Sök artiklar i PubMed En handledning i hur man söker med hjälp av ämnesord. PubMed är en databas med över 20 miljoner referenser som täcker medicin, omvårdnad, odontologi, veterinärmedicin, hälso- och sjukvård samt de prekliniska ämnesområdena. 1) Börja med att utifrån ditt ämne identifiera lämpliga söktermer. Exempel: Du vill hitta artiklar om riskfaktorer i relation till rökning och lungcancer. 2) Eftersom PubMed är en internationell databas måste söktermerna vara på engelska. På http://mesh.kib.ki.se/swemesh/swemesh_se.cfm hittar du en översättningsdatabas (svenskaengelska-svenska). Kolla upp vilka engelska termer du bör använda. Skriv in termen på svenska, klicka sedan på Search (till exempel lungcancer). Nu vet du att följande termer ska användas (utifrån vårt exempel om lungcancer): Smoking, Risk Factors, Lung Neoplasms. Om du får flera alternativ på termer, välj det mest relevanta. 3) Gå nu till PubMed via bibliotekets Sök i databaser www.mah.se/bibliotek 1
PubMed PubMed är den världsledande artikeldatabasen inom bland annat medicin och omvårdnad. I databasen finns det idag referenser till cirka 20 miljoner artiklar i tidskrifter från hela världen. I PubMed har du nu möjlighet att söka med dina engelska söktermer. För att få en bra sökning i PubMed kan du göra en ämnesordssökning med hjälp av medicinska ämnesord (MeSH). MeSH- vad är det? MeSH står för Medical Subject Headings och är en samling ämnesord som används för att beskriva innehållet i artiklarna i PubMed och göra dem sökbara. Ämnesorden kallas MeSHtermer. 2
Tanken med att använda MeSH-termer är att hitta allt som handlar om en viss företeelse genom att söka på en term. Två artiklar som handlar om samma sak ska tilldelas samma ämnesord. När man söker på MeSH-termen smoking får man därför endast upp de artiklar som har tilldelats detta som ämnesord och undviker artiklar där ordet smoking endast nämns i abstractet. På så sätt kan man göra sina sökningar mer träffsäkra och relevanta. För att söka med MeSH-termer 1) Skriv in din MeSHterm i sökrutan, till exempel smoking och välj sedan kategorin MeSH i rullgardinsmenyn ovanför sökrutan. Tryck sedan ENTER eller Search. Då kommer du in i MeSH database där du kan söka upp dina MeSH-termer i en ordlista. 3
2) Du får nu upp en lista över föreslagna MeSH-termer. Här får du en definition av de olika termerna. Leta rätt på den mest passande (oftast överst) och vänsterklicka på Links och sedan på PubMed. 4
3) Nu har du fått en träfflista med referenser till artiklar som har tilldelats denna MeSHterm och du kan vara säker på att artiklarna är relevanta. 5
4) Sök sedan upp dina andra söktermer genom att skriva in orden, till exempel lung neoplasms och risk factors Sök sedan upp MeSH i rullgardinsmenyn och klicka sedan på Search eller Enter. 6
5) Vill du sedan kombinera dina olika söktermer, kan du gå in i Advanced Search och kombinera dina olika sökningar med AND eller OR. AND innebär att alla sökord ska finnas och gör därmed sökningen snävare. OR innebär att ett eller flera sökord ska finnas och gör därmed sökningen vidare. Det vanligaste är att få för många träffar och du använder då AND för att begränsa sin sökning. Börja med att rensa sökrutan genom att klicka på Clear. Vänsterklicka sedan på var och en av söktermerna (numret på sökningen) och välj AND. Avsluta med att klicka på Search. På så sätt kan du bättre ringa in ditt ämnesområde. Du kommer att få en lista på de artiklar som handlar om alla de söktermer du anger. 7
