Institutionen för Ekologi, miljö och geovetenskap, Umeå universitet 2/9/13 Ht 2013 23 September 2013-17 January 2014 1 Genetik and Evolution 22.5 hp Lecturers: Department of Ecology and Environmental Sciences Barbara Giles (BEG), Course coordinator, tel 090-786-55 21 e-mail: barbara.giles@emg.umu.se Pär Ingvarsson (PKI) par.ingvarsson@emg.umu.se Folmer Bokma (FB) folmer.bokma@emg.umu.se Ulla Carlsson-Granér (UCG) ulla.carlson-graner@emg.umu.se Xiao-Ru Wang (XRW) Xiao-ru.wang@emg.umu.se Anders Nilsson (AN) anders.nilsson@emg.umu.se Assistenter Elisabet Åkerlund (EÅ), Hélène Prouillet-Leplat (HPL), Lovisa Lind (LL), Joanna Paczkowska (JP), Per Hedström (PH), Wojciech Uszko (WU), Erik Myrstener (EM) Viktoria Tengel (VT) Literature: Biology, 9th Edition, Campbell and Reece, (parts of Unit 2, Unit 3 and Unit 4) Lokal: Föreläsningar, lab, grupprum: Kolla varje dag Tider: See specified times; ca 8.30-11.30 & ca 12.30-15:30. OBL: Obligatoriska moment DATE ACTIVITY LECTURER Week 39: Läs kap 6, 16, 17, 12, 13 Mån 23.9 am 8:30-9:00 - Kursinformation, registrering KB5C2 BEG 9:30 - Livets uppkomst - varför genetik & evolution förberedelse MitosLab (Chap 25) Tis 24.9 am 8:30 - Cellens byggnad och den genetiska materialets KB5C2 BEG struktur (s. 140-161; 351-370 - VIKTIG ) Ons 25.9 am 8:30 - DNA:ts transkription, translation och KB5C2 BEG kromosomers uppbyggnad - mutationer (läs s. 371-396) pm Insläsning - s. 274-291, 294-309 Tors 26.9 am 8:30 - Cellcykler - mitos (läs s. 274-291) KB5C2 BEG 12:30 - OBL Gruppdiskussion-överföring av genetisk information, pm utlämning av skriftlig uppgift; förberedelse MitosLab NC240,250,280,290 EÅ + HPL Fre 27.9 am 08:30 Säkerhetsgenomgång; Lab - mitos (Gr 1) OBL NC 420 EÅ + VT 8:30 - Insamlings expedition (Gr 2) OBL UCG 12:30 Säkerhetsgenomgång; Lab - mitos (Gr 2) OBL NC 420 EÅ + VT pm 12:30 - Insamlings expedition (Gr 1) OBL UCG Week 40: Läs Kap 12, 13,14, 15 Mån 30.9 am 8:30 - Livscykler - meios (läs s. 294-309) KB3B3 BEG pm 12:30 - Mendel-en gen, två gener, genetiska lagarna (s. 308-331) KB5C2 BEG
Tis 1.10 am 8:30 - Mendels genetik - sannolikhet och statistik (s. 308-331) N300 BEG 2 pm 12:30 - Räkneövning 1 OBL NC230,240,280,290 EÅ + VT Ons 2.10 am 8:30 - Diskussion, fråga stund, feedback på uppgift OBL N210 EÅ + HPL - s. 332-350 Tors 3.10 am 8:30 - Utvidgning av Mendelsk genetik, könsbestämning NA332 BEG (s. 332-350) pm 12:30 - Räkneövning 2 OBL NC353-356 NC358-359 EÅ + HPL Fre 4.10 am 8:30 - Rekombination, koppling och kartering (s. 332-350) MA156 BEG pm 12:30 Lab - Bananfluga Lab 1 OBL NC430 EÅ + HPL Week 41: Läs Kap 15 + TentaInläsning Mån 7.10 am 08:30 Lab - Bananfluga Lab 2, analys OBL N260 EÅ + HPL pm 12:30-3-punktstest - räkneövningen 3 OBL KB5C2 EÅ + HPL Tis 8.10 am Inläsning Ons 9.10 am 10:00 Frågastund KB5C2 BEG Tors 10.10 am Inläsning Fri 11.10 am 9:00-14:00 Tenta - genetik Östra Paviljongen - Skrivsal 1 Week 42: Läs kap 22, 23, supplementary material Mån 14.10 am 8:30 - Mutations, Chromosomes and Gene duplication A303Tekn BEG Multigene traits - s. 343-348 Tis 15.10 am 8:30 - Populationsgenetik - genetisk variation i populationer N260 BEG Hardy-Weinberg modellen - s. 515-522; suppl Ons 16.10 am 8:30 - Utvidgning Hardy-Weinberg model, N230 BEG - s. 515-522; suppl Tors 17.10 am 8:30 - parningsystem -påverkan på genetiska variation N260 BEG pm 12:30 - Räkneövning 1 OBL NC353-356, NC358-359 EÅ + HPL
