Utbildningsplan Masterprogram, beräknings- och systembiologi Master's Programme, Computational and Systems Biology, 120 credits 120,0 högskolepoäng Gäller för antagna till utbildningen fr o m HT11. Utbildningens mål Programmet ger studenterna kunskaper, färdigheter och nätverk för att fortsätta med företagande, teknik eller på forskningsledarspåret inom bioteknik- och läkemedelsindustrin, samt inom den akademiska världen i postgenom- och biosimuleringseran. Kunskap och förståelse En master i beräknings- och systembiologi: har en välutvecklad kunskap om metoder och resultat inom beräknings- och systembiologi, har en solid grund inom biomodellering, inklusive användningen av modelleringsverktyg och vanligt förekommande operativsystem, har en solid grund inom bioinformatik, inklusive kunskap om de viktigaste genomiska databaserna, praktisk kunskap i att använda dem, och i att förstå centrala bioinformatiska algoritmer, har en grundläggande kunskap om industriell ekonomi, entreprenörskap och projektledning. Färdigheter och förmågor En master i beräknings- och systembiologi: kan följa och utveckla bästa praxis inom industri, förvaltning och akademisk forskning, särskilt inom bioteknik och bio/it-sektorn, kan självständigt formulera och lösa biologiska modelleringsproblem, kan arbeta självständigt som bioinformatiker, inklusive konstruera enklare algoritmer, samt ändra och anpassa algoritmer i vetenskaplig och teknisk litteratur, kan arbeta inom medicin- eller biovetenskapliga forsknings- eller projektgrupper, och bidraga med modellerings- och bioinformatisk kompetens, kan arbeta framgångsrikt i internationella tvärvetenskapliga grupper bestående av personer med såväl teknisk som affärs-/företagsbakgrund, och ha nödvändiga färdigheter inom talad och skriven engelska, Utbildningsplan för Masterprogram, beräknings- och systembiologi antagna fr o m HT11. Sida 1 av 5
har grundläggande färdigheter i projektplanering, projektledning samt projektöversyn och -analys inom småföretag. Värderingsförmåga och förhållningssätt En master i beräknings- och systembiologi kan: självständigt analysera och förhålla sig till ekonomiska, miljömässiga och etiska konsekvenser av tillämpningar av beräknings- och systembiologi, och utforma system och lösningar med detta i åtanke, genom egenutveckling bibehålla sin professionella kompetens under sin karriär, följa diskussionen om teknik och användningen av teknik i samhället och bidraga till densamma. Härutöver gäller de liknande mål för masterexamen som definieras i högskoleförordningen. Utbildningens omfattning och innehåll Programmet omfattar 120 högskolepoäng, vilket vid normal studietakt motsvarar två år. Programmet är på avancerad nivå och undervisningsspråket är engelska. Programmet består av ett basblock följt av tre inriktningsströmmar: (i) biomodellering, (ii) bioinformatik och (iii) bioteknik och företagande. Kurserna inom basblocket är obligatoriska och utgör ungefär hälften av poängen på programmet. För att få ett tillräckligt djup inom en inriktning behöver studenten normalt slutföra kurser om minst 15 högskolepoäng bland profilkurserna inom inriktningsströmmen i fråga. Behörighet och urval Studenter på de civilingenjörsprogram där masterprogrammet i beräknings- och systembiologi berättigar till civilingenjörsexamen Studenter på de civilingenjörsprogram vid KTH där masterprogrammet i beräknings- och systembiologi berättigar till civilingenjörsexamen vid KTH får