Influensarapport för vecka 2, 2014

Transkript

1 Influensarapport för 2, 2014 Denna rapport publicerades den 16 januari 2014 och redovisar influensaläget 2 (6/1 12/1) Innehållsförteckning Sammanfattning... 2 Vad visar övervakningssystemen?... 2 Lägesbeskrivning... 3 Läget i världen... 3 Fågelinfluensan... 3 Special: Övriga orsaker till luftvägsinfektioner i Sverige Vad flyger i luften?... 4 Fördjupad statistik... 5 Laboratoriebaserad övervakning... 5 Sentinelrapportering Sentinelprovtagning inom öppenvård och på barn- och infektionskliniker Vårdguiden på telefon Webbsök Special: Influensakaraktärisering... 15

2 Sammanfattning Övervakningssystemen visar nu samma nivåer av influensaaktivitet som innan jul- och nyårshelgen. Ännu har spridningen inte tagit ordentlig fart, så det är inte för sent att vaccinera sig. Våra analyser visar att de stammar som cirkulerar i Sverige stämmer väl överens med stammarna i säsongens vaccin. Skyddet av en vaccination kan därmed förväntas vara gott. Personer oavsett ålder som tillhör en riskgrupp (se länk) bör vaccinera sig. Specialavsnitt i denna rapport: - Övriga orsaker till luftvägsinfektioner (Vad flyger i luften?) - Fördjupad viruskarakterisering (vaccinlikhet och resistens) Vad visar övervakningssystemen? I tabellen sammanfattas övervakningsdata för respektive system. Läs mer om systemen här. Övervakningssystem Vecka 2 Förändring mot föregående Laboratoriebaserad övervakning 96 influensafall, varav: 81 A/H1N1pdm09 13 annan säsongsinfluensa A 2 B Trend: Ökning 609 prover 15,9% positiva Trend: Oförändrad Sentinelrapportering Sentinelprovtagning 4,8 patienter med ILS per listade patienter Aktivitet: Låg 13 fall, varav: 10 A/H1N1pdm09 2 A, ej subtypad 1 A/H3N2 0 B-Victoria 0 B-Yamagata Trend: Oförändrad Trend: Ökning 44 prover 25,0 % positiva Trend: Ökning 1177 Vårdguiden på telefon 2,8 % samtal om feber hos barn Aktivitet: Låg Trend: Minskning Webbsök för influensa Aktivitet: Låg Trend: Ökning 2

3 Lägesbeskrivning Varken den laboratoriebaserade övervakningen, sentinelövervakningen, Webbsök eller samtalen till 1177 Vårdguiden för feber bland barn visar några tecken på kraftigt ökande influensaaktivitet över de senaste två veckorna. Vi kan däremot förvänta oss en ökad spridning under kommande veckor, men det är för tidigt att säga när toppen kommer. Fortsatt är majoriteten av alla laboratorierapporterade fall och positiva sentinelprov influensa A(H1N1)pdm09. Influensa A(H1N1)pdm09 har under tidigare säsonger drabbat vuxna i arbetsför ålder hårdare än andra cirkulerande influensastammar och detta ses nu även i Nordamerika (se nedan). Även i Sverige kan vi förvänta oss att se många vuxna bland de sjuka och svårt sjuka. Läget i världen Danmark och Finland rapporterar fortsatt låg influensaaktivitet under 1. Från övriga Europa rapporteras en låg men i vissa länder ökande aktivitet, främst i söder. ECDC bedömer att influensasäsongen sakta men säkert startat i Europa. Tolv av femtio rapporterande länder inom WHO:s Europaregion hade en ökande trend under 1, men de flesta rapporterade en låg aktivitet. Endast Turkiet och Spanien rapporterade en medelhög aktivitet. Från Nordamerika rapporterades för 1 en hög och ökande influensaaktivitet. Eftersom säsongen där domineras av influensa A(H1N1)pdm09 vårdas en större andel vuxna (under 65 år) på sjukhus och intensivvård än förra säsongen, då influensa A(H3N2) dominerade där. I Kanada står hittills personer mellan 20 och 64 år för 58 procent av de laboratorieverifierade fallen, 52 procent av sjukhusinläggningarna och 77 procent av de intensivvårdade. Även i USA står vuxna under 65 år för en stor del av sjukhusinläggningarna (62 %). På Södra halvklotet är aktiviteten fortsatt låg, vilket är förväntat eftersom de är mellan epidemiska perioder. Fågelinfluensan Under 2 har fler än 10 nya fall av influensa A(H7N9) rapporterats bland patienter i östra Kina. En ökad försäljning av gatumat i samband med det stundande nyårsfirandet beskrivs som en möjlig orsak till att antalet fall ökar. Läs mer i CIDRAP:s sammanfattning. Fallet av influensa A(H5N1) i Kanada har beskrivits i mer detalj i en artikel på PROMED (se länk). Sammanfattningsvis hade patienten varit i Beijing/Peking i tre veckor och inte haft någon kontakt med fåglar. Patienten drabbades bland annat av encefalit och meningit till följd av infektionen, vilket är ovanligt i samband med influensainfektion men har påvisats förut i andra personer med H5N1. 3

