Clostridium difficile rapport

Clostridium difficile rapport Veckovis sammanställning av den frivilliga laboratorierapporteringen av Clostridium difficile Barbro Mäkitalo och Kristina Rizzardi 18-1-

Clostridium difficile rapport, vecka 42 (/1-21/1), 18 Rapport om det aktuella bakterieläget Redaktör: Barbro Mäkitalo Den frivilliga laboratorierapporteringen har pågått sedan i oktober 9 och infördes för att följa utvecklingen och underlätta upptäckt av utbrott av Clostridium difficile i Sverige. De inrapporterade siffrorna ska främst ligga till grund för analys av förändringar inom respektive laboratoriums upptagningsområde och är inte avsedda för jämförelse mellan de olika laboratorierna. Varje vecka sammanställs data från den frivilliga rapporteringen av C. difficile. Sedan oktober 11 deltar samtliga 26 laboratorier i den frivilliga rapporteringen av C. difficile. De mikrobiologiska laboratorierna i Kronoberg och Blekinge har gått ihop under 11 och fr.o.m. 12 rapporterar Växjö för båda laboratorierna. I följande blad åskådliggörs hur utvecklingen av antal nydiagnosticerade C. difficile-fall varierar per vecka. För att ett prov positivt för C. difficile-toxin ska anses vara ett nydiagnostiserat fall ska minst åtta veckor förflutit sedan föregående positiva prov. Därefter följer ett blad som visar utvecklingen av antalet nydiagnostiserade C. difficile-fall de senaste 2 veckorna för vart och ett av de rapporterande laboratorierna. En trendlinje visar ett glidande medelvärde över tre veckor. Sist visas sammanställningar i tabellform. Siffrorna från de senaste två veckorna bör tolkas med försiktighet eftersom information kan saknas från vissa laboratorier då rapporten sammanställs. Solna Folkhälsomyndigheten, SE-171 82 Solna. Besök: Nobels väg 18. Östersund Folkhälsomyndigheten, SE-831 4 Östersund. Besök: Forskarens väg 3. Telefon 1- E-post info@folkhalsomyndigheten.se www.folkhalsomyndigheten.se

C. difficile-fall per vecka 24 2 Glidande medelvärde 17 Glidande medelvärde 18 Totalt antal fall 18 16 14 1 1 8 6 4 1 1 3 4 4 Vecka 17

