Clostridium difficile rapport

Clostridium difficile rapport Veckovis sammanställning av den frivilliga laboratorierapporteringen av Clostridium difficile Barbro Mäkitalo och Kristina Rizzardi 18-12-6

Clostridium difficile rapport, vecka 48 (26/11-2/12), 18 Rapport om det aktuella bakterieläget Redaktör: Barbro Mäkitalo Den frivilliga laboratorierapporteringen har pågått sedan i oktober 9 och infördes för att följa utvecklingen och underlätta upptäckt av utbrott av Clostridium difficile i Sverige. De inrapporterade siffrorna ska främst ligga till grund för analys av förändringar inom respektive laboratoriums upptagningsområde och är inte avsedda för jämförelse mellan de olika laboratorierna. Varje vecka sammanställs data från den frivilliga rapporteringen av C. difficile. Sedan oktober 11 deltar samtliga 26 laboratorier i den frivilliga rapporteringen av C. difficile. De mikrobiologiska laboratorierna i Kronoberg och Blekinge har gått ihop under 11 och fr.o.m. 12 rapporterar Växjö för båda laboratorierna. I följande blad åskådliggörs hur utvecklingen av antal nydiagnosticerade C. difficile-fall varierar per vecka. För att ett prov positivt för C. difficile-toxin ska anses vara ett nydiagnostiserat fall ska minst åtta veckor förflutit sedan föregående positiva prov. Därefter följer ett blad som visar utvecklingen av antalet nydiagnostiserade C. difficile-fall de senaste 2 veckorna för vart och ett av de rapporterande laboratorierna. En trendlinje visar ett glidande medelvärde över tre veckor. Sist visas sammanställningar i tabellform. Siffrorna från de senaste två veckorna bör tolkas med försiktighet eftersom information kan saknas från vissa laboratorier då rapporten sammanställs. Solna Folkhälsomyndigheten, SE-171 82 Solna. Besök: Nobels väg 18. Östersund Folkhälsomyndigheten, SE-831 4 Östersund. Besök: Forskarens väg 3. Telefon 1- E-post info@folkhalsomyndigheten.se www.folkhalsomyndigheten.se

C. difficile-fall per vecka 24 2 Glidande medelvärde 17 Glidande medelvärde 18 Totalt antal fall 18 16 14 1 1 8 6 4 1 1 3 4 4 Vecka 17

3 1 Aleris Medilab 3 1 Borås 3 1 Eskilstuna 3 1 Falun 3 1 Gävle 3 1 Göteborg 3 1 Halmstad 3 1 Jönköping 3 1 Kalmar 3 1 Karlstad 3 1 Karolinska 3 1 Linköping 3 1 Skåne 3 1 Skövde 3 1 Stockholm/Unilabs 3 1 Sunderby 3 1 Sundsvall 3 1 Trollhättan 3 1 Umeå 3 1 Uppsala 3 1 Visby Vecka år 17/18 3 1 Västerås Vecka år 17/18 3 1 Växjö/Karlskrona Vecka år 17/18 3 1 Örebro Vecka år 17/18 3 1 Östersund Vecka år 17/18 Glidande medelvärde 16/17 Glidande medelvärde 17/18