4 Special: Övriga orsaker till luftvägsinfektioner i Sverige Vad flyger i luften? De mikrobiologiska laboratorierna vid Karolinska Universitetssjukhuset i Stockholm, Sahlgrenska universitetssjukhuset i Göteborg och Unilabs i Skövde analyserar en del av de luftvägsprover de får in för upp till olika virus (inklusive undertyper av vissa virus). Andelen positiva fynd har ökat under de senaste veckorna från 15% under till 31% under 1-2. Denna ökning är inget anmärkningsvärt för säsongen då flera virus som orsakar luftvägssymtom brukar cirkulera. Övervakningssystemet Webbsök för influensa visar fortfarande på låg influensaaktivitet. Det är även färre än vid samma tidpunkt föregående år som har ringt 1177 Vårdguiden angående feber och hosta (se sidan 13 i denna rapport). Få positiva RSV-fall har rapporterats (se ns RSVrapport). I tabellen nedan sammanfattas trenderna i andelen analyserade prover som varit positiva för flera vanliga luftvägsvirus. Andelen positiva prov för rhinovirus fortsätter att sjunka och var endast 7 % under den senaste perioden. Däremot ser man att andelen positiva fynd för influensa, metapneumovirus och RSV (respiratory syncytial virus) ökar. Coronavirus och adenovirus förekommer också. Alla dessa virus är vanliga orsaker till förkylningar. Andel positiva Vecka 1-2 Rhinovirus 23% 20% 15% 10% 7% Coronavirus 0,4% 0,2% 2,7% 4,8% 4,6% Influensa A och B 0,0% 0,1% 1,3% 5,2% 9,4% Adenovirus 1,6% 1,3% 3,1% 2,1% 1,7% RSV 0,5% 0,5% 0,4% 2,5% 3,2% Metapneumovirus 0,0% 0,0% 1,8% 2,7% 4,4% Mer information om förkylning och RSV finns på Folkhälsomyndighetens webbplats. 4

5 Fördjupad statistik Laboratoriebaserad övervakning Antal laboratorieverifierade influensafall (alla typer) per säsong och tidigare säsonger. För tidigare säsonger anges vilken subtyp (av influensa A) alt. linjetyp (av influensa B) som dominerade. Figuren inkluderar inte fall diagnosticerade inom sentinelövervakningen. Antal laboratorieverifierade influensafall per subtyp och totalt, samt antal analyserade prover och andel positiva, aktuell och kumulativt, säsong (Tabellen inkluderar inte fall diagnosticerade inom sentinelövervakningen.) Influensatyp Aktuell Föregående Förändring Kumulativt under säsongen Influensa A(H1N1)pdm ,8 % 329 Annan säsongsinfluensa A ,5% 83 Influensa B ,0% 18 Totalt antal fall ,0 % 430 Antal analyserade prover ,6 % Andel positiva prover 15,9% 15,0% 6,2 % 6,8 % 5

6 Antal laboratorieverifierade influensafall (alla typer) per län och invånare Färgskalan symboliserar antalet laboratorieverifierade influensafall per invånare och baserar sig på den frivilliga laboratorierapporteringen samt anmälningar av fall av influensa A(H1N1)pdm09 (anmälningsplikt). Län markerade med grått har den aktuella n inte haft något rapporterande laboratorium. I län markerade med vitt har minst ett laboratorium rapporterat, men inga influensafall har diagnosticerats. Observera att antalet tagna prover varierar mellan län och över tid och påverkar starkt antalet fall som diagnosticeras. Alla prover från Gotland analyseras i Stockholm. Incidensen i Stockholm har inte korrigerats för prover positiva för säsongsinfluensa A och B från Gotland, men den bör inte påverkas märkbart. 6

7 Antal laboratorieverifierade influensafall (alla typer) per län, aktuell och kumulativt denna säsong (Tabellen inkluderar inte fall diagnosticerade inom sentinelövervakningen.) Aktuell Kumulativt under säsongen Län Antal fall Antal fall per invånare Antal fall Antal fall per invånare Blekinge - 0,00 0 0,00 Dalarna 6 2,17 7 2,53 Gotland 0 0,00 0 0,00 Gävleborg 0 0, ,06 Halland 1 0,33 6 1,97 Jämtland 3 2,38 9 7,13 Jönköping 0 0,00 2 0,59 Kalmar 0 0,00 1 0,43 Kronoberg 1 0, ,38 Norrbotten 2 0,80 5 2,01 Skåne 3 0, ,98 Stockholm 32 1, ,39 Sörmland - 0,00 0 0,00 Uppsala 6 1, ,31 Värmland 6 2, ,08 Västerbotten 7 2, ,06 Västernorrland 4 1, ,57 Västmanland 1 0,39 2 0,78 Västra Götaland 20 1, ,81 Örebro 3 1,06 9 3,18 Östergötland 1 0, ,31 Totalt: 96 1, ,51 7