3 1 Aleris Medilab 43 2 1 3 4 3 1 Borås 43 2 1 3 4 3 1 Eskilstuna 43 2 1 3 4 3 1 Falun 43 2 1 3 4 3 1 Gävle 43 2 1 3 4 3 1 Göteborg 43 2 1 3 4 3 1 Halmstad 43 2 1 3 4 3 1 Jönköping 43 2 1 3 4 3 1 Kalmar 43 2 1 3 4 3 1 Karlstad 43 2 1 3 4 3 1 Karolinska 43 2 1 3 4 3 1 Linköping 43 2 1 3 4 3 1 Skåne 43 2 1 3 4 3 1 Skövde 43 2 1 3 4 3 1 Stockholm/Unilabs 43 2 1 3 4 3 1 Sunderby 43 2 1 3 4 3 1 Sundsvall 43 2 1 3 4 3 1 Trollhättan 43 2 1 3 4 3 1 Umeå 43 2 1 3 4 3 1 Uppsala 43 2 1 3 4 3 1 Visby 43 2 1 3 4 Vecka år 17/18 3 1 Västerås 43 2 1 3 4 Vecka år 17/18 3 1 Växjö/Karlskrona 43 2 1 3 4 Vecka år 17/18 3 1 Örebro 43 2 1 3 4 Vecka år 17/18 3 1 Östersund 43 2 1 3 4 Vecka år 17/18 Glidande medelvärde 16/17 Glidande medelvärde 17/18

C. difficile rapport vecka 42, 18 Fördelning av fall sker efter ankomstdatum för prov Antal positiva fynd av C. difficile Vecka 18 Laboratorium 1 2 3 4 6 7 8 9 1 11 12 13 14 16 17 18 19 21 22 23 24 26 27 28 29 3 31 32 33 34 36 37 38 39 4 41 42 Totalt Aleris Medilab 1 2 1 4 1 4 4 2 3 3 2 1 4 1 2 4 4 1 2 2 1 2 1 2 1 2 3 2 3 3 1 2 2 6 1 8 Borås klinisk mikrobiologi 3 3 2 1 2 4 4 1 1 4 4 3 2 4 4 6 3 7 11 4 2 3 6 1 3 4 8 4 3 7 3 11 3 1 3 16 Eskilstuna/Unilabs 1 4 6 6 6 9 8 6 4 3 6 7 4 7 11 8 4 3 3 7 1 2 6 1 4 2 4 7 2 8 7 6 4 7 6 8 3 243 Falun klinisk mikrobiologi 4 2 4 3 3 6 6 6 3 2 6 6 6 4 4 6 6 6 1 8 7 4 8 7 3 2 3 2 1 2 2 1 4 4 4 8 4 4 191 Gävle klinisk mikrobiologi 8 7 11 6 8 3 4 3 11 7 1 3 13 21 11 11 6 9 4 8 1 4 11 8 3 6 8 4 8 7 6 9 9 11 29 Göteborg, Sahlgrenska klinisk mikrobiologi 16 1 11 1 14 8 12 1 7 1 1 17 9 11 16 1 9 6 11 1 13 11 12 11 13 1 9 7 18 11 1 13 1 12 8 16 14 6 471 Halmstad klinisk mikrobiologi 4 4 6 7 2 6 3 2 6 3 1 6 3 2 6 4 3 3 3 2 3 4 9 4 7 4 3 4 7 2 168 Jönköping klinisk mikrobiologi 3 8 7 8 8 12 19 12 4 6 8 6 12 6 7 4 1 6 8 8 7 4 3 1 13 6 9 2 7 1 1 1 4 2 266 Kalmar, klinisk mikrobiologi 1 4 1 2 2 1 4 1 2 1 2 3 2 1 1 2 2 1 1 4 1 2 4 4 1 2 1 1 1 2 1 7 3 1 2 3 84 Karlstad klinisk mikrobiologi 8 2 3 3 4 4 7 4 3 4 6 3 11 3 4 4 9 7 4 6 3 3 3 2 2 3 4 3 6 2 4 4 12 6 6 4 4 4 4 193 Karolinska Universitetslaboratoriet 32 24 18 27 26 23 24 28 18 27 34 27 26 24 33 28 13 31 16 21 21 13 24 3 24 22 21 24 31 28 22 34 999 Linköping klinisk mikrobiologi 1 9 16 13 13 12 16 7 11 11 7 21 16 12 19 13 17 3 6 12 9 18 12 8 13 13 8 7 11 1 9 7 12 7 11 7 6 12 1 8 42 Malmö, MAS klinisk mikrobiologi 29 31 23 23 27 22 26 28 29 21 23 33 28 26 3 37 28 16 21 17 21 24 24 24 23 26 19 29 21 18 28 38 18 28 26 Skövde/Unilabs 4 12 8 4 8 8 4 8 6 8 7 4 4 2 1 3 9 7 8 9 3 4 6 6 3 9 6 9 6 3 4 2 8 7 4 Sunderby klinisk