CELL OCH MOLEKYLÄR BIOVETENSKAP. John E. Eriksson Cellbiologi Fakulteten för teknik och naturvetenskaper Åbo Akademi

Transkript

1 CELL OCH MOLEKYLÄR BIOVETENSKAP John E. Eriksson Cellbiologi Fakulteten för teknik och naturvetenskaper Åbo Akademi

2 Kandidatexamen i naturvetenskaper Utbildningslinje för biovetenskaper Cell och molekylär biovetenskap (CMB)

3 Utbildningslinje för biovetenskaper, studier Kandidatexamen i naturvetenskaper Gemensamma studier - Biovetenskaper - Språkstudier - Akademiska studiefärdigheter Filosofie magisterexamen Cell och molekylär biovetenskap Miljö- och marinbiologi Cellbiologi Biokemi Miljö- och marinbiologi Ämneslärare i biologi Ämneslärare i biologi

4 Cell och molekylär biovetenskap (CMB) Kurser för årskurs 1, 60 sp Biomolekyler och celler 5 sp Period 1 Gener och ärftlighet 5 sp Period 1 Evolutionen 5 sp Period 1-2 Ekologi 5 sp Period 2 Fysiologiska mekanismer 5 sp Period 3 Globala miljöfrågor 5 sp Period 3 Biolaborationer 1 5 sp Period 4 Tillämpad bioinformatik 5 sp Period 1-2 Kemiska ämnen och reaktionslära 5 sp Period 3 Kemisk jämvikt och drivkraft 5 sp Period 4 Finska 5 sp Period 1-2 Akademiska studiefärdigheter 5 sp Period 1-2

5 Cell och molekylär biovetenskap (CMB) Kurser för årskurs 2, 60 sp Bioimaging and microscopy 5 sp Period 1-2 Biokemiska metoder 5 sp Period 2 Cellbiologi I & II 10 sp Period 3-4 Biolaborationer 2 5 sp Period 3 Energimetabolismen 5 sp Period 4 Molekylärbiologi I 5 sp Period 4 Läkemedelskemi 5 sp Period 4 Kemi, atomstruktur och kemiska egenskaper 5 sp Period 1 Kemi, organiska föreningar och reaktioner 5 sp Period 2 Statistik 5 sp Period 1 Engelska 5 sp Period 1-2

6 Cell och molekylär biovetenskap (CMB) Kurser för årskurs 3, 60 sp Molekylärbiologi II 5 sp Period 1 Biolaborationer 3 5 sp Period 2 Strukturbiologi 5 sp Period 3-4 Histology and histopathology 5 sp Period 4 Bioportfölj I 5 sp Samlas under åk1-3 Kemi och samhälle 5 sp Period 1 Fritt valbara studier 15 sp Period 1-4 Akademisk framställning 5 sp Period 3 Kandidatavhandling 10 sp Period 3-4

7 Termin 2015/16 ÅK1: börjar med det nya CMB-kandidatprogrammet Vi rekommenderar: ÅK2: byter till det nya CMB-kandidatprogrammet ÅK3-: behåller det gamla kandidatprogrammet (cellbiologi)

8 BIOVETENSKAPERNA Biokemi, FM Cellbiologi, FM Miljö- och marinbiologi, FM Lärarlinje, FM MSc Program in Biomedical Imaging, MSc

9 UNDERVISNING I CELLBIOLOGI Cell- och molekylärbiologi Djur- och växtmorfologi och anatomi Djurfysiologi Genetik Utvecklingsbiologi Försöksdjurskunskap Immunologi Signalering och transkriptionsreglering Mikroskopiska tekniker, moderna visualiseringstekniker Bioinformatik Toxikologi Farmakologi Neurobiologi Teknologiöverföring, kommersialisering

10 Industri: ARBETSMARKNAD produktutveckling, kommersiella tjänster, koordinatorer, egen företagsverksamhet Övervakning, förvaltning: industri, statliga och kommunala forsknings- och övervakningsinstitut, hälsosektorn, sjukhus, statsförvaltning (ministerier), kommunalförvaltning, Europeiska Unionen, Finlands Akademi, TEKES Utbildning: grundskolor, yrkeshögskolor, universitet Forskning: universitet, industri (grundforskning och tillämpad forskning), vetenskapsförvaltning, vetenskapsjournalistik

