Introduktion till informationssökning. Magdalena Svanberg Miritt Zisser

Transkript

1 Introduktion till informationssökning Magdalena Svanberg Miritt Zisser

2 Dagens innehåll Om projektet Introduktion till medicinsk informationssökning Vad är en vetenskaplig artikel? Sökresurser Skriva referenser i text! Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

3 Projektarbetet Projektarbete på temat: lungadenokarcinom Läs artikeln: A transforming KIF5B and RET gene fusion in lung adenocarcinoma revealed from whole-genome and transcriptome sequencing. Ni hittar den via Kurswebben. Del 1: Allmän introduktion till ämnet (1/3-1/2 av uppsatsen) Litteratursökning på biblioteket Del 2: Referat av artikeln (1/3-1/2 av uppsatsen) Specifikationer för uppsatsen, se kurswebben Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

4 Bibliotekets stöd för informationssökning i samband med projektet Introduktion till informationssökning (idag) Litteratursökning torsdag 28/2 eller fredag1/3 obligatorisk Återkoppling på informationssökning och referenshantering 19/3 Kom till KIB-labb för hjälp med informationssökning, referenshantering eller basfunktioner i Word. Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

5 Mål hämtade ur högskolelagen Inom det område som utbildningen avser skall studenterna, utöver kunskaper och färdigheter, utveckla förmåga att: söka och värdera kunskap på vetenskaplig nivå. följa kunskapsutvecklingen, och utbyta kunskaper även med personer utan specialkunskaper inom området. Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

6 Vad är en vetenskaplig artikel? Film från Universitetet i Växjö Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

7 Vetenskapliga artiklar Ny forskning presenteras: Konferenser Avhandlingar Vetenskapliga artiklar (viktigast) Kvalitetskontroll - > peer review Papper/elektroniskt Tidskrifter/Öppna arkiv Olika typer av vetenskapliga artiklar, till exempel: Originalartiklar Översiktsartiklar (review) Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

8 Grundstrukturen i kortform (IMRAD) Introduktion och bakgrund Material och metod Resultat Diskussion I vetenskapliga artiklar bygger man vidare på andras kunskaper Citeringar Referenser (grundpelare) Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

9 Informationssökningsprocessen Värdera Formulera frågeställning Hämta material Hitta sökord Sök Välj källor Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

10 Källkritik Ragnar Levi: Vettigare vård : evidens och kritiskt tänkande i vården. Teckning Robert Nyberg Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

11 Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

12 Forskningsresultat i dagspressen Ur Aftonbladet Ur DN Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

13 Originalartikeln som publicerats i The Journal of Physiology Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

14 We show that fast-twitch skeletal muscles from mice provided nitrate in drinking water for 7 days display increased tetanic [Ca2+]i, which resulted in increased contractile force at low stimulation frequencies, which are those used most often for normal movement (Hennig &Lømo, 1985). These effects on intracellular Ca2+ handling are consistent with recent proposals (Bailey et al. 2010; Ferreira & Behnke, 2011). Practical application of the present results is not limited to exercise performance. The changes in Ca2+ handling and involved proteins (e.g. CASQ1 and DHPR) indicate a potential therapeutic role for nitrate. For example,impaired Ca2+ handling in skeletal muscle has recently been reported in mitochondrial myopathy (Aydin et al.2009). Specifically, Aydin et al. found that reduced CASQ1 mrna and protein expression caused reduced tetanic [Ca2+]i and muscle weakness in a mouse model of mitochondrial myopathy. Thus, nitrate supplementation may be used to improve contractile function in diseases with muscle weakness involving impaired Ca2+ handling. This is also interesting from a nutritional perspective since several leafy green vegetables are high in inorganic nitrate and the amount of nitrate used in the present study can be easily achieved by adopting a green diet. Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

15 Vad söker man på? Hela texten (fulltext) Webbsida, till exempel Socialstyrelsen eller Vårdguiden Google Scholar söker i hela artiklarna Bred sökning med brus Beskrivning av texten (referensdatabas) PubMed Bibliotekets katalog Mer precis sökning Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

