Tankmjölkscreening avseende antikroppar mot salmonellainfektion Resultatredovisning

Transkript

1 PM Handläggare SVA Dnr 976/2012 Estelle Ågren Enhet för idisslare och gris Jordbruksverket Tankmjölkscreening avseende antikroppar mot salmonellainfektion Resultatredovisning Syfte med projektet: Att få en god bild av salmonellaförekomst bland svenska mjölkbesättningar samt en bedömning om förekomsten förändrats sedan Utvärdering av hur lyckosam bekämpning av salmonella varit i svenska mjölkbesättningar de senaste åren. Projektet förväntas även ge underlag för beslut om det finns behov av en förändring av salmonellakontrollen i svenska mjölkbesättningar. Utvärdering av resultat (enligt ansökan): Prevalens för olika gränsvärden tas fram för hela landet och jämförs med resultat från tidigare screeningar. Geografisk fördelning av positiva prover visas på karta. Spatial analys där geografisk fördelning av positiva prover undersöks för att påvisa områden med högre eller lägre förekomst än förväntat (clustering) (kommer att redovisas senare i vetenskaplig tidskrift). Uppföljning av besättningar som haft en spärr pga salmonella som lyfts under de senaste åren. Sammanfattning Tankmjölkscreeningen av samtliga svenska mjölkbesättningar visar att 141 besättningar var testpostiva för antikroppar mot salmonella i tankmjölken (positiva i Mixed ELISA). 40 av dessa besättningar är positiva i Dublin ELISA vilket innebär att antikropparna sannolikt är orsakade S Dublin infektion. Ytterligare en besättning är enbart positiv i Dublin ELISA. Sammanlagt är det 142 besättningar som är testpositiva i Mixed ELISA och/eller Dublin ELISA. Andelen positiva besättningar är 3.0 % för Mixed ELISA och 0.9 % för Dublin ELISA. Förekomsten av testpositiva mjölkbesättningar varierar mellan olika regioner, från 0-5,5 % för besättning som var positiva i Mixed ELISA men inte positiva i Dublin ELISA. För Dublin ELISA varierade förekomsten från 0-17,7 %. Jämförelse med en screening 2007 visar ingen statistiskt signifikant skillnad i förekomst av testpositiva besättningar. 1(20)

2 26 av 41 besättningar som är positiva i Dublin ELISA är lokaliserade på Öland. Jämförelse med resultat från screeningen av samtliga mjölkbesättningar på Öland 2009 visar att det är statistiskt signifikant färre besättningar på Öland som är positiva i Dublin ELISA jämfört Av de 35 mjölkbesättningar som har varit spärrade på grund av salmonella sen 2005 och där spärren har hunnit lyftas har antikroppar påvisats i 37 % av besättningarna. Orsaken kan vara kvarstående infektion i besättningarna eller/och återinfektion efter lyft spärr. Resultaten ger anledning att ställa frågan om bekämpningen så som den har utförts i dessa besättningar har gett önskat resultat. Eftersom samtliga mjölkbesättningar omfattades gav screeningen en tydlig bild av nuläget och de geografiska skillnaderna blev mycket tydliga. Det möjliggjorde också uppföljning av de besättningar som varit spärrade. Resultaten har också stort värde för jämförelse med eventuella screeningar i framtiden. Prover och analyser Tankmjölksprov från samtliga mjölkleverantörer i Sverige togs ut av Eurofins under mars och april på beställning av Växa Sverige. Proverna har analyserats med två olika indirekta ELISA-tester för analys av antikroppar mot salmonella hos nötkreatur: 1. PrioCheck Salmonella Ab bovine Dublin ELISA nedan benämnd Dublin. Innehåller O- antigen 1,9, 12 och riktar sig primärt mot antikroppar orsakade av infektion med Salmonella Dublin, korsreaktioner mot andra serotyper kan förekomma. 2. PrioCheck Salmonella Ab bovine ELISA nedan benämnd Mixed. Innehåller O-antigen 1, 9, 12 samt 1, 4, 5, 12 och riktar sig primärt mot antikroppar orsakade av infektion med S Dublin och/eller S Typhimurium, men korsreaktioner med andra serotyper förekommer. De flesta typer av salmonella som förekommer hos nötkreatur i Sverige har ett eller flera av de O-antigen som denna test innehåller. Gränsvärde: Tillverkaren Prionics rekommenderar gränsvärde Percent Positivity (PP) 35. Baserat på resultat från tidigare projekt har SVA dock gjort bedömningen att ett gränsvärde på PP 20 är en rimligare nivå för svenska förhållanden. I denna rapport har gränsvärde PP 20 använts om inte annat anges. Sensitivitet: Testet har låg sensitivitet för detektion av infekterade besättningar om endast ett enstaka tankmjölkprov analyseras. I en studie av Veling et al anges sensitiviteten till 54 % (Veling, Barkema et al. 2002). En annan studie av Warnick et al visar att sensitiviteten kan höjas till över 90 % vid analys av upprepade tankmjölksprover (Warnick, Nielsen et al. 2006). Specificitet : Testet har utvärderats på tankmjölksprover från svenska mjölkbesättningar. För Dublin har specificiteten beräknats till minst 98.8 % ( CI 95 %) och för Mixed 96.3 % ( CI 95 %) vid gränsvärde PP 20 (Nyman, Agren et al. ). Dessa värden togs fram från resultaten i en begränsad tankmjölksundersökning på svenska mjölkbesättningar 2007 med antagandet att alla positiva resultat var falskt positiva. Det innebär att siffrorna är en underskattning av den faktiska specificiteten. Om resultaten i Dublin testet från års screening från samtliga regioner utom Öland och Skåne (där det finns kända Dublinbesättningar) används för att ta fram en justerad specificitet blir resultatet 99.7 % ( CI 95 %). Apparent prevalens : I denna rapport presenteras apparent prevalens dvs förekomst av andel testpositiva mjölkbesättningar om inget annat anges. 2(20)