C. difficile rapport vecka 48, 18 Fördelning av fall sker efter ankomstdatum för prov Antal positiva fynd av C. difficile Vecka 18 Laboratorium 1 2 3 4 6 7 8 9 1 11 12 13 14 16 17 18 19 21 22 23 24 26 27 28 29 3 31 32 33 34 36 37 38 39 4 41 42 43 44 4 46 47 48 Totalt Aleris Medilab 1 2 1 4 1 4 4 2 3 3 2 1 4 1 2 4 4 1 2 2 1 2 1 2 1 2 3 2 3 3 1 2 2 6 1 1 4 1 2 2 4 94 Borås klinisk mikrobiologi 3 3 2 1 2 4 4 1 1 4 4 3 2 4 4 6 3 7 11 4 2 3 6 1 3 4 8 4 3 7 3 11 3 1 3 6 7 178 Eskilstuna/Unilabs 1 4 6 7 6 9 8 6 4 3 6 7 4 7 11 8 4 3 3 7 1 2 6 1 4 2 4 7 2 8 7 6 4 7 6 8 3 9 8 3 7 6 282 Falun klinisk mikrobiologi 4 2 4 3 3 6 6 6 3 2 6 6 6 4 4 6 6 6 1 8 7 4 8 7 3 2 3 2 1 2 2 1 4 4 4 8 4 4 7 1 3 6 6 6 2 Gävle klinisk mikrobiologi 8 7 11 6 8 3 4 3 11 7 1 3 13 21 11 11 6 9 4 8 1 4 11 8 3 6 8 4 8 7 6 9 9 11 4 7 9 6 3 324 Göteborg, Sahlgrenska klinisk mikrobiologi 16 1 11 1 14 8 12 1 7 1 1 17 9 11 16 1 9 6 11 1 13 11 12 11 13 1 9 7 18 11 1 13 1 12 8 16 14 7 8 12 14 8 9 43 Halmstad klinisk mikrobiologi 4 4 6 7 2 6 3 2 6 3 1 6 3 2 6 4 3 3 3 2 3 4 9 4 7 4 3 4 7 6 3 3 2 4 3 2 194 Jönköping klinisk mikrobiologi 3 8 7 8 8 12 19 12 4 6 8 6 12 6 7 4 1 6 8 8 7 4 3 1 13 6 9 2 7 1 1 1 4 2 4 6 2 8 3 289 Kalmar, klinisk mikrobiologi 1 4 1 2 2 1 4 1 2 1 2 3 2 1 1 2 2 1 1 4 1 2 4 4 1 2 1 1 1 2 1 7 3 1 2 3 3 1 1 1 1 3 94 Karlstad klinisk mikrobiologi 8 2 3 3 4 4 7 4 3 4 6 3 11 3 4 4 9 7 4 6 3 3 3 2 2 3 4 3 6 2 4 4 12 6 6 4 4 4 4 3 2 218 Karolinska Universitetslaboratoriet 32 24 18 27 26 23 24 28 18 27 34 27 26 24 33 28 13 31 16 21 21 13 24 3 24 22 21 24 31 28 22 34 29 21 24 29 38 37 1177 Linköping klinisk mikrobiologi 1 9 16 13 13 12 16 7 11 11 7 21 16 12 19 13 17 3 6 12 9 18 12 8 13 13 8 7 11 1 9 7 12 7 11 7 6 12 1 8 11 7 13 6 6 Malmö, MAS klinisk mikrobiologi 29 31 23 23 27 22 26 28 29 21 23 33 28 26 3 37 28 16 21 17 21 24 24 24 23 26 19 29 21 18 28 38 18 28 26 24 19 18 21 29 16 1177 Skövde/Unilabs 4 12 8 4 8 8 4 8 6 8 7 4 4 2 1 3 9 7 8 9 3 4 6 6 3 9 6 9 6 3 4 2 8 7 8 3 6 11 9 8 299 Sunderby klinisk mikrobiologi 7 9 8 7 9 4 6 4 6 7 4 4 9 9 2 7 6 4 7 7 4 4 4 1 6 7 4 4 7 1 3 8 4 3 4 4 4 6 6 9 8 262 Stockholm/Unilabs 6 9 6 4 4 1 3 2 1 3 1 1 2 4 6 4 6 6 3 3 3 1 13 9 9 1 4 9 2 7 2 2 2 164 Sundsvall klinisk mikrobiologi 1 4 1 6 2 6 9 7 9 3 2 9 6 6 7 8 1 