Clostridioides (tidigare Clostridium) difficile rapport Veckovis sammanställning av den frivilliga laboratorierapporteringen av Clostridioides difficile Barbro Mäkitalo och Kristina Rizzardi 19-1-3
Clostridioides (tidigare Clostridium) difficile rapport, vecka 39 (23/9-29/9), 19 Rapport om det aktuella bakterieläget Redaktör: Barbro Mäkitalo Den frivilliga laboratorierapporteringen har pågått sedan i oktober 9 och infördes för att följa utvecklingen och underlätta upptäckt av utbrott av C. difficile i Sverige. De inrapporterade siffrorna ska främst ligga till grund för analys av förändringar inom respektive laboratoriums upptagningsområde och är inte avsedda för jämförelse mellan de olika laboratorierna. Varje vecka sammanställs data från den frivilliga rapporteringen av C. difficile. Sedan oktober 11 deltar samtliga 26 laboratorier i den frivilliga rapporteringen av C. difficile. De mikrobiologiska laboratorierna i Kronoberg och Blekinge har gått ihop under 11 och fr.o.m. 12 rapporterar Växjö för båda laboratorierna. I följande blad åskådliggörs hur utvecklingen av antal nydiagnosticerade C. difficile-fall varierar per vecka. För att ett prov positivt för C. difficile-toxin ska anses vara ett nydiagnostiserat fall ska minst åtta veckor förflutit sedan föregående positiva prov. Därefter följer ett blad som visar utvecklingen av antalet nydiagnostiserade C. difficile-fall de senaste 2 veckorna för vart och ett av de rapporterande laboratorierna. En trendlinje visar ett glidande medelvärde över tre veckor. Sist visas sammanställningar i tabellform. Siffrorna från de senaste två veckorna bör tolkas med försiktighet eftersom information kan saknas från vissa laboratorier då rapporten sammanställs. Solna Folkhälsomyndigheten, SE-171 82 Solna. Besök: Nobels väg 18. Östersund Folkhälsomyndigheten, SE-831 4 Östersund. Besök: Forskarens väg 3. Telefon 1- E-post info@folkhalsomyndigheten.se www.folkhalsomyndigheten.se
C. difficile-fall per vecka 24 2 Glidande medelvärde 18 Glidande medelvärde 19 Totalt antal fall 18 16 14 1 1 8 6 4 1 1 3 4 4 Vecka 19
3 1 Aleris Medilab 4 49 7 17 27 37 3 1 Borås 4 49 7 17 27 37 3 1 Eskilstuna 4 49 7 17 27 37 3 1 Falun 4 49 7 17 27 37 3 1 Gävle 4 49 7 17 27 37 3 1 Göteborg 4 49 7 17 27 37 3 1 Halmstad 4 49 7 17 27 37 3 1 Jönköping 4 49 7 17 27 37 3 1 Kalmar 4 49 7 17 27 37 3 1 Karlstad 4 49 7 17 27 37 3 1 Karolinska 4 49 7 17 27 37 3 1 Linköping 4 49 7 17 27 37 3 1 Skåne 4 49 7 17 27 37 3 1 Skövde 4 49 7 17 27 37 3 1 Stockholm/Unilabs 4 49 7 17 27 37 3 1 Sunderby 4 49 7 17 27 37 3 1 Sundsvall 4 49 7 17 27 37 3 1 Trollhättan 4 49 7 17 27 37 3 1 Umeå 4 49 7 17 27 37 3 1 Uppsala 4 49 7 17 27 37 3 1 Visby 4 49 7 17 27 37 Vecka år 18/19 3 1 Västerås 4 49 7 17 27 37 Vecka år 18/19 3 1 Växjö/Karlskrona 4 49 7 17 27 37 Vecka år 18/19 3 1 Örebro 4 49 7 17 27 37 Vecka år 18/19 3 1 Östersund 4 49 7 17 27 37 Vecka år 18/19 Glidande medelvärde 17/18 Glidande medelvärde 18/19