påbörja programmet om de vid terminsstarten har slutfört minst 150 högskolepoäng från årskurs 1 3 inklusive kandidatexamensarbete och nedan under särskilda behörighetskrav uppräknade kurser. De har garanterad plats på programmet. Ansökan görs senast 15 november. Övriga studenter Grundläggande behörighetskrav Kandidatexamen, motsvarande svensk kandidatexamen (180 högskolepoäng), från ett universitet erkänt av den svenska staten eller godkänt av någon annan erkänd organisation. God kunskap i skriven och talad engelska. Särskilda behörighetskrav Utbildningsplan för Masterprogram, beräknings- och systembiologi antagna fr o m HT11. Sida 2 av 5
Förkunskapskravet till masterprogrammet i beräknings- och systembiologi är en svensk eller utländsk examen motsvarande kandidatexamen på 180 högskolepoäng, med högskolepoäng inom följande ämnen: flervariabelanalys, linjär algebra och datalogi inklusive programmering. Sökanden måste också kunna visa att de besitter goda kunskaper i engelska, motsvarande Engelska B. Urval Urvalet till masterprogrammet i beräknings- och systembiologi är baserat på en sammantagen utvärdering av följande urvalskriterier: universitet, betyg (betygsmedelvärde), kurser av relevans för programmet, arbetslivserfarenhet samt referenser. Sökanden rekommenderas starkt att bifoga resultat från Graduate Record Examination (GREs allmänna prov såväl som från ett av ämnesproven i antingen datalogi, fysik, matematik eller biokemi, cell- och molekylärbiologi), för att underlätta utvärderingskommitténs arbete med att bedöma i vilken utsträckning urvalskriterierna är uppfyllda. Ytterligare information Fullständig information om behörighetskraven finns i KTHs lokala antagningsordning, se http://intra.kth. se/regelverk/utbildning-forskning/grundutbildning/antagning/1.27192 Utbildningens genomförande Utbildningens upplägg Läsåret omfattar 40 veckor och är vid KTH indelat i fyra perioder. Varje period omfattar ungefär sju veckor. Varje läsperiod följs av en tentamensperiod. Programmets första år ägnas huvudsakligen åt de obligatoriska kurserna inom basblocket. Andra året består huvudsakligen av valfria kurser och det avslutande examensarbetet. Kurser Utbildningen sker i kursform. Kurslistor finns i bilaga 1. Utbildningen sker i kursform med stort inslag av datorlaborationer och projekt, muntliga presentationer och föreläsningar, skriftliga rapporter, hemtentamina och vanliga skriftliga tentamina. Basblocket under år 1 består i huvudsak av obligatoriska kurser. Under år 2 är endast en kurs obligatorisk. Minst 15 högskolepoäng måste läsas inom den valda inriktningen. Betygssystem För kurser på KTH används en sjugradig målrelaterad betygsskala A-F som slutbetyg för kurser på grundnivå och avancerad nivå. A-E är godkända betyg med A som högsta betyg. Betygen godkänd (P) och underkänd (F) används som slutbetyg då särskilda skäl föreligger. Villkor för deltagande i utbildningen Utbildningsplan för Masterprogram, beräknings- och systembiologi antagna fr o m HT11. Sida 3 av 5