8 Antal laboratorieverifierade influensafall per laboratorium, aktuell och kumulativt denna säsong. (Tabellen inkluderar inte fall diagnosticerade inom sentinelövervakningen.) Län Laboratorium Antal laboratorieverifierade fall Antal Influensa A(H1N1)pdm09 Aktuell Annan säsongsinfluensa A Influensa B Kumulativt under säsongen Influensa A(H1N1)pdm09 Annan säsongsinfluensa A Influensa B provtagna Aktuell Andel prover positiva för influensa Aktuell Blekinge Karlskrona ,0% Dalarna Falun ,0% Gotland Visby ,0% Gävleborg Gävle ,0% Halland Halmstad ,3% Jämtland Östersund ,0% Jönköpings län Jönköping ,0% Kalmar län Kalmar ,0% Kronoberg Växjö ,0% Norrbotten Sunderby ,0% Luleå ,0% Region Skåne Malmö ,5% Stockholm Aleris Medilab ,0% Karolinska Solna/Huddinge ,9% S:t Göran/Unilabs ,0% 8

9 Län Laboratorium Antal laboratorieverifierade fall Antal Aktuell Kumulativt under säsongen provtagna Influensa Annan Influensa Influensa Annan Influensa Aktuell A(H1N1)pdm09 säsongsinfluensa B A(H1N1)pdm09 säsongsinfluensa B A A Andel prover positiva för influensa Aktuell Sörmland Eskilstuna/Unilabs ,0 % Uppsala län Uppsala ,8% Värmland Karlstad ,8% Västerbotten Umeå ,2% Västernorrland Sundsvall ,5% Västmanland Västerås ,7% Västra Götaland Borås ,3% Göteborg ,5 % Skövde ,6% Trollhättan ,0% Örebro län Örebro ,0% Östergötland Linköping ,1% Totalt: ,9% Ett streck (-) indikerar att laboratoriet inte har rapporterat antal fall eller antal provtagna för aktuell. 1 Alla prover från Gotland analyseras vid Karolinska Universitetssjukhuset i Solna och är inkluderade i deras redovisning. 2 Alla prover från Sörmland analyseras av Unilabs i Skövde. 3 Huvuddelen av proverna från Blekinge analyseras i Växjö och är inkluderade i deras redovisning. Mer information om den laboratoriebaserade övervakningen. 9

10 Sentinelrapportering Antal patienter med influensaliknande sjukdom (ILS) per listade patienter, säsong och tidigare säsonger Antal patienter med influensaliknande sjukdom (ILS) per län, aktuell Län Antal patienter med ILS Patientunderlag * Antal ILS-patienter per listade Blekinge 0 0 0,0 Dalarna ,0 Gotland ,0 Gävleborg ,4 Halland ,0 Jämtland ,0 Jönköping 0 0 0,0 Kalmar 0 0 0,0 Kronoberg ,4 Norrbotten 0 0 0,0 Skåne ,0 Stockholm ,6 Södermanland ,0 Uppsala ,8 Värmland 0 0 0,0 Västerbotten ,0 Västernorrland 0 0 0,0 Västmanland ,0 Västra Götaland ,0 Örebro 0 0 0,0 Östergötland ,0 Totalt: ,83 * Län med noll patientunderlag saknar antingen rapporterande sentinelläkare eller så har inte någon rapport skickats in aktuell. 10

11 Sentinelprovtagning inom öppenvård och på barn- och infektionskliniker Antal sentinelfall per influensatyp och andel positiva, per 11

12 Antal prov och andel positiva prover, aktuell, samt antal sentinelfall per influensatyp och län, aktuell och kumulativt sedan 40, Provernas ursprungslän Antal inskickade prover Aktuell Kumulativt Aktuell Antal laboratorieverifierade fall Influensa A Influensa B Totalt Kumulativt Aktuell Kumulativt Aktuell Kumulativt Andel positiva prover Blekinge* Dalarna* ,0% Gotland* ,0% Gävleborg* ,0% Halland* Jämtland* ,0% Jönköping* ,0% Kalmar ,0% Kronoberg ,0% Norrbotten* ,0% Skåne* ,0% Stockholm* ,0% Sörmland* Uppsala* ,0% Värmland Västerbotten* ,0% Västernorrland* ,0% Västmanland* Västra Götaland* ,0% Örebro Östergötland Totalt: ,0% * I dessa län sker sentinelprovtagning även på barn- och infektionskliniker. Mer information om sentinelövervakningen. Aktuell 12

13 1177 Vårdguiden på telefon Lågt för säsongen Minskning jämfört med föregående Andel samtal till 1177 Vårdguiden gällande feber hos barn av samtliga samtal med angiven kontaktorsak Mer information om 1177 Vårdguiden på telefon: 13

14 Webbsök Låg influensaaktivitet. Normal nivå för säsongen. Ökning jämfört med föregående Uppskattad andel av befolkningen som har influensaliknande sjukdom - modell baserad på influensarelaterade sökningar på 1177 Vårdguidens webbplats 1177.se Länk till Webbsöks veckorapport på SMI:s hemsida (publiceras varje måndag). 14

