Correlations between unexplained infertility and single nucleotide polymorphism in the genes of leukemia inhibitory factor receptor and gp130
|
|
- Hugo Lundqvist
- för 6 år sedan
- Visningar:
Transkript
1 Correlations between unexplained infertility and single nucleotide polymorphism in the genes of leukemia inhibitory factor receptor and gp130 Marwa Malki Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi Biomedicinska analytikerprogrammet Examensarbete, 15 högskolepoäng Handledare: Anneli Stavreus-Evers Institutionen för kvinnors och barns hälsa Akademiska sjukhuset, Uppsala
2 Abstract About 30 % of all infertile couples suffer from infertility of an unexplained cause. Leukemia inhibitory factor (LIF) is a glycoprotein produced by the endometrium and is an important cytokine in the implantation process. LIF exerts its biological functions through heterodimerization of its two receptors: LIF receptor (LIFR) and gp130. Point mutations in the LIF gene have been associated with female infertility. The aim of this study was to investigate whether single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the genes of LIFR and gp130 could cause reduced fertility in women. To this end, 115 samples from women diagnosed with unexplained infertility and 191 samples from fertile women were studied. Three SNPs in the gp130 gene and two SNPs in the LIFR gene were analyzed using real-time PCR. One significant difference and a tendency to difference were detected in the gp130 gene for women with unexplained infertility. There were no differences in the LIFR gene variations. In conclusion, polymorphisms in gp130, and thereby disturbances in the LIF pathway, could be one cause for infertility in women diagnosed with unexplained infertility. Key words: Female infertility, leukemia inhibitory factor, mutation, blastocyst implantation, genotyping.
3 Introduktion Ofrivillig infertilitet drabbar mer än 10 % av alla par (Altmäe et al., 2009). Av dessa par är omkring 30 % infertila av okänd orsak och får därmed diagnosen oförklarad infertilitet (Aghajanova et al., 2009). Kvinnor med oförklarad infertilitet har ingen tydlig orsak till sin ofrivilliga barnlöshet. De har normala ovulationscykler, normala hormonprofiler, inga organpatologier och ingen rubbning i endometriets mognad som kan ge en minskning av implantationsreceptiviteten. Det finns inte heller några belägg för att deras partner orsakar infertiliteten (Altmäe et al., 2010). Två faktorer krävs för att en kvinna ska kunna bli gravid: ett livsdugligt embryo och ett mottagligt endometrium. Hos oförklarat infertila kvinnor har embryon av hög kvalitet återförts men ändå har ingen graviditet inträffat (Aghajanova 2010). Implantation av ett embryo när embryo fäster vid uterusväggen är en kritisk punkt vid graviditeten. Självständigt utvecklade preimplantationsembryon blir då beroende av den moderliga miljön och ett kontrollerat samspel fordras för embryots fortsatta utveckling (Stewart et al., 1992). Viktiga interaktioner mellan embryo och endometrium startar dock redan innan embryot fäster till epitelytan i uterus. Tillväxthormoner och cytokiner produceras aktivt av både blastocyst och endometrium. Samspelet sker dels genom sekretion av flera ligander från embryo till receptorerna leukemia inhibitory factor (LIF), fukosylerade oligosackarider och ghrelin på endometriet. Det sker även genom sekretion av endometriets ligander till receptorer uttryckta på det tidiga embryot såsom LIF, heparin-binding epidermal growth factor-like growth factor (HB-EGF) och insulin growth factor. Därefter följer en komplex kaskad av cell-cell och parakrina interaktioner mellan embryot och moderns endometrieyta. Blastocysten fäster till endometriet och decidualiseringen en adaption av uterus för att möjliggöra implantation i endometriet ökar. Detta följs av att trofoblaster tränger in i endometriet för att senare bilda en placenta (Aghajanova 2010, Lindhard et al., 2002). Ett mottagligt endometrium är en väsentlig faktor vid implantation och följer en kvinnas menstruationscykel. Menstruationscykeln delas in i tre perioder efter de förändringar som sker i endometriet: menstruationsfas, proliferationsfas och sekretionsfas. Under menstruationsfasen sker en avstötning av endometriets ytskikt som sedan återuppbyggs i proliferationsfasen. Endometriet förbereds för implantation av ett embryo vid sekretionsfasen och det är endast under en specifik tid i mitten av fasen som en implantation kan inträffa. Denna period kallas
4 window of implantation (WOI) och sker då komplexinteraktioner mellan flera faktorer skapar ett receptivt endometrium för blastocystimplantation. Ett samspel med olika signalsubstanser mellan embryo och moderns uterus är alltså viktigt för en lyckad implantation. Leukemia inhibitory factor (LIF) är ett av de viktigaste och mest studerade ämnena relaterade till en lyckad implantation (Aghajanova et al., 2009, Aghajanova 2010). LIF identifierades och karaktäriserades första gången genom dess förmåga att sätta igång differentiering av myeloiska leukemiceller (Gearing et al., 1987). Sedan dess har LIF visats vara viktigt i flera biologiska aktiviteter, däribland en lyckad implantation av ett embryo. LIF-mRNA och -protein produceras in vivo i mänsklig uterus och uttrycks i livmoderkörtlar under menstruationscykelns sekretionsfas. LIF har detekterats under WOI hos både fertila och infertila kvinnor, dock med betydligt lägre koncentrationer hos oförklarat infertila kvinnor (Laird et al., 1997). LIF är ett glykoprotein tillhörande gruppen interleukin-6 (IL-6). Cytokinerna i gruppen har en liknande struktur och har transmembranproteinet gp130 som gemensam signalreceptor. Växelverkan av LIF sker genom heterodimerisering av leukemia inhibitory factor receptor (LIFR). Dess aktivering sker genom att LIF binder till LIFR som finns på cellytan och är ett transmembranprotein bestående av två subenheter: LIF receptor-β (LIFRβ) och gp130. LIF binder specifikt till LIFRβ med låg affinitet och vid bindning induceras en konformationsändring av komplexet som skapar en heterodimerisering av subenheterna. På så sätt skapas ett receptor-ligandkomplex med hög affinitet. Komplexet kan inducera en signal och därmed aktivera de intracellulära signaleringsvägarna janus kinase/signal transducer and activator of transcription (JAK/STAT), mitogen-activated protein kinase (MAPK) och phosphatidylinositol-3-kinase/serine-threonine protein kinase (PI3K/AKT) (Kimber, 2005, Song et al., 2006, Aghajanova 2010). JAK/STAT spelar en viktig roll i regleringen av bland annat cellapoptos, differentiering och proliferation, MAPK främjar celladhesion, proliferation, migration och överlevnad medan PI3K/AKT reglerar cellmetabolism, proliferation och överlevnad (Dressen et al., 2007). SOCS1-genen kodar för proteinet supressor of cytokine signaling 1 som inhiberar JAK/STAT genom samverkan med dess receptor JAK. SOCS1 inhiberar därmed LIFmedierad signalering och är uttryckt under tidig graviditet i human placenta (Aghajanova et al., 2009). Genom immunofärgning har det visats att endometriet från fertila kvinnor har höga nivåer av LIFR och gp130 jämfört med låga SOCS1-nivåer under menstruationscykelns sekretionsfas. Denna reglering skiljer sig hos kvinnor med oförklarad infertilitet, där istället