Fre 18.10 am 8:30 - Naturlig selektion 1 (läs s. 523-533, suppl.) KB3B3 BEG 3 pm 12:30 - Räkneövning 2 OBL NC240,250,280,290 EÅ + HPL Week 43: kap22, 23, supplementary material Mån 21.10 am 8:30 - Naturlig selektion 2 (läs s. 523-533, suppl.) N230 BEG pm 12:30 - Räkneövning 3 OBL NC353-356, NC358-359 EÅ + HPL Tis 22.10 am 8:30 - Genetisk drift - migration (läs suppl.) N230 BEG Ons 23.10 am 8:30 - Adaptation N230 PKI Tors 24.10 am 8:30 - Mikroevolution - artbildningsprocesser 1 N230 PKI - s. 534-532 Fre 25.10 am 8:30 - Mikroevolution - artbildningsprocesser 2 N230 PKI 13:00 - Attend a PhD thesis defense pm Baosheng Wang: Hybridization & evolution of Eurasian pines KB3B1 Week 44: Läs kap 24, supplementary material Mån 28.10 am 8:30 - diskussion - artbildningsprocesser OBL NC353-356,NC358-359 PKI + EÅ Tis 29.10 am 8:30 -Human evolution (s. 769-779) KB5C2 PKI - förberedelse för diskussion om human evolution Ons 30.10 am 8:30 - Literature discussion - human evolution OBL NC353-356,NC358-359 PKI + EÅ Tors 31.10 am 8:30 - Molekylär evolution I KB5C2 PKI - förberedelse för diskussion om molekylär evolution Fre 1.11 am 8:30 - Molekylär evolution II KB5C2 PKI pm 12:30 - Literature diskussion OBL NC240,250,280,290 EÅ + PKI Week 45: Förbereda för evolutionstentamin Mån 4.11 am 10:00 - frågastund KB5C2 BEG, PKI Tis 5.11 am Inläsning Ons 6.11 am 09:00-14:00 Tenta - Evolution Östra Paviljongen - Skrivsal 2 pm Inläsning
Tors 7.11 am 8:30-9:00 - Introduktion fördjupningsuppgift - OBL KB5C2 BEG, UCG 9:00-11:30 - Origin of life, history of life on earth, major mass extinctions, FB continental drift & phylogeography, major transitions 4 pm 12:30-15:00 - video life in the rocks, discussion of video KB5C2 FB Fre 8.11 am 8:30 - History life on earth, Groups treated in systematics KB5C2 FB (continued from day 1) Week 46: Mån 11.11 am 8:30 - principles of developmental biology, KB5C2 FB ontogeny and phylogeny, homology, synapomorphy, pleisiomorphy pm 12:30-15:00 - video rare glimpses, discussion of video KB5C2 FB Tis 12.11 am 8:30 - Phylogenetics (systematics) history KB5C2 FB (Socrates to today, Linneaus, Darwin, Hennig), parsimony, distance matrix, algorithms fokus på grupper i systematik delen) pm 12:30-15:00 - phylogenetics exercise distance matrix OBL KB5C2 FB, EM Ons 13.11 am 8:30 - phylogenetics: likelihood, contrast with parsimony KB5C2 FB pm 12:30-15:00 - exercise on likelihood OBL NC345 FB, EM Tors 14.11 am 8:30 - (OBL) read article requiring tree thinking & KB5C2 FB history, e.g. historical biogeography, Wallace line, glacial refugia) TEST EXAM - continue working with tree thinking Fre 15.11 am 08:30-10:00 - Summarize & discuss tree thinking article (group).nc230,240,250,290 FB, EM OBL 10:00-11:30 - Discussion exam results (OBL) KB5C2 FB Week 47: Mån 18.11 am 8:30 - Bakterier/ Arkeer KB5C2 UCG - (s. 553-566, 597-599, 602-606, 610-620, Kap 27) Tis 19.11 am 8:30 - Livscykler, Protister (s. 297-298; kap 28) KB5C2 UCG pm 12:30 - Materialstudier: Bakterier/Arkeer NC 430+NC440 UCG, JP Ons 20.11 am 8:30 - Introduktion Plantae, Landväxter KB5C2 UCG (livscykler, mossor, ormbunkar mfl) - (kap 29-30) pm 12:30 - Materialstudier: Protister NC 430+NC440 UCG, JP, LL Tors 21.11 am 8:30-9:30 Fröväxter KB5C2 UCG 10:00-11:00 Barrträd aktuell forskning KB5C2 XRW pm 12:30 - Materialstudier: Växter NC 430+NC440 UCG, JP, LL