Inför varje termin (1 15 november resp. 1 15 maj) ska den studerande lämna en obligatorisk studieanmälan och göra kursval inför nästa termin. Minst 45 högskolepoäng måste vara klara under utbildningens första år (inklusive omtentamensperioden i augusti) för att studenten ska bli uppflyttad till år två på programmet. Studenterna måste välja inriktningsspår under programmets första år. Tillgodoräknanden Under vissa omständigheter, och i överenskommelse med programansvarig, kan högskolepoäng för tidigare studier tillgodoräknas i enlighet med KTHs lokala regler, se http://intra.kth.se/regelverk /utbildning-forskning/grundutbildning/prestationer/1.27200 Utlandsstudier Under vissa omständigheter, och i överenskommelse med programansvarig, kan studier genomföras vid andra universitet inom eller utanför Sverige. Högskolepoäng kan erhållas i enlighet med KTHs lokala regler, se http://intra.kth.se/regelverk/utbildning-forskning/grundutbildning/utbytesstudier/1.27222 Examensarbete I utbildningen ingår ett examensarbete för civilingenjörs-/masterexamen som är en kurs om 30 högskolepoäng. Merparten av kurserna måste vanligen vara slutförda innan examensarbetet påbörjas. Kurser motsvarande minst 60 högskolepoäng, däribland 10 högskolepoäng profilkurser inom vald inriktning, måste definitivt vara slutförda. Syftet med exmensarbetet är att studenten visar sin förmåga att utföra ett självständigt projektarbete med hjälp av de kunskaper som inhämtats på de i programmet ingående kurserna. Det är studentens ansvar att, med stöd från KTH, hitta en en lämplig uppgift för sitt examensarbete. Mer information om reglerna för examensarbeten vid KTH finns på http://intra.kth.se/regelverk /utbildning-forskning/grundutbildning/examensarbete/1.27212 Examen Teknologie masterexamen erhålls efter genomgånget utbildningsprogram. Programmet är utformat så att den studerande vid examen uppfyller de nationella examenskraven och har fullgjort kurser om 120 högskolepoäng där: minst 90 högskolepoäng utgörs av kurser på avancerad nivå, varav 60 högskolepoäng (inklusive 30 högskolepoäng examensarbete) med fördjupning inom huvudområdet för utbildningen. Studenterna måste ansöka om examen och också visa papper på sin kandidatexamen (eller motsvarande). Se KTHs lokala examensordning http://intra.kth.se/regelverk/utbildning-forskning/grundutbildning /examina/1.27227 Namn på examen Degree of Master of Science Teknologie masterexamen Utbildningsplan för Masterprogram, beräknings- och systembiologi antagna fr o m HT11. Sida 4 av 5
Bilaga 1 - Kurslista Bilaga 2 - Inriktningsbeskrivningar Utbildningsplan för Masterprogram, beräknings- och systembiologi antagna fr o m HT11. Sida 5 av 5
Bilaga 1: Kurslista Masterprogram, beräknings- och systembiologi (TBSBM), Utbildningsplan för kull HT2011 Utbildningsplan Beslutad utbildningsplan som PDF: Gällande för kull HT2011 Gemensamma kurser Årskurs 1 Obligatoriska kurser (51,0 Högskolepoäng) Kurskod Kursnamn Omfattning Utb. nivå DA2205 Vetenskapsteori och forskningsmetodik 7,5 hp Avancerad nivå DD2397 Tillämpad bioinformatik 7,5 hp Avancerad nivå DD2398 Kvantitativ systembiologi 7,5 hp Avancerad nivå DD2399 Omikdata och systembiologi 7,5 hp Avancerad nivå DD2435 Neuronnäts- och biomodellering 9,0 hp Avancerad nivå DD2450 Algoritmisk bioinformatik 6,0 hp Avancerad nivå SK2530 Introduktion till biomedicin 6,0 hp Avancerad nivå Rekommenderade kurser Kurskod Kursnamn Omfattning Utb. nivå DD2400 Cell- och molekylärbiologi 15,0 hp Avancerad nivå DD2401 Neurovetenskap 7,5 hp Avancerad nivå DD2432 Artificiella neuronnät och andra lärande system 6,0 hp Avancerad nivå DD2447 Statistiska metoder i datalogin 6,0 hp Avancerad nivå ME2806 From Science to Business 7,5 hp Avancerad nivå Utbildningsplan för Masterprogram, beräknings- och systembiologi antagna fr o m HT11. Bilaga 1, sida 1 av 3