C. difficilerapport vecka 39, 19 Fördelning av fall sker efter ankomstdatum för prov Antal positiva fynd av C. difficile Laboratorium 1 2 3 4 6 7 8 9 1 11 12 13 14 16 17 18 19 21 22 23 24 26 27 28 29 3 31 32 33 34 36 37 38 39 Totalt Aleris Medilab 1 4 7 2 2 1 3 1 1 1 3 2 4 2 3 1 2 1 1 1 2 2 1 48 Borås klinisk mikrobiologi 3 1 6 3 8 3 4 6 2 3 1 1 8 4 4 6 6 4 1 8 4 2 3 6 3 4 7 8 3 4 2 3 6 6 4 4 3 2 174 Eskilstuna/Unilabs 2 3 4 4 7 2 2 3 2 3 6 2 3 4 2 1 4 3 2 2 7 3 4 6 2 3 7 3 8 12 7 8 3 6 16 Falun klinisk mikrobiologi 4 4 9 3 2 7 4 1 4 2 2 4 2 2 3 2 2 6 7 3 3 2 3 2 3 3 3 2 3 1 3 1 3 6 6 132 Gävle klinisk mikrobiologi 2 1 8 7 7 7 7 6 8 9 6 7 6 4 8 7 8 7 6 6 7 6 4 8 6 6 6 4 6 8 6 11 4 6 249 Göteborg, Sahlgrenska klinisk mikrobiologi 13 8 12 12 1 17 13 14 11 11 16 9 12 8 8 1 11 9 9 12 12 13 1 1 1 12 12 11 11 8 1 1 6 6 12 7 4 Halmstad klinisk mikrobiologi 2 3 6 8 8 3 6 6 2 4 4 2 2 4 3 2 4 3 6 3 7 3 6 1 6 2 3 8 2 4 2 Jönköping klinisk mikrobiologi 3 1 4 2 1 3 6 1 1 4 8 4 4 2 2 2 4 4 7 1 8 9 1 4 2 4 1 4 4 4 129 Kalmar, klinisk mikrobiologi 2 3 6 2 1 1 1 2 1 4 2 2 3 4 2 4 1 4 1 2 4 1 2 2 4 2 2 3 3 2 3 3 1 4 1 8 Karlstad klinisk mikrobiologi 4 8 3 7 3 4 3 3 3 6 6 6 6 2 6 4 1 8 3 7 4 7 1 4 6 2 8 7 3 7 6 8 1 4 4 6 6 196 Karolinska Universitetslaboratoriet 36 26 14 31 27 3 26 21 22 21 29 22 29 21 18 27 24 22 24 23 17 19 26 22 27 36 32 32 26 24 964 Linköping klinisk mikrobiologi 4 9 3 6 11 3 14 11 9 11 7 4 6 12 8 14 3 3 7 11 6 8 6 1 6 7 7 8 4 6 3 6 16 12 36 Malmö, MAS klinisk mikrobiologi 23 33 27 24 28 27 28 17 28 34 42 23 22 17 24 24 34 34 23 23 24 29 31 28 22 22 26 24 32 24 31 38 33 38 36 183 Skövde/Unilabs 4 3 1 3 3 4 3 9 3 4 2 7 4 3 2 6 3 2 1 6 2 4 4 6 6 4 3 4 6 3 7 171 Sunderby klinisk mikrobiologi 7 3 8 4 6 6 1 2 7 2 1 4 3 14 8 6 8 8 8 7 4 2 8 4 6 7 2 1 7 9 9 23 Stockholm/Unilabs 3 8 6 1 2 Sundsvall klinisk mikrobiologi 7 4 1 9 2 3 9 7 3 4 3 4 2 4 7 6 3 7 3 6 3 3 1 3 1 2 1 7 1 3 168 Trollhättan klinisk mikrobiologi 2 7 1 4 6 3 3 4 8 8 8 3 9 6 2 7 9 2 7 1 6 6 4 2 4 3 3 3 2 2 17 Umeå klinisk mikrobiologi 8 4 3 3 3 4 3 8 2 8 2 3 1 4 4 2 1 2 4 2 4 1 3 11 2 3 3 3 3 7 2 4 147 Uppsala klinisk mikrobiologi 1 9 6 8 1 6 7 1 8 6 1 6 8 8 6 3 1 9 1 3 4 7 4 8 7 8 9 6 8 1 6 1 249 Visby klinisk mikrobiologi 3 4 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 2 2 1 1 3 4 4 2 2 2 2 2 1 1 3 4 1 3 62 Västerås klinisk mikrobiologi 1 1 2 1 2 1 2 2 1 3 2 2 4 3 3 1 1 2 9 1 3 1 4 3 6 3 2 91 Växjö/Karskrona klinisk mikrobiologi 4 9 4 8 7 4 8 9 7 8 6 13 7 8 9 4 7 2 8 8 4 2 9 6 3 8 6 4 7 6 7 7 11 Örebro klinisk mikrobiologi 4 4 4 4 3 1 3 1 4 6 9 11 3 3 8 4 7 7 6 3 7 1 4 3 6 1 8 9 11 2 1 Östersund klinisk mikrobiologi 3 2 1 2 3 4 2 4 1 2 1 2 1 3 1 2 1 2 1 2 1 3 4 Totalt 119 194 6 14 161 146 168 149 144 9 171 4 149 136 166 143 131 4 14 141 134 146 143 1 138 161 3 136 142 149 3 144 18 171 147 181 4 919 Antal nydiagnostiserade fall av C.difficile* Laboratorium 1 2 3 4 6 7 8 9 1 11 12 13 14 16 17 18 19 21 22 