mikrobiologi 7 9 8 7 9 4 6 4 6 7 4 4 9 9 2 7 6 4 7 7 4 4 4 1 6 7 4 4 7 1 3 8 4 3 4 4 224 Stockholm/Unilabs 6 9 6 4 4 1 3 2 1 3 1 1 2 4 6 4 6 6 3 3 3 1 13 9 9 1 4 14 Sundsvall klinisk mikrobiologi 1 4 1 6 2 6 9 7 9 3 2 9 6 6 7 8 1 2 7 6 3 2 7 6 3 7 2 6 2 7 6 3 8 2 4 8 7 237 Trollhättan klinisk mikrobiologi 3 2 3 4 3 2 3 2 3 4 2 4 2 1 7 6 4 1 1 3 4 3 4 3 4 1 4 8 2 2 4 6 2 6 8 8 9 Umeå klinisk mikrobiologi 2 7 7 4 4 7 1 3 6 4 6 4 4 3 4 6 3 6 9 4 7 3 2 3 4 3 2 1 3 8 8 2 8 188 Uppsala klinisk mikrobiologi 1 3 3 1 6 7 8 9 9 6 4 6 1 3 7 8 3 12 6 8 7 11 6 3 4 3 9 7 7 11 7 8 4 6 3 6 4 1 9 6 3 4 Visby klinisk mikrobiologi 1 1 2 1 2 1 1 1 3 1 1 3 1 1 1 1 2 1 1 1 3 2 4 1 37 Västerås klinisk mikrobiologi 3 1 1 1 2 3 1 1 4 3 1 1 3 3 1 1 1 2 2 2 1 3 4 1 3 3 2 1 4 3 2 1 7 Växjö/Karskrona klinisk mikrobiologi 6 11 11 2 13 1 9 9 1 3 1 8 9 8 7 7 3 4 6 11 1 11 6 12 6 9 4 6 4 9 9 12 1 7 9 7 13 11 1 7 349 Örebro klinisk mikrobiologi 6 6 3 6 11 1 7 9 3 4 9 3 1 4 3 1 3 6 6 6 8 3 8 4 3 8 4 4 8 4 3 4 7 8 11 1 238 Östersund klinisk mikrobiologi 1 2 3 2 1 3 6 7 1 2 2 1 1 2 3 2 4 1 2 4 2 2 2 3 2 1 6 2 1 1 3 3 4 3 2 12 Totalt 173 182 167 167 166 177 18 167 167 169 187 174 161 19 167 189 173 132 171 149 181 168 127 174 147 143 147 19 167 17 167 6 8 16 21 181 1 6899 Antal nydiagnostiserade fall av C.difficile * Vecka 18 Laboratorium 1 2 3 4 6 7 8 9 1 11 12 13 14 16 17 18 19 21 22 23 24 26 27 28 29 3 31 32 33 34 36 37 38 39 4 41 42 Totalt Varav uppgift saknas Aleris Medilab 1 1 1 4 1 3 4 2 2 3 2 1 4 2 3 4 1 2 2 1 2 1 1 1 1 2 1 3 3 2 2 1 69 1 Borås klinisk mikrobiologi 3 2 1 1 4 2 4 3 1 4 3 1 4 4 2 3 7 2 4 2 1 2 1 2 3 4 6 1 2 2 6 3 11 Eskilstuna/Unilabs 8 4 2 3 3 4 7 6 4 3 1 3 2 4 8 3 2 2 6 7 1 4 8 2 3 2 4 2 7 6 4 3 4 1 173 1 Falun klinisk mikrobiologi 1 2 3 2 2 6 6 4 2 1 4 4 2 4 3 4 3 1 1 8 4 4 7 4 3 2 3 2 1 2 4 3 2 4 3 4 2 2 2 136 Gävle klinisk mikrobiologi 6 6 2 7 6 3 4 2 2 7 1 1 9 1 3 9 4 6 2 7 1 4 4 3 4 4 4 4 1 3 3 6 3 4 8 7 Göteborg, Sahlgrenska klinisk mikrobiologi 13 6 7 7 13 6 8 9 6 13 8 6 14 7 11 6 7 11 4 7 9 9 9 7 11 9 8 4 4 3 14 9 8 9 4 6 7 11 9 334 6 Halmstad klinisk mikrobiologi 4 4 6 7 2 3 4 4 3 2 6 3 4 1 3 3 2 6 4 3 3 3 2 3 2 4 8 4 6 4 3 3 4 2 Jönköping klinisk mikrobiologi 3 8 7 8 8 12 19 12 4 6 8 6 12 6 7 4 1 6 8 8 7 4 3 1 13 6 9 2 7 1 1 1 4 2 266 18 Kalmar, klinisk mikrobiologi 1 4 4 2 2 1 4 