5 nivån av SOCS1 i endometriet är högre kombinerat med lägre halter av LIFR och gp130. Det är därför troligt att signaleringsvägen för LIF är påverkad hos dessa kvinnor och möjligtvis kan vara en förklaring till deras infertilitet (Aghajanova et al., 2009). Mutationer misstänks vara orsak till barnlösheten hos infertila kvinnor, men några underliggande genetiska förändringar har inte kunnat påvisas (Giess et al., 1999). Stewart et al. har i en studie av knock-out möss visat ett samband mellan infertilitet och LIF-gendefekt. Möss med LIF-genen inaktiverad utvecklades normalt och visade inga större fenotypiska förändringar med enda undantaget att honmöss med en homozygot LIF-geninaktivering inte blev gravida. Honorna var fertila blastocyster hittades i deras uterus men dessa kunde varken implanteras eller utvecklas. Uterus visade endast ett mycket litet tecken på decidualisering; den var blek och mindre vaskulär än normalt. Blastocysterna var dock livsdugliga och kunde implanteras samt utvecklas hos en recipient utan LIF-defekt. Vad gäller hanmöss med homozygot inaktivering på LIF-genen har det visats att dessa är fertila och kan få avkomma med både honor utan LIF-defekt och heterozygot-defekta honor (Stewart et al. 1992). Förutom vid preimplantation och implantation har LIF visats vara viktig även vid embryoutveckling och placentation. Möss med en LIFR-mutation visar en störd placentation vilket leder till dålig intrauterin näring hos fostret och postnatal död inom 24 timmar. En homozygot genmutation i gp130 gör dock att fostret dör före födseln, möjligen som konsekvens av dess funktion hos även de andra cytokinerna tillhörande IL-6 gruppen (Lindhard et al., 2002). Undersökningar har gjorts av infertilitet hos människor som konsekvens av mutationer hos LIF-genen. Giess et al. undersökte alla tre kodande exoner på den mänskliga LIF-genen för att påvisa eventuell förekomst av mutationer hos kvinnor med infertilitet av olika orsaker. Det antogs att kvinnor med en homozygot defekt skulle vara helt infertila och att kvinnor med en heterozygot defekt av translationen skulle ha en reducerad biotillgänglighet och/eller strukturella förändringar av produkten av LIF-genen. Heterozygota punktmutationer i LIF hittades hos ett fåtal kvinnor med infertilitet. Motsvarande regioner i LIF-proteinet tror man är mycket viktiga för växelverkan med LIFR och förändringar i dessa borde därför leda till en minskad biologisk aktivitet av LIF-proteinet. Endast en homozygot polymorfism hittades i en icke-kodande region och bland fertila kontroller. Resultaten antyder att en heterozygot form av en LIF-genmutation kan ge upphov till minskad tillgänglighet och/eller biologisk aktivitet av LIF i uterus och leda till infertilitet hos kvinnor (Giess et al., 1999). En senare studie där sambandet mellan mutationer och infertilitet också undersöktes stöder inte hypotesen att LIF-
6 genmutationer kan orsaka implantationsmisslyckanden. I den studien upptäcktes ingen mutation bland infertila kvinnor (Steck et al., 2004). Nyligen gjordes ännu en studie av hur en mutation i LIF-genen kan påverka fertiliteten. Frekvensen av mutationer i LIF-genen visar sig vara förhöjd hos infertila kvinnor i jämförelse med fertila. Studien visar även att mutationerna hos infertila kvinnor kan kompenseras och att en behandling därmed kan lyckas (Novotny et al. 2009). Det gäller även för gendefekta möss där chansen till embryoimplantation ökar vid behandling som ökar nivån av LIF-mRNA (Giess et al., 1999). En människas genom består till 99,9 % av DNA-sekvenser som är identiska mellan olika individer. Resterande 0,1 % representerar främst så kallade single nucleotide polymorphism (SNP) som är den vanligaste formen av genetisk variation hos människan. SNP innebär en substitution av ett enkelt baspar och inträffar med en frekvens av cirka 1 baspar (bp) per 1000 bp. För att mutationen ska kunna betecknas som en SNP ska den minst förekommande genotypen ha en frekvens på minst 1 % hos en befolkning (Johnson et al., 2004). Syftet med min studie var att studera SNP hos kvinnor med diagnosen oförklarad infertilitet och att jämföra dessa med SNP hos fertila kvinnor. Undersökningen gjordes på generna som kodar för receptorerna LIFR och gp130 och hypotesen var att SNP i dessa gener kan vara en bakomliggande orsak till oförklarad infertilitet. Genen som kodar för LIFR har sitt lokus i kromosom 5 och innehåller mer än 70 kilobaspar (kb) med 20 exoner (Tomida et al., 1996). Gp130-genen, som har storleken 51 kb, finns också i kromosom 5 och innehåller 17 exoner (Szalai et al., 2000). Material och metod Provmaterial Försöksmaterialet innefattade 306 prover tagna vid Akademiska sjukhuset, Uppsala, Sverige och Karolinska Institutet i Huddinge, Stockholm, Sverige. Proverna hade samlats sedan 2007 och förvarats vid -20ºC eller -70ºC. Från vissa av proverna hade DNA tidigare renats fram från fryst helblod. Av proverna var 115 från kvinnor med diagnosen oförklarad infertilitet och 191 från kvinnor som blivit gravida på naturligt sätt. Projektet var godkänt av etikprövningsnämnden (Dnr: 2009/498) och var en del av en stor studie där också LIF- samt SOCS1-genen blev analyserade.
7 DNA-extrahering DNA renades fram enligt QIAamp DNA Blood Maxi kit, (QIAGEN, Hilden, Tyskland), med få undantag. All centrifugering gjordes i 20ºC. Överföring till filterkolonn gjordes i två steg med centrifugering vid 1000 x g i 3 min efter varje gång. Tvätt utfördes genom centrifugering vid 1780 x g 2 min med tvättbuffert AW1 och 20 min med tvättbuffert AW2. Eluering av DNA gjordes genom tillsats av 800 µl elueringsbuffert (AE) två gånger med centrifugering vid 1780 x g 2 min efter första och 5 min efter andra tillsatsen. Eluatet samlades upp för att sedan frysas -20ºC/-70ºC. Koncentrationsbestämning Koncentrationsmätning av DNA gjordes enligt Quant-iT dsdna BR Assay Kit, (invitrogen, Eugene, OR USA) med en Qubit fluorometer (invitrogen, Eugene, OR USA). SNP-genotypning med realtids-pcr PCR-maskinen som användes för analysen var StepOnePlus Real-Time PCR System (Applied Biosystems, Foster City, CA USA). Följande SNP-primers användes för genotypningen; TaqMan SNP Genotyping Assays (Applied Biosystems, Foster City, CA USA) med Assay ID C_ _10 (rs ), C_ _10 (rs891012), C_ _10 (rs ), C_ _10 (rs ) och C_ _10 (rs ). SNP-primer späddes 1:4 i Tris-EDTA buffert (TE). En stamlösning innehållande primer samt TaqMan Universal PCR Master Mix (Applied Biosystems, Foster City, CA USA) tillreddes. Varje brunn på en PCR-platta med 96 brunnar innehöll 1,25 µl utspädd primer, 12,5 µl Master Mix samt 10,25 µl DNas-fritt vatten. Slutligen tillsattes 1 µl DNA från försöksmaterialet i varje brunn och 1 µl DNas-fritt vatten i tre brunnar för negativa kontroller. Plattan centrifugerades 220 x g i 2 min (4ºC). PCR-analysen innefattade ett initialt steg på 95ºC i 10 min, därefter 45 cykler med 92ºC i 15 sek och 60ºC i 1 min enligt TaqMan SNP Genotyping Assays Protocol, (Applied Biosystems, Foster City, CA USA).
