Att samarbeta kring data för forskning. Ulla Mörtberg Environmental Management and Assessment research group, KTH LifeWatch

Transkript

1 Att samarbeta kring data för forskning Ulla Mörtberg Environmental Management and Assessment research group, KTH LifeWatch

2 Att samarbeta kring data för forskning Tillgång på data LifeWatch

3 soft tools Social process (Environmental) Systems Analysis methods and tools Strategic Environmental Assessment Environmental Impact Assessment Green Procurement Process Tools Prediction Tools Data hard tools Models Physical, chemical, meteorological Surface water, ground water Ecological Experiments Standards Environmental Management and Assessment research group, KTH

4 TILLGÅNG PÅ DATA?

5 Århuskonventionen Konventionen om: tillgång till miljöinformation, allmänhetens deltagande i beslutsprocesser, och rätt till rättslig prövning i miljöfrågor, Prop. 2004/05:65 i Sverige lagstiftning som ska garantera allmänhetens tillgång till miljöinformation

6 Trender för tillgången på miljödata Minskar Ökar

7 Development of global land-to-sea runoff data accessibility (377 most near-coastal monitoring stations in WMO s Global Terrestrial Network for River Discharge [GTN-R, 2005]) Green monitored/reported catchment area White unmonitored/unreported catchment area Hannerz, PhD thesis, 2008

8 Success story on data sharing ARCTIC DATA

9 Arctic data An improved bathymetric portrayal of the Arctic Ocean: Implications for ocean modeling and geological, geophysical and oceanographic analyses (Jakobsson et al. 2008)

10 Arctic data for download

11 Att dela data ger mer DISKUSSIONER OM METODER

12 Exempelvis hur ska man applicera modeller på förekomstdata? European Breeding Bird Atlas Climatic envelope models Proceedings of the National Academy of Sciences

13 Det pågår även andra LÄRPROCESSER

14 Lärprocesser modeller och prognoser baserade på olika typer av data Hans Rosling

15 Lärprocesser modeller och prognoser baserade på olika typer av data För vissa typer av data kräver även allmänheten tillgång på rådata många gör egna system och modeller Hans Rosling

16 Exempel på SAMARBETE KRING DATA FÖR FORSKNING

17 GBIF Global Biodiversity Information Facility

18 Lifemapper bygger på GBIF-data

19 Infrastruktur för forskning LIFEWATCH

20 Lifewatch Stora mängder biodiversitetsdata samlas fortlöpande in av forskare, miljöövervakare, inventerare och av skickliga enskilda personer med eget intresse Idag är all denna information spridd i ett stort antal skilda databaser

21 LifeWatch Europa Ett europeiskt initiativ för att Skapa ett nätverk av dataflöden och databaser med information om biologisk mångfald Göra data direkt tillgänglig för användare Med verktyg för analys, modellering och presentation som fritt kan nyttjas av forskare och andra aktörer Stärka biodiversitetsforskning

22 LifeWatch Europa Drivits inom EU:s 7:e ramprogram för forskning, under åren i en planeringsfas, På gång - starta (förhoppningsvis) en omfattande konstruktionsfas under åren och att därefter gå in i en driftsfas.

23 Svenska Lifewatch I första steget SLU, Umeå universitet, Göteborgs universitet, Lunds universitet, Naturhistoriska riksmuseet/gbif, SMHI och Fiskeriverket Vetenskapsrådet Ledning, samordning och huvudsakligt genomförare ArtDatabanken, SLU Självständigt gentemot Lifewatch Europa

24 Svenska Lifewatch Mål: Stärka forskning inom analyser och modellering av biologisk mångfald nationellt Bidra till att svensk forskning inom området ska kunna vara världsledande Knyta samman ett allt mer omfattande nätverk av dataleverantörer och användare i Sverige

25 Svenska Lifewatch Utbyggnadsfas : Uppbyggnad av nätverk av aktörer med ansvar för data, enas om standard inklusive taxonomi, dataformat, metadata, behörighet, mm Nätverk av databaser och webbtjänster parterna (data providers) gör sina data digitalt tillgängliga i ett gemensamt nätverk med gemensam webbingång, andra kan ladda in data Webbgränssnitt och analysverktyg Artportalen 2.0 (snart )

26 Svenska Lifewatch Webbgränssnitt riktat till forskare, kopplat till den nya generationen av Artportalen, som möjliggör för enskilda forskare att definiera egna variabler, mm Åtkomst till andras data, kartunderlag, omvärldsfaktorer och analysverktyg Möjlighet att själv bestämma när egna data ska bli tillgängliga för andra Attraktivt att skapa sin egen databas i Artportalen (istället för på lokal dator) Data blir långsiktigt säkerställda och återanvändbara