16 Ta reda på bakgrunden PubMed Gene Medline Plus Genetics Home Reference Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) Böcker till exempel Alberts, Bruce : Molecular biology of the cell (se ordlista) Color atlas of Genetics (e-bok nås via katalogen) Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

17 Om referenser 1 En Referens är en hänvisning till en publicerad eller opublicerad källa. En referens används för att visa på att du använt någon annans material för ditt egna kunskapsbyggande. Ett Citat är en exakt återgivning av någon annans påstående. Ett citat markeras med citationstecken Referat är att återge någon annans text eller del av text med dina egna ord. Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

18 Om referenser 2 När refererar man? När refererar man inte? Styrk och diskutera dina egna resultat genom andra forskares arbeten Visa att du är inläst på området skapa trovärdighet Visa att du använt relevanta källor Gör det lätt för läsaren att hitta dina källor Var konsekvent och korrekt undvik plagiat Information som är allmänt vedertagen Välkända datum och årtal inom historia litteratur, kultur, tradition och välkända personer Allmänna fakta som återfinns i många olika källor Observationer som görs i det vardagliga livet Vem är läsaren? Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

19 Referera eller ej? Förkylning är en infektion i övre luftvägarna som orsakas av virus. Hälften av alla förkylningar orsakas av rinovirus och dess hundra serotyper. Andra virus som orsakar förkylning eller förkylningsliknande symtom är influensavirus, parainfluensavirus, enterovirus, adenovirus, RS-virus och metapneumovirus. Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

20 Plagiat (eller fusk) - enligt KI är följande fusk att kopiera text från Internet eller andra källor utan att källhänvisa att otillåtet samarbeta med student (till exempel att studiekamraters svar är identiska trots att uppgiften är individuell) att kopiera en annan students uppsats eller annat skriftligt arbete att till exempel vid salsskrivning ta med andra hjälpmedel/saker till skrivplatsen än vad som enligt KI:s regler är tillåtna Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

21 Tre huvudstilar Harvard (efternamn, år) Osteogenesis imperfecta är en genetisk sjukdom (Cooper et al., 2008). Cambridge (upphöjda siffror) Osteogenesis imperfecta är en genetisk sjukdom. 1 Vancouver (siffror i text) Osteogenesis imperfecta är en genetisk sjukdom [1]. Osteogenesis imperfecta är en genetisk sjukdom (1). Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 6 22 februari

22 Vancouver style ICMJE (Vancouver Style) = International Committee of Medical Journal Editors Används ofta inom medicin Siffersystem; sifferangivelser i text med löpande numrering referenslistan ställs upp i den ordning som referenserna förekommer i texten varje källa förekommer i referenslistan endast en gång om man refererar till en källa flera gånger används samma siffra som första gången man refererade till källan Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 7 22 februari

23 Referenser i text, ett exempel Orsaken till sjukdomen, adenosinkinasbrist, är mutationer i en gen, kallad ADK, som kodar för enzymet (1). Genom att sekvensbestämma all proteinkodade gensekvenser, så kallad helexomsekvensiering (2), kunde en gen identifieras. Funktionen för denna gen passade med den biokemiska avvikelsen (1, 3) Referenslista: 1. Mudd SH. Hypermethioninemias of genetic and non-genetic origin: A review. Am J Med Genet C Semin Med Genet Feb 15;157(1): Kasper DL. Harrison's principles of internal medicine. New York: McGraw-Hill, Medical Pub. Division;

24 Referenser i text Det ska vara tydligt för läsaren var man hämtat fakta från. Grundregeln i allt vetenskapligt arbete är att man alltid bör använda sig av originalkällan. En referens för varje påstående Referens placeras före punkt. Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

25 OK eller plagiat? Texten på övre halvan är originalet Texten på undre halvan är studentens text OK ställ er upp och räck upp handen Tveksamt ställ er upp Plagiat sitt kvar Referensen är: [1] Lung Cancer (Non-Small Cell) [Internet]. Georgia: American Cancer Society; [updated 2012 Feb 17; cited 2013 Feb 18]. Available from: Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