8 Statistiska analyser Statistiska analyser gjordes med programmet Statistical Package for Social Sciences statistical software (SPSS v. 17,0 for PC; SPSS Inc., Chicago, IL USA). Ett p-värde räknades ut enligt Pearson s Chi Square med samma program och värden 0,05 ansågs som statistiskt signifikanta. Uträkningar av eventuella avvikelser från Hardy-Weinbergs jämviktslag gjordes (Microsoft Office Excel 2007, Microsoft Corporation, Redmond, WA USA) och ett värde mellan 0,05> >3,8 godkändes. Resultat Analysen med fluorometer visade att det erhållna DNA:t var av tillräcklig renhet för en analys med PCR. SNP analyserades i generna för gp130 samt LIFR genom de tag SNP som valts till studien. Polymorfismer i gp130-genen (rs , rs och rs ) visas i tabell 1. Polymorfismer i LIFR-genen (rs och rs ) visas i tabell 2. Gruppen infertila kvinnor separerades från fertila kontroller. Alla resultat var inom jämvikt för Hardy- Weinbergs lag vilket ses i båda tabellerna. I tabellerna ses även frekvensen av homozygota och heterozygota genotypsvariationer samt allelfrekvens hos båda dessa grupper. Signifikanta skillnader i allelfrekvens mellan kontroller och infertila hittades i polymorfismen A/T för rs med en prevalens för A på 89 % respektive 95 % (p=0,015). I övrigt sågs inga signifikanta skillnader mellan grupperna (tabell 1 och 2). Tabell 1: Heterozygot och homozygot polymorfism samt allelfrekvens i genen gp130. Grupperna med fertila kvinnor och kvinnor med diagnosen oförklarad infertilitet har frånskilts. visar Hardy- Weinbergs jämviktstest. P-värdet är enligt Pearson s Chi Square och indikerar statistisk signifikans på skillnaden mellan studiegrupperna. Kontroller n (%) Infertila n (%) p-värde Gp130 AA 161 (80,9) 96 (89,7) rs AT 34 (17,1) 11 (10,3) A/T TT 4 (2,0) 0,180 0 (0,0) 0,575 0,083 p (A) 0,894 0,949 q (T) 0,106 0,051 0,015 Gp130 TT 0 (0,0) 0 (0,0) rs TC 14 (7,0) 14 (13,1) [T/C] CC 185 (93,0) 0, (86,9) 0,469 0,064 p (T) 0,035 0,065 q (C) 0,965 0,935 0,068 Gp130 AA 98 (49,7) 49 (45,8) rs AG 78 (39,6) 46 (43,0) [A/G] GG 21 (10,7) 0, (11,2) 0,809 0,803 p (A) 0,695 0,673 q (G) 0,305 0,327 0,314
9 Tabell 2: Heterozygot och homozygot polymorfism och allelfrekvens i genen LIFR. Grupperna med fertila kvinnor och kvinnor med diagnosen oförklarad infertilitet har frånskilts. visar Hardy- Weinbergs jämviktstest. P-värdet är enligt Pearson s Chi Square och indikerar statistisk signifikans på skillnaden mellan studiegrupperna. Kontroller n (%) Infertila n (%) p-värde LIFR GG 6 (3,0) 7 (6,5) rs GA 67 (33,7) 31 (29,0) [G/A] AA 126 (63,3) 0, (64,5) 0,187 0,282 p (G) 0,198 0,210 q (A) 0,802 0,790 0,403 LIFR TT 0 (0,0) 0 (0,0) rs TC 21 (10,6) 7 (6,6) [T/C] CC 177 (89,4) 0, (93,4) 0,725 0,174 p (T) 0,053 0,033 q (C) 0,947 0,967 0,180 Diskussion Genvariationer har visats spela en stor roll för människors benägenhet till olika sjukdomar (Johnson et al., 2004). Frågeställningen i min studie var om genvariationer även har en betydelse i reproduktionsförmågan hos kvinnor. För detta ändamål studerades generna för LIFR och gp130, de två receptorer som behövs för LIF-aktivering. LIF är en viktig cytokin i samspelet mellan endometrium och embryo vid implantation (Aghajanova 2010). De SNP i gp130-genen som valts för studien finns på genens intron: rs på intron 15, rs på intron 14 och rs på intron 5. Introner kodar inte för aminosyrasyntes vid translation och därför sker inget direkt utbyte av aminosyror i samband med polymorfism. Man har visat att polymorfism i introner kan påverka splitsning av mrna och/eller transkription i en gen och därmed ändra kvaliteten och/eller kvantiteten på mrna- och proteinuttrycket (Suzuki et al., 2004). Ingen av de SNP som analyserades i den här studien har tidigare undersökts i relation till fertilitet och reproduktion. SNP i rs och rs (gp130-genen) har studerats där en association till metabolt syndrom hittats (Gottardo et al., 2008). Polymorfism i gp130 i övrigt har även associerats till risk för myelom (Birmann et al., 2009), kardiovaskulära sjukdomar (Benrick et al., 2008), typ-2 diabetes (Wang et al., 2005) och fetma (Wolford et al., 2003). Polymorfism i rs i gp130-genen visade sig skilja grupperna infertila samt fertila kvinnor i min studie. Dessutom hade fertila kvinnor en högre frekvens av minor allele och homozygota mutationer i denna SNP än infertila kvinnor. Frågan blir därför om homozygota
10 mutationer och högre frekvens av minor allele är fördelaktig för kvinnors reproduktionsförmåga. Liknande resultat visades i en studie där oförklarad infertilitet associerades med polymorfism i en gen inblandad i folatmetabolism. I den studien hittades en högre frekvens av homozygota mutationer i solute carrier family -genen hos fertila kontroller än hos infertila kvinnor (Altmäe et al., 2009). I övrigt visade polymorfism i rs (gp130-genen) en tendens att skilja grupperna åt (p=0,064). Studien innefattade sammanlagt 306 prover varav 115 var från oförklarat infertila kvinnor, vilket är en stor omfattning för en sådan studiegrupp. Ännu fler personer skulle därför antagligen inte ha gett en statistisk signifikans på rs De SNP som undersökts i LIFR-genen är båda på icke-kodande nedströmsregioner. Här hittades inga skillnader i polymorfism mellan de två grupperna. Man kan dock inte veta om detta gäller hela LIFR-genen eller om det bara var dessa icke-kodande regioner som inte visade intressanta resultat. Ingen slutsats kan därför dras vad gäller LIFR-genen. I denna studie användes TaqMan realtids-pcr för analys av SNP. PCR-metoden använder två specifika prober där varje probe är komplementär till var sin allel-variant i en polymorfism. Genom fluorescens går det att mäta vilka prober som kunnat binda till DNA-strängen och på så sätt få ett svar på genotypen. Metoden är robust, felnivån i genotypning är mycket låg och metoden går att automatisera, vilket minskar risken för laborativa felkällor. Resultaten erhålls enkelt och direkt genom mätning av fluorescensen (Seeb et al., 2009). Tidigare har metoder baserade på restriction fragment length polymorphism (RFLP) använts mycket för att detektera SNP. Restriktionsenzymer (endonukleaser) klyver regionerna av polymorfism på DNA-strängen och genom användning av gel-elekrofores separeras fragmenten. Antal och storlek på fragmenten anger polymorfismen. I jämförelse med realtids- PCR är denna metod dyrare, samt mer arbets- och tidskrävande. Dessutom kräver den manuell avläsning vilket inkluderar felkällor på den mänskliga faktorn. Avläsningen kan också lätt bli felaktig på grund av ofullständig enzymklyvning av endonukleaset (Johnson et al., 2004). Pyrosekvensering är en annan DNA-sekvenseringsmetod där komplementära strängar till en DNA-sträng syntetiseras enzymatiskt. Bindning av nukleotider till en DNA-mall får pyrofosfat (PPi) att lösgöras och ATP att bildas. Genom en enzymreaktion leder detta till att ljus att genereras, vilket blir ett mått på DNA. Metoden är enkel och använder sig av varken märkta primers, märkta nukleotider eller gel-elektrofores. Pyrosekvensering är en alternativ metod till realtids-pcr. Precisionen, felnivån och tidsåtgången är ungefär desamma för de två
11 metoderna. Med pyrosekvensering erhålls också enkelt ett resultat som är tillförlitligt (Nordfors et al., 2002). Kvinnor med oförklarad infertilitet är en ovanlig studiegrupp eftersom den inte anses vara homogen. Dessutom kan vissa av kvinnorna ha blivit felaktigt diagnosticerade som oförklarat infertila när den egentliga orsaken är endometrios. Endometrios är en kronisk inflammatorisk sjukdom som kan leda till infertilitet hos kvinnor. Den kännetecknas av en extrauterin tillväxt av endometriets körtlar och stroma (Novotny et al., 2009). Sjukdomen kan endast säkerställas med laparoskopi och i de fall då detta inte gjorts och en kvinna inte visat några kliniska tecken till sjukdomen kan hon ha fått en felaktig diagnos (Altmäe et al., 2009). Sammanfattningsvis visar min studie att polymorfism i gp130-genen kan bidra till problem med bindning av LIF och andra interleukiner och därmed orsaka reproduktionsproblem hos vissa kvinnor med oförklarad infertilitet. Detta kan vara en delförklaring till försämrad fertilitet hos kvinnor. Analys av fler SNP skulle dock ha kunnat ge en större kunskap om hur genetiska variationer påverkar fertiliteten. Homozygota mutationer i gp130-genen och en högre frekvens av minor allele har visat sig vara bättre för fertilitet, eftersom frekvensen av dessa var högre hos fertila än hos infertila kvinnor i min studie. Polymorfism i LIFR-genen som orsak till infertilitet kunde inte påvisas.