11 Biovetenskap: Cellbiologi John Eriksson, professor i cellbiologi, ämnesföreträdare Lea Sistonen, professor i cell och molekylärbiologi Kid Törnquist, professor i biologi fysiologi, cellfysiologi, t.f. ämnesföreträdare Christer Lindqvist, lektor Diana Toivola, lektor, forskare vid Finlands Akademi Eva Henriksson, usniversitetslärare Annika Meinander, doktorsassistent Bioteknikcentrum: Daniel Abankwa, docent Eleanor Coffey, docent Cecilia Sahlgren, professor Univ. of Technology, Eindhoven Barbro Lindholm, byråsekreterare Gunilla Henriksson, speciallaboratoriemästare Esa Nummelin, laboratoriemästare (deltid) Thomas Bymark, laboratorietekniker Jari Korhonen, forskningstekniker Maija-Liisa Hoffrén, instrumentvårdare

12 CELLBIOLOGINS LÄRARKÅR

13 CELLBIOLOGISKA TILLÄMPNINGSOMRÅDEN Åldrande och stress Cancer Immunologi, immunologiska sjukdomar Populatiosgenetik Genetisk diagnostik Modifierade gener Stamceller Diabetesforskning Virologi Nanoteknologi Endokrinologi

14 BALANS MELLAN CELLDÖD OCH CELLDELNING Celldelning Celldöd Sjukdomar som leder till cellackumulering (cancer, autoimmuna sjukdomar etc.) Homeostas Sjukdomar med cellförlust (neurodegenerativa sjukdomar, AIDS etc.)

15 CELLENS ÖVERLEVNADSEKVATION Dödssignaler Överlevnadssignaler Cytoskeletala signaler Signaler vid stress

16 SIGNALERING FRÅN DÖDSRECEPTORER

17 Cytoskelettet deltar i cellsignaleringen Integrins, adhesion molecules Intermediate filaments P-buffer Akt TSC1/2 Death receptors Kinase scaffolds Raf Cdc25 Rheb mtor Cellrörelse Cellens överlevnad Celltillväxt Celldelning Cellstorlek

18 Post-doctoral fellows Hanna-Mari Pallari Emilia Peuhu Graduate students Tomoko Asaoka Saima Ferraris Claire Hyder Kimmo Isoniemi Julia Lindqvist Ponnuswamy Mohanasundaram Preethy Paul Mika Remes Elin Torvaldson Research associate Helena Saarento Alumni Aurelie dethonel-d Orgeix Tao He Tim Holmström Marko Kallio Aura Kaunisto Vitaly Kochin Annika Meinander Andrey Mikhailov Mikko Nieminen Minna Poukkula Adolfo Rivero-Muller Cecilia Sahlgren Andrzey Stepulak Thomas Söderström Diana Toivola Stefanie Tran Collaborators and contributors Cytoskelettet och cellöverlevnad Institutionen för biovetenskap och Åbo bioteknikcentrum Robert Goldman, Northwestern University, USA Shin-Ichi Hisanaga, Tokyo Metropolitan Univ., Japan Susumu Imanishi, Turku Centre for Biotechnology Hannu Kalimo, Univ. of Helsinki, Finland Kuo-Feng Lee, Salk Institute, La Jolla, USA Paria Mohseni, Andras Nagy, Univ. of Toronto, Canada Milos Pekny, Univ. of Gothenburg, Sweden Cecilia Sahlgren, Åbo Akademi Univ., Finland Funding - The Academy of Finland - Sigrid Jusélius Foundation - The Finnish Cancer Foundations - Technological Development Agency of Finland - Åbo Akademi Univ. Foundation

19 Intrasslade proteiner i celler Stressproteiner skyddar mot proteindenaturering

20 Stressfaktorer skyddar mot cellstress och deltar i organismens utveckling Stress HSFs Hsps Proteinhomeostas Stressrespons Cancer Livslängd Utveckling

21 Sistonen Lab September 2011

22 Forskning i cellfysiologi Forskningsinriktning Sfingolipider och sköldkörtelcancer Cellers kalciumsignalering Nya målgener för lipider i cancerceller Lipider och kaliumkanaler

23 Cell Physiology Research Group Vilka är vi? Kid Törnquist, FD, Professor (Fysiologi) Tero Viitanen, FD, forskare Christoffer Löf, FM, doktorand Pramod Sukumaran, FM, doktorand Kati Kemppainen, FM, doktorand Veronica Kalhori, FM, doktorand Md. Yasir Asghar, Fil.Lic,, doktorand Ilari Pulli, FM, doktorand Helena Saarento, FM, teknisk hjälp