15 Special: Influensakaraktärisering God vaccinlikhet och ingen resistens mot neuraminidashämmare A(H1N1)pdm09 Totalt har 22 A(H1N1)pdm09-stammar analyserats avseende genetisk vaccinlikhet genom sekvensering av hemagglutiningenen sedan säsongsstarten v. 40. Samtliga 22 stammar tillhör genetisk grupp 6/subgrupp 6B. En stam med provtagningsdatum v. 29, det vill säga före starten av influensasäsongen, har karaktäriserats och tillhör även den grupp 6, men subgrupp 6C (se Fylogenetiskt träd nedan). Enligt ECDC:s senaste rapport över den europeiska influensakaraktäriseringen t.o.m. december 2013 detekteras nu stammar tillhörande subgrupp 6B med ökande frekvens globalt, i motsats till senare delen av föregående säsong i EU/EEAländerna, då stammar tillhörande subgrupp 6C dominerade. Tidigare cirkulerande stammar av subgrupp 6B har uppvisat god antigenisk likhet med vaccinstammen för nuvarande säsong ( ), A/California/07/2009. Sedan säsongstarten v. 40 så har 23 A(H1N1)pdm09-stammar analyserats för mutationer associerade med resistens mot neuraminidashämmarna oseltamivir (Tamiflu) och zanamivir (Relenza) genom sekvensering av genen för neuraminidas. Ingen resistensmutation har påvisats bland dessa prover. Inte heller bland de europeiska stammarna (32 st. varav 11 svenska) har någon resistensmutation påvisats (sammanställning av ECDC, v. 51). I Sapporo, Japan påvisades under november och december ett kluster av sex stammar med mutation H275Y, som ger upphov till resistens mot oseltamivir (och peramivir). Denna mutation påvisades i ytterligare ett prov från en annan del av landet. En av patienterna hade behandlats med neuraminidashämmare. Man kunde inte identifiera någon epidemiologisk koppling mellan dessa patienter, men neuraminidasgenen hos proverna var nära besläktade, vilket tyder på en klonal spridning av en resistent stam. Alla sju stammarna var känsliga för zanamivir (och laninamivir). Uppgifterna publicerades i Eurosurveillance 9 januari, 2014, se länk nedan. I USA har 13 av 595 analyserade A(H1N1)pdm09-stammar visat sig vara resistenta mot oseltamivir enligt CDC:s senaste veckorapportering som omfattar v. 40-v. 1. Samtliga 23 analyserade A(H1N1)pdm09-stammar har, i likhet med samtliga stammar föregående säsong, mutation S31N i matrixgenen, vilken ger upphov till resistens mot amantadin (används inte i Sverige). Detsamma gäller för de 14 europeiska stammar (varav 11 svenska) som analyserats hittills (sammanställning av ECDC, v. 51). A(H3N2) Samtliga åtta A(H3N2)-stammar med provtagningsdatum från v. 40 och framåt, samt tre stammar med provtagnings datum före v. 40, tillhör genetisk subgrupp 3C, baserat på sekvensering av hemagglutiningenen. Till grupp 3C hör även vaccinstammen för säsongen, A/Texas/50/2012 (se Fylogenetiskt träd nedan). Subgrupp 3C var den dominerande under senare delen av föregående säsong bland de stammar som samlades in i EU/EEA-länderna enligt ECDC:s senaste rapport. Enligt denna sammanställning kan subgrupp 3C delas upp i ytterligare förgreningar 3C.1, 3C.2 och 3C.3, där den sistnämnda verkar öka globalt sett. Av de 11 svenska karaktäriserade stammarna så tillhör sex av dessa 3C.3 och medan resterande fem 15

16 tillhör 3C.2. Enligt ECDC-rapporten ses inga tecken på förändrad antigenicitet bland dessa identifierade och definierade grupperingar/subgrupperingar. Sedan säsongstarten v. 40 så har nio A(H3N2)pdm09-stammar analyserats för mutationer associerade med resistens mot neuraminidashämmarna oseltamivir (Tamiflu) och zanamivir (Relenza) genom sekvensering av genen för neuraminidas. Ingen resistensmutation har påvisats bland dessa stammar. Totalt har 17 europeiska stammar (inkl. två svenska) analyserats och inga resistensmutationer har påvisats (sammanställning av ECDC v. 51). Liksom föregående säsong så har samtliga A(H3N2)-stammar (8 st.) mutation S31N i matrixgenen, vilken ger upphov till resistens mot amantadin (används inte i Sverige). Samtliga europeiska stammar (12 st. varav 1 svensk) som analyserats är även de resistenta mot amantadin (sammanställning av ECDC v. 51). B/Yamagata Av de fem B/Yamagatalinje-lika stammar där hemagglutiningenen sekvenserats klustrar fyra till genetisk grupp 3, representerad av vaccinstammen för föregående säsong, B/Wisconsin/1/2010. En stam tillhör genetisk grupp 2 som representeras av vaccinstammen för nuvarande säsong, B/Massachusetts/02/2012 (se Fylogenetiskt träd nedan). Enligt ECDC:s senaste rapport dominerar virus av grupp 2 bland de B/Yam-stammar som cirkulerar för tillfället. Antiserum genererat mot vaccinstammen B/Massachusetts/02/2012 har visat sig reagera bra med stammar från både grupp 2 och grupp 3. De fem stammarna har även analyserats för mutationer associerade med resistens mot neuraminidashämmarna oseltamivir (Tamiflu) och zanamivir (Relenza) genom sekvensering av genen för neuraminidas. Inga resistensmutationer har påvisats. Fram till v 51 hade endast två europeiska stammar rapporterats in till ECDC:s databas. Dessa innehöll inga resistensmutationer. B/Victoria Endast en stam tillhörande B/Victoria-linjen har påvisats men var inte av tillräcklig styrka för vidare karaktärisering. Enligt ECDC:s senaste rapport uppvisar de senast cirkulerande stammarna i B/Victorialinjen endast ett fåtal avvikelser gentemot den tidigare vaccinstammen B/Brisbane/60/2008. Medan det trivalenta vaccinet för säsongen 2013/2014 innehåller B/Yamagatalinje-stammen (B/Massachusetts/02/2012) så innehåller det kvadrivalenta vaccinet (används inte i Sverige) även stam B/Brisbane/60/2008, tillhörande Victoria-linjen. För vidare läsning: Influenza virus characterisation, Summary Europe December 2013 A community cluster of influenza A(H1N1)pdm09 virus exhibiting cross-resistance to oseltamivir and peramivir in Japan, November to December 2013, EuroSurveillance, 9 jan