26 OK? (1) About 40% of lung cancers are adenocarcinomas. These cancers start in early versions of the cells that would normally secrete substances such as mucus. This type of lung cancer occurs mainly in people who smoke (or have smoked), but it is also the most common type of lung cancer seen in non-smokers. It is more common in women than in men, and it is more likely to occur in younger people than other types of lung cancer. About 40% of lung cancers are adenocarcinomas (1). These cancers start in early versions of the cells that would normally secrete substances such as mucus (1). This type of lung cancer occurs mainly in people who smoke (or have smoked), but it is also the most common type of lung cancer seen in non-smokers. It is more common in women than in men, and it is more likely to occur in younger people than other types of lung cancer (1). Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

27 OK? (2) About 40% of lung cancers are adenocarcinomas. These cancers start in early versions of the cells that would normally secrete substances such as mucus. This type of lung cancer occurs mainly in people who smoke (or have smoked), but it is also the most common type of lung cancer seen in non-smokers. It is more common in women than in men, and it is more likely to occur in younger people than other types of lung cancer. About 40% of lung cancers are adenocarcinomas. These cancers start in early versions of the cells that would normally secrete substances such as mucus. This type of lung cancer occurs mainly in people who smoke (or have smoked), but it is also the most common type of lung cancer seen in non-smokers. It is more common in women than in men, and it is more likely to occur in younger people than other types of lung cancer. (1) Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

28 OK? (3) About 40% of lung cancers are adenocarcinomas. These cancers start in early versions of the cells that would normally secrete substances such as mucus. This type of lung cancer occurs mainly in people who smoke (or have smoked), but it is also the most common type of lung cancer seen in non-smokers. It is more common in women than in men, and it is more likely to occur in younger people than other types of lung cancer. About 40% of all instances of lung cancers are adenocarcinomas (1). They start in early versions of the cells that would normally secrete substances such as mucus (1). Adenocarcinoma occurs mainly in smokers (or former smokers), but it is also the most common type of lung cancer in non-smokers. It is more common in women than in men, and it occurs in younger people more often than other kinds of lung cancer (1). Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

29 OK? (4) About 40% of lung cancers are adenocarcinomas. These cancers start in early versions of the cells that would normally secrete substances such as mucus. This type of lung cancer occurs mainly in people who smoke (or have smoked), but it is also the most common type of lung cancer seen in non-smokers. It is more common in women than in men, and it is more likely to occur in younger people than other types of lung cancer. About 40% of lung cancers are adenocarcinomas (1). Smokers and former smokers predominates the patient group. However, adenocarcinoma is also the most common form of lung cancer among people who never smoked. Compared to other forms of lung cancer the incidence of adenocarcinoma is higher in young people. There is a sex difference with more cases of adenocarcinoma in women than in men (1). The development of adenocarcinoma starts in early versions of ephitelial cells (1). Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

30 OK? (5) About 40% of lung cancers are adenocarcinomas. These cancers start in early versions of the cells that would normally secrete substances such as mucus. This type of lung cancer occurs mainly in people who smoke (or have smoked), but it is also the most common type of lung cancer seen in non-smokers. It is more common in women than in men, and it is more likely to occur in younger people than other types of lung cancer. Ungefär 40 % av alla fall av lungcancer är adenocarcinoma (1). Denna cancerform börjar i tidiga versioner av celler som utsöndrar sekret, till exempel slem (1). Denna typ av lungcancer förekommer framför allt hos personer som röker (eller har rökt), men det är också den vanligaste typen av lungcancer hos ickerökare. Den är vanligare hos kvinnor än män, och det är vanligare att den förekommer hos unga än andra typer av lungcancer (1). Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

31 Bilder Källan/upphovsmannen ska anges. De flesta bilder behöver man be om tillstånd att använda. Bilder tillgängliga med Creative commons-licenser kan användas utan särskilt tillstånd, se till exempel Wikimedia commons, men källa måste ändå anges Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

32 Bildkällor - exempel Figur 1. Strukturen hos protein KIF5B. Reproducerad från: DB_1bg2.png / av Emw. CC BY-NC 3.0 Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari

33 Kontakt framöver KIB-labb varje vardag mellan i Solna och Huddinge Via telefon, e-post och chat varje vardag mellan 9-17 På biblioteket mån-torsdag , fredag och lördag Se mer på ki.se/ub Miritt Zisser och Magdalena Svanberg 22 februari