1 2 1 2 3 1 1 1 2 2 4 1 1 4 1 1 2 3 1 1 1 1 1 6 2 1 2 1 68 16 Karlstad klinisk mikrobiologi 2 3 2 2 3 3 4 4 3 1 3 1 4 2 3 2 6 3 1 4 2 1 3 1 1 2 3 2 6 2 3 3 4 8 3 2 2 4 2 134 Karolinska Universitetslaboratoriet 18 27 17 12 12 24 17 16 17 22 13 24 23 16 11 16 21 18 1 9 18 21 12 18 9 16 14 9 17 21 13 16 16 21 18 23 19 18 23 7 19 Linköping klinisk mikrobiologi 7 11 8 13 9 13 7 1 11 17 11 1 8 13 3 3 1 9 8 8 7 11 12 6 6 7 6 7 4 1 6 9 4 3 9 4 7 6 343 Malmö, MAS klinisk mikrobiologi 27 19 21 14 18 19 12 19 22 1 19 23 21 17 23 23 9 1 11 14 18 16 13 19 18 17 17 12 18 27 11 13 12 27 21 17 742 Skövde/Unilabs 3 7 6 4 4 3 6 1 4 3 8 4 4 4 2 8 2 8 3 6 3 9 2 12 1 4 4 1 3 8 9 3 4 3 3 1 7 6 188 4 Sunderby klinisk mikrobiologi 7 9 8 7 9 4 6 4 6 7 4 4 9 9 2 7 6 4 7 7 4 4 4 1 6 7 4 4 7 1 3 8 4 3 4 4 224 Stockholm/Unilabs 6 9 4 6 4 4 1 3 1 1 3 1 1 2 4 6 4 4 6 3 3 3 1 13 9 9 1 4 136 134 Sundsvall klinisk mikrobiologi 8 3 6 3 1 4 6 4 7 2 1 6 4 7 3 4 8 2 2 3 4 3 1 4 2 4 2 3 2 2 2 4 3 2 3 6 3 4 1 Trollhättan klinisk mikrobiologi 2 2 3 3 3 1 1 2 3 4 1 2 2 1 3 1 2 4 2 2 3 3 1 3 6 1 2 2 3 4 3 1 4 8 6 4 4 122 12 Umeå klinisk mikrobiologi 2 7 7 4 3 6 1 1 3 6 4 3 4 1 4 3 3 6 9 4 4 6 2 1 3 1 3 2 4 1 3 4 8 7 2 6 163 Uppsala klinisk mikrobiologi 1 3 3 1 6 7 8 9 9 6 4 6 1 3 7 8 3 11 4 8 7 11 6 3 4 3 7 6 6 7 4 6 3 4 1 4 2 23 Visby klinisk mikrobiologi 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 3 1 1 1 1 1 1 1 1 3 2 1 1 32 1 Västerås klinisk mikrobiologi 1 1 1 1 4 2 2 1 1 3 1 1 3 3 1 1 1 2 2 1 3 3 1 2 2 1 1 4 3 2 1 6 12 Växjö/Karlskrona klinisk mikrobiologi 4 9 2 1 6 7 8 8 3 6 8 7 4 6 2 4 3 9 8 11 6 1 2 7 3 2 8 6 7 7 6 7 4 4 8 11 8 6 11 Örebro klinisk mikrobiologi 3 6 2 6 9 4 6 4 7 3 2 3 7 2 4 8 3 2 4 2 3 6 8 3 1 2 3 3 7 3 1 2 7 1 8 4 6 17 Östersund klinisk mikrobiologi 1 2 3 2 3 4 3 4 4 1 1 1 2 3 1 2 1 2 4 1 2 2 2 1 1 2 2 2 1 1 71 1 Totalt 133 146 119 122 137 133 134 137 14 1 124 112 148 133 119 148 127 1 131 91 1 118 141 138 12 127 18 19 112 78 1 118 129 133 117 122 116 127 6 132 116 14 247 287 *Ett nytt fall definieras som en person med ett avföringsprov posivit för C. difficile där det ska ha förflutit minst 8 veckor mellan positivt prov från samma patient. I ovanstående tabell inkluderas även de positiva fynd där falldefinitionsfrågan har lämnats obesvarad eller besvarats med "uppgift saknas".