12 Acknowledgement Ett stort tack till Anneli Stavreus-Evers för en mycket bra handledning i mitt projekt. Jag vill även tacka Theodora Kallak för all hjälp med experiment, uträkningar och tolkningar och ett tack till Signe Altmäe för hjälp med informationssökning och skrivarbete. Referenser Aghajanova L. Update on the role of leukemia inhibitory factor in assisted reproduction. Current Opinion in Obstetrics and Gynecology 2010; 22: Aghajanova L, Altmäe S, Bjuresten K, et al. Disturbances in the LIF pathway in the endometrium among women with unexplained infertility. Fertility and Sterility 2009; 91: Altmäe S, Martínez-Conejero JA, Salumets A, et al. Endometrial gene expression analysis of the time embryo implantation in women with unexplained infertility. Molecular Human Reproduction 2010; 16: Altmäe S, Stavreus-Evers A, Ruiz JR, et al. Variations in folate pathway genes are associated with unexplained infertility. Fertilty and Sterility 2009; Epub ahead of print. Benrick A, Jirholt P, Wernstedt I, et al. A non-conservative polymorphism in the IL-6 signal transducer (IL6ST)/gp130 is associated with myocardial infarction in a hypertensive population. Regulatory Peptides 2008; 146: Birmann BM, Tamimi RM, Giovannucci E, et al. Insulin-like growth factor-1- and interleukin-6-related gene variation and risk of multiple myeloma. Cancer Epidemiology, Biomarkers & Prevention 2009; 18: Dressen O, Brivanlou AH. Signaling pathways in cancer and embryonic stem cells. Stem Cell Reviews 2007; 3:7-17. Gearing DP, Goughl NM, King JA, et al. Molecular cloning and expression of cdna encoding a murine myeloid leukaemia inhibitory factor (LIF). The EMBO Journal 1987; 6: Giess R, Tanasescu I, Steck T, et al. Leukemia inhibitory factor gene mutations in infertile women. Molecular Human Reproduction 1999; 5: Gottardo L, De Cosmo S, Zhang YY, et al. A polymorphism at the IL6ST (gp130) locus is associated with traits of the metabolic syndrome. Obesity 2008; 16: Johnson VJ, Yucesoy B, Luster MI. Genotyping of single nucleotide polymorphisms in cytokine genes using real-time PCR allelic discrimination technology. Cytokine 2004; 27:
13 Kimber SJ. Leukemia inhibitory factor in implantation and uterine biology. Reproduction 2005; 130: Laird SM, Tuckerman EM, Dalton CF, et al. The production of leukemia inhibitory factor by human endometrium: presence in uterine flushings and production by cells in culture. Human Reproduction 1997; 12: Lindhard A, Bentin-Ley U, Ravn V, et al. Biochemical evaluation of endometrial function at the time of implantation. Fertility and Sterility 2002; 78: Nordfors L, Jansson M, Sandberg G, et al. Large-scale genotyping of single nucleotide polymorphisms by pyrosequencing and validation against the 5 nuclease (TaqMan ) assay. Human Mutation 2002; 19: Novotny Z, Krizan J, Sima R, et al. Leukemia inhibitory factor (LIF) gene mutations in women diagnosed with unexplained infertility and endometriosis have a negative impact on the IVF outcome. A pilot study. Folia Biologica (Praha) 2009; 55: Seeb JE, Pascal CE, Ramakrishnan R, et al. SNP genotyping by the 5 -nuclease reaction: advances in high-throughput genotyping with nonmodel organisms. Methods in Molecular Biology 2009; 578: Song H, Lim H. Evidence for heterodimeric association of leukemia inhibitory factor (LIF) receptor and gp130 in the mouse uterus for LIF signaling during blastocyst implantation. Reproduction 2006; 131: Steck T, Giess R, Suetterlin MW, et al. Leukemia inhibitory factor (LIF) gene mutations in women with unexplained infertility and recurrent failure of implantation after IVF and embryo transfer. European Journal of Obstetrics & Gynecology and Reproductive Biology 2004; 112: Stewart CL, Kaspar P, Brunet LJ, et al. Blastocyst implantation depends on maternal expression of leukemia inhibitory factor. Nature 1992; 359: Suzuki A, Ji G, Numabe Y, et al. Single nucleotide polymorphisms associated with aggressive periodontitis and severe chronic periodontitis in Japanese. Biochemical and Biophysical Research Communications 2004; 317: Szalai C, Toth S, Falus A. Exon-intron organization of the human gp130 gene. Gene 2000; 243: Tomida M, Gotoh O. Structure of the Gene Encoding the Human Differentiation-Stimulating Factor/Leukemia Inhibitory Factor Receptor. Journal of Biochemistry 1996; 120: Wang H, Zhang Z, Chu W, et al. Molecular screening and association analyses of the interleukin 6 receptor gene variants with type 2 diabetes, diabetic nephropathy, and insulin sensitivity. Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism 2005; 90: Wolford JK, Colligan PB, Gruber JD, et al. Variants in the interleukin 6 receptor gene are associated with obesity in Pima Indians. Molecular Genetics and Metabolism 2003; 80:
Så fäster embryot i livmoderslemhinnan Musslor och patogena mikroorganismer Hearing om delegation och legitimering
Nr 1 februari 2003 Tidskrift för Institutet för biomedicinsk laboratorievetenskap Så fäster embryot i livmoderslemhinnan Musslor och patogena mikroorganismer Hearing om delegation och legitimering Faktorer
Läs merCirkulerande cellfritt DNA
Cirkulerande cellfritt DNA - en introduktion Anne Ricksten Equalismöte 2016-11-14 Vad är cirkulerande fritt DNA (cfdna)? Extracellulärt DNA som finns i cirkulationen Fragmenterat DNA, medelstorlek på ca
Läs merCORRELATION BETWEEN ENDOMETRIAL MARKERS AND PREGNANCY OUTCOME IN WOMEN WITH UNEXPLAINED INFERTILITY Liselotte Runesson
Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi Biomedicinska analytikerprogrammet Examensarbete, 15 högskolepoäng CORRELATION BETWEEN ENDOMETRIAL MARKERS AND PREGNANCY OUTCOME IN WOMEN WITH UNEXPLAINED
Läs merDelprov 3 Vetenskaplig artikel
Delprov 3 Vetenskaplig artikel # of Questions: 15 Question #: 1 I denna uppgift ska du läsa en vetenskaplig artikel (CHCHD2 mutations in autosomal dominant late-onset Parkinson s disease: a genome-wide
Läs merLaboration DNA. Datum:16/11 20/ Labgrupp: 11 Laboranter: Johanna Olsson & Kent Johansson
Laboration DNA Datum:16/11 20/11 2015 Labgrupp: 11 Laboranter: Johanna Olsson & Kent Johansson Material och metod Materiallista hänvisas till labhandledning s.3 (BIMA15 ht 2015, Lab III: DNA.) Uppsamling
Läs merGenetik II. Jessica Abbott
Genetik II Jessica Abbott Nukleosid Sockergrupp + kvävebas Kvävebaser: Puriner (adenin, guanin) Pyrimidiner (cytosin, thymin i DNA, uracil i RNA) Basparning A=T G C Packning av DNA i eukaryot cellkärna
Läs merKarl Holm Ekologi och genetik, EBC, UU. ebc.uu.se. Nick Brandt. Populationsgenetik
Karl Holm Ekologi och genetik, EBC, UU karl.holm@ ebc.uu.se Nick Brandt Populationsgenetik Kursens upplägg Föreläsningar 24/4, 10:15-16:00 Friessalen Introduktion, HWE 27/4, 10:15-16:00 Inavel 28/4, 10:15-16:00
Läs merReproduktions- Immunologi
Reproduktions- Immunologi Tolerans av placenta och foster Immunsvar & Tolerans Antigen Immunsystemet Främmande Immunsvar Kroppseget Tolerans Graviditet: En utmaning för immunsystemet Skydda fostret från
Läs merDNA-labb / Plasmidlabb
Översikt DNA-labb Plasmidlabb Preparation och analys av -DNA från Escherichia coli Varför är vi här idag? Kort introduktion till biokemi och rekombinant DNA- teknologi Vad skall vi göra idag? Genomgång
Läs merTidiga erfarenheter av arvets mysterier
Cellens genetik Cellen Växtcellen Växtcellen Tidiga erfarenheter av arvets mysterier Artförädling genom riktad avel Religiösa förbud mot syskongiftemål Redan de gamla grekerna.. Aristoteles ~350 år före
Läs merSkrivning för biolog- och molekylärbiologlinjen, genetik 5p.
