Taxonomi och fylogeni hos fjällborstmaskar (Annelida: Polychaeta: Aphroditiformia)

Relevanta dokument
Biodiversitet och fylogeni hos kedjemaskar (Catenulida, Platyhelminthes), med tonvikt på den svenska faunan

Tomat och banan hur är de släkt?

Artavgränsningar inom svenska artkomplex av fåborstmaskar (Oligochaeta)

Omtentamen för Påbyggnadskurs i Zoologisk systematik, SU,

Att bygga ett fylogenetiskt träd

Tentamen i Zoo Systematik och Morfologi Torsdagen den 18 januari 2007 Kl

Tentamen för Zoologisk systematik 15 hp, HT 2010, SU,

Vad är en art? morfologiska artbegreppet

Långsiktiga mål för Svenska artprojektet

Svensk sammanfattning (Swedish summary)

Sik i Bottenhavet - En, två eller flera arter? Sammandrag

INSTITUTIONEN FÖR MARINA VETENSKAPER

Darwin NO-biennal i Falun april 2015 Från släktträd till databaser. Workshop med koppling till evolution systematik arter

Släktskap mellan människa och några ryggradsdjur

Taxonomisk revision av Acarosporomycetidae och Candelariales i Norden

Slemmaskar, eller nemertiner, finns över hela

Digital sekvensinformation och Nagoyaprotokollet

Restaurering av kallvattenskorallrev i Sverige. Lisbeth Jonsson Institutionen för Biologi och Miljövetenskap, Tjärnö, Göteborgs Universitet

DNA-ordlista. 16S: Egentligen 16S rrna. Mitokondriell gen med förhållandevis liten variation som ofta används för att artbestämma DNA från däggdjur.

Miljöövervakning av genetisk mångfald. Linda Laikre Stockholms universitet

rapport 2013/6 FISKUNDERSÖKNINGAR I FYRISÅN 2012

Stamträd med hjälp av databaser och program från Internet

Coalescent trees in phylogenetic inference

Evolution. Hur arter uppstår, lever och försvinner

INSTITUTIONEN FÖR BIOLOGI OCH MILJÖVETENSKAP

BILAGA. till KOMMISSIONENS DELEGERADE FÖRORDNING (EU) /...

Motivet finns att beställa i följande storlekar

Systematik - indelningen av organismvärlden. Kap 3 sid i boken

Värdering av ekosystemtjänster av urban grönska

KSLA:s yttrande över översynen av Svenska artprojektet

Evolution, del 2: Evolutionsprocesser och förändringar i det genetiska materialet. Jessica Abbott Forskare Evolutionär Ekologi

Utbildningslinjen för biovetenskaper Tom Wiklund, linjeansvarig

Motsvarade kursen dina förväntningar?/did the course live up to your expectations?

Evolution. Hur arter uppstår, lever och försvinner

Epidemiologi och populationsbiologi hos Puccinia graminis i havre för bekämpning av svartrost i Sverige

Systematik - indelningen av organismvärlden. Kap 2 s34-38, kap 3 sid i boken

Program för forskning om biologisk mångfald

Bilaga 1 Flödesschema för Mosaic i marin miljö

Streckkodning av den svenska floran och faunan förutsättningar och utmaningar

Allmän studieplan för utbildning på forskarnivå i kulturgeografi

Olika celltyper Indelningen av organismvärlden. Kap 2 s34-38, kap 3 sid i boken

Allmän studieplan för utbildning på forskarnivå i kulturgeografi

KURSLITTERATUR (VT-15)

Dessa och andra frågor som berör släktskap

Kursansvarig: Mariana Hagberg, rum 5F 414, tel Kursadministratör: Kristina Oskarsson, rum 5F 411, tel

Europeiska unionens råd Bryssel den 10 juni 2016 (OR. en)

Biologi. Ämnesprov, läsår 2016/2017. Delprov A1. Årskurs. Elevens namn och klass/grupp

Allmän studieplan för utbildning på forskarnivå i växtfysiologi/växters cell och molekylärbiologi

Karbyskolan No ÅK 7 Masi Delavari. Välkommen till NO kursen!