17 A_Linkoping_2_2013(12_13) A_Gothenburg_1_2013(12_13) A_Malmoe_1_2013(12_13) A_Orebro_2_2012(12_13) A_Karlstad_1_2012(12_13) A_Malmoe_2_2013(12_13) A_Stockholm_4_2013(12_13) A_Stockholm_53_2012(12_13) A_Uppsala_4_2013(12_13) A_Kalmar_2_2012(12_13) A_Malmoe_4_2013(12_13) A_Malmoe_5_2013(12_13) A_Stockholm_48_2012(12_13) A_Trollhattan_3_2012(12_13) A_Stockholm_45_2012(12_13) A_Madagascar_02064_2013 A_Belgium_G1041_2013 A_Mahajanga_1171_2013 A_Orebro_1_2013(12_13) A_Estonia_76677_2013 A_Norway_1702_2013 A_South_Africa_4706_2013 H1pdm09A_Skovde_3_2013_v29 A_Sweden_2_2013(12_13) A_Stockholm_13_2013(12_13) A_Stockholm_42_2012(12_13) A_Stockholm_47_2012(12_13) A_Linkoping_1_2012(12_13) A_Malmoe_3_2013(12_13) A_Stockholm_52_2012(12_13) A_Stockholm_14_2013(12_13) A_Stockholm_46_2012(12_13) A_Jordan_20326_2013 A_Acores_PT_139_2013 A_Skovde_1_2013(12_13) A_Vimmerby_1_2013(12_13) A_Stockholm_32_2013_v51 A_Stockholm_33_2013_v48 A_Uppsala_6_2013_v45 A_Stockholm_24_2013_v46 A_Stockholm_25_2013_v46 A_Uppsala_7_2013_v46 A_Stockholm_26_2013_v46 A_Sweden_138_2013_v45 A_Stockholm_20_2013_v41 A_Stockholm_19_2013_v40 A_Halmstad_1_2013_v42 A_Stockholm_21_2013_v44 A_Stockholm_23_2013_v42 A_Skovde_4_2013_v50 A_Stockholm_28_2013_v50 A_Stockholm_38_2013_v52 A_Stockholm_39_2013_v52 A_Stockholm_37_2013_v52 A_Uppsala_10_2013_v51 A_Stockholm_35_2013_v50 A_Uppsala_9_2013_v52 A_Gothenburg_5_2013_v49 A_Norway_2417_2013 A_Stockholm_15_2013(12_13) A_Stockholm_32_2012(12_13) A_South_Africa_3686_2013 A_Sweden_3_2013(12_13) A_Stockholm_8_2012(11_12) A_Stockholm_9_2012(11_12) A_Stockholm_1_2012(11_12) A_Stockholm_48_2011(11_12) A_Gothenburg_1_2012(11_12) A_Lund_1_2011(11_12) A_Umea_2_2012(11_12) A_Stockholm_16_2012(11_12) A_Stockholm_15_2012(11_12) A_Umea_3_2012(11_12) A_Stockholm_17_2012(11_12) A_Stockholm_25_2012(11_12) A_Halmstad_2012(11_12) A_Kalmar_1_2012(11_12) A_Stockholm_47_2011(11_12) A_Hong_Kong_5659_2012 A_Stockholm_28_2012(12_13) A_Stockholm_35_2011 A_Stockholm_35_2011(11_12) A_Linkoping_7_2011(10_11) A_Stockholm_36_2011(11_12) A_Astrakhan_1_2011 