Utbildningsplan för civilingenjörsprogrammet i molekylär bioteknik vid Uppsala universitet, 300 hp, 2017/2018

Transkript

1 Utbildningsplan för civilingenjörsprogrammet i molekylär bioteknik vid Uppsala universitet, 300 hp, 2017/2018 Programmets syfte Studieplanen för civilingenjörsprogrammet i molekylär bioteknik är upplagd för att utbilda civilingenjörer med de kunskaper, färdigheter och förhållningssätt som behövs för att tillämpa och utveckla ny teknik inom ett brett område av bioteknik. Utbildningen omfattar beräkningsvetenskap, biologi, bioinformatik, datavetenskap, fysik, kemi, matematik och molekylärbiologi, samt deras tekniska tillämpningar. Under utbildningen läggs stor vikt på kunskaper och färdigheter inom kommunikation och etik eftersom det är viktigt för civilingenjörens roll i samhället. Programmet har tre profiler som alla syftar till att utbilda civilingenjörer med en helhetssyn där komplexa uppgifter kan lösas inom givna ramvillkor. På profilen Molekylär bioteknik för produktion är fokus att designa och utveckla cellulära produktionssystem för att framställa fysiska produkter, på profilen Tillämpad bioinformatik är fokus att hantera och analysera storskalig biologisk och biomedicinsk data, och på profilen Tillämpad molekylär biofysik är fokus att analysera och modellera biologiska och biomedicinska processer på molekyl- och cellnivå. 1

2 ÅRSKURS 1, civilingenjörsprogrammet i molekylär bioteknik, läsåret 2017/2018 Period Kurskod Kursens benämning Hp 1 Nivå/ Djup Huvudområde 11 1MA010 O Baskurs i matematik 5 G1N M Basic Course in Mathematics 1KB007 Grundläggande kemi (5) G1N K Basic Chemistry 1MB111 Introduktion till molekylär bioteknik 5 G1N B, T Introduction to Molecular Biotechnology 12 1KB007 Grundläggande kemi (forts.) (5) 10 G1N K Basic Chemistry 1MA025 Linjär algebra och geometri I 5 G1F M Linear Algebra and Geometry I 1MA013 Envariabelanalys, del 1 (5) G1F M Single Variable Calculus 13 1MA013 Envariabelanalys, del 2 (5) 10 G1F M Single Variable Calculus 1KB472 Grundläggande organisk kemi 10 G1F K, T Basic Organic Chemistry 14 1MB102 Cellbiologi 15 G1F B, T Cell Biology 1 Siffror inom parentes visar kursens arbetsbelastning under perioden. Siffror utan parentes visar när poäng på slutförd kurs kan inregistreras i UPPDOK. O Kurs som är markerad med fet stil är obligatorisk inom programmet. 2

3 ÅRSKURS 2, civilingenjörsprogrammet i molekylär bioteknik, läsåret 2017/2018 Period Kurskod Kursens benämning Hp Nivå/ Djup Huvudområde Anm.kod 21 1MA024 O Linjär algebra II 5 G1F M UU Linear Algebra II 1KB426 Bioteknisk metodik 5 G1F B, T, K UU Methods in Biotechnology 1MA016 Flervariabelanalys (5) G1F M UU Several Variable Calculus 22 1MA016 Flervariabelanalys (forts.) (5) 10 G1F M - Several Variable Calculus 1MA034 Transformmetoder 5 G1F M UU Transform Methods 1TD393 Beräkningsvetenskap I 5 G1F D, M, T UU Scientific Computing I FA104 Mekanik 5 G1F F, T Mechanics 1TD433 Programmeringsteknik I 5 G1N D, T Computer Programming I 1MB203 Biologisk mångfald- mönster och 5 G1F B processer Biological diversity- patterns and processes 24 1MB204 Bioinformatisk strukturbiologi 5 G2F B, T Structural Bioinformatics 1MS005 Sannolikhet och statistik 5 G1F M Probability and Statistics 1KB300 Kemisk termodynamik 5 G1F K, T Chemical Thermodynamics 3

