1. Medicinsk genetik, 7-11 april Vecka 15 8.00 9.00 10.00 11.00 12.00 13.00 14.00 15.00 16.00 7 april Introduktion och genomgång av övningsuppgifter JL Kromosomer och Kromosomavvikelser PG Monogena och multifaktoriella sjukdomar KLR och HM 16:30 Restdugga Cellbiologi CMB, von Eulers v 3 8 april Monogena och multifaktoriella sjukdomar forts KLR och HM Genetisk vägledning och Fosterdiagnostik EB 9 april Syndromutredningar JL Welandersalen Egen tid; Instuderingsfrågor 13:00-14:15 Restdugga Medicinsk Biokemi 10 april Cancergenetik ET Förberedelse övningsuppgifter 11 april Övningsuppgifter i Klinisk Genetik * JL, KLR, HM, AL Astra (T3), Glaxo (T3), Pharmacia (T3), Solander (T3) Obligatoriskt moment JL Johanna Lundin KLR Kristina Lagerstedt Robinson AL PG Peter Gustavsson ET Emma Tham HM Helena Malmgren EB Erik Björck, Karolinska Universitetssjukhuset Solna, Norrbacka, S4:01 Welandersalen, Karolinska Universitetssjukhuset Solna, B4:00 Adresser till salar övriga veckor finns även på sista sidan i schemat Agne Lieden 1
2. Molekylärbiologiska tekniker, 14 apr - 9 maj Vecka 16 8.00 9.00 10.00 11.00 12.00 13.00 14.00 15.00 16.00 14 april 09:00-15:00 Resttenta Medicinsk Biokemi 15 april 16 april 17 april 18 april Långfredag 2
Molekylärbiologiska tekniker, fortsättning Vecka 17 8.00 9.00 10.00 11.00 12.00 13.00 14.00 15.00 16.00 21 apr Annandag påsk 22 apr Introduktion och rundvandring PA Enzymes used in DNA manipulation PA Transfection and reporter genes 23 apr Cloning techniques and PCR Real time PCR Global gene expression Immunohistochemistry Labgenomgång* PA TJ FF KY PD 24 apr RNA extraktion Methods to analyse DNA DNA-binding / promoter rerecruitment, chromatin PD RNA extraktion 25 apr cdna syntes och PCR Protein:protein interactions cdna syntes och PCR Alfred Nobels Allé 8, Lecture hall, Hus F, Blickagången 9, AV Velmurugesan Arulampalam TJ Tomas Jakobsson LJ Luca Jovine PS TD Tassos Damdimopoulos KY Konstantin Yakimchuk IN Ivan Nalvarte TB SLG Sylvie Le Guyader Peter Svensson MÖ Marie Österlund FF Fredrik Fagerström-Billai PD Pauliina Damdimopoulou PA Per Antonson Peter Swoboda Thomas Bürglin Carsten Daub Chunyan Zhao 3
Molekylärbiologiska tekniker, fortsättning Vecka 18 8.00 9.00 10.00 11.00 12.00 13.00 14.00 15.00 16.00 28 apr DNA cloningisolation of DNA fragments and restriction enzyme digestion Introductory Microbiology: Understanding Our Microbiome VA DNA cloningisolation of DNA fragments and restriction enzyme digestion 29 apr Gel-electrophoresis and DNA-ligation Fluorescence microscopy Lab: Gel-electrophoresis and DNA-ligation SLG 30 apr 1 maj Första Maj 2 maj Alfred Nobels Allé 8, Lecture hall, Hus F, Blickagången 9, AV Velmurugesan Arulampalam TJ Tomas Jakobsson LJ Luca Jovine PS Peter Swoboda TD Tassos Damdimopoulos KY Konstantin Yakimchuk IN Ivan Nalvarte TB Thomas Bürglin SLG Sylvie Le Guyader Peter Svensson MÖ Marie Österlund Carsten Daub FF Fredrik Fagerström-Billai PD Pauliina Damdimopoulou PA Per Antonson Chunyan Zhao 4
Molekylärbiologiska tekniker, fortsättning Vecka 19 8.00 9.00 10.00 11.00 12.00 13.00 14.00 15.00 16.00 5 maj Transformation Transgene technology PA Knockout technology PA Transformation 6 maj Protein analysis (1D/2D Western, Massspec, proteomics) IN Pharm drug dev MÖ Lab: * Start o/n cultures Lab: * Start o/n cultures 7 maj Restriktionsklyvning och gelanalys Frågestund Restriktionsklyvning och gelanalys 8 maj 9 maj 09.00-12.00 Dugga Skriva labrapport Skrivsal: 5Y Alfred Nobels Allé 8, Lecture hall, Exam hall 5Y, Blickagången 9, AV Velmurugesan Arulampalam TJ Tomas Jakobsson LJ Luca Jovine PS TD Tassos Damdimopoulos KY Konstantin Yakimchuk IN Ivan Nalvarte TB SLG Sylvie Le Guyader Peter Svensson MÖ Marie Österlund FF Fredrik Fagerström-Billai PD Pauliina Damdimopoulou PA Per Antonson Peter Swoboda Thomas Bürglin Carsten Daub Chunyan Zhao 5