2 7 6 3 2 7 6 3 7 2 6 2 7 6 3 8 2 4 8 7 4 9 8 273 Trollhättan klinisk mikrobiologi 3 2 3 4 3 2 3 2 3 4 2 4 2 1 7 6 4 1 1 3 4 3 4 3 4 1 4 8 2 2 4 6 2 6 8 8 9 1 3 3 3 183 Umeå klinisk mikrobiologi 2 7 7 4 4 7 1 3 6 4 6 4 4 3 4 6 3 6 9 4 7 3 2 3 4 3 2 1 3 8 8 2 8 8 8 4 6 4 223 Uppsala klinisk mikrobiologi 1 3 3 1 6 7 8 9 9 6 4 6 1 3 7 8 3 12 6 8 7 11 6 3 4 3 9 7 7 11 7 8 4 6 3 6 4 1 9 6 7 11 14 6 8 7 34 Visby klinisk mikrobiologi 1 1 2 1 2 1 1 1 3 1 1 3 1 1 1 1 2 1 1 1 3 2 4 1 1 2 4 Västerås klinisk mikrobiologi 3 1 1 1 2 3 1 1 4 3 1 1 3 3 1 1 1 2 2 2 1 3 4 1 3 3 2 1 4 3 2 1 1 3 3 2 3 2 89 Växjö/Karskrona klinisk mikrobiologi 6 11 11 2 13 1 9 9 1 3 1 8 9 8 7 7 3 4 6 11 1 11 6 12 6 9 4 6 4 9 9 12 1 7 9 7 13 11 1 7 9 6 7 7 1 7 39 Örebro klinisk mikrobiologi 6 6 3 6 11 1 7 9 3 4 9 3 1 4 3 1 3 6 6 6 8 3 8 4 3 8 4 4 8 4 3 4 7 8 11 8 2 4 4 27 Östersund klinisk mikrobiologi 1 2 3 2 1 3 6 7 1 2 2 1 1 2 3 2 4 1 2 4 2 2 2 3 2 1 6 2 1 1 3 3 4 4 2 2 2 1 113 Totalt 173 182 167 168 166 177 18 167 167 169 187 174 161 19 167 189 173 132 171 149 181 168 127 174 147 143 147 19 167 17 167 6 8 16 21 184 166 169 192 4 146 17 169 142 79 Antal nydiagnostiserade fall av C.difficile * Vecka 18 Laboratorium 1 2 3 4 6 7 8 9 1 11 12 13 14 16 17 18 19 21 22 23 24 26 27 28 29 3 31 32 33 34 36 37 38 39 4 41 42 43 44 4 46 47 48 Totalt Varav uppgift saknas Aleris Medilab 1 1 1 4 1 3 4 2 2 3 2 1 4 2 3 4 1 2 2 1 2 1 1 1 1 2 1 3 3 2 2 1 1 4 1 2 2 3 82 1 Borås klinisk mikrobiologi 3 2 1 1 4 2 4 3 1 4 3 1 4 4 2 3 7 2 4 2 1 2 1 2 3 4 6 1 2 2 6 3 3 6 124 Eskilstuna/Unilabs 8 4 2 3 3 4 7 6 4 3 1 3 2 4 8 3 2 2 6 7 1 4 8 2 3 2 4 2 7 6 4 3 4 1 4 1 7 4 199 1 Falun klinisk mikrobiologi 1 2 3 2 2 6 6 4 2 1 4 4 2 4 3 4 3 1 1 8 4 4 7 4 3 2 3 2 1 2 4 3 2 4 3 4 2 2 2 4 1 2 4 4 6 Gävle klinisk mikrobiologi 6 6 2 7 6 3 4 2 2 7 1 1 9 1 3 9 4 6 2 7 1 4 4 3 4 4 4 4 1 3 3 6 3 4 8 7 2 4 6 2 224 Göteborg, Sahlgrenska klinisk mikrobiologi 13 6 7 7 13 6 8 9 6 13 8 6 14 7 11 6 7 11 4 7 9 9 9 7 11 9 8 4 4 3 14 9 8 9 4 6 7 11 9 6 14 8 1 7 384 9 Halmstad klinisk mikrobiologi 4 4 6 7 2 3 4 4 3 2 6 3 4 1 3 3 2 6 4 3 3 3 2 3 2 4 8 4 6 4 3 3 4 6 3 3 2 4 3 2 176 Jönköping klinisk mikrobiologi 3 8 7 8 8 12 19 12 4 6 8 6 12 6 7 4 1 6 8 8 7 4 3 1 13 6 9 2 7 1 1 1 4 2 4 6 2 8 3 289 18 Kalmar, klinisk mikrobiologi 1 4 4 2 2 1 4 1 2 1 2 3 1 1 1 2 2 4 1 1 4 1 1 2 3 1 1 1 1 1 6 2 1 2 1 2 1 1 1 3 76 Karlstad klinisk mikrobiologi 2 