A_Stockholm_14_2010(10_11) A_Linkoping_5_2011(10_11) A_Linkoping_8_2011(10_11) A_Stockholm_8_2010(10_11) A_Stockholm_9_2010(10_11) A_Kalmar_1_2010(10_11) A_Karlstad_2_2011(10_11) A_Linkoping_2_2011(10_11) A_Linkoping_6_2011(10_11) A_Malmoe_13_2011(10_11) A_Stockholm_15_2010(10_11) A_Jonkoping_1_2010(10_11) A_Karlstad_1_2011(10_11) A_Stockholm_10_2011(10_11) A_St._Petersburg_27_2011 A_Vaxjo_2_2010(10_11) A_Malmoe_4_2010(10_11) A_Malmoe_7_2010(10_11) A_Malmoe_8_2010(10_11) A_Stockholm_2_2011(10_11) A_Stockholm_11_2011(10_11) A_Sweden_1_2011(10_11) A_Stockholm_17_2010(10_11) A_Malmoe_1_2011(10_11) A_Linkoping_3_2011(10_11) A_Malmoe_2_2011(10_11) A_Stockholm_12_2011(10_11) A_Stockholm_4_2011(10_11) A_Stockholm_8_2011(10_11) A_Stockholm_9_2011(10_11) A_Malmoe_14_2011(10_11) A_Malmoe_12_2011(10_11) A_Linkoping_4_2011(10_11) A_Karlstad_1_2010(10_11) A_Stockholm_3_2011(10_11) A_Boras_1_2012(12_13) A_Halmstad_1_2010(10_11) A_Belgium_G917_2012 A_Stockholm_33_2012(12_13) A_Stockholm_2_2013(12_13) A_Stockholm_49_2012(12_13) A_Norway_2197_2013 A_Stockholm_5_2013(12_13) A_Uppsala_1_2013(12_13) A_Uppsala_3_2013(12_13) A_Stockholm_3_2013(12_13) A_Sundsvall_1_2013(12_13) A_Stockholm_34_2012(12_13) A_Stockholm_34_2012 A_Stockholm_27_2012(12_13) A_Stockholm_30_2011(11_12) A_Stockholm_27_2011(11_12) A_Peru_2023_2012 A_St._Petersburg_100_2011 A_Stockholm_18_2012(11_12) A_Stockholm_14_2011(10_11) A_Stockholm_44_2012(12_13) A_Stockholm_13_2011(10_11) A_Iceland_59_2011 A_Uppsala_6_2011(10_11) A_Uppsala_5_2011(10_11) A_Umea_1_2011(10_11) A_Gothenburg_1_2011(10_11) A_Orebro_1_2011(10_11) A_Stockholm_20_2011(10_11) A_Hong_Kong_3934_2011 A_Stockholm_13_2010(10_11) A_Stockholm_19_2010(10_11) A_Stockholm_12_2010(10_11) A_Stockholm_11_2010(10_11) A_Malmoe_4_2011(10_11) A_Christchurch_16_2010 A_Stockholm_50_2012(12_13) A_Norway_120_2013 A_Paris_1878_2012 A_Czech_Republic_32_2011 A_Lviv_N6_2009 A_Hong_Kong_2212_2010 A_Bayern_69_2009 A_Dakar_20_2012 A_California_07_2009 A_California_04_ changes Säsongen 2013/2014 Vaccinstam 2013/2014 Tidigare säsonger: (10_11) (11_12) (12_13) Grupp/subgrupps-representanter Fylogenetiskt träd för influensa A(H1N1)pdm09, hemagglutinin (HA1) Grupp 6 Grupp 7 Grupp 5 Grupp 6 Subgrupp 6C Subgrupp 6B