27 Svenska Lifewatch Gemensam analysplattform Data görs öppet tillgänglig genom att webbtjänster kopplas till primärdatabaserna Analysverktyg för rumsliga och tidsmässiga analyser samt prediktionsmodeller Kan ladda upp egna data och kartor Omvärldsfaktorer som klimatdata från SMHI Metadata, instruktioner, användarstöd

28 resurser

29 Webbtjänster, standarder, autentisering e-infrastruktur resurser

30 Analyser, modeller (applikationer) Webbtjänster, standarder, autentisering hopfogning e-infrastruktur resurser

31 e-laboratorium Forskarens analyser & presentationer e-service Datauttag & presentationer (fördef. sekvens.) Analyser, modeller (applikationer) Webbtjänster, standarder, autentisering hopfogning e-infrastruktur resurser

32 LifeWatch e-laboratorium Forskarens analyser & presentationer e-service Datauttag & presentationer (fördef. sekvens.) Analyser, modeller (applikationer) Webbtjänster, standarder, autentisering hopfogning e-infrastruktur resurser

33 Svenska Lifewatch Exempel på e-service Bioklimatiska modeller för arters utbredning nu och med ett förändrat klimat Arters populationsutveckling över tiden Artrikedom i olika områden, t.ex. av arter knutna till viss biotop eller påverkade av specifik faktor Risk för algblomning i sjöar eller hav

34 Svensk struktur vision SEIS GBIF LifeWatch Europa GEOSS ETC-BDC Artfakta Klimat, mark, kem-fys, ekologi Svenska LifeWatch Analysportal Presentations- & analysverktyg, arbetsflöden Standarder, inkl. taxonomi (INSPIRE, TDWG) GIS topografi, satellit, tematiskt Web-service Forsknings- DB Web-service Statliga DB Web-service Musei- DB Web-service Artportalen Web-service Andra DB Ekologisk forskning, LTER & FOMA Statlig övervakning Taxonomisk forskning Frivilliga observatörer Konsultfirmor Andra

35 27 miljoner observationer av arter nya observationer rapporteras/dag bilder på arter

36 Artportalen 2.0 En och samma portal för alla grupper Koll före rapportering Görs tillsammans med Norge Första version juni 2011

37 Artportalen 2.0 Fritt tillägg av nya parametrar intressant för forskare och forskarstuderande Möjlighet att styra visning Valideringsverktyg

38 Webbtjänster Programvara för kommunikation mellan datorer Kan transformera data till standard Olika typer: SOAP, Tapir och OGC

39 Karttjänster WMS och WFS för kartor och GIS-lager

40 REST-tjänster hämtar tillämpningar från andra hemsidor genom url:s, t.ex. Kartor (Google, Länskartor)

41 Klient för R-statistik

42 Verktyg för att ladda upp egna artlistor Verktyg för att ladda upp egna kartor och polygoner Carychium minimum Carychium tridentatum Acroloxus lacustris Galba truncatula Buccinum truncatulum Lymnaea stagnalis Pseudosuccinea Pseudosuccinea columella Radix auricularia Radix balthica Radix ovata Radix labiata Radix peregra Lymnaea peregra Stagnicola corvus Stagnicola fuscus Stagnicola palustris Myxas glutinosa Omphiscola Omphiscola glabra Physa fontinalis Physella acuta Physella heterostropha Aplexa hypnorum Planorbidae Gyraulus crista Gyraulus laevis Gyraulus riparius Gyraulus acronicus Gyraulus albus Gyraulus parvus Anisus spirorbis Anisus leucostoma Anisus vorticulus Anisus leucostoma Anisus septemgyratus Anisus vortex Bathyomphalus contortus Helisoma duryi Hippeutis complanatus

43 Verktyg för att beräkna förekomstarea och utbredningsområde Verktyg för att ställa frågor inom polygoner

44 Verktyg för spatial statistik, t.ex. antal i olika områden

45 Verktyg för beräkning av långsiktiga trender Foto: Daniel Flordal

46 Åtkomst till Artfaktadatabas Parameteriserade ekologiska artattribut (>2000 faktorer) T.ex. biotop- och substratpreferenser, livshistorieegenskaper, rödlistestatus, påverkansfaktorer, länsförekomster, artfaktablad

47 Artförekomst i förhållande till områden med specifika biotoper Ädellöv Tall Gran

48 Biodiversitetsportalen En samlad portal varifrån allt nås Alla tillämpningar Metadata Manualer & instruktioner Allmän information om projektet

49 Svenska Lifewatch ska erbjuda En kraftfull e-infrastruktur för biodiversitetsforskning Standarder & dataformat Administration av användare Metadata, tekniska kringdata Öppen tillgång till databaser, modeller och resultat Systematik och taxonomi Observationsdata hantering Observationsdata analys och bearbetning Artfakta och klimatdata m.fl. omvärldsvariabler Lätt tillgängliga resurser Användarstöd Kommunikation & utbildning