3 Resultat i hela landet 2007 och Under hösten 2007 samlades tankmjölksprover in från ca 1000 svenska mjölkbesättningar. Proverna analyserades med samma test som användes vid screeningen. Tabellen nedan visar resultaten för hela landet. Andelen positiva besättningar bör jämföras med konfidensintervallet som är framtaget för 2007 års screening. Test och år Antal positiva (PP 35) Antal positiva (PP 20) Antal undersökta Andel positiva (PP 35) Andel positiva (PP 20) 95 % CI (PP20) Dublin % 1.3% % Dublin % 0.9% Alla undersökta Mixed % 4.0% % Mixed % 3.0% Alla undersökta Uppskattning av antal infekterade besättningar ( True prevalens ) Den sanna förekomsten av salmonellainfekterade mjölkbesättningar kan beräknas utifrån apparent prevalens tillsammans med testets sensitivitet och specificitet. Problemet är att värdena för sensitivitet och specificitet endast är ungefärliga och små skillnader kan göra stora skillnader i slutresultatet när ett stort antal prover undersöks. Om vi antar att sensitiviteten för båda testerna är 60 %. För specificiteten utgår vi från den justerade specificiteten för Dublin testet på 99.7 % ( CI 95 %) enligt ovan. Vi antar också att Mixed testet har samma specificitet som Dublin testet. Baserat på dessa antaganden kan en ungefärlig uppskattning av antalet salmonellainfekterade mjölkbesättningar göras. Agens Uppskattad true prevalens med 95 % CI Uppskattat antal salmonellainfekterade mjölkbesättningar med 95 % CI (beräknat utifrån totalt 4683 mjölkbesättningar) Alla serotyper 4.6 % ( ) 217 ( ) Salmonella Dublin 1.0 % ( ) 49 (34-59) Uppskattat antal besättningar infekterade med salmonella Dublin är 23 % av uppskatta antal infekterade besättningar med samtliga serotyper. För antal test positiva besättningar är den relationen 29 % dvs i motsvarande storleksordning. Det stödjer att samma höga specificitet kan användas för Mixed Elisan. Om specificiteten för Mixed Elisan har överskattats så innebär det att antalet salmonellainfekterade besättningar (alla serotyper) också har överskattats. 3(20)

4 0 Frequency Frequency Histogrammen nedan visar antal besättningar på Y-axeln och PP värde för testet på X-axeln. Mixed (n=4683) Resultat O49 Dublin (n=4683) Resultat O9 4(20)

5 0 Mixed Diagrammet nedan visar analysresultat för samtliga tankmjölksprover med Mixed resultat på Y- axeln och Dublin resultat på X-axeln. Gränsvärdena PP 20 är markerade med röda linjer. Sammanlagt var 142 besättningar positiva i Mixed och/eller Dublin. 141 besättningar var positiva i Mixed varav 40 var positiva även i Dublin. Ytterligare en besättning var positiv i Dublin men inte i Mixed Dublin 5(20)

6 Tabellerna nedan visar de besättningar som är undersökta både 2007 och. Där framgår hur många som kvarstår positiva, kvarstår negativa samt hur många som konverterat från positiva till negativa respektive negativa till positiva. Mixed Elisa Påvisat Ej påvisat Totalt Påvisat Ej påvisat Totalt Dublin Elisa Påvisat Ej påvisat Totalt Påvisat Ej påvisat Totalt