Kompletterande information Under vårterminen väljs (minst) 9 hp rekommenderade, eller valfria, kurser. Årskurs 2 Obligatoriska kurser (73,5 Högskolepoäng) Kurskod Kursnamn Examensarbete inom biomedicinsk teknik, avancerad nivå DD225X Biomodeling, Bioinformatics Forskningsmetod inom industriell ekonomi ME2001 Biotech and entrepreneurship Examensarbete inom industriell ekonomi, avancerad nivå ME200X Biotech and entrepreneurship Project Management: Leadership and Control ME2016 Alla Omfattning Utb. nivå 30,0 hp Avancerad nivå 7,5 hp Avancerad nivå 30,0 hp Avancerad nivå 6,0 hp Avancerad nivå Rekommenderade kurser Kurskod Kursnamn Omfattning Utb. nivå BB2280 Molekylär modellering 7,5 hp Avancerad nivå BB2300 Beräkningskemi 7,5 hp Avancerad nivå BB2440 Bioinformatik och biostatistik 7,0 hp Avancerad nivå BB2470 Genetik och genomik 10,0 hp Avancerad nivå BB2510 Proteomik 6,0 hp Avancerad nivå DD2257 Visualisering 7,5 hp Avancerad nivå DD2352 Algoritmer och komplexitet 7,5 hp Avancerad nivå DD2390 Internetprogrammering 6,0 hp Avancerad nivå DD2402 Avancerad individuell kurs i beräkningsbiologi 6,0 hp Avancerad nivå DD2403 Avancerad individuell kurs i beräkningsbiologi 9,0 hp Avancerad nivå DD2431 Maskininlärning 6,0 hp Avancerad nivå DD2447 Statistiska metoder i datalogin 6,0 hp Avancerad nivå DN2266 Matematiska modeller, analys och simulering del 1 7,5 hp Avancerad nivå EL2320 Tillämpad estimering 7,5 hp Avancerad nivå EL2620 Olinjär reglering 7,5 hp Avancerad nivå EN2202 Mönsterigenkänning 7,5 hp Avancerad nivå EN2500 Informationsteori och källkodning 7,5 hp Avancerad nivå ME2018 Leading Temporary Organizations and Projects Ges ej 2012/2013 6,0 hp Avancerad nivå ME2064 Finansiell styrning i industriföretag 6,0 hp Avancerad nivå ME2800 Ideation - Creating a Business Idea 7,5 hp Avancerad nivå ME2802 Execution - Running your own Company 7,5 hp Avancerad nivå Utbildningsplan för Masterprogram, beräknings- och systembiologi antagna fr o m HT11. Bilaga 1, sida 2 av 3
ME2803 Growth - Managing Your Firm 7,5 hp Avancerad nivå ME2804 Social Innovation and Entrepreneurship 7,5 hp Avancerad nivå ME2813 Affärsmodeller innovation 7,5 hp Avancerad nivå SF1811 Optimeringslära 6,0 hp Grundnivå SF2960 Inferensteori 6,0 hp Avancerad nivå SK2520 Experimentella metoder inom molekylär biofysik 8,0 hp Avancerad nivå Kompletterande information Inriktningsspår är: 1. 2. 3. Biomodeling Bioinformatics Biotech and Entrepreneurship ME2016 är obligatorisk för alla. DD225X är obligatorisk inom 1. och 2. ME200X och ME2001 är obligatoriska inom 3. Rekommenderade kurser inom dessa spår är: 1. 2. 3. BB2280, BB2300, DD2402, DD2403, DD2431, DD2447, DD2257, DN2266, EL2320, EL2620, EN2202, SK2520, SF1811, vid Stockholms universitet: MM7016 Matematiska dynamiska modeller i biologi DD2352, DD2431, DD2390, DD2402, DD2403, DD2447, DN2266, BB2280, BB2300, BB2440, BB2470, BB2510, EL2320, EL2620, EN2202, EN2500, SF1811, SF2960, vid Stockholms universitet: MF3003 Biostatistik för fysiker och KB8007 Komparativ genomik ME2018, ME2064, ME2813, ME2800, ME2802, ME2803, ME2804, DD2431, DD2390 Utbildningsplan för Masterprogram, beräknings- och systembiologi antagna fr o m HT11. Bilaga 1, sida 3 av 3
Bilaga 2: Inriktningar Masterprogram, beräknings- och systembiologi (TBSBM), Utbildningsplan för kull HT2011 Utbildningsplan Beslutad utbildningsplan som PDF: Gällande för kull HT2011 Programmet har inga inriktningar. Utbildningsplan för Masterprogram, beräknings- och systembiologi antagna fr o m HT11. Bilaga 2, sida 1 av 1