2012-03-16 OBS: Ändringar kan bli aktuella Schema: Bevarandebiologi 15 hp, VT 2012 Kursen arrangeras av Avdelningen för populationsgenetik, Zoologiska institutionen, Stockholms universitet Johan Charlier (JC) - kursledare Linda Laikre () - kursansvarig Lovisa Wennerström (LW) Anna Palmé (AP) Mija Jansson (MJ) Peter Guban (PG) Anastasia Eklund (AE) Karin Norén (KN) Bodil Elmhagen (BE) Sven Jakobsson (SJ) Peter Hambäck (PH) Helena Larsdotter Mellström (HLM) rum F518, tel 16 42 79, johan.charlier@zoologi.su.se rum F520, tel 16 42 83, linda.laikre@popgen.su.se rum F511b, tel 16 14 10, lovisa.wennerstrom@zoologi.su.se rum F518, tel 16 42 79, anna.palme@popgen.su.se rum F511a, tel 16 42 37, mija.jansson@zoologi.su.se rum F509, peter.g.99@gmail.com rum F509, saphierwolf@hotmail.com karin.noren@zoologi.su.se bodil.elmhagen@zoologi.su.se sven.jakobsson@zoologi.su.se peter.hamback@botan.su.se helena.mellstrom@zoologi.su.se Gästföreläsare: Studiebesök: Ann Dahlerus, Svenska Rovdjursföreningen Thord Fransson, Naturhistoriska riksmuseet Mats Amundin, Kolmårdens djurpark Anders Lekander, Lantrasforum Helena Olsson, Djurparkschef, Parken Zoo, Eskilstuna Jennie Westander, Forskningschef, Parken Zoo, Eskilstuna Sandra Jönsson, Zoolärare, Kolmårdens djurpark Parken Zoo, Eskilstuna SLU - Sötvattenslaboratoriet, Drottningholm Lokaler: Föreläsningar D508 Datorlaborationer D334 Hemsida: Självstudier: Litteratur: www.popgen.su.se/bevbio Kursen förutsätter självstudier på icke-schemalagd tid Primack, R.B. 2008. A primer of conservation biology. Sinauer Associates, Inc. Publishers Frankham, R., Ballou, J.D., Briscoe, D.A.2004. A primer of conservation genetics. Cambridge University Press. Båda böckerna går att köpa på Akademibokhandeln, Frescati. Litteraturhänvisningar: Obs - hänvisningarna är ungefärliga. Föreläsningarnas kronologi följer inte nödvändigtvis böckernas. Böckerna är ett viktigt komplement till föreläsningarna. Böckerna ger fördjupning och bredd inom vissa områden som vi inte kommer att hinna behandla så utförligt på kursen.
1. Vecka 12 2012-03-19 Måndag 9 00-9 30 Introduktion av kursen JC 9 30-12 00 Föreläsning: Introduktion till bevarandebiologi och bevarandegenetik 13 00-15 00 Datorlab 1: Deterministiska processer som styr populationers genetiska sammansättning JC/AE Litteratur: Primack kap. 1: 1-15, 34-54, 2, Frankham et al. kap 1 2012-03-20 Tisdag 9 30-10 30 Föreläsning: Genomgång Datorlab 1 JC 11 00-12 00 Föreläsning: Bevarandebiologi, bevarandegenetik, forts 13 00-15 00 Datorlab 2: Stokastiska processers betydelse JC/PG Litteratur: Frankham et al. kap. 2, 1-21, kap 3 2012-03-21 Onsdag Inläsning, Räkneövningar, BIG-information fr. 12.00 BÄR eftermiddag, sal E306 13 00-13 30 Studentinflytande 13 30-15 00 Jobb efter examen 13 00-14 00 Rebecka Salamon redovisar sitt exjobb, "Spatial genetic structure of the Swedish moose", Frescati backe sal 107 Litteratur: Frankham et al. kap. 2, 1-21, kap 3 2012-03-22 Torsdag 9 30-12 00 Föreläsning: Populations- och bevarandegenetik, forts 13 00-14 00 Föreläsning: Genomgång av datorlab 2 JC 14 30-15 30 Genomgång: Problemlösning 1 JC Litteratur: Frankham et al. kap 4 sid 52-59, 63-75 2012-03-23 Fredag 9 00-10 00 Föreläsning: Molekylära metoder JC 10 30-12 00 Datorlab 3: Populationssystem JC/PG 13 00-15 00 Föreläsning: Populationsstruktur, små populationers genetik, pedigree-analys Litteratur: Frankham et al. kap 4 sid 63-75, kap 6 Vecka 13 2012-03-26 Måndag 9 30-10 15 Föreläsning: Genomgång datorlab 3 JC 10 45-12 00 Genomgång: Problemlösning 2 JC em Räkneövningar - självständigt arbete Litteratur: Frankham et al. kap 4 sid 59-65, kap 5
2. 2012-03-27 Tisdag Inläsning, Räkneövningar 14 30-15 30 Seminarium, Kjell Danell, "Efforts to exterminate the large predators - our last war?", sal D502 2012-03-28 Onsdag 9 30-12 00 Föreläsning: Effektiv populationsstorlek. Avel av hotade djur. 13 00-16 00 Datorlab 4: Pedigree-analys MJ/LW Litteratur: Frankham et al. kap 5, 8 2012-03-29 Torsdag 9 30-10 20 Föreläsning: Genomgång av datorlab 4 LW 11 00-12 00 Föreläsning: Pedigree-analys för bevarande av hotade lantraser LW/MJ 13 00-15 30 Gästföreläsning: Bevarande av hotade husdjursraser 2012-03-30 Fredag 9 00-10 30 Grupp 1: Laboration: start av proteinelektrofores 10 30-12 00 Grupp 1: Datorlaboration 5: analys av populationsgenetiska data 12 45-14 15 Föreläsning: Statistisk analys av molekylärgenetisk data, tolkning av labresultat 14 15-16 15 Grupp 1: Laboration: proteinelektrofores, forts Litteratur: Labhandledning Vecka 14 2012-04-02 Måndag Inläsning, Räkneövningar 2012-04-03 Tisdag 08 30-10 00 Grupp 2: Laboration: start av proteinelektrofores 10 15-11 45 Grupp 3: Laboration: start av proteinelektrofores 10 15-11 45 Grupp 2: Datorlaboration 5: analys av populationsgenetiska data 14 15-16 15 Grupp 2: Laboration: proteinelektrofores, forts. 14 15-15 45 Grupp 3: Datorlaboration 5: analys av populationsgenetiska data 16 15-18 15 Grupp 3: Laboration: proteinelektrofores, forts. Litteratur: Labhandledning Anders Lekander KT/PG AE/JC JC KT/PG AE + LW el. PG AE + LW el. PG
3. 2012-04-04 Onsdag 10 00-16 00 Studiebesök: Sötvattenslaboratoriet 2012-04-05 Torsdag Egen analys av labresultat. Skriftlig redovisning lämnas/mailas till JC senast måndag 16 april kl. 16.00. 2012-04-06 Fredag Långfredagen Vecka 15 PÅSKLOV Vecka 16 2012-04-16 Måndag Egen analys av labresultat. Skriftlig redovisning lämnas/mailas till JC senast måndag 16 april kl. 16.00. Litteratur: Frankham et al. kap 1: 22-28, kap 9 2012-04-17 Tisdag 9 30-10 30 Föreläsning: Moderna djurparker, organisationer och bevarandearbete 11 00-12 00 Föreläsning: Svenska djurparkers bidrag till bevarande av kattdjur 13 00-14 20 Genomgång: Problemlösning 3 LW 14 30-15 30 Seminarium, Hans Ellegren, "The genomics of species divergence in flycatchers", sal D502 2012-04-18 Onsdag 9 30-12 00 Föreläsning: Sårbarhetsanalys med Vortex JC Sandra Jönsson Sandra Jönsson em Datorlab 6: Sårbarhetsanalys med Vortex