Har patienten tidigare lämnat positivt prov de senaste 8 veckorna (av totalt antal positiva fynd) Vecka 18 1 2 3 4 6 7 8 9 1 11 12 13 14 16 17 18 19 21 22 23 24 26 27 28 29 3 31 32 33 34 36 37 38 39 4 41 42 Totalt J 4 36 48 33 3 33 43 43 27 32 4 43 39 41 42 47 4 4 42 41 1 31 4 3 47 39 34 31 47 37 41 34 33 34 42 33 4 49 39 47 162 N 126 131 119 11 13 127 13 1 129 132 1 17 139 123 16 143 112 128 127 83 1 114 139 131 96 1 14 11 13 7 117 117 126 1 111 117 1 121 146 1 111 99 496 Uppgiften saknas 6 9 4 6 4 4 1 7 2 7 2 1 2 13 3 4 2 6 4 7 3 3 3 1 13 9 9 1 4 17 Fält ej ifyllt 1 6 8 1 2 2 6 2 2 3 2 8 12 3 2 2 1 4 2 2 2 1 1 3 2 1 3 8 3 4 3 1 1 3 4 1 112 Totalt 173 182 167 167 166 177 18 167 167 169 187 174 161 19 167 189 173 132 171 149 181 168 127 174 147 143 147 19 167 17 167 6 8 16 21 181 1 6899 Kön (av totalt antal positiva fynd) 1 2 3 4 6 7 8 9 1 11 12 13 14 16 17 18 19 21 22 23 24 26 27 28 29 3 31 32 33 34 36 37 38 39 4 41 42 Totalt Kvinna 11 9 77 84 9 93 83 88 81 78 92 78 94 84 81 98 88 93 8 7 87 78 86 9 73 94 76 73 84 49 83 98 94 91 74 83 83 74 18 9 77 74 49 Man 72 87 9 71 72 73 94 92 8 89 77 77 93 9 8 97 79 96 88 7 84 71 9 73 4 8 71 7 63 6 84 7 76 76 76 73 7 86 12 91 78 77 3349 Uppgiften saknas 1 1 Totalt 173 182 167 167 166 177 18 167 167 169 187 174 161 19 167 189 173 132 171 149 181 168 127 174 147 143 147 19 167 17 167 6 8 16 21 181 1 6899 Resultat av analys (av totalt antal positiva fynd) 1 2 3 4 6 7 8 9 1 11 12 13 14 16 17 18 19 21 22 23 24 26 27 28 29 3 31 32 33 34 36 37 38 39 4 41 42 Totalt Direktpositiv toxintest på feces 136 148 139 1 131 122 129 132 113 129 136 128 2 121 13 124 143 122 12 132 13 126 97 128 18 99 122 89 123 122 126 128 118 124 13 13 16 1 121 132 38 Direktpositiv toxintest på feces, Toxinpositiv från framodlad stam 1 3 3 9 6 6 7 8 8 4 4 2 11 9 4 12 4 8 6 1 7 4 9 6 7 6 6 6 4 3 4 3 2 227 Toxinpositiv från framodlad stam 18 17 6 26 18 17 11 12 14 11 18 24 18 12 11 1 1 1 17 14 26 24 14 11 2 13 13 23 18 8 11 8 18 16 17 14 6 631 Fält ej ifyllt 17 8 17 21 12 24 24 18 14 12 13 24 11 22 14 17 24 21 28 31 18 11 11 21 8 11 14 17 19 18 8 31 13 11 733 Totalt 173 182 167 167 166 177 18 167 167 169 187 174 161 19 167 189 173 132 171 149 181 168 127 174 147 143 147 19 167 17 167 6 8 16 21 181 1 6899