinformatik 9:00-12:00 grupprum ABC* Grupparbete Genteknik: Diskussion I 3
Mån v. 40 28/9 9:00-12:00 FB107 Alla F: DNA replikation och reparation i eukaryota celler/ S.Åström 13:00-16:00 grupprum DEF* Grupparbete Genteknik: Diskussion I 29/9 10:00-12:00 FB107 Alla* Grupparbete Genteknik: Introduktionsföreläsning II / N. Visa 13:00-16:00 Alla Grupparbete Genteknik: Självstudier 30/9 9:00-12:00 FB107 Alla F: Mutationer / S. Åström 13:00-17:00 grupprum ABC* Grupparbete Genteknik: Diskussion II 1/10 9:00-12:00 FB107 Alla F: Transkription / A. Östlund Farrants 13:00-17:00 grupprum DEF* Grupparbete Genteknik: Diskussion II 2/10 9:00-12:00 FB107 Alla F: Transkriptionsreglering / A. Östlund Farrants Mån v. 41 5/10 9:00-12:00 FB107 Alla F: RNA processing / L. Wieslander 13:00-17:00 lab A-F* MB2: Laboration Dag 2 6/10 9:00-12:00 FB107 Alla F: Proteinsyntes / N. Visa 13:00-17:00 lab A-F* MB2: Laboration Dag 3 7/10 9:00-12:00 FB107 Alla F: Reglering av proteinsyntes / N. Visa 13:00-15:00 lab A-F* MB2: Laboration Dag 4 8/10 9:00-12:00 Alla Självstudier 13:00-16:00 FB107 Frågestund v. 39-41 9/10 9:00-17:00 Alla Självstudier 17:00 A-F* Inlämning av laborationsrapport MB2 * Obligatorisk närvaro Skriftlig tenta CMB-I dag 16/10 kl. 9:00-13:00 Ugglevikssalen (Södra huset, mellan E och F, ingång i E- huset på plan 5) 4
CMB-II (11 hp) Dag Tid Lokal Grupp Aktivitet / Lärare Mån v. 43 19/10 9:00-12:00 FB107 Alla F: Membran / P. Ljungdahl 20/10 9:00-12:00 FB107 Alla F: Sekretoriska vägar / P. Ljungdahl 21/10 9:00-12:00 FB107 Alla F: Cellkärnans funktionella organisation / L. Wieslander 22/10 9:00-12:00 FB107 Alla F: Organellstruktur och funktion - I / E. Pesquet 23/10 Alla Självstudier Mån v. 44 26/10 9:00-12:00 FB107 Alla F: Organellstruktur och funktion - II / E. Pesquet 27/10 9:00-12:00 FB107 Alla F: Plasmamembran och cellvägg / P. Ljungdahl o E. Pesquet 13:00-15:00 FB107 A-F* MB3: Introduktion 13:15-17:00 A-F* MB3: Dag 1 28/10 9:00-12:00 FB107 Alla F: Cellmotilitet - I / R. Karlsson 13:00-17:00 A-F* MB3: Dag 2 29/10 9:00-12:00 FB107 Alla F: Cellmotilitet - II / R. Karlsson 13:00-17:00 A-B* MB3: Dag 3 (OBS! Separat schema för varje grupp!!) 30/10 Självstudier Mån v. 45 2/11 9:00-12:00 FB107 Alla F: Extracellulär matris / R. Karlsson 13:00-17:00 C-D* MB3: Dag 3 (OBS! Separat schema för varje grupp!!) 3/11 9:00-12:00 FB107 Alla Självstudier 4/11 9:00-12:00 FB107 Alla F: Cellsignalering - I / C. Andréasson 13:00-17:00 E-F* MB3: Dag 3 (OBS! Separat schema för varje grupp!!) 5/11 9:00-12:00 FB107 Alla F: Cellsignalering - II / P. Ljungdahl o E. Pesquet 6/11 Självstudier Mån v. 46 9/11 9:00-12:00 FB107 Alla F: Cellcykeln / A.K. Östlund Farrants 10/11 9:00-12:00 FB107 Alla F: Cytogenetik: mitos och meios / C. Andréasson 11/11 9:00-12:00 FB107 Alla F: Mendelsk genetik / N. Visa 13:00-14:15 MB3: Dag 3 (Reservtid) 14:30-15:30 A-F* MB3: Dag 4 12/11 9:00-12:00 FB107 Alla F: Genkartering / N. Visa 13/11 Alla Självstudier Mån v. 47 16/11 9:00-12:00 FB107 Alla Självstudier 17/11 9:00-12:00 FB107 Alla F: Könsbestämning, dosskompensation, imprinting / N. Visa 13:00-16:00 FB107 Alla Frågestund v. 43-45 18/11 10:00-12:00 FB107 A-F* MB4: Introduktionsföreläsning 5
19/11 9:00-17:00 Alla Självstudier 17:00 A-F* MB4: Inlämning av pre-lab frågeformulär 20/11 9:00-13:00 Omtenta CMB-I 14:00-17:00 A-F* MB4: Dag 1 Mån v. 48 23/11 9:00-12:00 Alla F: Genetisk variation och populationsgenetik / A. Nilsson 13:00-17:00 A-F* MB4: Dag 2 24/11 10:00-12:00 FB107 Alla F: Kvantitativgenetik / A. Nilsson 13:00-17:00 A-F G: Genetik: Räkneövningar- I 25/11 9:00-12:00 FB107 Alla F: Human genetik och genetiska sjukdomar / U. Theopold 13:00-17:00 A-F G: Genetik: Räkneövningar- II 26/11 9:00-17:00 Alla Självstudier 27/11 10:00-12:00 FB107 Alla Frågestund v. 46-47 13:00-16:00 A-F* MB4: Dag 3 Mån v. 49 30/11 9:00-12:00 FB107 Alla F: Celldifferentiering / M. Mannervik R 13:00-17:00 A-F G: Genetik: Räkneövningar- III 17:00 Alla Vetenskapligt skrivande: Inlämning av egen essä 1/12 10:00-12:00 FB107 Alla F: Nervcellens differentiering och funktion / M. Öhman 13:00-15:00 A-F* MB4: Dag 4 2/12 10:00-12:00 FB107 Alla F: Eukaryota virus / A. Nilsson 12:00-14:00 Alla ARBETSMARKNADSDAGEN I Aula Magna 14:00-17:00 A-F* MB4: Dag 5 3/12 10:00-12:00 FB107 Alla Självstudier 13:00-16:00 A-F* MB4: Dag 6 4/12 9:00-12:00 A-F* MB4: Dag 7 Mån v. 50 7/12 9:00-12:00 Alla F: Infektionsbiologi / A. Barragan 13:00-17:00 A-F* MB4: Dag 8 8/12 9:00-12:00 Alla F: Cancer / U. Theopold 13:00-17:00 A-F* MB4: Dag 9 9/12 10:00-12:00 FB107 Alla Självstudier 10/12 10:00-12:00 Alla Frågestund v. 48-50 13:00-15:00 A-F* METODER: Uppföljningsdiskussion 15:15-16:00 FB107 A-F* Muntlig kursutvärdering 11/12 9:00-17:00 Alla Självstudier 17:00 A-F* MB4: Inlämning av laborationsrapport 17:00 Alla Vetenskapligt skrivande: Inlämning av utvärdering * Obligatorisk närvaro Skriftlig tenta CMB-II dag 18/12 kl. 9:00-13:00 Värtasalen (ovanför Universitetesblibliotek på plan 6, bredvid Södra huset) 6