Skrivning för biolog- och molekylärbiologlinjen, genetik 5p. Namn: Adress: Resultat: Betyg: Hjälpmedel: Miniräknare. Formelblad med tabell. Skrivtid: 9.00-13.00. Beräkningar och svar ska vara motiverade.
Läs merDNA FRÅN BLOD & KINDCELLER
EQUALIS Användarmöte, Molekylärdiagnostik 2012 Quality Hotel, Ekoxen, Linköping 7 8 november, 2012 DNA FRÅN BLOD & KINDCELLER Majid Osman, kemist, PhD Klinisk kemi, Linköping DNA stabilitet Provtagning
Läs merBestämning av antalet aktiva CYP2D6 genkopior (CNV) med Pyrosequencing. Anna-Lena Zackrisson PhD. anna-lena.zackrisson@rmv.se
Bestämning av antalet aktiva CYP2D6 genkopior (CNV) med Pyrosequencing Anna-Lena Zackrisson PhD INTRODUKTION LINKÖPINGSENHETEN RÄTTSMEDICIN RÄTTSKEMI RÄTTSGENETIK INTRODUKTION Sammanställa genetisk information
Läs merNo association between folate intake, pregnancy outcome and single nucleotide polymorphisms in the MTHFR gene in women with unexplained infertility
Institutionen för kvinnors och barns hälsa Biomedicinska analytikerprogrammet Examensarbete 15 hp, VT 2013 No association between folate intake, pregnancy outcome and single nucleotide polymorphisms in
Läs merTillämpning av olika molekylärbiologiska verktyg för kloning av en gen
IFM/Kemi Linköpings Universitet September 2011/LGM Projektlaboration i genteknik Tillämpning av olika molekylärbiologiska verktyg för kloning av en gen Innehållsförteckning Inledning... 3 Amplifiering
Läs merRNA-syntes och Proteinsyntes
RNA-syntes och Proteinsyntes Jenny Flygare (jenny.flygare@ki.se) Genexpression - översikt 5 (p) A T G T C A G A G G A A T G A 3 (OH) T A C A G T C T C C T T A C T 3 (OH) 5 (p) VAD TRANSLATERAS DEN HÄR
Läs merTentamen. Lycka till! Medicin A, Molekylär cellbiologi. Kurskod: MC1004. Kursansvarig: Christina Karlsson. Datum 120512 Skrivtid 4h
Tentamen Medicin A, Molekylär cellbiologi Kurskod: MC1004 Kursansvarig: Christina Karlsson Datum 120512 Skrivtid 4h Totalpoäng: 88p Poängfördelning Johanna Sundin: fråga 1-10: 18p Ignacio Rangel: fråga
Läs merHundar hjälper oss att förstå människans sjukdomar. Kerstin Lindblad-Toh
Hundar hjälper oss att förstå människans sjukdomar Kerstin Lindblad-Toh Målsättning med min forskning Att hitta människors sjukdomsgener via: - djurmodeller - en bättre förståelse av arvsmassan - storskalig
Läs mer) / (c l) -A R ) = (A L. -ε R. Δε = (ε L. Tentamen i Biomätteknik (TFKE37), 9 januari Uppgift 1 (10p)
Tentamen i Biomätteknik (TFKE37), 9 januari 2014. Uppgift 1 (10p) För akronymerna FT- IR, AUC, AFM, UV och MALDI: a) Skriv ut förkortningen! b) Föreslå för varje metod två egenskaper hos biomolekyler som
Läs merSyfte? Naturliga populationer i Trollsvattnen. Otoliter för åldersbestämning. Vävnadsprover för genetisk analys
Syfte? Inblick i vanlig genotypbestämningsmetod Allozymer har ofta använts som genetisk markör vid populationsgenetiska studier Studera genetisk variation inom och mellan populationer används inom bevarandebiologin
Läs merEndometrios. Ann-Kristin Örnö MD, PhD Department of Obstetrics and Gynecology, Clinical Sciences, Lund University, Lund, Sweden
Endometrios Ann-Kristin Örnö MD, PhD Department of Obstetrics and Gynecology, Clinical Sciences, Lund University, Lund, Sweden Endometrium utanför uterus. Lokalisation; främst i lilla bäckenet nära uterus
Läs merDNA-analyser: Diagnosticera cystisk fibros och sicklecellanemi med DNA-analys. Niklas Dahrén
DNA-analyser: Diagnosticera cystisk fibros och sicklecellanemi med DNA-analys Niklas Dahrén Diagnosticera cystisk fibros med DNA-analys Cystisk fibros Vad innebär sjukdomen?: Sjukdomen innebär att de epitelceller
Läs merLab-perspektiv på Lupusträsket. Maria Berndtsson, Karolinska Universitetslaboratoriet
Lab-perspektiv på Lupusträsket Maria Berndtsson, Karolinska Universitetslaboratoriet Bakgrund Diagnostik Komplicerande faktorer Externkontroller Framtid/förbättringar 2 Lab-perspektiv på Lupusträsket Vad
Läs merKod: Personnummer: Plats nr: Inlämnad kl: ID kollad: Poäng: Betyg: SKRIV DIN KOD PÅ ALLA SIDOR ÄVEN OM FRÅGAN LÄMNAS OBESVARAD.