Utbildningsplaner för kandidat-, magister och masterprogram. 1. Identifikation. Avancerad nivå

Allmän studieplan för utbildning på forskarnivå i innovation, entreprenörskap och management av intellektuella tillgångar

Kunskap, vetenskap och forskning

INSTITUTIONEN FÖR BIOLOGI OCH MILJÖVETENSKAP

En släktskapsstudie om Centralamerikas

Lokal pedagogisk planering för arbetsområdet genetik i årskurs 9

BIO100, Biologi, baskurs, 60 högskolepoäng

Bioresursdagarna 2017 Digerdödens offer hjälper oss att förstå utvecklingen av humanpatogena bakterier. Brittmarie Lidesten, Bioresurs

8FA224. Medicinsk genetik, 7,5 hp. Medical Genetics. Fristående kurs. Medicinska fakulteten. Gäller från: 2014 HT. Kursplan

Evolution, del 3: Arter och artbildning. Jessica Abbott Forskare Evolutionär Ekologi

Evolution. Hur arter uppstår, lever och försvinner

Manual HSB Webb brf

NGS för övervakning och utbrottshantering av livsmedelsburna bakterier

FRÅGOR. Tre lag vinner:

Kopplingar till kursplaner för grundskolan

Karl Holm Ekologi och genetik, EBC, UU. ebc.uu.se. Nick Brandt. Populationsgenetik

Evolutionen hos mammutar och deras nu levande släktingar. För elever A B C. Anna Lorenc. Dean Madden [Ed.] bioscience explained

Potamotrygonidae, broskfiskarnas outsider. Inledning. Sötvattensrockor

Svensk nationell datatjänst, SND BAS Online

8MEA07. Medicinsk genetik, 7,5 hp. Medical Genetics. Programkurs. Medicinska fakulteten. Gäller från: 2017 HT PRELIMINÄR. Kursplan

Varför tror du att späckhuggaren har en fena på ryggen? Vad tror du att den använder fenorna på sidan till?

Studieplan för ämne på forskarnivå

Litteraturstudie. Utarbetat av Johan Korhonen, Kajsa Lindström, Tanja Östman och Anna Widlund

Snabbguide till GlobalTwitcher (Juni 2012)

Introduktion DNA, gammalt och modernt

a. Uppvisar något, eller några, av dessa träd ett motsägande fylogenetiskt samband? Om ja; ange vilket/vilka. Om nej; skriv nej.

Livets myller Ordning i myllret

INSIKT nr 4 årgång vetlanda.pingst.se

Identifiering av nattfjärilar

Regler för doktorsavhandling och disputation

Introduktion och Havet som miljö, 7,5 hp, HT 2014 (Kurskod: MAR101)

Övning i bioinformatik

Lärarhandledning: Bävern Djurrikets byggmästare. Författad av Jenny Karlsson

Allmän studieplan för utbildning på forskarnivå i molekylärbiologi

Att göra ett examensarbete

Betygskriterier för kursen Zoologisk systematik 15 hp ht 2015

Använda kunskaper i biologi för att granska information, kommunicera och ta ställning i frågor som rör hälsa, naturbruk och ekologisk hållbarhet.

Svampar - det du behöver veta om svamp... och lite till...

Ramböll Sverige AB Kävlinge Erik Hedman

DNA-analys av spillning NRM

Bottenfaunaundersökning norr om Esterön och i inseglingsleden till l{orrköpings hamn 2013

EUROPEISKA KOMMISSIONEN

Sälens matvanor kartläggs

BIMA46, Biomedicin: Molekylär cellbiologi, 10 högskolepoäng Biomedicine: Molecular Cell Biology, 10 credits Grundnivå / First Cycle

Kopplingar till kursplaner för grundskolan

Mosaic ramverk för naturvärdesbedömning i marin miljö

Kort introduktion till bibliometri samt huvuddragen i den norska modellen. Per Ahlgren

Innehåll Sammanfattning...sid. 2

NÅGON man tycker mycket om HAR DÖTT

Fortsättning av en bibliometrisk studie för jämförelse mellan LTU och vissa andra europeiska universitet

Erik Persson, 10 sept Det gröna kulturarvet

Transkript:

FORSKNINGSRAPPORT FRÅN SVENSKA ARTPROJEKTET Projektperiod: 2006 2009 Erika Norlinder Instutitionen för Biologi och Miljövetenskap, Göteborgs Universitet HAVSBORSTMASKAR: Taxonomi och fylogeni hos fjällborstmaskar (Annelida: Polychaeta: Aphroditiformia) Introduktion Aphroditiforma polychaeter är en stor grupp havsborstmaskar som finns i havets alla biotoper. Det svenska namnet, fjällborstmaskar, syftar på de fjäll (elytror) som täcker ryggen. Man kan hitta dem från tidvattenzonen till de stora havsdjupen. Gruppen består av omkring 1100 arter som är indelade i över 200 släkten som traditionellt är indelade i sex familjer: Acoetidae, Aphroditidae, Eulepetidae, Pholoidae, Pholoididae, Polynoidae och Sigalionidae. Vid projektets start var kunskapen om gruppen undermålig, och vi visste mycket lite om dess basala släktskap. Projektets upplägg var att göra ett släktträd för hela Aphroditiformia med hjälp av morfologiska och genetiska studier för att kunna lösa upp frågetecken kring detta. Inom ramen för projektet har även ett mer specifikt taxonomiskt problem avhandlats: En återbeskrivning av Bylgides sarsi (Kinberg in Malmgren, 1865) har gjorts med hjälp av ursprungsmaterial från Östersjön och insamlat nytt material från samma lokal. Harmothoe imbricata (Linné, 1767) är en vanligt förekommande fjällborstmask längs svenska västkusten. Den anses förekomma i flera olika färgvarianter. Detta är ovanligt hos havsbortsmaskar, och i avsaknad av genetiska studier på denna art fanns möjligheten att den kunde omfatta flera kryptiska arter. Vi undersökte detta med hjälp av exemplar av Harmothoe imbricata med olika färger insamlade i Sverige, Norge och Svalbard. Användandet av genetiska studier för att lösa taxonomiska bekymmer är standard idag. Det ställer i sin tur höga krav på att det finns verifiering (s.k. vouchers, beläggexemplar) av de organismer man jobbar med. En voucher gör att andra forskare kan verifiera den taxonomiska identiteten som författaren använt för en studie. Vouchern ska finnas tillgänglig på en allmän institution så som ett museum. Material och metoder De morfologiska studierna utfördes på levande material som undersöktes i mikroskop. Insamling av arter har utförts i Sverige, Norge, Storbritannien och Papua Nya Guinea.