3. Bioinformatik, 12maj - 16maj Vecka 20 8.00 9.00 10.00 11.00 12.00 13.00 14.00 15.00 16.00 12 maj Introduktion to Bioinformatics Genome organization and evolution Lab 1 * 13 maj Scientific publications and archives Archives and information retrieval Lab 1 * 14 maj C. Elegans C. Elegans TB PS 15 maj Alignments and phylogenetic trees Structural bioinformatics Lab 2 * Lab 2* Datasal 6G 16 maj Proteomics and systems biology Alfred Nobels Allé 8, Lecture hall, Computer room Matilda, 6G AV Velmurugesan Arulampalam TJ Tomas Jakobsson LJ Luca Jovine PS Peter Swoboda TD Tassos Damdimopoulos KY Konstantin Yakimchuk IN Ivan Nalvarte TB Thomas Bürglin SLG Sylvie Le Guyader Peter Svensson MÖ Marie Österlund Carsten Daub FF Fredrik Fagerström-Billai PD Pauliina Damdimopoulou PA Per Antonson Chunyan Zhao 6
4. Strukturbiologi, 19 maj - 23 maj Vecka 21 8.00 9.00 10.00 11.00 12.00 13.00 14.00 15.00 16.00 19 maj Protein structure and stability Struktur Datalab * LJ 20 maj Making molecules for structural studies Struktur Datalab * LJ 21 maj Protein crystallography Struktur Datalab * LJ 22 maj Protein crystallography II Struktur Datalab * LJ 23 maj Other techniques Struktur Datalab * Rättning, Grupp 1-8 LJ Alfred Nobels Allé 8, Lecture hall, Alfred Nobels Allé 23, Computer room S311 AV Velmurugesan Arulampalam TJ Tomas Jakobsson LJ Luca Jovine PS TD Tassos Damdimopoulos KY Konstantin Yakimchuk IN Ivan Nalvarte TB SLG Sylvie Le Guyader Peter Svensson MÖ Marie Österlund FF Fredrik Fagerström-Billai PD Pauliina Damdimopoulou PA Per Antonson Peter Swoboda Thomas Bürglin Carsten Daub Chunyan Zhao 7
Vecka 22 8.00 9.00 10.00 11.00 12.00 13.00 14.00 15.00 16.00 26maj 09.00-12.00 Omdugga Förberedelser presentationer YELLOW 27 maj Förberedelser presentationer 28 maj Integrerande projekt * Presentationer Integrerande projekt * Presentationer 29 maj Kristi Himmelfärdsdag 30 maj Alfred Nobels Allé 8, Lecture hall, Novum, Blickagången 6, plan 6 (elevator E), Blickagången 6A, street level, Seminar room Yellow AV Velmurugesan Arulampalam TJ Tomas Jakobsson LJ Luca Jovine PS Peter Swoboda TD Tassos Damdimopoulos KY Konstantin Yakimchuk IN Ivan Nalvarte TB Thomas Bürglin SLG Sylvie Le Guyader Peter Svensson MÖ Marie Österlund Carsten Daub FF Fredrik Fagerström-Billai PD Pauliina Damdimopoulou PA Per Antonson Chunyan Zhao 8
Vecka 23 8.00 9.00 10.00 11.00 12.00 13.00 14.00 15.00 16.00 2 juni Frågestund Kursrådsmöte Restdugga cellbiologi PURPLE v. Eulers v 3 3 juni 4 juni 09:00-15:00 Tentamen 5Y 5 juni 6 juni Alfred Nobels Allé 8, Lecture hall, Exam hall 5Y AV Velmurugesan Arulampalam TJ Tomas Jakobsson LJ Luca Jovine PS TD Tassos Damdimopoulos KY Konstantin Yakimchuk IN Ivan Nalvarte TB SLG Sylvie Le Guyader Peter Svensson MÖ Marie Österlund FF Fredrik Fagerström-Billai PD Pauliina Damdimopoulou PA Per Antonson Peter Swoboda Thomas Bürglin Carsten Daub Chunyan Zhao 9
Adresser till undervisningslokaler Literature Bioinformatics Kartor över Karolinska,Solna och Huddinge finns på kurswebben under rubriken "Schema" Petrénsalen Nobels väg 12B KI Campus, Solna Norrbacka, Karolinska Universitetssjukhuset, Solna S4:01 Welandersalen, B4:00 Karolinska Universitetssjukhuset, Solna B4:00, Ingång B2 Arthur Lesk, Introduction to Bioinformatics, 3rd edition 1: Introduction 2: Genome organization and evolution 3: Scientific publications and archives 4: Archives and information retrieval 5: Alignments and phylogenetic trees 6: Structural bioinformatics 7: Proteomics and systems biology Sal Alfred Nobels Allé 8, plan 6 KI Campus, Huddinge Hus F2, plan 8 Karolinska Universitetssjukhuset, Huddinge Datasal 6G Alfred Nobels Allé 8, plan 6 KI Campus, Huddinge Datasal S311 Alfred Nobels Alle 23 KI Campus, Huddinge Seminar room YELLOW Novum, Blickagången 6A, Street level, Course expedition KI Campus, Huddinge Skrivsal 5Y Alfred Nobels Allé 8, plan 5 KI Campus, Huddinge 10