STOCKHOLMS UNIVERSITET Institutionen för biologisk grundutbildning Cell och molekylärbiologi 2015-02-02 Omtentamen CMB-II (11 hp) Kod: Personnummer: Plats nr: Inlämnad kl: ID kollad: Poäng: Betyg: Skrivtiden
Läs merHundar hjälper oss att förstå människans sjukdomar. Kerstin Lindblad-Toh
Hundar hjälper oss att förstå människans sjukdomar Kerstin Lindblad-Toh Målsättning med min forskning Att hitta människors sjukdomsgener via: - djurmodeller - en bättre förståelse av arvsmassan - storskalig
Läs merMolekylärbiologisk diagnostik av tarmparasiter
Molekylärbiologisk diagnostik av tarmparasiter Vad, När, Var och Hur? Jessica Ögren Länssjukhuset Ryhov Juni 2012 Molekylärbiologiska metoder De senaste två decennierna har molekylärbiologiska tekniker
Läs merSara Ekvall, doktorand Inst. för immunologi, genetik & patologi Uppsala universitet Handledare: Marie-Louise Bondeson & Göran Annerén
Sara Ekvall, doktorand Inst. för immunologi, genetik & patologi Uppsala universitet Handledare: Marie-Louise Bondeson & Göran Annerén Celler & DNA Vår kropp är uppbyggd av ~100 000 miljarder celler I cellen
Läs merImmunohistochemical study of hemoglobin-related proteins in endometrium from fertile and infertile women
Immunohistochemical study of hemoglobin-related proteins in endometrium from fertile and infertile women Abdulhak Sida Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi Biomedicinska analytikerprogrammet
Läs merGenetik. - cellens genetik - individens genetik. Kap 6
Genetik - cellens genetik - individens genetik Kap 6 Vad bestämmer hur en organism (cell) ser ut och fungerar? Generna (arvsanlagen) och miljön Hur går det till? En gen är en ritning för hur ett protein
Läs merHemoglobinutredningar på Karolinska. Christin Sisowath Sjukhuskemist Karolinska Universitetslaboratoriet, Klinisk kemi
Hemoglobinutredningar på Karolinska Christin Sisowath Sjukhuskemist Karolinska Universitetslaboratoriet, Klinisk kemi Analyser på Karolinska för hemoglobinutredningar Hemoglobinfraktioner HPLC (HbA 2 och
Läs merScreening av fetalt RHD i maternell plasma. Åsa Hellberg BMA, PhD Klinisk immunologi och transfusionsmedicin Labmedicin Skåne
Screening av fetalt RHD i maternell plasma Åsa Hellberg BMA, PhD Klinisk immunologi och transfusionsmedicin Labmedicin Skåne När används blodgruppsgenomisk typning? oberoende analys vid oklara serologiska
Läs merHysteroskopisk kirurgi & Uterusmissbildningar
Hysteroskopisk kirurgi & Uterusmissbildningar Arne Rådestad Aleris Specialistvård Nacka sjukhus Reproduktionsmedicin april 2018 Etiology of uterine leiomyomas From C Walker and E.Stewart Uterine Fibroids:
Läs merDNA-LCT -13910 C>T, Taqman alleldiskriminering, Malmö
1(5) DNA-LCT -13910 C>T, Taqman alleldiskriminering, Malmö Bakgrund, indikation och tolkning Enzymet laktas finns i tunntarmens enterocyter och möjliggör digestionen av diasackariden laktos/mjölksocker
Läs merHardy-Weinberg jämnvikt Processer som minskar genetisk variation: Inavel Genetisk drift
Populationsgenetik Hardy-Weinberg jämnvikt Processer som minskar genetisk variation: Inavel Genetisk drift Processer som ökar genetisk variation: Mutationer Migration Miljömässiga förändringar Balancen
Läs merTaqMan Sample-to-SNP Kit - evaluation of kit for low-cost and fast preparing of DNA-samples before genotype analysis
Institutionen för Biokemi och Mikrobiologi Biomedicinska analytikerprogrammet Examensarbete 15 hp, vt 2009 TaqMan Sample-to-SNP Kit - evaluation of kit for low-cost and fast preparing of DNA-samples before
Läs merÄr trafikrelaterade avgaser en riskfaktor för astma hos vuxna? Lars Modig
Är trafikrelaterade avgaser en riskfaktor för astma hos vuxna? Lars Modig Vad vet vi om fordonsavgaser och luftvägsbesvär/sjukdomar bland vuxna? Luftföroreningar påverkar luftvägarna Experimentella studier
Läs merGenetisk testning av medicinska skäl
Genetisk testning av medicinska skäl NÄR KAN DET VARA AKTUELLT MED GENETISK TESTNING? PROFESSIONELL GENETISK RÅDGIVNING VAD LETAR MAN EFTER VID GENETISK TESTNING? DITT BESLUT Genetisk testning av medicinska
Läs merNUKLEINSYRORNAS UPPBYGGNAD: Två olika nukleinsyror: DNA deoxyribonukleinsyra RNA ribonukleinsyra
NUKLEINSYRORNAS UPPBYGGNAD: Två olika nukleinsyror: DNA deoxyribonukleinsyra RNA ribonukleinsyra Monomererna som bygger upp nukleinsyrorna kallas NUKLEOTIDER. En nukleotid består av tre delar: en kvävebas
Läs merPedagogisk planering Bi 1 - Individens genetik
Centralt innehåll Genetik Arvsmassans uppbyggnad samt ärftlighetens lagar och mekanismer. Celldelning, dnareplikation och mutationer. Genernas uttryck. Proteinsyntes, monogena och polygena egenskaper,
Läs merSammanfattning Arv och Evolution
Sammanfattning Arv och Evolution Genetik Ärftlighetslära Gen Information om ärftliga egenskaper. Från föräldrar till av komma. Tillverkar proteiner. DNA (deoxiribonukleinsyra) - DNA kan liknas ett recept
Läs merFramtida tekniker MLPA (Multiplex Ligation Probe Amplification) med tillämpning inom Talassemi. Dick Nelson Klinisk kemi, Labmedicin Skåne
Framtida tekniker MLPA (Multiplex Ligation Probe Amplification) med tillämpning inom Talassemi. Dick Nelson Klinisk kemi, Labmedicin Skåne α-talassemi 4 genotyper Wild type αα / αα - - α + -talassemi α
Läs merInstuderingsfrågor avsnitten Molekylär genetik och Rekombinant DNA tekniker, MCB
Instuderingsfrågor avsnitten Molekylär genetik och Rekombinant DNA tekniker, MCB Molekylärgenetikdelen 1. Vad är DNA? 2. Vad heter byggstenarna i DNA? 3. Vad är RNA? 4. Vad är en bas, nukleosid, nukleotid
Läs merMed hopp om framtiden transposoner, DNA som flyttar sig själv
Med hopp om framtiden transposoner, DNA som flyttar sig själv Jessica Bergman Populärvetenskaplig sammanfattning av Självständigt arbete i biologi VT 2008 Institutionen för biologisk grundutbildning, Uppsala
Läs merKursbok: The immune system Peter Parham
T cells aktivering. Kursbok: The immune system Peter Parham Kapitel 6 Primary Immune response: First encounter of naive T cells with antigen on APC. This happens in the secondary lymphoid tissues. Priming
Läs merGraviditetsdiabetes hälsokonsekvenser för mor och barn i ett längre perspektiv
Graviditetsdiabetes hälsokonsekvenser för mor och barn i ett längre perspektiv Ingrid Östlund Kvinnokliniken USÖ SFOG 2010-08-30 Graviditetsdiabetes (GDM) asymptomatiskt tillstånd av glucosintolerans upptäckt
Läs merMångfald inom en art. Genotyp. Genpool. Olika populationer. Fig En art definieras som
Mångfald inom en art Population och art. Vad är skillnaden? Vad är en art? Genetisk variation Genetiskt olika populationer Tillämpningar av genetisk variation Etiska problem En art En art definieras som
Läs merPolymerase Chain Reaction
Polymerase Chain Reaction The Polymerase Chain Reaction Molekylärbiologisk metodik T3 ht 11 Märit Karls Kunskapsmål för detta avsnitt Från kursplan: Studenten skall kunna: förklara grundläggande principer
Läs merMångfald inom en art. Genotyp. Genpool. Olika populationer. Fig En art definieras som
Mångfald inom en art Population och art. Vad är skillnaden? Vad är en art? Genetisk variation Genetiskt olika populationer Tillämpningar av genetisk variation Etiska problem En art En art definieras som
Läs merMutationer. Typer av mutationer
Mutationer Mutationer är förändringar i den genetiska sekvensen. De är en huvudorsak till mångfalden bland organismer och de är väsentliga för evolutionen. De här förändringarna sker på många olika nivåer
Läs merKap 26 Nukleinsyror och proteinsyntes. Bilder från McMurry
Kap 26 Nukleinsyror och proteinsyntes Bilder från McMurry Namn Efternamn 26 februari 2011 2 Varje DNA molekyl är uppbyggd av många gener induviduella DNA segmant som innehåller instruktioner för syntes
Läs merTranskription och translation = Översättning av bassekvensen till aminosyrasekvens