3 2 2 3 3 4 4 3 1 3 1 4 2 3 2 6 3 1 4 2 1 3 1 1 2 3 2 6 2 3 3 4 8 3 2 2 4 2 3 3 1 3 3 4 1 Karolinska Universitetslaboratoriet 18 27 17 12 12 24 17 16 17 22 13 24 23 16 11 16 21 18 1 9 18 21 12 18 9 16 14 9 17 21 13 16 16 21 18 23 19 18 23 22 21 3 3 88 23 Linköping klinisk mikrobiologi 7 11 8 13 9 13 7 1 11 17 11 1 8 13 3 3 1 9 8 8 7 11 12 6 6 7 6 7 4 1 6 9 4 3 9 4 7 6 7 3 6 9 6 379 Malmö, MAS klinisk mikrobiologi 27 19 21 14 18 19 12 19 22 1 19 23 21 17 23 23 9 1 11 14 18 16 13 19 18 17 17 12 18 27 11 13 12 27 21 17 13 11 14 21 13 829 61 Skövde/Unilabs 3 7 6 4 4 3 6 1 4 3 8 4 4 4 2 8 2 8 3 6 3 9 2 12 1 4 4 1 3 8 9 3 4 3 3 1 7 6 1 6 9 7 7 223 4 Sunderby klinisk mikrobiologi 7 9 8 7 9 4 6 4 6 7 4 4 9 9 2 7 6 4 7 7 4 4 4 1 6 7 4 4 7 1 3 8 4 3 4 4 4 6 6 9 8 262 Stockholm/Unilabs 6 9 4 6 4 4 1 3 1 1 3 1 1 2 4 6 4 4 6 3 3 3 1 13 9 9 1 4 9 1 7 2 2 2 9 7 Sundsvall klinisk mikrobiologi 8 3 6 3 1 4 6 4 7 2 1 6 4 7 3 4 8 2 2 3 4 3 1 4 2 4 2 3 2 2 2 4 3 2 3 6 3 3 6 4 3 4 2 176 2 Trollhättan klinisk mikrobiologi 2 2 3 3 3 1 1 2 3 4 1 2 2 1 3 1 2 4 2 2 3 3 1 3 6 1 2 2 3 4 3 1 4 8 6 4 4 4 1 1 2 2 137 Umeå klinisk mikrobiologi 2 7 7 4 3 6 1 1 3 6 4 3 4 1 4 3 3 6 9 4 4 6 2 1 3 1 3 2 4 1 3 4 8 7 2 6 7 7 4 3 194 Uppsala klinisk mikrobiologi 1 3 3 1 6 7 8 9 9 6 4 6 1 3 7 8 3 11 4 8 7 11 6 3 4 3 7 6 6 7 4 6 3 4 1 4 6 8 11 3 266 Visby klinisk mikrobiologi 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 3 1 1 1 1 1 1 1 1 3 2 1 1 1 1 34 1 Västerås klinisk mikrobiologi 1 1 1 1 4 2 2 1 1 3 1 1 3 3 1 1 1 2 2 1 3 3 1 2 2 1 1 4 3 2 1 1 2 2 2 68 12 Växjö/Karlskrona klinisk mikrobiologi 4 9 2 1 6 7 8 8 3 6 8 7 4 6 2 4 3 9 8 11 6 1 2 7 3 2 8 6 7 7 6 7 4 4 8 11 8 8 2 4 6 9 4 289 14 Örebro klinisk mikrobiologi 3 6 2 6 9 4 6 4 7 3 2 3 7 2 4 8 3 2 4 2 3 6 8 3 1 2 3 3 7 3 1 2 7 1 8 4 6 3 1 3 2 4 3 191 Östersund klinisk mikrobiologi 1 2 3 2 3 4 3 4 4 1 1 1 2 3 1 2 1 2 4 1 2 2 2 1 1 2 2 2 2 1 3 2 1 78 2 Totalt 133 146 119 122 137 133 134 137 14 1 124 112 148 133 119 148 127 1 131 91 1 118 141 138 12 127 18 19 112 78 1 118 129 133 117 122 116 127 6 1 126 118 137 117 129 13 112 64 34 *Ett nytt fall definieras som en person med ett avföringsprov posivit för C. difficile där det ska ha förflutit minst 8 veckor mellan positivt prov från samma patient. I ovanstående tabell inkluderas även de positiva fynd där falldefinitionsfrågan har lämnats obesvarad eller besvarats med "uppgift saknas".