Den fylogenetiska studien inkluderade 56 taxa. De genetiska studierna genomfördes genom sekvensering av olika gener (18s rdna, 28s rdna, CO1 och 16S rdna), och vi använde oss av 24 morfologiska karaktärer. Data analyserades med hjälp av parsimoni, maximum likelihood och Bayesiansk inferens. I studien av Harmothoe imbricata användes mikroskopiering, fotografering och genetisk analys av två genetiska markörer, en mitokondriell (CO1) och en nukleär (ITS1 5.8SrDNA ITS2) på 57 individer som representerade 10 olika färger insamlade från Svalbard, Norge och Sverige. En analys av ett haplotypnätverk utfördes. Arbetet med betydelsen av vouchers baserades på litteratur och sökning på GenBank för att undersöka hur ofta vouchers deponerats under ett år i tidskriften Molecular Phylogenetics and Evolution. Resultat Resultaten från den fylogenetiska studien bekräftar att fjällmaskarna utgör en monofyletisk grupp. De fjällösa pisioniderna och chrysopetaliden Palmyra aurifera Savigny i Lamarck, 1818 hamnar emellertid även de inom fjällmaskarna. Detta har tidigare varit omdiskuterat. I fallet med pisioniderna förklaras förlusten av elytror som en sekundär förlust. I fallet med P. aurifera kan vi inte vara helt säkra. Det finns flera lika parsimoniska förklaringar, och endast förklaringen med förlust av fjäll hos P. aurifera utgör en tydlig synapomorfi för hela fjällmaskgruppen. Fler resultat från den fylogenetiska analysen är att polynoiderna är monofyletiska med acoetiderna som systergrupp. Iphionidae höjs till familjestatus från underfamiljen Iphioninae. En annan underfamilj som elimineras är Harmothoinae som nu behandlas som en junior synonym till Polynoinae. Placeringen av familjerna Pholoidae, Pholoididae, Pisionidae och Sigalionidae har genom historien varit omdiskuterad. Vi kan med vår studie bekräfta att Pholoididae och Pisionidae hamnar inom Sigalionidae, medan Pholoidaes position är mer oklar. Roten på fjällmaskträdet förblir osäker, eftersom Aphroditidae och Eulepethidae är oupplösta systertaxa inom en polytomi med övriga fjällmaskar. I ombeskrivningen av Bylgides sarsi användes resultat från ovanstående analys. I den studien framgår tydligt att Bylgides sarsi bör betraktas som en egen art, skild från dess nära släkting på västkusten Bylgides elegans (Théel, 1879). Den skiljer sig också från de Harmothoe-arter som var med i analysen. Vi kan dock inte vara helt säkra innan vi fått möjlighet att studera typarten för Harmothoe. Den är emellertid svår att få tag på, men dess placering i trädet skulle förtydliga släktestillhörigheten hos Bylgides sarsi. Typlokal och lectotyp bestämdes under arbetet, och voucher har deponerats i Naturhistoriska riksmuseet. Harmothoe imbricata är en färgpolymorf art, baserat på minimum spanning haplotype network från CO1 data. Variationen i ITS-regionen var väldigt begränsad, vilket tyder på att det är en art och inte ett komplex av olika arter. Voucherstudien resulterade i en ny nomenklatur för deponering av vouchers på exempelvis museer. Diskussion Det här projektet har lett till nya insikter i fjällmaskarnas evolution. Resultaten kan utgöra bas för framtida analyser, och det sista ordet är säkerligen inte sagt om fjällmaskarnas fylogeni. För att kunna säkerställa familjen Acoetidaes plats i trädet behöver fler taxa studeras, vilket även gäller för familjerna Aphroditidae och Eulepethidae.