Transkription och translation = Översättning av bassekvensen till aminosyrasekvens OBS! Grova drag för prokaryota system! Mycket mer komplicerat i eukaryota system! RNA: Tre huvudtyper: trna transfer RNA
Läs merDiagnosticera cystisk fibros med DNA-analys. Niklas Dahrén
Diagnosticera cystisk fibros med DNA-analys Niklas Dahrén Cystisk fibros Vad innebär sjukdomen?: Sjukdomen innebär att de epitelceller som bekläder kroppens ytor (inkl. luftvägarna och matsmältningssystemet)
Läs merMaria Fransson. Handledare: Daniel Jönsson, Odont. Dr
Klassificering av allvarlig kronisk parodontit: En jämförelse av fem olika klassificeringar utifrån prevalensen av allvarlig kronisk parodontit i en population från Kalmar län Maria Fransson Handledare:
Läs merMasterprogrammet i molekylära tekniker inom livsvetenskaperna
Masterprogrammet i molekylära tekniker inom na 5MT15 Inrättad av rektor 2014-06-10 Fastställd av Styrelsen för utbildning 2014-06-17 Reviderad av Styrelsen för utbildning 2014-12-17 Sid 2 (5) 1. Basdata
Läs merOF MAKING A DIFFERENCE
1 OF MAKING A DIFFERENCE ÅRSSTÄMMAN 2 MAJ 2019 Thomas Axelsson, CEO 2 10 15 % AV ALLA PAR I FERTIL ÅLDER LIDER AV INFERTILITET 3 Vårt mål är att vara den ledande leverantören av produkter och tjänster
Läs merPersonnummer. DUGGA Molekylärbiologi T3 / HT p (G = 24 p)
KORTSVARSFRÅGOR 1. Restriktionsenzymet HindIII klyver sekvensen 5 -AAGCTT-3 och lämnar ett fyra basers 5 -överhäng. Rita ut hur DNA-ändarna ser ut på ett fragment som klyvts med HindIII. (2p) SV: 5 -A
Läs merMapping sequence reads & Calling variants
Universitair Medisch Centrum Utrecht Mapping sequence reads & Calling variants Laurent Francioli 2014-10-28 l.francioli@umcutrecht.nl Next Generation Sequencing Data processing pipeline Mapping to reference
Läs merDiagnosticera sicklecellsanemi med DNA-analys. Niklas Dahrén
Diagnosticera sicklecellsanemi med DNA-analys Niklas Dahrén Sicklecellsanemi Erytrocyterna ser ut som skäror : Sjukdomen innebär a0 de röda blodkropparna (erytrocyterna) ser ut som skäror (eng. sickle)
Läs merLycka till! Tentamen. Kursens namn: Medicin C, Tumörbiologi Kursens kod: MC1728 Kursansvarig: Anna Göthlin Eremo
Tentamen Kursens namn: Medicin C, Tumörbiologi Kursens kod: MC1728 Kursansvarig: Anna Göthlin Eremo Datum: 2012-06-01 Skrivtid: 4 timmar 08:15-12:15 (P245) Poängfördelning: Karin Franzén Pia Wegman Sabina
Läs merIn Vitro Fertilisering IVF. Jan Holte
In Vitro Fertilisering IVF Jan Holte Verksamhet Carl von Startade 1990 Linnékliniken Utredningar av barnlöshet och hormonrubbningar Under 2017: Ca 100 ovulationsstimulationer/ inseminationer 1100 IVF 500
Läs merMedicinsk genetik del 1: Introduktion till genetik och medicinsk genetik. Niklas Dahrén
Medicinsk genetik del 1: Introduktion till genetik och medicinsk genetik Niklas Dahrén Vad menas med genetik och medicinsk genetik? Genetik: Genetik är det samma som ärftlighetslära och handlar om hur
Läs merRealtids-PCR. icycler BioRad, mikrotiterplattor. LightCycler Roche, kapillärer. ABI Prism 7000 Applied Biosystem mikrotiterplattor
Realtids-PCR icycler BioRad, mikrotiterplattor LightCycler Roche, kapillärer ABI Prism 7000 Applied Biosystem mikrotiterplattor Molekylärbiologisk metodik T3 ht 2011 Märit Karls Kunskapsmål för detta avsnitt
Läs merFörklara de egenskaper hos cellens "byggstenar" som utnyttjas för att upprätthålla cellens integritet och understödja livsfunktionerna.
Nämnden för biomedicinsk, medicinsk och folkhälsovetenskaplig utbildning (NBMFU)) d f b d k d k h 1(5) LÄKA13 Cellbiologi 18 högskolepoäng (hp) Nivå G1N Allmänna uppgifter Huvudområde Medicin Typ av kurs
Läs merGynObstetrik. the33. Reproduktionsendokrinologi och menstruationscykeln. Health Department
GynObstetrik Reproduktionsendokrinologi och menstruationscykeln Health Department Innehållsförteckning 1 Reproduktionsendokrinologi..2 Hypotalamus.........2 Hypofysen.. 2 Ovarierna........2 Menstruationscykel.......3
Läs merEn genetisk studie av TNF-alfa, IL-1-beta och CTLA-4 hos personer med kärlinflammationer och höga halter immunkomplex H E B A C H A R A N E K
En genetisk studie av TNF-alfa, IL-1-beta och CTLA-4 hos personer med kärlinflammationer och höga halter immunkomplex H E B A C H A R A N E K Examensarbete Stockholm, Sverige 2006 En genetisk studie av
Läs merKodnummer: 1) Beskriv processerna som sker i replikationsgaffel (eng. replication fork)? (3)
Bi 75hp / Lärarprogrammet Tentamen i BL2018 CMB; Molekylär cellbiologi & genetik, 10,5 hp 2018-01-13 1) Beskriv processerna som sker i replikationsgaffel (eng. replication fork)? (3) Bi 60hp Tentamen i
Läs merHUGO-projektet. Kartläggningen av det mänskliga genomet
Vem är HUGO? HUGO-projektet Kartläggningen av det mänskliga genomet Kartläggning av genom Genom= allt DNA hos en organism. Kartläggningen sker genom att man bestämmer DNA-sekvensen för hela genomet och
Läs merLycka till! Tentamen. Sal: T143. OBS! Ange svaren till respektive lärare på separata skrivningspapper om inget annat anges
Tentamen Kursens namn: Medicin C, Tumörbiologi Kursens kod: MC1728 Kursansvarig: Anna Göthlin Eremo Datum: 2015 06 04 Skrivtid: 4 timmar (16:15 20:15) Sal: T143 Poängfördelning: Karin Franzén Anna Göthlin
Läs merIn Vitro Fertilisering IVF
In Vitro Fertilisering IVF Jan Holte MD, PhD, Senior Consultant Carl von Linné Clinic Uppsala Science Park S-752 81 Uppsala Sweden www.linne.se Chairman of the Board, Centre for Reproductive Biology, a
Läs merMolekylärbiologi: Betygskriterier
Molekylärbiologi: Betygskriterier De obligatoriska momenten laboration och presentationsövningar examineras separat (endast G). Se separat utdelade anvisningar. Betygskriterier för teoridelen (se nedan).
Läs merEn bioinformatisk genjakt
En bioinformatisk genjakt Efter en ide från: CUSMOBIO, Milano, Italien. Hur man kan söka i databaser efter information om en gen som kan ge ökad risk för bröstcacer. Bakgrund Människor utan symptom men
Läs merKlipp-och-klistra DNA: fixa mutationen med gen editering DNA, RNA och Protein
Huntingtons sjukdom forsknings nyheter. I klartext Skriven av forskare För de globala HS medlemmarna. Klipp-och-klistra DNA: fixa mutationen med gen editering Forskare gör exakta ändringar av DNA i ett
Läs merHT 2011. En farmakologs syn på. Biologisk variation. Orsaker & konsekvenser Läkemedelsanvändning. I Nylander. Medicin & Farmaci
HT 2011 En farmakologs syn på Biologisk variation Orsaker & konsekvenser Läkemedelsanvändning I Nylander Medicin & Farmaci Individrelaterade faktorer Vad händer i veckan? Introduktion Miljöns inverkan
Läs merBestämning av FTO (Fat mass and obesity associated gene) polymorfism
Bestämning av FTO (Fat mass and obesity associated gene) polymorfism Dzenan Smajlovic Biomedicinska analytiker programmet 180 högskolepoäng Högskolan i Kalmar, Naturvetenskapliga institutionen Examensarbete
Läs merSelektion av resistenta bakterier vid väldigt låga koncentrationer av antibiotika.
Selektion av resistenta bakterier vid väldigt låga koncentrationer av antibiotika. Linus Sandegren Uppsala Universitet Inst. för Medicinsk Biokemi och Mikrobiologi linus.sandegren@imbim.uu.se Hur påverkas
Läs merDNA-sekvenserings utskick Carola Andersson KMP-lab Sahlgrenska Universitetssjukhuset
DNA-sekvenserings utskick 2012 Carola Andersson KMP-lab Sahlgrenska Universitetssjukhuset Meningen med utskicket Kvalitets kontroll av: Längd läsbar sekvens Detektion av mutationer/variationer Namngivning
Läs merKort beskrivning av analyterna i 42-plex
1 (6) 2014-11-17 Klinisk immunologi/transfusionsmedicin Kort beskrivning av analyterna i 42-plex EGF Epidermal growth factor är en tillväxtfaktor som reglerar proliferation och differentiering. EGF verkar
Läs merDNA-molekylen. 1869 upptäcktes DNA - varken protein, kolhydrat eller lipid.