23 24 26 27 28 29 3 31 32 33 34 36 37 38 39 Totalt Varav uppgift saknas Aleris Medilab 1 4 3 2 2 3 1 1 2 3 2 2 1 2 1 1 2 2 1 36 Borås klinisk mikrobiologi 2 9 4 3 3 1 4 1 2 1 9 4 3 4 4 3 4 4 2 1 6 3 3 7 6 3 4 2 2 4 4 2 3 2 2 131 Eskilstuna/Unilabs 2 2 3 4 6 4 4 2 4 2 4 3 1 4 2 3 4 2 1 4 1 2 2 7 3 3 4 1 3 4 1 6 8 7 8 1 6 133 3 Falun klinisk mikrobiologi 3 4 7 2 2 4 2 3 1 3 2 2 2 2 2 3 3 2 2 6 2 3 2 3 2 3 2 3 2 2 1 1 1 3 3 6 16 Gävle klinisk mikrobiologi 1 7 7 6 7 6 7 6 3 4 1 6 4 6 4 2 3 3 3 4 4 4 2 4 6 6 8 2 3 3 177 Göteborg, Sahlgrenska klinisk mikrobiologi 11 6 9 7 7 11 1 1 6 9 1 7 8 7 3 8 11 1 11 8 8 9 9 7 1 13 6 8 8 3 1 3 13 Halmstad klinisk mikrobiologi 2 3 6 4 2 3 6 6 2 4 4 2 2 4 3 2 4 2 4 2 7 3 1 2 3 8 2 4 2 139 Jönköping klinisk mikrobiologi 3 1 4 2 1 3 6 1 1 4 8 4 4 2 2 2 4 4 7 1 8 9 1 4 2 4 1 4 4 4 129 Kalmar, klinisk mikrobiologi 2 3 6 2 1 1 1 2 1 4 2 2 2 4 2 3 1 4 2 4 1 2 2 4 2 2 3 3 2 3 3 1 4 1 82 49 Karlstad klinisk mikrobiologi 4 2 6 3 1 3 3 2 3 3 3 6 2 4 4 7 2 2 4 1 3 2 3 3 4 6 6 2 2 2 138 Karolinska Universitetslaboratoriet 9 3 17 1 21 22 13 18 14 18 17 22 18 23 17 12 18 17 18 19 18 11 18 14 22 17 17 18 28 22 26 21 17 21 19 727 1 Linköping klinisk mikrobiologi 4 3 3 3 9 3 13 1 12 6 9 4 4 4 11 11 7 4 8 3 1 3 3 3 9 4 7 3 1 4 3 4 12 9 222 Malmö, MAS klinisk mikrobiologi 17 26 24 19 21 21 23 31 16 16 13 14 21 26 14 19 18 16 23 24 21 16 21 18 27 27 24 28 33 837 74 Skövde/Unilabs 2 2 6 2 2 3 4 2 8 2 4 2 7 4 4 4 2 4 2 4 2 1 4 1 4 3 4 3 3 3 4 6 3 7 4 137 14 Sunderby klinisk mikrobiologi 7 3 8 4 6 6 1 2 7 2 1 4 3 14 8 6 8 8 8 7 4 2 8 4 6 7 2 1 7 9 9 23 1 Stockholm/Unilabs 3 8 6 1 2 18 Sundsvall klinisk mikrobiologi 4 4 1 2 2 4 4 3 2 3 3 2 2 3 6 1 2 4 2 4 1 1 1 3 2 1 8 1 3 2 111 Trollhättan klinisk mikrobiologi 2 7 1 4 2 3 3 4 4 6 6 3 8 2 6 2 4 3 3 6 1 1 4 4 2 2 1 3 2 2 2 123 24 Umeå klinisk mikrobiologi 7 3 3 3 4 3 4 7 1 8 2 3 1 4 4 2 1 2 4 4 2 4 3 6 4 2 3 1 2 3 7 2 2 4 1 Uppsala klinisk mikrobiologi 7 4 8 1 3 1 8 6 9 4 8 8 4 3 9 4 1 1 4 7 2 2 6 6 7 4 8 3 2 7 1 1 2 1 Visby klinisk mikrobiologi 3 3 2 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 3 1 3 1 2 2 1 2 1 1 4 1 3 Västerås klinisk mikrobiologi 1 1 2 1 2 1 2 2 1 3 2 2 3 3 3 1 2 9 1 4 3 3 1 2 4 1 4 1 7 Växjö/Karlskrona klinisk mikrobiologi 4 3 4 6 6 4 6 7 7 4 6 6 4 4 1 6 3 4 3 3 4 4 4 6 6 4 6 9 184 4 Örebro klinisk mikrobiologi 1 3 3 4 3 2 4 3 7 2 1 4 4 8 8 2 4 3 4 2 3 3 2 6 3 3 3 6 1 4 7 7 8 2 Östersund klinisk mikrobiologi 2 2 1 2 3 1 2 1 1 1 2 1 3 2 1 1 1 1 1 1 4 39 Totalt 92 4 123 119 123 18 1 1 118 112 128 13 114 1 111 123 1 11 114 17 12 18 114 18 19 123 18 122 1 19 1 111 113 111 14 138 114 131 463 216 *Ett nytt fall definieras som en person med ett avföringsprov posivit för C. difficile där det ska ha förflutit minst 8 veckor mellan positivt prov från samma patient. I ovanstående tabell inkluderas även de positiva fynd där falldefinitionsfrågan har lämnats obesvarad eller besvarats med "uppgift saknas".