Litteratur: Frankham et al. kap 5, sid 93-99 JC/AE 2012-04-19 Torsdag 9 30-11 30 Datorlab 6, forts.: Sårbarhetsanalys med Vortex 12 30-13 50 Genomgång: Problemlösning 4 LW 14 00-14 30 Presentation av projektarbeten JC JC/AE 2012-04-20 Fredag Vargtema 10 00-10 50 Föreläsning: Den svenska vargstammen el. MJ 11 10-12 00 Föreläsning: Djurparkernas roll Mats Amundin 13 00-14 00 Föreläsning: Rovdjurens roll i ekosystemet SJ 14 15-15 30 Föreläsning: Bevarande av varg i Sverige Ann Dahlerus Vecka 17 2012-04-23 Måndag 9 30-16 00 Datorlab 6, forts.: Sårbarhetsanalys med Vortex Lämna in protokoll, datorlab 6: senast 16.00 Litteratur: Frankham et al. kap 5, sid 93-99 JC/AE
4. 2012-04-24 Tisdag INLÄSNING 2012-04-25 Onsdag INLÄSNING 2012-04-26 Torsdag INLÄSNING 2012-04-27 Fredag 9 00-12 00 Skrivning Bevarandegenetik och bevarandebiologi KT/PG/AE mfl Vecka 18 2012-04-30 Måndag Valborg 2012-05-01 Tisdag Första maj 2012-05-02 Onsdag 9 00-12 00 Föreläsning: Introduktion till bevarandeekologi KN em Inläsning: två bevarandebiologiska fallstudier Litteratur: Fallstudier + Primack kap 1 16-33, 54-49, kap 2, 4-5 2012-05-03 Torsdag 10 00-12 00 Föreläsning: Bevarandeekologi hos fisk SJ 13 00-14 00 Föreläsning: Bevarande av marina däggdjur Christina Geijer 2012-05-04 Fredag 9 30-11 00 Föreläsning: Bevarande av ängs- och hagmarker 13 00-15 00 Diskussion om de två inlästa bevarandebiologiska fallstudierna Litteratur: Primack kap 1 54-49, kap 4-5 Vecka 19 2012-05-07 Måndag 9 30-12 00 Föreläsning: Bevarandeekologi hos insekter HLM AP KN 13 00-16 00 Diskussion: Etik och bevarande KN Litteratur: Primack kap 4-5 2012-05-08 Tisdag 8 00-17 30 Studiebesök: Parken Zoo, Eskilstuna: praktiskt bevarandearbete i djurparksvärlden Helena Olsson, Jennie Westander 2012-05-09 Onsdag 9 30-12 00 Föreläsning: Bevarandeekologi hos däggdjur BE em Grupparbete om utdelade artiklar Litteratur: Primack kap 4-5 2012-05-10 Torsdag 9 30-12 00 Grupparbete om utdelade artiklar 13 00-16 00 Grupparbete om utdelade artiklar Litteratur: Primack kap 1 54-49, kap 4-5
5. 2012-05-11 Fredag 9 30-12 00 Föreläsning: Bevarandeekologi hos växter PH 13 00-16 00 Litteraturseminarie Litteratur: Primack kap 4-5 Vecka 20 2012-05-14 Måndag 10 00-12 00 Redovisning av grupparbete KN em Inläsning/projektarbete 2012-05-15 Tisdag 9 30-12 00 Föreläsning: Bevarandeekologi hos fåglar Thord Fransson em Inläsning/projektarbete 2012-05-16 Onsdag 10 00-15 00 Exkursion till Tyresta / Naturum KN 2012-05-17 Torsdag Kristi himmelfärds dag 2012-05-18 Fredag INLÄSNING Vecka 21 2012-05-21 Måndag INLÄSNING 2012-05-22 Tisdag 9 00-14 00 Skrivning Bevarandeekologi och bevarandebiologi 2012-05-23 Onsdag Projektarbete 2012-05-24 Torsdag Projektarbete 2012-05-25 Fredag Projektarbete Vecka 22 2012-05-28 Måndag Projektarbete 2012-05-29 Tisdag 14 00 - Inlämning av projektarbete 2012-05-30 Onsdag Förberedelse opposition/redovisning 2012-05-31 Torsdag 8 30-16 00 Redovisning KN/JC mfl. 2012-06-01 Fredag 8 30-16 00 Redovisning KN/JC mfl.