7 Mixed Resultat uppdelat per län 2007 och Resultaten nedan visar att förekomsten av positiva besättningar i olika regioner varierar mellan 0 % och 17.7 % för Mixed och mellan 0 % och 15 % för Dublin. Förekomsten av Dublin positiva besättningar är högst i Kalmar län, med endast enstaka positiva besättningar i andra län. Samtliga resultat för ligger inom konfidensintervallet för 2007 års undersökning, det vill säga att ingen statistiskt signifikant ökning eller minskning av förekomsten har kunnat påvisas. I sju av de åtta län där inga positiva besättningar påvisades med Mixed i 2007 års screening finns enstaka positiva besättningar. Detta kan bero på att inte alla besättningar undersöktes 2007 eller vara ett tidigt tecken på spridning. Diagrammen nedan visar analysresultat uppdelat per län för samtliga tankmjölksprover med Mixed resultat på Y-axeln och Dublin resultat på X-axeln. Gränsvärdena PP 20 är markerade med röda linjer. TMP screening (n=4683) Blekinge län Dalarnas län Gotlands län Gävleborgs län Hallands län Jämtlands län Jönköpings län Kalmar län Kronobergs län Norrbottens län Skåne län Stockholms län Södermanlands län Uppsala län Värmlands län Västerbottens län Västernorrlands län Västmanlands län Västra Götalands län Örebro län Östergötlands län Graphs by Lan Dublin 7(20)

8 Mixed TMP screening 2007 (n~1000) Blekinge län Dalarnas län Gotlands län Gävleborgs län Hallands län Jämtlands län Jönköpings län Kalmar län Kronobergs län Norrbottens län Skåne län Stockholms län Södermanlands län Uppsala län Värmlands län Västerbottens län Västernorrlands län Västmanlands län Västra Götalands län Örebro län Östergötlands län Graphs by Lan Dublin 8(20)

9 Tabellerna nedan visar resultat per län sorterat så att de län som har högst andel positiva besättningar kommer först. Mixed per län Antal pos Antal us Antal pos 2007 Antal us 2007 Andel pos Andel pos % CI nedre Öland Gotlands län Dalarnas län Skåne län Örebro län Gävleborgs län Östergötlands län Uppsala län Västra Götalands län Värmlands län Södermanlands län Kronobergs län Jämtlands län Norrbottens län Stockholms län Hallands län Kalmar län utom Öland Blekinge län Jönköpings län Västernorrlands län Västerbottens län Västmanlands län TOTALT % CI övre 9(20)

10 10(20)

11 Dublin per län 95% CI Antal pos Antal us Antal pos 2007 Antal us 2007 Andel pos Andel pos 2007 nedre gräns 95% CI övre gräns Öland Skåne län Uppsala län Norrbottens län Södermanlands län Östergötlands län Kronobergs län Västerbottens län Västra Götalands län Kalmar län utom Öland Blekinge län Dalarnas län Gotlands län Gävleborgs län Hallands län Jämtlands län Jönköpings län Stockholms län Värmlands län Västernorrlands län Västmanlands län Örebro län TOTALT (20)

12 12(20)

13 Mixed minus Dublin per län Mixed- Dublin Antal us Andel pos Mixed-Dublin Gotlands län Dalarnas län Örebro län Gävleborgs län Skåne län Öland Värmlands län Uppsala län Västra Götalands län Östergötlands län Jämtlands län Stockholms län Kronobergs län Hallands län Södermanlands län Kalmar län utom Öland Blekinge län Jönköpings län Norrbottens län Västernorrlands län Västerbottens län Västmanlands län TOTALT (20)

14 14(20)

15 0 Mixed Resultat Öland 2007, 2009 och I Kalmar län finns 26 av de 41 besättningar som är positiva i Dublin Elisan, samtliga dessa besättningar ligger på Öland. 21 av de positiva besättningarna ligger i Borgholms kommun. Resultaten har jämförts med de prover som insamlades på Öland 2007 samt resultaten från den screening som genomfördes på Öland År 2009 samlades tankmjölkprover in under mars och analyserades med samma Dublin test som användes 2007 och. Resultaten nedan visar en statistiskt signifikant lägre andel positiva besättningar jämfört med 2009 (binomial test p = 0.02). Tabell med resultat för Ölandsbesättningar vid screeningarna 2007, 2009 och. Öland Dublin Antal pos Antal us Andel pos 95% CI nedre gräns 95% CI övre gräns Alla undersökta Alla undersökta Diagrammet nedan visar analysresultat för samtliga tankmjölksprover från Öland med Mixed Elisans resultat på Y-axeln och Dublin Elisans resultat på X-axeln.. Gränsvärdena PP 20 är markerade med röda linjer. Öland Screening Dublin 15(20)

