Litteratursökning och referenshantering MATTHIAS BANK, MEDICINSKA FAKULTETEN, BIBLIOTEK & IKT

Transkript

1 Litteratursökning och referenshantering MATTHIAS BANK, MEDICINSKA FAKULTETEN, BIBLIOTEK & IKT

2 Dagens upplägg Databassök Övning PubMed Repetition PubMed Strukturera frågeställningen Embase Web of Science

3 Upplägg (forts.) Referenshantering EndNote

4 Övning sök i PubMed Finns det vetenskaplig evidens att probiotiska bakterier, t.ex. lactobacilli, kan förebygga gastrointestinala sjukdomar - i möss? - i människan? Vilka specifika sjukdomar är det som kan förebyggas eller behandlas med probiotiska bakterier?

5 Diskutera i smågrupper Svårigheter när man söker i PubMed

6 Produceras av National Library of Medicine (NLM) Fritt tillgängligt Ca 25 miljoner referenser Bevakar cirka 5600 tidskrifter

7 Välj sökord Ta inte för många sökord Fritext i PubMed fungerar bra, PubMed korrigerar felstavningar bred sökning Använd MeSH (Medical subjet headings) för att fokusera sökningen/öka relevansen

8 Ämnesord - vad är MeSH? Det naturliga språket är mångfaldigt Vissa databaser har ett kontrollerat vokabulär synonymer mappas mot preferred terms Diabetes mellitus, type 1 Sudden-Onset Diabetes Mellitus; Diabetes Mellitus, Type I; IDDM; Insulin-Dependent Diabetes Mellitus 1 Artiklarna taggas/indexeras med preferred terms Relevansen av träffarna höjs

9 MeSH: exempel Lactobacillus

10 Mesh versus fritext MeSH: bra för bredare termer, t.ex. sjukdomar, celltyper, mikroorganismer, species Fritext: nya behandlingsmetoder, labbteknik, nya läkemedel

11 Logiska operatorer AND OR NOT Standardoperatorn är AND.

12 Filters i PubMed Studietyp, publikationstyp Abstract available Publikationsår Humans, animals Språk Åldersgrupper (för kliniska studier)

13 Före sökningen Tänk igenom ditt informationsbehov Är syftet att få en översikt över ett nytt, bredare område? hitta allt i ett avgränsat forskningsfält? hitta det senaste i ett avgränsat fält?

14 PICO strukturera frågeställningen P: Problem, population, etc. I: Intervention C: Comparison, control, jämförelse O: Outcome criteria, effektmått

15 Frågeställnings komponenter (PICO). SBU: Utvärdering av metoder i hälso- och sjukvården. Stockholm 2013.

16 Sökstrategi building blocks Steg 1 Steg 2 Steg 3 Kombinera termer med AND/OR AND Kombinera termer med AND/OR AND Kombinera termer med AND/OR

17 Övning, sök PubMed Användning av probiotiska bakterier mot gastrointestinala sjukdomar i människan vilka risker och säkerhetsaspekter finns det?

18 Strukturering Gastrointestinal diseases in humans Probiotics OR AND lactobacillus AND Risks, safety

19 Embase Innehåller 32 millioner litteraturreferenser inom humanmedicin och angränsande områden > nya referenser/år Täcker ca tidskrifter Klinisk och pre-klinisk medicin, cellbiologi Enastående täckning av läkemedelsforskning

20 Sökresultat Embase versus PubMed Sökterm Embase PubMed Neoplasms - breast neoplasms - intestinal neoplasms - lung neoplasms Cardiovascular diseases - myocardial infarction Multiple sclerosis Quality of life

21 EmTree Embase ämnesordslista, innehåller preferred terms och synonymer Täcker även hela MeSH, automatisk mappning av MeSHtermer till Emtree-termer

22 Emtree versus MeSH Emtree MeSH

23 Sökuppgift Hitta litteratur om tillväxt egenskaper hos Escherichia coli Growth characteristics Hitta artikeln Juergensmeyer MA et al. Shaking alone, without concurrent aeration, affects the growth characteristics of Escherichia coli. Letters in Applied Microbiology, ,

24 Web of Science Interdisciplinär databas Bevakar ca tidskrifter Pearl growing strategi: Leta upp en viktig artikel (pärla) och kolla vilka andra artiklar som har citerat den Ämnessökning, fördelning av publikationerna över forskare tidskrifter institutioner länder

25 Sökuppgifter Web of Science Hitta artikeln Saarela M et al. Probiotic bacteria: safety, functional and technological properties. Journal of Biotechnology, (3): Hur ofta har artikeln citerats? Leta upp artiklar om probiotiska bakterier där minst 1 författare har Lunds universitet som affiliering

26 Journal Citation Reports (JCR) Journal impact factor: Antalet citeringar delat på antalet publikationer IF for 2015, Trends in Microbiology

27 Litteraturreferenser Hoonhorst S, Timens W, Koenderman L, Lo Tam Loi A, Lammers J, Ten Hacken N, et al. Increased activation of blood neutrophils after cigarette smoking in young individuals susceptible to COPD: subtitle. Respiratory Research. 2014; 15(10): Referenser - viktiga delar: Författare Titel Tidskrift Volym, häfte (evtl), sidnummer

28 EndNote Spara dina litteraturreferenser Spara fulltexter Referera korrekt i Word, bibliografi i Word

29 Till sist Har du frågor? Kontakta oss gärna vid infodisken eller via nätet. Telefon bibliotek BMC: Personligt