4 ÅRSKURS 3, civilingenjörsprogrammet i molekylär bioteknik, läsåret 2017/2018 Period Kurskod Kursens benämning Hp 1 Nivå/ Djup Huvudområde Anm.kod 31 1FA528 O Elektromagnetism och vågrörelselära (5) G1F F, T UU Electromagnetism and Wave Physics 1TD722 Programmeringsteknik II 5 G1F D, T UU Computer Programming II 1MB311 Mikrobiologi 5 G2F B, T UU Microbiology 32 1KB501 Kvantmekanik och kemisk bindning I 5 G1F K, T UU Quantum Mechanics and Chemical Bonding I 1FA528 Elektromagnetism och vågrörelselära (5) 10 G1F F, T - Electromagnetism and Wave Physics 1DL301 Databasteknik I 5 G2F D, T, STS UU Database Design I 33 1MB331 Bioinformatisk metodik 5 G2F B, T, K Methods in Bioinformatics 1MB321 Genomik experimentella metoder 5 G2F T, B Genomics Experimental Methods 1MB344 Multivariat dataanalys och 5 G2F D, T försöksplanering Multivariate data analysis and experimental design 34 1MB332 Självständigt arbete i molekylär bioteknik Independent Project in Molecular Biotechnology 15 G2E T 1 Siffror inom parentes visar kursens arbetsbelastning under perioden. Siffror utan parentes visar när poäng på slutförd kurs kan inregistreras i UPPDOK. O Kurs som är markerad med fet stil är obligatorisk inom programmet. 4

5 Årskurs 4 och 5 föreslås få en omfattande förändring: - De två inriktningarna (Bioinformatik och Molekylär bioteknik) ersätts med tre profiler Molekylär bioteknik för produktion, Tillämpad bioinformatik och Tillämpad molekylär biofysik - Vi inför alternativa obligatoriska slutkurser i period 52, en för varje profil. De ska vara projektkurser där studenterna tillämpar kunskaper och färdigheter från tidigare kurser i skarpa projekt - Till slutkurserna krävs 30 hp relevanta förkunskapskurser på avancerad nivå - Tidigare har alla kurser hösten årskurs 4 varit obligaoriska det tar vi bort med undantag för 1TD395 Beräkningsvetenskap II som blir kvar som obligatorisk - Syftet med förändringen är att få till tydligare koppling mellan kurser på avancerad nivå och på så sätt garantera att alla studenterna uppfyller kravet på fördjupning samt generella färdigheter - Parallelt med utvecklingen av profiler har vi sett över kursutbudet årskurs 4 och 5 överlag och föreslår förändringar som ska matcha önskemål från studenter och arbetsgivare Nya kurser i förslaget: - 1MB447 Experimentella metoder i strukturbiologi, 10 hp (utökad version av 1MB443 Röntgenkristallografi) - 1MB448 Proteomik och metabolomik, 5 hp - 1TD328 Skriptprogrammering, 5 hp - 1MB459 Statistisk slutledning för bioinformatik, 5 hp - 1MB449 Fysikalisk molekylärbiologi, 5 hp - 1MB461 Molekylär evolution, 5 hp (första halvan av 1MB446 Molekylär evolution och fylogenianalys) - 1MB463 Immunteknik, 10 hp (teknikinriktad kurs som ersätter Immunologi) - 1MB462 Genomanalys, 10 hp (Sammanslagning av 1MB428 Genombiologi + 1MB445 Genombioinformatik) - 1MBXXX Automatiserad prediktiv modellering, 5 hp (teoridelen av 1MB525 Komplexa data, analys och visualisering) - 1MBXXX Fylogenianalys, 5 hp (andra halvan av 1MB446 Molekylär evolution och fylogenianalys) Befintliga kurser som går på andra program och som inkluderas i studieplanen - 1TE698 Nanoteknik för industriella tillämpningar inom life science, 5 hp - 1TE012 Innovationsledning och entreprenörskap, 10 hp - 1RT361 Kommunal och industriell avloppsrening, 5 hp (fortsättningskurs på 1RT490 Reglerteknik I) Kurser som utgår från studieplanen där innehållet inte överförs till någon ny kurs: - 1MB415 Diskret beräkningsbiologi, 10 hp - 1MB511 Beräknings- och systembiologi I, 15 hp - 1BG301 Protein Engineering, 15 hp - 1DL250 Programvaruteknik, 5 hp Ny tillvalskurs: - 1TE743 Industriell ekonomi, 5 hp - 1DL210 Algoritmer och datastrukturer I, 5 hp - 1MB205 Projekt i laborativ syntetisk biologi I, 15 hp (kurs i samband med igem, International Genetically Engineered Machine, en studentdrivet projekt där en sommarkurs ingår, grundläggande nivå) - 1MB405 Projekt i laborativ syntetisk biologi II, 15 hp (se ovan, avancerad nivå) Ordinarie kurs som blir tillvalskurs: - 1TD184 Optimeringsmetoder, 5 hp 5

