Metadatastödd manuell klassificering av medicinska publikationer: en titt på människa vs maskin Daniel Wadskog Karolinska Institutet

Transkript

1 Metadatastödd manuell klassificering av medicinska publikationer: en titt på människa vs maskin Daniel Wadskog Karolinska Institutet Certain data included herein are derived from the Web of Science prepared by THOMSON REUTERS, Inc. (Thomson ), Philadelphia, Pennsylvania, USA: Copyright THOMSON REUTERS 2015 All rights reserved.

2 Disposition Hur klassade vi publikationer på Karolinska Institutet? Hur väl stämmer den manuella klassningen med de alternativa klassningar vi har att tillgå? 2

3 Förutsättningar för Karolinska Institutet Enbart medicinska publikationer Enligt FOKUS bör medicin klassas på 5-siffernivå Vi har tillgång till MeSH (kontrollerad medicinsk vokabulär) Vi har professionella indexerare på biblioteket Vi har ett egenbyggt bibliometrisystem baserat på WoS och Medline (ingen publikationsdatabas) Ca 4000 pek per år För FOKUS innebär det dvs över publikationer 3

4 Olika metadata finns som kandidater till klassificeringsstöd (och eventuell automatisering) Forskarens egen ämnestillhörighet enligt SCB/UKÄ Mesh-termer ISI-klassningar Institution (både per forskare och per publikation) Abstract/titel 4

5 Klassningar per halvtidsvecka: 350 publikationer (all time high =479) Klassningar på en arbetsdag: 150 publikationer (all time high =233) Klassningar på en arbetad timme: 30 publikationer (all time high =68) Dvs, det tar ca 7 veckors heltidsarbete för att indexera ett års publikationer. Eller ett halvår med två man på halvtid för att indexera 4 års FOKUS-förberedelse. Vi klassade totalt 2200 publikationer från

6 Författarmappning KI-författare har valt eget forskningsämne utifrån SCB/UKÄ:s system på 5-siffernivå 6

7 Ena sidan av myntet Neurolog Onkolog Manuellt SCB/UKÄklassade till Onkologi 7

8 Cancer and Oncology 8

9 Andra sidan av myntet Neurolog Onkolog Manuellt SCB/UKÄklassade till Onkologi 9

10 Cancer and Oncology 70% 10

11 Neurologi Cancer 11

12 Neurology 52% 23% 12

13 MeSH-mappning Våra indexerare har mappat meshen mot SCB/UKÄ i de fall där det är möjligt 13

14 Ena sidan av myntet Neurologi Onkologi Manuellt SCB/UKÄklassade till Onkologi 14

15 Cancer and Oncology 15

16 Andra sidan av myntet Radiologi Onkologi Manuellt SCB/UKÄklassade till Onkologi 16

17 Cancer and Oncology 93% 17

18 Neurology 18

19 Neurology 94% 19

20 Hur fungerar Thomson Reuters tidskriftsklasser? 20

21 Ena sidan av myntet Neurologi Onkolog Manuellt SCB/UKÄklassade till Onkologi 21

22 Oncology 22

23 Andra sidan av myntet Neurologi Onkologi Manuellt SCB/UKÄklassade till Onkologi 23

24 Cancer and Oncology 46% 24

25 Neurosciences 25

26 Neurology 30% 22% 26

27 Institutionstillhörighet som proxy? En del institutioner har relativt specifika forskningsinriktningar 27

28 Dentistry Våra institutioners randighet 28

29 Mappningstoppen Då vet vi allt om Cancer och Neurologi, hur är det med resten då? 29

30 Andel Mesh-mappade publikationer som klassats till samma SCB/UKÄ-klassning Publications Share MeSH Cancer och onkologi 246 0,93 Kardiologi 152 0,89 Psykiatri 121 0,78 Neurologi 114 0,95 Folkhälsovetenskap, global hälsa, socialmedicin och epidemiologi 100 0,57 Neurovetenskaper 77 0,01 Endokrinologi och diabetes 75 0,53 Infektionsmedicin 74 0,22 Hälso- och sjukvårdsorganisation, hälsopolitik och hälsoekonomi 72 0,69 Gastroenterologi 70 0,81 Medicinsk bioteknologi 70 0,01 Immunologi inom det medicinska området 67 Reumatologi och inflammation 60 0,85 Cell- och molekylärbiologi 55 0,00 Lungmedicin och allergi 52 0,75 Reproduktionsmedicin och gynekologi 51 0,24 Radiologi och bildbehandling 50 0,66 Medicinsk genetik 46 0,02 Urologi och njurmedicin 42 0,81 Farmakologi och toxikologi 42 0,17 Mikrobiologi inom det medicinska området 38 0,03 Pediatrik 36 0,08 Arbetsmedicin och miljömedicin 32 0,00 Näringslära 24 0,00 Oto-rino-laryngologi 23 0,70 Fysiologi 21 Beroendelära 20 0,75 30

31 Andel författar-mappade publikationer som klassats till samma SCB/UKÄ-klassning Publications share author Cancer och onkologi 246 0,70 Kardiologi 152 0,66 Psykiatri 121 0,64 Neurologi 114 0,23 Folkhälsovetenskap, global hälsa, socialmedicin och epidemiologi 100 0,78 Neurovetenskaper 77 0,97 Endokrinologi och diabetes 75 0,63 Infektionsmedicin 74 0,57 Hälso- och sjukvårdsorganisation, hälsopolitik och hälsoekonomi 72 0,38 Gastroenterologi 70 0,61 Medicinsk bioteknologi 70 0,29 Immunologi inom det medicinska området 67 0,78 Reumatologi och inflammation 60 0,65 Cell- och molekylärbiologi 55 0,76 Lungmedicin och allergi 52 0,50 Reproduktionsmedicin och gynekologi 51 0,69 Radiologi och bildbehandling 50 0,40 Medicinsk genetik 46 0,74 Urologi och njurmedicin 42 0,81 Farmakologi och toxikologi 42 0,60 Mikrobiologi inom det medicinska området 38 0,76 Pediatrik 36 0,72 Arbetsmedicin och miljömedicin 32 0,84 Näringslära 24 0,75 Oto-rino-laryngologi 23 0,52 Fysiologi 21 0,38 Beroendelära 20 0,30 31

32 32

33 33

34 34

35 Två sidor av myntet Biblioteksklassad till ämne B Proxyklassad till ämne B 35

36 36