24 NATURAL KILLER CELLS HENRY HÄGERSTRAND & CHRISTER LINDQVIST + COWORKERS WE STUDY NATURAL KILLER CELLS AND THE ROLE OF 1/ TARGET CELL LIGAND LATERAL DISTRIBUTION, MOBILITY, AND LIPID ASSOCIATION IN KILLING 2/ EFFECT OF NATURAL AND SEMI-SYNTHETIC MOLECULES (POLYPHENOLS) IN KILLING Methods -Killing assay (NK cell killing of target cells) -Immunocytochemical methods (staining/blocking of membrane components) -Microscopic methods (confocal, live cell confocal, scanning and transmission electron microscopy) -Cell sorting (FACS) Natural Killer cell (NK), Target cell (TC).

25 Laboratoriet för Epitelbiologi Diana Toivola, FD, Docent Finlandsakademiforskare, Lektor i cellbiologi Consulting assistant professor, Stanford Universitet Vi forskar i: Hur keratinfilament skyddar oss från sjukdomstillstånd? Sjukdomsmodeller vi studerar: Tarminflammation Tarmcancer Diabetes Diana Metoder: Celler, djurmodeller (mus), cellbiologi, biokemi, mikroskopi och visualisering Huvudsaklig undervisning: Mikroskopi, Histologi dtoivola@abo.fi

26 Eva Henriksson, Universitetslärare i cellbiologi Institutionen för biovetenskaper Kurser 2012/2013: - Cellbiologi - Vetenskaplig framställningsteknik - Cell Signaling X-och Y- kromosom Forskningsområde: Reglering av genexpression i manliga könsceller Aktuella frågor: - Hur påverkar stressproteiner (HSFs) X- och Y kromosomala gener - Hur påverkar åldrandet funktionen av dessa stressproteiner

27 Reglering av det medfödda immunförsvaret Annika Meinander, FD Akademilektor i cellbiologi Forskningsintresse: Reglering av det medfödda immunförsvaret med hjälp av ubikvitylering Metodologisk expertis: - Inflammationssignallering förmedlad via NF-kB - Reglering av cellsignallering med hjälp av ubikvitylering och andra post-translationella modifikationer - Drosophila melanogaster som modellorganism

28 Cell-Cell Signalering i Stamceller och Cancer Med focus på Notch signalering Notch i STAMCELLER Notch i CANCER Cecilia Sahlgren Åbo Bioteknikcentrum Nanomedicin Sammarbete Fysikalisk Kemi (ÅA) STAM CELL DIFFERENTIERAD CELL

29 Turku Centre for Biotechnology Mechanisms and sensors for small GTPases Group Abankwa: Camilo Guzman (Postdoc), Reihaneh Kouhi Esfahani (grad. student), Alessio Ligabue (Postdoc), Tina Oetken (Postdoc/Sen Tech), Maja Solman (grad. student), Arafath Najumudeen (grad. student) More to come

30 Kinase Function in Brain Understanding the molecular mechanisms of brain development and disease Imaging: Proteomics: Molecular Biology: Biochemistry Coffey lab

31 Toppmoderna tekniker i cellvisualisering ATT SE DET MAN INTE SER

32 ~1900 ~

33

34 Turku Bioimaging From atoms to anatomy NANOSCALE IMAGING Latest instruments and best expertise Latest probes and methods Latest image analysis tools in vivo IMAGING OF HUMANS AND ANIMALS CELL AND TISSUE IMAGING

35 MODERNA MIKROSKOP

36 LEICA TCS SP5: THE BROADBAND CONFOCAL High-speed Live Cell Imaging and High Resolution Morphology all in one. From 300 frames/s to to 64 Megapixels per image. The fastest True Confocal System Best resolution, contrast, depth imaging with single point scanning system Leading in Multispectral Imaging: Highest flexibility for multi-labelling due to AOBS, 5 SP detectors, APD, ROI Spectrometer, spectral FLIM Intelligent and Intuitive Interface Quick access Digital dashboard Experiment wizards

37 STED Optical microsocopy beyond the diffraction limit Two super-resolution channels real optical resolution approximately nm Customized features White laser Laser source with freely adjustable wavelength FLIM-FCS features STED-AFM Live-cell capabilities coming up

38 38

39

40

41

42 Control (SiHa) (1.5 million cells) Tumor treated with HIT compound 2mg/kg 4mg/kg 6mg/kg

43 Control (SiHa) (1.5 million cells) Sample Ctrl 2 mg/kg 4 mg/kg 6 mg/kg

44

45 Hälsningar från BioCity!