Har patienten tidigare lämnat positivt prov de senaste 8 veckorna (av totalt antal positiva fynd) Vecka 18 1 2 3 4 6 7 8 9 1 11 12 13 14 16 17 18 19 21 22 23 24 26 27 28 29 3 31 32 33 34 36 37 38 39 4 41 42 43 44 4 46 47 48 Totalt J 4 36 48 33 31 33 43 43 27 32 4 43 39 41 42 47 4 4 42 41 1 31 4 3 47 39 34 31 47 37 41 34 33 34 42 33 4 49 4 1 49 29 41 39 3 191 N 126 131 119 11 13 127 13 1 129 132 1 17 139 123 16 143 112 128 127 83 1 114 139 131 96 1 14 11 13 7 117 117 126 1 111 117 1 121 146 123 121 113 1 12 12 122 123 13 664 Uppgiften saknas 6 9 4 6 4 4 1 7 2 7 2 1 2 13 3 4 2 6 4 7 3 3 3 1 13 9 9 1 4 9 2 8 2 2 3 Fält ej ifyllt 1 6 8 1 2 2 6 2 2 3 2 8 12 3 2 2 1 4 2 2 2 1 1 3 2 1 3 8 3 4 3 1 1 3 4 1 3 1 7 2 7 137 Totalt 173 182 167 168 166 177 18 167 167 169 187 174 161 19 167 189 173 132 171 149 181 168 127 174 147 143 147 19 167 17 167 6 8 16 21 184 166 169 192 4 146 17 169 142 79 Kön (av totalt antal positiva fynd) 1 2 3 4 6 7 8 9 1 11 12 13 14 16 17 18 19 21 22 23 24 26 27 28 29 3 31 32 33 34 36 37 38 39 4 41 42 43 44 4 46 47 48 Totalt Kvinna 11 9 77 84 96 93 83 88 81 78 92 78 94 84 81 98 88 93 8 7 87 78 86 9 73 94 76 73 84 49 83 98 94 91 74 83 83 74 18 91 83 8 13 82 9 83 86 77 489 Man 72 87 9 71 72 73 94 92 8 89 77 77 93 9 8 97 79 96 88 7 84 71 9 73 4 8 71 7 63 6 84 7 76 76 76 73 7 86 12 93 83 84 89 72 6 87 83 6 38 Uppgiften saknas 1 1 Totalt 173 182 167 168 166 177 18 167 167 169 187 174 161 19 167 189 173 132 171 149 181 168 127 174 147 143 147 19 167 17 167 6 8 16 21 184 166 169 192 4 146 17 169 142 79 Resultat av analys (av totalt antal positiva fynd) 1 2 3 4 6 7 8 9 1 11 12 13 14 16 17 18 19 21 22 23 24 26 27 28 29 3 31 32 33 34 36 37 38 39 4 41 42 43 44 4 46 47 48 Totalt Direktpositiv toxintest på feces 136 148 139 1 131 122 129 132 113 129 136 128 2 121 13 124 143 122 12 132 13 126 97 128 18 99 122 89 123 122 126 128 118 124 13 13 16 4 132 14 1 19 119 143 14 126 6123 Direktpositiv toxintest på feces, Toxinpositiv från framodlad stam 1 3 3 9 6 6 7 8 8 4 4 2 11 9 4 12 4 8 6 1 7 4 9 6 7 6 6 6 4 3 4 3 6 9 12 4 4 4 1 26 Toxinpositiv från framodlad stam 18 17 6 26 18 17 11 12 14 11 18 24 18 12 11 1 1 1 17 14 26 24 14 11 2 13 13 23 18 8 11 8 18 16 17 14 6 11 13 7 17 7 691 Fält ej ifyllt 17 8 17 22 12 24 24 18 14 12 13 24 11 22 14 17 24 21 28 31 18 11 11 21 8 11 14 17 19 18 8 31 13 12 21 16 18 8 8 826 Totalt 173 182 167 168 166 177 18 167 167 169 187 174 161 19 167 189 173 132 171 149 181 168 127 174 147 143 147 19 167 17 167 6 8 16 21 184 166 169 192 4 146 17 169 142 79