18 A_Gothenburg_4_2013_v49 A_Stockholm_34_2013_v49 A_Stockholm_22_2013_v45 A_Stockholm_29_2013_v50 A_Gothenburg_2_2013(12_13) A_Sweden_8_2013(12_13) A_Belgium_S0923_2013 A_Gothenburg_3_2013_v34 A_Stockholm_16_2013(12_13) A_Stockholm_7_2013(12_13) A_Stockholm_8_2013(12_13) A_Malmoe_6_2013(12_13) A_Stockholm_6_2013(12_13) A_Stockholm_56_2013(12_13) A_Sweden_1_2013(12_13) A_Sweden_6_2013(12_13) A_Sweden_9_2013(12_13) A_Ghana_DILI-498_2013 A_Vladivostok_73_2013 A_Samara_73_2013 A_South_Africa_4655_2013 A_Stockholm_55_2012(12_13) A_Estonia_77365_2013 A_Stockholm_9_2013(12_13) A_Stockholm_41_2012(12_13) A_Stockholm_36_2013_v50 A_Umea_1_2012(11_12) A_Stockholm_14_2012(11_12) A_Texas_50_2012 A_Orebro_1_2012(11_12) A_Stockholm_2_2012(11_12) A_Stockholm_25_2011(11_12) A_Stockholm_32_2011(11_12) A_Stockholm_43_2011(11_12) A_Stockholm_13_2012(11_12) A_Sweden_12_2012(11_12) A_Sweden_9_2012(11_12) A_Ostersund_2_2011(11_12) A_Trollhattan_2_2012(11_12) A_Berlin_93_2011 A_Sweden_5_2013(12_13) A_Skovde_2_2013(12_13) A_Sweden_7_2013(12_13) A_Sweden_4_2013(12_13) A_Stockholm_1_2013(12_13) A_Stockholm_31_2013_v49 A_Stockholm_11_2013(12_13) A_Sweden_139_2013_v48 A_Stockholm_17_2013_v36 A_Stockholm_18_2013_v36 A_Estonia_76663_2013 A_Stockholm_30_2013_v48 A_Malmoe_5_2012(12_13) A_Uppsala_3_2012(12_13) A_Stockholm_10_2013(12_13) A_Gothenburg_7_2012(12_13) A_Stockholm_29_2012(12_13) A_Stockholm_36_2012(12_13) A_Stockholm_51_2012(12_13) A_Ireland_M28426_2013 A_Ghana_DARI-0098_2013 A_Norway_2418_2013 A_Sweden_1_2012(11_12) A_Ostersund_2_2012(12_13) A_Karlstad_1_2013(12_13) A_Gothenburg_8_2012(12_13) A_Uppsala_2_2012(12_13) A_Victoria_361_2011 A_Karlstad_3_2011(11_12) A_Stockholm_5_2012(11_12) A_Sweden_5_2012(11_12) A_Stockholm_26_2011(11_12) A_Stockholm_39_2012(12_13) A_Stockholm_18_2011 A_Cameroon_12V-5062_2012 A_Sweden_6_2012(11_12) A_Sweden_4_2012(11_12) A_Stockholm_39_2011(11_12) A_Stockholm_7_2012(11_12) A_Mahajanga_3628_2012 A_Maevatanana_974_2013 A_Athens_GR_112_2012 A_Stockholm_12_2012(11_12) A_Gothenburg_3_2011(11_12) A_Stockholm_29_2011(11_12) A_Malmoe_15_2011(11_12) A_Stockholm_34_2011(11_12) A_Stockholm_37_2011(11_12) A_Sweden_7_2012(11_12) A_Vaxjo_5_2012(11_12) A_Vaxjo_6_2012(11_12) A_Uppsala_1_2012(11_12) A_Umea_5 2011_(11_12) A_Sweden_3_2011(11_12) A_Stockholm_40_2011(11_12) A_Stockholm_49_2011(11_12) A_Malmoe_3_2012(11_12) A_Malmoe_2_2012(11_12) A_Sweden_4_2011(11_12) A_Stockholm_33_2011(11_12) A_Stockholm_4_2012(11_12) A_Madagascar_0648_2011 A_Stockholm_11_2012(11_12) A_Stockholm_22_2012(11_12) A_Galicia_RR9911_2012 A_Iowa_19_2010 A_Lisboa_SU91_2012 A_Stockholm_31_2011(11_12) A_Sweden_2_2012(11_12) A_Vaxjo_1_2012(11_12) A_Vaxjo_2_2012(11_12) A_Uppsala_11_2011(11_12) A_Sweden_11_2012(11_12) A_Stockholm_3_2012(11_12) A_Umea_6_2011(11_12) A_Umea_7_2011(11_12) A_Malmoe_1_2012(11_12) A_Stockholm_6_2012(11_12) A_Stockholm_28_2011(11_12) A_Stockholm_38_2011(11_12) A_Stockholm_41_2011(11_12) A_Stockholm_44_2011(11_12) A_Stockholm_45_2011(11_12) A_Uppsala_9_2011(11_12) A_Uppsala_10_2011(11_12) A_Vaxjo_4_2012(11_12) A_Vaxjo_1_2011(11_12) A_Stockholm_42_2011(11_12) A_Vaxjo_3_2012(11_12) A_Stockholm_23_2012(11_12) A_Stockholm_24_2012(11_12) A_Sweden_3_2012(11_12) A_Israel_20_2013 A_Plzen_22_2013 A_Stockholm_12_2013(12_13) A_Stockholm_30_2012(12_13) A_Stockholm_31_2012(12_13) A_Ostersund_3_2012(12_13) A_Ostersund_4_2012(12_13) A_Stockholm_37_2012(12_13) A_Stockholm_40_2012(12_13) A_Stockholm_38_2012(12_13) A_Stockholm_54_2012(12_13) A_Sweden_8_2012(11_12) A_Sweden_10_2012(11_12) A_Stockholm_19_2012(11_12) A_Uppsala_12_2011(11_12) A_Stockholm_20_2012(11_12) A_Stockholm_21_2012(11_12) A_Alabama_05_2010 A_Johannesburg_3495_2012 A_Minnesota_10_2012 A_Perth_16_2009 A_Norway_1186_2011 A_Norway_1330_2010 A_Brisbane_10_2007 A_Wisconsin_67_2005 A_Calefornia_7_2004 A_Wellington_1_2004 A_Fujian_411_2002 A_Moscow_10_99 A_Sydney_5_ changes Säsongen 2013/2014 Vaccinstam 2013/2014 Tidigare säsonger: (11_12) (12_13) Grupp/subgrupp-representanter Fylogenetiskt träd för influensa A(H3N2), hemagglutinin (HA1) S ub g r u p p 3 C Subgrupp 3A Subgrupp 3B