6) Du har nu en träfflista på artiklar som handlar om både söktermen smoking och lung neoplasms. Genom att kombinera fler söktermer kan du på detta sätt ringa in ditt ämnesområde stegvis. 8
7) Ibland kan det vara så att du vill begränsa din sökning på sätt som är omöjliga att täcka in med ämnesord. Det kan till exempel vara så att du bara är intresserad av artiklar publicerade efter en viss tidpunkt eller du kanske bara är intresserad av artiklar som handlar om en viss åldersgrupp. Du kan även göra språkbegränsningar för att undvika artiklar på språk du inte behärskar. Dessa och andra begränsningar gör du under Limits. Välj begränsningar och klicka sedan på Search. Tips! Om du bockar för rutan Abstracts filtrerar du bort notiser m.m. T 9
8) Här är träfflistan efter att dessa begränsningar gjorts. I rutan Search details kan du se hur sökningen genomförts. Om du inte har tid att skriva ut eller läsa alla artiklar du finner kan du välja att skriva ut sökhistoriken, skicka referenserna till din e-mail (Send to: E-mail) eller spara på ditt NCBI konto (My NCBI ) 10
Så läser du referenserna: Lung cancer screening in the randomized Prostate, Lung, Colorectal, and Ovarian (PLCO) Cancer Screening Trial. Hocking WG, Hu P, Oken MM, Winslow SD, Kvale PA, Prorok PC, Ragard LR, Commins J, Lynch DA, Andriole GL, Buys SS, Fouad MN, Fuhrman CR, Isaacs C, Yokochi LA, Riley TL, Pinsky PF, Gohagan JK, Berg CD; PLCO Project Team. J Natl Cancer Inst. 2010 May 19;102(10):722-31. Epub 2010 May 4. J Natl Cancer Inst: Förkortning av tidskriftens namn. Håll markören över förkortningen för att se hela namnet på tidskriften. 2010: År då artikeln publicerades May 19: Månad och datum då artikeln publicerades 102(10): Volym och nummer. Nummerbeteckning inom parentes. 722-31: Artikeln börjar på sidan 722 och slutar på sida 731 Epub 2010 May 4 Datum då artikeln publicerades elektroniskt 11
Hur hittar jag artiklarna? Efter att ha sökt i artikeldatabasen PubMed har du nu hittat ett antal artiklar som är intressanta för ditt arbete. I vissa fall finns det i PubMed möjlighet att nå fulltext artikeln direkt om den ligger fritt online. Annars klicka på: Via Check for fulltext kan du direkt se om tidskriften finns elektroniskt då det står: Full text available via. Finns tidskrifterna inte elektroniskt får du information om tidskriften ingår i Malmö högskolas samlingar (Holdings in Malmö högskolas bibliotekskatalog) eller på vilket bibliotek de finns på i Sverige (Holdings in Libris). Om du klickar på länken med Full text available via XXX kommer du antingen direkt till artikeln eller in på tidskriftens hemsida där du får leta upp rätt volym och nummer av tidskriften. När du hittat artikeln får du leta efter pdf eller fulltext och sedan klicka för att få fram fulltexten. 12
Holdings in Malmö högskolas bibliotekskatalog innebär att tidskriften finns i tryckt eller elektronisk form på något av våra bibliotek. Klicka på länken för att se vilket bibliotek som har tidskriften (location/placering) och vilka år vi har den (Bibl. bestånd). Om det är en elektronisk tidskrift är den tillgänglig överallt inom högskolan samt externt om du loggar du in med din datoridentitet. Om tidskriften inte finns vare sig elektroniskt eller tryckt på Malmö högskolas bibliotek kan du fjärrlåna artikeln. Artikelkopior från bibliotek inom Norden kostar 20 kr/artikel och artikelkopior från bibliotek i övriga världen kostar 100 kr/artikel. Beställningen kan du göra via www.mah.se/bit/fjarrlan eller via Då står det Inter Library Loan Request document via your library /2010-09-15 13