Fre 22.11 am 8:30 - Svampar, Fungi KB5C2 UCG 5 - Kap 28-31 Week 48: Mån 25.11 am 8:30 - Materialstudier: svamp NC 430+NC440 UCG, JP, LL pm 12:30 - Gruppdiskussion: Bakterier/protister/svampar/växter/livscyklar NC354,355,356,358,359 UCG + Tis 26.11 am 10:00-12:00 - Introduktion till djuravsnittet, KB5C2 AN Djurens ursprung och embryologi (s. 700-710) Ons 27.11 am 10:00-12:00 - Ryggradslösa djur I & II (s. 712-738) KB5C2 AN Introduktion grupparbete ryggradslösa djur OBL - s. 712-747 Tors 28.11 am 8:30 - Blötdjur & leddjur (s. 712-738) KB5C2 AN pm 12:30-14:00 -Materialstudier:Ryggradslösa djur I & II (delade) NC430/Museet PH, WU 14:00-15:30 -Materialstudier:Ryggradslösa djur I & II (delade) NC430/Museet PH, WU Fre 29.11 am 08:30-11:30 - Materialstudier: Blötdjur/ M: Leddjur (delade) NC430/Museet PH, WU Materialstudier: Blötdjur/ M: Leddjur (delade) NC430/Museet PH, WU - s. 738-747 Week 49: Mån 2.12 am 10:00-12:00 - Tagghudingar & ryggsträngsdjur KB5C2 AN 12:30-14:00 - Materialstudier: Deuterostomier/ NC430/Museet PH, WU Dissektion: Daggmask & syrsa (delade grupper) OBL NC430/Museet PH, WU 14:00-15:30 - Materialstudier: Deuterostomier/ NC430/Museet PH, WU pm Dissektion: Daggmask & syrsa (delade grupper) OBL NC430/Museet PH, WU Tis 3.12 am 8:30 - Fiskar, grod- & kräldjur (s. 747-773) KB5C2 AN - s. 738-747 Ons 4.12 am 08:30-10:00 - Materialstudier: Fiskar/Grod & kräldjur NC430/Museet PH, WU (delade grupper) 10:00-11:30 - Materialstudier: Fiskar/Grod och kräldjur NC430/Museet PH, WU - s. 747-779 Tors 5.12 am 8:30 - Fåglar och däggdjur KB5C2 AN 12:30-14:00 - Materialstudier: Däggdjur/ Museet PH, WU Film: Däggdjur KB5C2 PH, WU (delade grupper) 14:00-15:30 - Materialstudier: Däggdjur/ Museet PH, WU pm Film: Däggdjur KB5C2 PH, WU
Fre 6.12 am 8:30 - Redovisning grupparbeten ryggradslösa djur, OBL KB5C2 AN 6 - för tentamen Week 50: Mån 9.12 am 10:00 - Frågestund fylogeni & systematik KB5C2 FB, UCG, AN pm Tis 10.12 am Inläsning Inläsning Ons 11.12 am 09:00-14:00 Tenta - Fylogeni & systematik Östra Paviljongen - Skrivsal 7 Tors 12.12 am 08:30 - Projekt details, writing - final topic choice - OBL BEG, UCG pm Fre 13.12 Week 51: Mån 16.12 Tis 17.12 Ons 18.12 13.12.19-14.01.04: SEMESTER Tis 7.1 Ons 8.1 Tors 9.1 Fre 10.1 Mån 13.1 Week 2: Projekt work Week 3: Projekt & PRESENTATION God jul och gott nytt år! Tis 14.1 Inlämning av skriftlig arbete Ons 15.1 am 9:00 - student seminars & discussion KB5C2 BEG/UCG/AN pm 12:30 - student seminars & discussion KB5C2 BEG/UCG/AN
Tors 16.1 am 9:00 - student seminars & discussion KB5C2 BEG/UCG/AN 7 pm 12:30 - student seminars & discussion KB5C2 BEG/UCG/AN Fri 17.1 am 9:00 - student seminars & discussion KB5C2 BEG/UCG/AN pm 12:30 - student seminars & discussion KB5C2 BEG/UCG/AN Muntlig kursutvärdering