6 ÅRSKURS 4, civilingenjörsprogrammet i molekylär bioteknik, 2017/2018 Period Kurskod Kursens benämning Hp Nivå/ Djup Huvudområde Anm.kod 41 1TD395 Beräkningsvetenskap II 5 A,B,C G1F D, T UU Scientific Computing II 1MB447 F Experimentella metoder i strukturbiologi 10 A A1N T UU Experimental Methods in Structural Biology 1MB448 B,P Proteomik och metabolomik 5 B,C A1N T, BK UU Proteomics and Metabolomics 1TD328 B Skriptprogrammering 5 B A1N D, T UU Script Programming 1RT490 Reglerteknik I 5 C G2F T, STS UU Automatic Control 42 1MB429 F,P Makromolekylära maskiner 5 A,B A1N T, MB UU Macromolecular Machines 1MB449 F,P Fysikalisk molekylärbiologi 5 A,B A1N T UU Physical Molecular Biology 1MB412 F Molekylär och statistisk mekanik 5 A A1N K, T, B UU Molecular and Statistical Mechanics 1KB756 P Processteknisk modellering 5 B A1N T, K UU Technology of Process Modelling 1TD396 Datoriserad bildanalys I 5 C A1N D, T UU Computer Assisted Image Analysis I 1MB416 B Kunskapsbaserade system inom 5 C A1N T, BK UU bioinformatik Knowledge-based Systems in Bioinformatics 1MB459 B Statistisk slutledning för bioinformatik Statistical Inference for Bioinformatics 5 C A1N T, BK UU MB431 F,P Mikrobiella reglermekanismer 5 A,B A1F T, MB Microbial Regulatory Mechanisms 1MB433 P Syntetisk biologi 10 A A1F T, MB, TBT Synthetic Biology 1MB463 Immunteknik 10 B A1N T, TBT Immune Technology 1MB461 B Molekylär evolution 5 C A1N T, BK Molecular Evolution 1DL471 B Informationshanteringssystem 10 C A1N D, T, BK Information Management Systems 44 1KB768 P Proteinbioteknologi 10 A A1N K, T, TBT Protein Biotechnology 1TD268 B Stora datamängder inom vetenskapliga 5 B A1N D, TBV, T tillämpningar Large Datasets for Scientific Applications 6

7 1MB462 B Genomanalys 10 B A1F T, BK Genome Analysis 1TE698 Nanoteknik för industriella tillämpningar 5 A,C A1N T inom life science Nanotechnology for Industrial Applications in Life Science 1TE012 Innovationsledning och entreprenörskap 10 C A1F T, TBT Innovation Management and Entrepreneurship Gäller studenter som påbörjat årskurs 4 läsår 2017/2018 eller senare: Krav på en av en av de obligatoriska slutkurserna i period 52 inom examen. Förkunskapskrav till slutkurserna för profilerna Molekylär bioteknik för produktion, Tillämpad bioinformatik, och Tillämpad molekylär biofysik är 30 hp av kurser årskurs 4 och 5 märkta med P, B, och F, respektive. I period undviks schemakrockar om kurser med samma bokstav efter poängtalet väljs. Kurserna i period 41 kan även läsas i period 51. 7

8 ÅRSKURS 5, civilingenjörsprogrammet i molekylär bioteknik, inriktning bioinformatik, läsåret 2017/18 Period Kurskod Kursens benämning Hp Nivå/Djup Huvudområde Anm.kod 51 1MB513 Tillämpad bioinformatik 10 A1F T, BK UU Applied Bioinformatics 1MB514 Populationsgenetisk analys 5 A1F B, T, BK UU Population Genetic Analysis 52 1MB525 Komplexa data analys och visualisering 15 A1N T, BK UU Complex Data - Analysis and Visualization MB931 Examensarbete i bioinformatik 30 A2E T Degree Project in Bioinformatics Engineering Entreprenörskolan i Uppsala 1 60 A1F T, INT INT School of Entrepreneurship in Uppsala 1 Ej platsgaranti. 8