Har patienten tidigare lämnat positivt prov de senaste 8 veckorna (av totalt antal positiva fynd) 1 2 3 4 6 7 8 9 1 11 12 13 14 16 17 18 19 21 22 23 24 26 27 28 29 3 31 32 33 34 36 37 38 39 Totalt J 27 4 33 26 38 38 43 29 37 32 31 41 4 29 43 23 3 4 33 39 26 36 38 34 28 3 39 38 27 27 38 4 33 4 33 33 31 23 1316 N 86 137 12 11 119 17 123 116 11 14 127 1 112 116 1 14 94 111 11 13 112 16 16 117 16 117 18 18 113 11 19 19 136 128 18 143 123 4387 Uppgiften saknas 3 8 8 2 4 1 2 2 1 2 1 1 2 2 3 1 2 1 46 Fält ej ifyllt 3 9 13 9 4 1 4 4 8 3 2 2 6 2 16 7 1 1 1 2 2 3 2 3 1 2 7 4 2 3 1 6 7 17 Totalt 119 194 6 14 161 146 168 149 144 9 171 4 149 136 166 143 131 4 14 141 134 146 143 1 138 161 3 136 142 149 3 144 18 171 147 181 4 919 Kön (av totalt antal positiva fynd) 1 2 3 4 6 7 8 9 1 11 12 13 14 16 17 18 19 21 22 23 24 26 27 28 29 3 31 32 33 34 36 37 38 39 Totalt Kvinna 63 94 82 72 84 73 82 7 88 72 88 91 78 73 67 96 7 69 79 71 72 78 81 69 7 8 72 87 8 7 77 79 8 76 92 92 82 98 81 313 Man 6 1 74 73 77 73 86 74 67 72 71 8 76 76 69 7 68 62 7 69 69 6 69 76 73 66 66 74 73 61 6 7 68 68 93 79 6 83 73 28 Uppgiften saknas 1 1 Totalt 119 194 6 14 161 146 168 149 144 9 171 4 149 136 166 143 131 4 14 141 134 146 143 1 138 161 3 136 142 149 3 144 18 171 147 181 4 919 Resultat av analys (av totalt antal positiva fynd) 1 2 3 4 6 7 8 9 1 11 12 13 14 16 17 18 19 21 22 23 24 26 27 28 29 3 31 32 33 34 36 37 38 39 Totalt Direktpositiv toxintest på feces 97 6 122 17 1 116 139 118 137 17 121 1 119 122 11 124 113 8 119 17 114 16 1 112 119 16 123 18 11 111 117 1 118 138 123 18 148 13 461 Direktpositiv toxintest på feces, Toxinpositiv från framodlad stam 1 9 8 2 9 6 8 9 6 1 3 7 8 6 3 1 9 7 1 6 2 3 1 6 6 11 9 4 3 8 8 6 1 2 Toxinpositiv från framodlad stam 11 9 12 12 18 13 14 1 1 13 18 12 6 13 18 1 18 14 9 11 16 8 12 11 17 14 1 13 19 9 Fält ej ifyllt 1 17 18 21 8 9 13 8 14 16 17 8 12 21 14 16 8 16 8 9 1 17 1 19 12 24 22 6 11 11 11 16 27 27 16 8 14 9 Totalt 119 194 6 14 161 146 168 149 144 9 171 4 149 136 166 143 131 4 14 141 134 146 143 1 138 161 3 136 142 149 3 144 18 171 147 181 4 919