16 Tabellen nedan visar att 13 av de besättningar som var positiva 2009 kvarstod positiva. 32 av besättningarna hade konverterat från positiva till negativa och 13 besättningar hade gått från negativa 2009 till positiva. Öland Dublin Påvisat Ej påvisat Saknas Totalt Påvisat Ej påvisat Totalt Tabellen nedan visar resultaten för Ölands två kommuner. Andelen positiva besättningar är högre än i övriga delar av landet i båda kommunerna, men tre gånger så hög i Borgholms kommun som i Mörbylånga. Öland Dublin /kommun Antal pos Antal us Andel pos Borgholm Mörbylånga Totalt (20)

17 Uppföljning av spärrade besättningar I dessa resultat ingår samtliga 35 mjölkbesättningar som spärrats efter 2005 och där salmonella har påvisats i besättningen och spärren har hunnit lyftas. Besättningar som haft serotyper av salmonella som inte har något av de O-antigen som ingår i testerna, och som därför inte förväntas kunna ge positivt utslag i testerna, har inte inkluderats. Resultaten visar att 37 % av dessa besättningar har positiva tankmjölksprover. Hos de besättningar som har varit spärrade på grund av S Dublin är denna andel högre än bland de som varit spärrade på grund av andra serotyper (47 % jämfört med 28 %). Orsaken till positiva tankmjölksprover kan vara kvarstående infektion i besättningen eller/och återinfektion av besättningen efter lyft spärr. Hur länge sen spärren lyftes verkar inte påverka sannolikheten för att en besättning som varit spärrad ska ha antikroppar i tankmjölken, kvarstående antikroppstitrar efter att infektionen försvunnit förklarar följdaktligen inte resultaten. Resultaten ger anledning att ställa frågan om bekämpningen så som den har utförts i dessa besättningar har gett önskat resultat. Tabellen nedan visar resultaten för mjölkbesättningar som varit spärrade på grund av salmonella, där salmonella har påvisats i besättningen och där spärren har hunnit lyftas. Besättningar med lyft spärr (Mixed) Antal pos Antal us Andel pos Spärr Dublin Spärr Övriga (som har O-antigen som ingår i Mixed Elisan) Totalt (20)

18 0 100 Mixed Mixed 100 Diagrammet nedan visar analysresultat för samtliga tankmjölksprover från besättningar som varit spärrade på grund av salmonella. Mixed Elisans resultat på Y-axeln och Dublin Elisans resultat på X-axeln. Gränsvärdena PP 20 är markerade med röda linjer Dublin. Diagrammet nedan visar analysresultat för samtliga tankmjölksprover från besättningar som varit spärrade på grund av salmonella uppdelat på serotyper. Mixed resultat på Y-axeln och Dublin resultat på X-axeln. Gränsvärdena PP 20 är markerade med röda linjer. Dublin (n=17) Reading (n=5) Subsp (I) 4,5:b:- (n=1) Subsp (I) O4,5,12:i:- (n=2) Typhimurium (n=10) Graphs by Serotyp I Dublin 18(20)

19 0 100 Mixed Mixed 100 Diagrammet nedan visar analysresultat för tankmjölksprover i förhållande till när spärren lyftes. Mixed resultat på Y-axeln och datum för lyft spärr på X-axeln.. Gränsvärdet PP 20 är markerat med en röd linje. 01jan jan jan jan jan jan jan sparrlyft Diagrammet nedan visar analysresultat för tankmjölksprover i förhållande till när spärren lyftes för besättningar som varit spärrade på grund av salmonella. Mixed resultat på Y-axeln och datum för lyft spärr på X-axeln.. Gränsvärdet PP 20 är markerat med en röd linje. Dublin Reading Subsp (I) 4,5:b:- Subsp (I) O4,5,12:i:- Typhimurium Graphs by Serotyp I sparrlyft 19(20)

20 Referenser: Nyman, A. K. J., E. C. C. Agren, et al. (). "Evaluation of the specificity of three enzymelinked immunosorbent assays for detection of antibodies against Salmonella in bovine bulk milk." Acta Veterinaria Scandinavica 55. Warnick, L. D., L. R. Nielsen, et al. (2006). "Simulation model estimates of test accuracy and predictive values for the Danish Salmonella surveillance program in dairy herds." Preventive veterinary medicine 77(3-4): Veling, J., H. W. Barkema, et al. (2002). "Herd-level diagnosis for Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin infection in bovine dairy herds." Preventive veterinary medicine 53(1-2): (20)