Genetik Ärftlighetslära - hur går det till när egenskaper går i arv? Molekylär genetik - information i DNA och RNA Klassisk genetik - hur olika egenskaper ärvs Bioteknik - Hur DNA flyttas mellan olika
Läs merLycka till! Omtentamen. Kursens namn: Medicin C, Tumörbiologi Kursens kod: MC1728 Kursansvarig: Anna Göthlin Eremo
Omtentamen Kursens namn: Medicin C, Tumörbiologi Kursens kod: MC1728 Kursansvarig: Anna Göthlin Eremo Datum: 2012-11-24 Skrivtid: 4 timmar Poängfördelning: Karin Franzén Sabina Davidsson Pia Wegman Marike
Läs merNomenklatur för vanliga SNP-analyser Gör vi rätt?
Nomenklatur för vanliga SNP-analyser Gör vi rätt? Camilla Valtonen-André Tisdagen den 10 nov 2015 Nomenklatur för vanliga SNP-analyser Nomenklatur vad är det? Vad är rätt nomenklatur? Guidelines Varför
Läs merFamiljär hyperkolesterolemi med NGS-analys
Familjär hyperkolesterolemi med NGS-analys Equalis användarmöte Molekylär diagnostik Birgitta Kjellström Sektionen för Genanalys, Klinisk kemi 2017-11-16 Familjär hyperkolesterolemi Familjär hyperkolesterolemi
Läs merErik Eriksson VMD Enheten för Bakteriologi
Diagnostik VTEC/EHEC Erik Eriksson VMD Enheten för Bakteriologi SVA Tänker prata om VTEC / EHEC Sjukdomsframkallande faktorer PCR Magnetiska kulor (Immunomagnetisk separation) Diagnostik de vanligaste
Läs merObesity Trends* Among U.S. Adults BRFSS, 1985
Obesity Trends* Among U.S. Adults BRFSS, 1985 (*BMI 30, or ~ 30 lbs overweight for 5 4 person) No Data
Läs merKursbok: The immune system Peter Parham. Kapitel 5 Hela skall läsas och kunnas utom: Kapitel 5.5; Fig. 5.9 Kapitel 5.11 och 5.12
T-cellsutveckling. Kursbok: The immune system Peter Parham Kapitel 5 Hela skall läsas och kunnas utom: Kapitel 5.5; Fig. 5.9 Kapitel 5.11 och 5.12 Några viktiga punkter för att börja med: T celler: thymus
Läs merKombinerad träning kan muskeln bli snabb, stark och uthållig på samma gång?
OMT/FYIM Kongress/Årsmöte 20-21 mars 2015 Kombinerad träning kan muskeln bli snabb, stark och uthållig på samma gång? Tommy Lundberg Karolinska Institutet Acknowledgements Inst. för hälsovetenskap, Mittuniversitetet
Läs merDe olika typer av T celler är specialiserade på att identifiera och bekämpa patogen på olika sätt.
De olika typer av T celler är specialiserade på att identifiera och bekämpa patogen på olika sätt. En av de väsentligaste skillnaderna mellan effektor och naiva T celler är att de inte behöver co-stimulering
Läs merDatorer och matematik hjälper oss att motverka sjukdomar
Datorer och matematik hjälper oss att motverka sjukdomar Adam Ameur Bioinformatiker Lund, 26e November 2014 Introduktion till bioinformatik Bioinformatik - en tvärvetenskaplig disciplin där algoritmer
Läs merMängden utslag kan avgöra risken. Den som har psoriasis har en ökad risk för hjärtkärlsjukdomar.
HJÄRTAT Mängden utslag kan avgöra risken Den som har psoriasis har en ökad risk för hjärtkärlsjukdomar. Det är känt att hälsosamma levnadsvanor minskar risken. Men mycket tyder på att även valet av behandling
Läs merDNA-ordlista. Amplifiera: Att kopiera och på så sätt mångfaldiga en DNA-sekvens med hjälp av PCR.
DNA-ordlista Alignment: Att placera DNA-sekvenser intill varandra. Detta gör att man kan urskilja var och hur mycket de skiljer sig från varandra, vilket är ett av de mest grundläggande sätten att analysera
Läs merDNA- alfa- 1- antitrypsin, sekvens med Big Dye Direct
1(6) DNA- alfa- 1- antitrypsin, sekvens med Big Dye Direct Bakgrund, indikation och tolkning Proteinet alfa-1-antitrypsin (A1AT, AAT) är en av kroppens viktigaste proteashämmare och tillhör proteinsuperfamiljen
Läs merIGF-Systemet som diagnostiskt hjälpmedel. Kerstin Brismar. Inst för molekylär medicin och kirurgi, Karolinska Institutet
IGF-Systemet som diagnostiskt hjälpmedel Kerstin Brismar Inst för molekylär medicin och kirurgi, Karolinska Institutet kerstin.brismar@ki.se 21 sept 2017 First publications IGF-I Kerstin Hall et al 1972
Läs merVad är MHC? MHC och TCR struktur. Antigen processering och presentation. Kursbok: The immune system Peter Parham
Vad är MHC? MHC och TCR struktur. Antigen processering och presentation. Kursbok: The immune system Peter Parham Kapitel 3; hela Lite Historia: 1953: George Snell upptäcker en grupp av gener som bestämmer
Läs merUtvärdering av IVIG behandling vid post-polio syndrom. Kristian Borg
Utvärdering av IVIG behandling vid post-polio syndrom Kristian Borg Div of Rehabilitation Medicine, Karolinska Institutet and Danderyd University Hospital Stockholm Sweden Pågående denervation som kompenseras
Läs merForskningens dag 7 8 november 2012 Hur mår provrörsbarnen?
Forskningens dag 7 8 november 2012 Hur mår provrörsbarnen? Karin Källén Hur mår provrörsbarnen? Bakgrund: Hur mäter man hälsa genom att utnyttja register? Vad mäter man? Hur jämför man risker? Hur tolkar
Läs merDeepti vill flytta fokus från huden
Deepti vill flytta fokus från huden Idag vet vi att den som har psoriasis löper större risk än andra att drabbas av hjärtkärlsjukdomar. Men vi vet inte varför det är så. Det vill forskaren Deepti Verma
Läs merOptimerat NGS-flöde för rutintypning av bakterier
Optimerat NGS-flöde för rutintypning av bakterier Paula Mölling, Molekylärbiolog, Docent Bianca Törös, Daniel Golparian, Sara Thulin Hedberg, Paula Mölling Laboratoriemedicinska länskliniken, Molekylärdiagnostik
Läs merBootstrapping i fall-/kontrollstudier av genetiska markörer
Bootstrapping i fall-/kontrollstudier av genetiska markörer Håkan Lövkvist RSKC 2011-03-09 Vad är bootstrapping? Bootstrap = stövelstropp Annan översättning: Ta sig i kragen, vara självbärande Litterär
Läs merLycka till! Omtentamen. Kursens namn: Medicin C, Tumörbiologi Kursens kod: MC1728 Kursansvarig: Anna Göthlin Eremo
Omtentamen Kursens namn: Medicin C, Tumörbiologi Kursens kod: MC1728 Kursansvarig: Anna Göthlin Eremo Datum: 2012-08-20 Skrivtid: 4 timmar Poängfördelning: Karin Franzén Sabina Davidsson Pia Wegman Marike
Läs merLÄKEMEDELSMETABOLISM: MEKANISMER FÖR INTERINDIVIDUELL VARIABILITET
LÄKEMEDELSMETABOLISM: MEKANISMER FÖR INTERINDIVIDUELL VARIABILITET Maria Norlin LÄKEMEDELSMETABOLISM: MEKANISMER FÖR INTERINDIVIDUELL VARIABILITET 1 Varför reagerar vi olika på läkemedel? MILJÖ GENER NutriJon
Läs merPreklinisk Diabetesforskning Henrik Ortsäter henrik.ortsater@sodersjukhuset.se
Preklinisk Diabetesforskning Henrik Ortsäter henrik.ortsater@sodersjukhuset.se Disposition: Denna föreläsning kommer att behandla Diabetesforskning, en historik Mekanismer för glukosstimulerad insulinsekretion
Läs mer