9 ÅRSKURS 5, civilingenjörsprogrammet i molekylär bioteknik, inriktning molekylär bioteknik, 2017/2018 Period Kurskod Kursens benämning Hp Nivå/ Djup Huvudområde Anm.kod 51 1BG301 Protein engineering 15 A1F B, T, K UU Protein engineering 1KB446 Biosensorer 5 A1N K, T UU Biosensors 1KB457 Nanobioteknik 10 A1N K, T UU Nanobiotechnology 52 1KB764 Molekylär bioteknik för förnybar energi 15 A1F T, MB, K UU Molecular Biotechnology for Renewable Energy 1MB525 Komplexa data analys och 15 A1N T, BK UU visualisering Complex data - analysis and visualization MB930 Examensarbete i molekylär bioteknik 30 A2E T Degree Project in Molecular Biotechnology Engineering Entreprenörskolan i Uppsala 1 60 A1F T, INT UU School of Entrepreneurship in Uppsala 1 Ej platsgaranti. 9

10 ÅRSKURS 5, civilingenjörsprogrammet i molekylär bioteknik, 2018/2019 Preliminär Period Kurskod Kursens benämning Hp Nivå/ Djup Huvudområde 51 1RT361 Kommunal och industriell avloppsrening 5 A A1N T Municipal and Industrial Wastewater Treatment 1KB457 Nanobioteknik 10 B A1N K, T Nanobiotechnology 1KB446 P Biosensorer 5 A,B A1N K, T Biosensors 1MBXXX B,P Automatiserad prediktiv modellering 5 A,C A1F T, BK Automated Predictive Modeling 1MB514 Populationsgenetisk analys 5 C A1F B, T, BK Population Genetic Analysis 1MBXXX Fylogenianalys 5 C A1F T, BK Phylogenetics 52 1MBXXX Molekylär bioteknik för produktion 15 A1F T Molecular Biotechnology for Production eller 1KBXXX Tillämpad molekylär biofysik 15 A1F T Applied Molecular Biophysics eller 1MBXXX Tillämpad bioinformatik 15 A1F T, BK Applied Bioinformatics MB930 Examensarbete i molekylär bioteknik 30 A2E T Degree Project in Molecular Biotechnology Engineering Entreprenörskolan i Uppsala 1 60 A1F T, INT School of Entrepreneurship in Uppsala Gäller studenter som påbörjat årskurs 4 läsår 2017/2018 eller senare: Krav på en av en av de obligatoriska slutkurserna i period 52 inom examen. Förkunskapskrav till slutkurserna för profilerna Molekylär bioteknik för produktion, Tillämpad bioinformatik, och Tillämpad molekylär biofysik är 30 hp av kurser årskurs 4 och 5 märkta med P, B, och F, respektive. I period 51 undviks schemakrockar om kurser med samma bokstav efter poängtalet väljs. 1 Ej platsgaranti. 10

11 Tillvalskurser: Period Kurskod Kursens benämning Hp Nivå/ Djup Huvudområde Anm.kod 1 1DL210 Algoritmer och datastrukturer I 5 G1F D, T UU , 2, 3 1TE743 Industriell ekonomi 5 G1F INT 1 1TE743 Industriell ekonomi 5 G1F INT UU TE743 Industriell ekonomi 5 G1F INT UU , 3 1TE061 Industriell projektledning 5 G1F T, INT UU TD184 Optimeringsmetoder 5 A1N D, T UU FE030 Individ, organisation och ledarskap 5 GXX Fek 4 1KB425 Molekylär igenkänning i biologiska 15 A1F K system 1MB785 1 Bibliografiskt projekt 5 G2F T 1MB786 1 Bibliografiskt projekt 10 G2F T 1MB773 1 Forskningspraktik 10 A1N T 1MB774 1 Forskningspraktik 15 A1N T 1MB775 1 Forskningspraktik 20 A1N T 1MB MB MB381 2 Projekt i laborativ syntetisk biologi I Projekt i laborativ syntetisk biologi II Öppen fördjupningskurs i molekylär bioteknik och bioinformatik I 15 G1F T 15 A1N T 10 A1N B 1 Individuell kurs, kontakta examinator vid kursansvarig institution (IBG, för registrering. 2 Kursen utlyses efter särskild ordning. Kontakta kursansvarig institution (IBG, för information. 11