Ackrediteringens omfattning Klinisk mikrobiologi. Metod/ Mätprincip. Komponent/Undersökning. Bilaga 2a /536

Transkript

1 Klinisk bakteriologi Clostridium difficile ribotypning Isolat från: feces PCR Sekvenator Ribotyp lika/olika Corynebacterium diphtheriae typning och toxinbestämning Isolat från: svalg, sår Biokemi Toxintest påvisad/ ej påvisad Toxin påvisat/ej påvisat EHEC Isolat från: feces, blod, urin, livsmedel, miljöprov Virulensgener påvisade/ej påvisade Enterokocker resistensgener helgenom Isolat från: feces, blod, urin Next Generation Sequencing Ion Chef/ Ion Torrent/ Extraktionsrobot påvisad samt resistensgener påvisade/ej påvisade Legionella pneumophila sekvensbaserad typning Isolat från: sputum,, borstprov, bronksekret, trakealsekret sekvensanalys Sekvenstyp Legionella species artbestämning sekvensering av mip-genen Isolat från: Sputum,, borstprov, bronksekret, trakealsekret sekvensanalys 1(9)

2 Legionella species artbestämning Isolat från: sputum,, borstprov, bronksekret, trakealsekret Masspektrometri MALDI Biotyper Listeria monocytogenes helgenom Mycobacterium tuberculosis komplexet typning Isolat från: blod, likvor, placenta, ascites ledvätska, livsmedel Isolat från: sputum,, biopsi, bronkialsekret, pleuravätska, vävnadsprov, abscess, punktat, ventrikelsköljvätska, urin Next Generation Sequencing fragmentanalys Ion Chef/ Ion Torrent/ Extraktionsrobot påvisad samt serotyp/ taxon ej påvisad Sekvenstyp Mycobacterium tuberculosis komplexet spoligotypning Isolat från: sputum,, biopsi, bronkialsekret, pleuravätska, vävnadsprov, abscess, punktat, ventrikelsköljvätska,urin hybridisering CCD-kamera Spoligo octalnummer Mycobacterium tuberculosis komplexet resistensbestämning Isolat från: sputum,, biopsi, bronkialsekret, pleuravätska, vävnadsprov, abscess, punktat, ventrikelsköljvätska,urin Fluorescens Bactec MGIT 960 Känslig/Resistent (modifierad SIR) Pertussis IgG antitoxin (PT) ELISA Spektrofotometer IU/mL 2(9)

3 Resistensbestämning Isolat från: feces, sår, blod, urin, näsa, svalg Diskdiffusion mm SIR Resistensbestämning Isolat från: feces, sår, blod, urin, näsa, svalg Gradienttest mg/l SIR Salmonella typning Isolat från: feces, blod, urin, sår, abscess, miljöprov Agglutination Serotyp Staphylococcus aureus - nuc, meca/mecc, PVL Isolat från: feces, sår, blod, urin, näsa, svalg PCR Microchip-baserat elektroforessystem Resistensgen, toxingen påvisad/ ej påvisad Staphyloccus aureus spa-typning Isolat från: feces, sår, blod, urin, näsa, svalg sekvensanalys Sekvenstyp Streptococcus pyogenes typning Isolat från: blod, likvor, svalg, cervix, sår sekvensanalys Sekvenstyp Streptococcus pneumoniae typning Isolat från: nasopharynx, sputum, hörselgång, sinus, blod, likvor Geldiffusion påvisad samt serotyp/ej påvisad 3(9)

4 Streptococcus pneumoniae typning Isolat från: nasopharynx, sputum, hörselgång, sinus, blod, likvor Agglutination Serotyp Streptococcus pneumoniae typning Isolat från: nasopharynx, sputum, hörselgång, sinus, blod, likvor Kapselsvällning Faskontrastmikroskop Serotyp Klinisk parasitologi Cryptosporidium/Cyclospora/Cytoisospora Feces Sputum Ziehl-Neelsen-färgning Mikroskopi Echinococcus spp Ig ELISA Spektrofotometer Arbiträr enhet Echinococcus spp IgG Western Blot Påvisad/ej påvisad Entamoeba histolytica Ig Entamoeba histolytica IgG ELISA Spektrofotometer Arbiträr enhet IFL Fluorescensmikroskop Titer Entamoeba histolytica/dispar Feces Abscessmaterial 4(9)

5 Fecesparasiter, cystor och maskägg Feces Koncentrering Mikroskopi Leishmania spp Hud Blod (EDTA) Giemsafärgning Mikroskopi Plasmodium Ig Pneumocystis jiroveci Sputum Bronkialsekret Pleuravätska Ascites Trakealsekret Munsköljvätska Vävnadsprov IFL Fluorescensmikroskop Titer IFL Fluorescensmikroskop 5(9)

6 Pneumocystis jiroveci Sputum Bronkialsekret Pleuravätska Ascites Trakealsekret Munsköljvätska Vävnadsprov Schistosoma spp ägg Urin Membranfiltrering Mikroskopi Schistosoma spp Ig ELISA Schistosoma spp Ig IFL Toxocara IgG ELISA Spektrofotometer Arbiträr enhet IFL Fluorescensmikroskop Titer ELISA Spektrofotometer Påvisad/ej påvisad Toxoplasma Amnionvätska material Cerebrospinalvätska Blod (EDTA) Glaskropp 6(9)

7 Toxoplasma gondii IgM ISAGA Påvisad/ej påvisad Toxoplasma gondii IgG Agglutination Titer Trypanosoma cruzi Ig ELISA Spektrofotometer Påvisad/ej påvisad Klinisk virologi Enterovirus inklusive Poliovirus Feces Likvor Svalgprov Svalgsköljvätska Isolering på cellkultur Enterovirus genotypning Feces Likvor Svalg Svalgsköljvätska Isolat från: feces, likvor, svalg, svalgsköljvätska PCR och sekvensering PCR påvisad samt typ/ ej påvisad Influensavirus A och B typning, subtypning och linjetypning Näsprov Nasofarynx Likvor Obduktionsmaterial Extraktionsrobot Påvisad/ej påvisad 7(9)

8 Influensavirus Nasofarynx Svalgsköljvätska Svalgprov Cellkultur från: Nasofarynx Svalgsköljvätska Svalg Likvor Isolering på vävnadskultur Mässlingvirus IgG ELISA Spektrofotometer miu/ml Parotitvirus IgG ELISA Spektrofotometer Titer Puumalavirus IgM Rabiesvirus IgM/IgG ELISA Spektrofotometer Påvisad/ej påvisad Neutralisationstest Fluorescensmikroskop IU/mL Rubellavirus IgG ELISA Spektrofotometer IU/mL 8(9)

9 TBE-virus IgM ELISA Spektrofotometer Påvisad/ej påvisad Provtagning omfattas inte av ackrediteringen. Om laboratoriet ändå själv utför provtagning omfattas provningen inte av ackrediteringen. Verksamhet utanför de egna laboratorielokalerna, s.k. fältverksamhet, ingår inte i ackrediteringen. Ackrediteringsomfattningen är flexibel enligt vad som anges i detta beslut. Det ackrediterade organet skall alltid kunna tillhandahålla en uppdaterad lista över den aktuella omfattningen för sin ackreditering. 9(9)