19 B_Stockholm_14_2013_v49 B_Austria_723028_2013 B_Jordan_30332_2013 B_Moscow_64_2013 B_Norway_2281_2013 B_Austria_735346_2013 B_Massachusetts_02_2012_cell B_Madagascar_01609_2013 B_Poland_6_2013 B_Estonia_55669_2011 B_Norway_2161_2013 B_Estonia_77391_2013 B_Dakar_17_2013 B_Hong_Kong_3577_2012 B_Stockhom_17_2011(10_11) B_Stockholm_6_2012(11_12) B_Stockholm_7_2012(11_12) B_Stockholm_8_2012(11_12) B_Stockholm_9_2012(11_12) B_Stockholm_9_2013(12_13) B_Stockholm_10_2013(12_13) B_Stockholm_11_2013(12_13) B_Stockholm_12_2013(12_13) B_Stockholm_16_2012(12_13) B_Stockholm_18_2012(12_13) B_Stockholm_19_2012(12_13) B_Stockholm_20_2012(12_13) B_Stockholm_21_2012(12_13) B_Trollhattan_1_2012(12_13) B_Stockholm_17_2012(12_13) B_Stockholm_1_2013(12_13) B_Stockholm_3_2013(12_13) B_Stockholm_5_2013(12_13) B_Sweden_7_2013(12_13) B_Massachusetts_02_2012_egg B_Malmoe_1_2011(10_11) B_Stockholm_2_2013(12_13) B_Belgium_S0929_2013 B_Belgium_G1077_2013 B_Tomsk_36_2013 B_South_Africa_4437_2013 B_Stockholm_4_2013(12_13) B_Karlstad_1_2013(12_13) B_Stockholm_6_2013(12_13) B_Stockholm_7_2013(12_13) B_Brisbane_3_2007 B_Stockholm_14_2012(12_13) B_Stockholm_15_2012(12_13) B_Kalmar_1_2012(12_13) B_Vaxjo_1_2012(12_13) B_Malmoe_1_2013_v47 B_Novosibirsk_1_2012 B_Stockholm_13_2012(12_13) B_Estonia_76615_2013 B_Antananarivo_1226_2013 B_Moramanga_1070_2013 B_Sweden_9_2013_v51 B_Sweden_10_2013_v51 B_Sweden_11_2013_v52 B_Poland_1_2013 B_Lithuania_9521_2013 B_CasteloBranco_PT_179_2013 B_Wisconsin_01_2010 B_Stockholm_12_2011 B_Stockholm_12_2011(10_11) B_Karlstad_1_2011(10_11) B_Sweden_2_2011(11_12) B_Stockholm_19_2011(11_12) B_Sweden_2_2012(11_12) B_Stockholm_4_2012(11_12) B_Stockholm_2_2012(11_12) B_Stockholm_11_2010(10_11) B_Stockholm_6_2010(10_11) B_St._Petersburg_24_2012 B_Florida_4_2006 B_Panama_46_90 B_Yamagata_16_88 B_USSR_100_83 B_Singapore_222_79 B_Odessa 3886_2010 B_St_Petersburg_27_2012 B_Stockholm_9_2011(10_11) B_Sweden_1_2011(10_11) B_Hong_Kong_514_2009 B_Stockholm_6_2011(10_11) B_Dakar_10_2012 B_Dakar_18_2013 B_Denmark_23_2012 B_England_393_2008 B_Brisbane_60_2008 B_Paris_1762_2009 B_Montana_06_2012 B_Norway_2090_2012 B_Hong_Kong_3534_2012 B_Sweden_3_2011(11_12) B_Jordan_30330_2013 B_Jordan_30266_2013 B_Sweden_1_2013(12_13) B_Leon_116_2013 B_Formosa_V2367_2012 B_Sweden_2_2013(12_13) B_England_226_2013 B_Malmoe_3_2012(12_13) B_Zamora_102_2013 B_Dakar_19_2013 B_Bratislava_911_2013 B_Estonia_77361_2013 B_Hungary_23_2013 B_Ireland_00125_2013 B_Stockholm_8_2011(10_11) B_Stockholm_11_2011(10_11) B_Stockholm_5_2011(10_11) B_Stockholm_13_2011(10_11) B_Stockholm_14_2011(10_11) B_Stockholm_16_2011(10_11) B_Stockholm_7_2010(10_11) B_Karlstad_3_2011(10_11) B_Stockholm_4_2011(10_11) B_Stockholm_15_2011(10_11) B_Stockholm_7_2011(10_11) B_Stockholm_10_2011(10_11) B_Orebro_1_2012(11_12) B_Stockholm_11_2012(11_12) B_Stockholm_5_2012(11_12) B_Stockholm_10_2012(11_12) B_Sweden_3_2013(12_13) B_Malta_MV636714_2011 B_Slovenia_1190_2013 B_Stockholm_3_2012(11_12) B_Stockholm_18_2011(10_11) B_Ozirgeti_542_2013 B_Johannesburg_3964_2012 B_Gothenburg_1_2013(12_13) B_Stockholm_8_2010(10_11) B_Malmoe_2_2011(10_11) B_Malaysia_2506_2004 B_Taiwan_55_2009 B_CAMBODIA_30_2011 B_HongKong_330_2001 B_Victoria_2_87 B_Beijing_1_87 B_Ann_Arbor_1_87 B_HongKong_05_ change Säsongen 2013/2014 Vaccinstam 2013/2014 Tidigare säsonger: (10_11) (11_12) (12_13) Grupprepresentanter Fylogenetiskt träd för influensa B, hemagglutinin (HA1) Grupp 2 Grupp 3 Yamagata-linjen Victoria-linjen Grupp 1