Det är av stor vikt att fortsätta utforska både molekylära och morfologiska data för att få en fördjupad kunskap om den här gruppen. En önskan för framtiden hade varit att göra stora revisioner på fjällmasksgrupper baserat på både molekylära och morfologiska data för att kunna lösa taxonomiska oklarheter. Det skulle vara värdefullt att samla in nytt material från gamla typlokaler och jämföra med gammalt material som finns på museer. Redovisning av insamlat material Det material som har använts i projektet kommer att deponeras på Naturhistoriska riksmuseet och blir därmed offentligt tillgängligt. De sekvenser som har publicerats finns på GenBank med accessionummer i motsvarande publicerade artiklar. Inga nya arter har upptäckts inom projektet. PUBLIKATIONER Norlinder, E., Pleijel, F. Redescription and generic affinity of Bylgides sarsi (Kinberg in Malmgren, 1865), (Polynoidae, Aciculata, Annelida). Manuscript. Norlinder, E., Wiklund, H., Nygren, A., Pleijel, F. 2012. Phylogeny of scaleworms (Aphroditiformia, Annelida), assesed fron 18SrRNA, 28SrRNA 16SrRNA, mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COI), and morphology. Molecular Phylogenetics and Evolution 65: 490 500. Nygren, A., Norlinder, E., Panova, M., Pleijel, F. 2011. Colour polymorphism in the polychaete Harmothoe imbricata (Linnaeus, 1767). Marine Biology Research 7: 54 62. Pleijel, F., Jondelius, U., Norlinder, E., Nygren, A., Oxelman, B., Schander, C., Sundberg, P., Thollesson, M., 2008. Phylogenies without roots? A plea for the use of vouchers in molecular phylogenetic studies. Molecular Phylogenetics and Evolution 48: 369 371. Doktorsavhandling Scale-worm systematics (Annelida, Polychaeta). Erika Norlinder Instutitionen för Biologi och Miljövetenskap Göteborgs Universitet Avhandlingen försvarades och godkändes 2013-03-03. Sammanfattning av doktorsavhandlingen Artikel I Fjällmaskar utgör en grupp segmenterade marina maskar. De finns i alla marina bentiska habitat, från strandkanten ner till de stora havsdjupen. Gruppen innefattar ungefär 1200 arter indelade i över 200 släkten. Släktskapet inom gruppen fjällmaskar, har varit näst intill okänt. Den här studien belyser den släktskapen. 56 fjällmaskstaxa inklusive åtta utgruppstaxa inkluderades i analysen som använde både nukleära markörer (18SrRNA, 28SrRNA), mitokondriella markörer (16SrRNA, COI) och 24 morfologiska karaktärer. Data analyserades med hjälp av Bayesiansk analys, maximum likelihood och parsimoni, både separat och kombinerade. Analyserna visar att fjällmaskarna utgör en monofyletisk grupp. Även några taxa utan fjäll (elytror) hör hemma inom fjällmaskgruppen, nämligen pisionider och Palmyra aurifera Savigny in Lamarck, 1818. Avsaknad av fjäll inom pisioniderna grundas på en sekundär förlust av denna egenskap. När det gäller P. aurifera är detta emellertid oklart. Resultaten från studien föranleder en del taxonomiska ändringar på familje- och underfamiljsnivå.

Artikel II Mer taxonomi behandlas i en återbeskrivning av Bylgides sarsi (Kinberg in Malmgren, 1865). Den baseras på syntyper och nytt material från Östersjön och resultat från släktskapsträdet i artikel I. Artikel III Harmothoe imbricata (Linnaeus, 1767) har rapporterats vara färgpolymorf. Tills nu har inga genetiska studier genomförts för att ge stöd för detta, vilket gör att det skulle kunna röra sig om ett komplex av kryptiska arter. 57 individer med 10 olika färgmorfer från Svalbard, Norge och Sverige användes i en molekylär analys med två markörer (COI and ITS1 5.8SrRNA TIS2). Denna studie bekräftade att H. imbricata är färgpolymorf. Den skillnad i allelfrekvens som upptäcktes, kunde förklaras av geografiska avstånd. Artikel IV I systematisk forskning är det av stor vikt att deponera vouchers (beläggexemplar) av exemplar man studerat. Det gör att andra forskare kan verifiera den taxonomiska identiteten som författaren använt i en studie. En voucher kan bestå av arter, underarter, lokala populationer eller cellkulturer. En terminologi läggs fram som ska framhålla värdet på den taxonomiska verifieringen med avseende på genetiska data i form av sekvenser, kopplade till beläggexemplar. Rapport granskad och godkänd: 2016-12-07

Färgpolymorfi hos bandfjällmask Harmothoe imbricata från svenska västkusten. Foton: Fredrik Pleijel